MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015214	TAA	2	6	91242	91247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955807
1502	NC_015214	A	6	6	91251	91256	100 %	0 %	0 %	0 %	325955807
1503	NC_015214	T	6	6	91269	91274	0 %	100 %	0 %	0 %	325955807
1504	NC_015214	T	6	6	91304	91309	0 %	100 %	0 %	0 %	325955807
1505	NC_015214	CAT	2	6	91428	91433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955807
1506	NC_015214	TTGA	2	8	91449	91456	25 %	50 %	25 %	0 %	325955807
1507	NC_015214	ATA	2	6	91632	91637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955807
1508	NC_015214	TAAA	2	8	91749	91756	75 %	25 %	0 %	0 %	325955807
1509	NC_015214	GCT	3	9	91882	91890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955808
1510	NC_015214	TGA	2	6	91945	91950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955808
1511	NC_015214	CTG	2	6	91961	91966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955808
1512	NC_015214	CT	3	6	91971	91976	0 %	50 %	0 %	50 %	325955808
1513	NC_015214	CAT	2	6	92056	92061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955808
1514	NC_015214	AGT	3	9	92073	92081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955808
1515	NC_015214	T	7	7	92094	92100	0 %	100 %	0 %	0 %	325955808
1516	NC_015214	T	6	6	92176	92181	0 %	100 %	0 %	0 %	325955808
1517	NC_015214	A	6	6	92189	92194	100 %	0 %	0 %	0 %	325955808
1518	NC_015214	TCTT	2	8	92205	92212	0 %	75 %	0 %	25 %	325955808
1519	NC_015214	GTAA	2	8	92333	92340	50 %	25 %	25 %	0 %	325955808
1520	NC_015214	ATC	2	6	92358	92363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955808
1521	NC_015214	GCTT	2	8	92448	92455	0 %	50 %	25 %	25 %	325955808
1522	NC_015214	CAA	2	6	92459	92464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955808
1523	NC_015214	T	6	6	92487	92492	0 %	100 %	0 %	0 %	325955808
1524	NC_015214	TGCA	2	8	92540	92547	25 %	25 %	25 %	25 %	325955808
1525	NC_015214	T	6	6	92569	92574	0 %	100 %	0 %	0 %	325955808
1526	NC_015214	ATC	2	6	92648	92653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955808
1527	NC_015214	GAT	2	6	92672	92677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955808
1528	NC_015214	TCA	2	6	92757	92762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955808
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1530	NC_015214	TCT	2	6	92842	92847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955808
1531	NC_015214	T	6	6	92896	92901	0 %	100 %	0 %	0 %	325955808
1532	NC_015214	CAT	2	6	92996	93001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955808
1533	NC_015214	T	6	6	93007	93012	0 %	100 %	0 %	0 %	325955808
1534	NC_015214	AAT	2	6	93071	93076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955808
1535	NC_015214	AGC	2	6	93081	93086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955808
1536	NC_015214	ACAG	2	8	93430	93437	50 %	0 %	25 %	25 %	325955809
1537	NC_015214	ATA	2	6	93503	93508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955809
1538	NC_015214	GATG	2	8	93528	93535	25 %	25 %	50 %	0 %	325955809
1539	NC_015214	CAA	2	6	93539	93544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955809
1540	NC_015214	GTG	2	6	93581	93586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955809
1541	NC_015214	AGA	2	6	93663	93668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955809
1542	NC_015214	GTTAA	2	10	93679	93688	40 %	40 %	20 %	0 %	325955809
1543	NC_015214	ATT	2	6	93772	93777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955809
1544	NC_015214	CAT	2	6	93852	93857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955809
1545	NC_015214	CGG	2	6	93858	93863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955809
1546	NC_015214	AAG	2	6	93988	93993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955809
1547	NC_015214	GCT	2	6	94045	94050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955809
1548	NC_015214	ATT	2	6	94073	94078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955809
1549	NC_015214	TGA	2	6	94128	94133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955809
1550	NC_015214	AAG	2	6	94134	94139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955809
1551	NC_015214	ATT	2	6	94192	94197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955809
1552	NC_015214	CAAG	2	8	94214	94221	50 %	0 %	25 %	25 %	325955809
1553	NC_015214	TTC	2	6	94225	94230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955809
1554	NC_015214	A	6	6	94234	94239	100 %	0 %	0 %	0 %	325955809
1555	NC_015214	CTG	2	6	94265	94270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955809
1556	NC_015214	GAA	2	6	94279	94284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955809
1557	NC_015214	TGT	2	6	94368	94373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955810
1558	NC_015214	GGTG	2	8	94398	94405	0 %	25 %	75 %	0 %	325955810
1559	NC_015214	T	6	6	94501	94506	0 %	100 %	0 %	0 %	325955810
1560	NC_015214	CAAAA	2	10	94628	94637	80 %	0 %	0 %	20 %	325955810
1561	NC_015214	CAA	2	6	94645	94650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955810
1562	NC_015214	ATC	2	6	94659	94664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955810
1563	NC_015214	TCG	2	6	94686	94691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955810
1564	NC_015214	TCA	2	6	94692	94697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955810
1565	NC_015214	GCC	2	6	94700	94705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955810
1566	NC_015214	GAAA	2	8	94734	94741	75 %	0 %	25 %	0 %	325955810
1567	NC_015214	ACA	2	6	94761	94766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955810
1568	NC_015214	CAT	2	6	94847	94852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955810
1569	NC_015214	TAA	2	6	94856	94861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955810
1570	NC_015214	CCA	2	6	94966	94971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955810
1571	NC_015214	TCT	2	6	94980	94985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955810
1572	NC_015214	TCA	2	6	95044	95049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955810
1573	NC_015214	AGAT	2	8	95082	95089	50 %	25 %	25 %	0 %	325955810
1574	NC_015214	AATA	2	8	95139	95146	75 %	25 %	0 %	0 %	325955810
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1589	NC_015214	GAT	2	6	95779	95784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955811
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1592	NC_015214	CTT	2	6	96000	96005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955812
1593	NC_015214	GTTG	2	8	96023	96030	0 %	50 %	50 %	0 %	325955812
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1595	NC_015214	AAC	2	6	96103	96108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955812
1596	NC_015214	ACCA	2	8	96132	96139	50 %	0 %	0 %	50 %	325955812
1597	NC_015214	AAGT	2	8	96190	96197	50 %	25 %	25 %	0 %	325955812
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1601	NC_015214	TTTC	2	8	96482	96489	0 %	75 %	0 %	25 %	325955812
1602	NC_015214	AATA	2	8	96495	96502	75 %	25 %	0 %	0 %	325955812
1603	NC_015214	GAA	2	6	96558	96563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955812
1604	NC_015214	ACTA	2	8	96588	96595	50 %	25 %	0 %	25 %	325955812
1605	NC_015214	TGT	2	6	96602	96607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955812
1606	NC_015214	TAAA	2	8	96708	96715	75 %	25 %	0 %	0 %	325955812
1607	NC_015214	TAT	2	6	96806	96811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955812
1608	NC_015214	A	7	7	96943	96949	100 %	0 %	0 %	0 %	325955812
1609	NC_015214	TAC	2	6	96954	96959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955812
1610	NC_015214	ATT	2	6	97265	97270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955813
1611	NC_015214	GAAAA	2	10	97271	97280	80 %	0 %	20 %	0 %	325955813
1612	NC_015214	TTA	2	6	97301	97306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955813
1613	NC_015214	ATG	2	6	97314	97319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955813
1614	NC_015214	TGG	2	6	97342	97347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955813
1615	NC_015214	TGA	2	6	97387	97392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955813
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1623	NC_015214	T	6	6	97743	97748	0 %	100 %	0 %	0 %	325955814
1624	NC_015214	GTTT	2	8	97790	97797	0 %	75 %	25 %	0 %	325955814
1625	NC_015214	ATT	2	6	97815	97820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955814
1626	NC_015214	GCT	2	6	97901	97906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955814
1627	NC_015214	AG	3	6	97940	97945	50 %	0 %	50 %	0 %	325955814
1628	NC_015214	ACT	2	6	97991	97996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955814
1629	NC_015214	ATTT	2	8	98007	98014	25 %	75 %	0 %	0 %	325955814
1630	NC_015214	T	6	6	98012	98017	0 %	100 %	0 %	0 %	325955814
1631	NC_015214	AG	3	6	98217	98222	50 %	0 %	50 %	0 %	325955814
1632	NC_015214	GAA	2	6	98228	98233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955814
1633	NC_015214	CTT	2	6	98276	98281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955814
1634	NC_015214	AAT	2	6	98294	98299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955814
1635	NC_015214	TAT	2	6	98350	98355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955814
1636	NC_015214	ACT	2	6	98429	98434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955814
1637	NC_015214	TAT	2	6	98461	98466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955814
1638	NC_015214	TTAA	2	8	98469	98476	50 %	50 %	0 %	0 %	325955814
1639	NC_015214	AGA	2	6	98489	98494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955814
1640	NC_015214	ATC	2	6	98544	98549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955814
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1642	NC_015214	GAC	2	6	98607	98612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955814
1643	NC_015214	AGA	2	6	98686	98691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955814
1644	NC_015214	AGA	2	6	98849	98854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955814
1645	NC_015214	GTT	2	6	98871	98876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955814
1646	NC_015214	AT	3	6	98888	98893	50 %	50 %	0 %	0 %	325955814
1647	NC_015214	TAA	2	6	98978	98983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955814
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1649	NC_015214	CTG	2	6	99040	99045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955814
1650	NC_015214	A	7	7	99048	99054	100 %	0 %	0 %	0 %	325955814
1651	NC_015214	TA	3	6	99085	99090	50 %	50 %	0 %	0 %	325955814
1652	NC_015214	AAT	2	6	99219	99224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955814
1653	NC_015214	GAT	2	6	99242	99247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955814
1654	NC_015214	GAT	2	6	99276	99281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955814
1655	NC_015214	TAAAT	2	10	99287	99296	60 %	40 %	0 %	0 %	325955814
1656	NC_015214	ACA	2	6	99460	99465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955815
1657	NC_015214	AACCA	2	10	99475	99484	60 %	0 %	0 %	40 %	325955815
1658	NC_015214	AAG	2	6	99510	99515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955815
1659	NC_015214	AGC	2	6	99530	99535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955815
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1661	NC_015214	A	6	6	99691	99696	100 %	0 %	0 %	0 %	325955816
1662	NC_015214	CTG	2	6	99721	99726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955816
1663	NC_015214	GCA	2	6	99727	99732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955816
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1666	NC_015214	ATT	3	9	99865	99873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955816
1667	NC_015214	T	6	6	99894	99899	0 %	100 %	0 %	0 %	325955816
1668	NC_015214	GCT	2	6	99900	99905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955816
1669	NC_015214	ATT	2	6	99946	99951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955816
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1687	NC_015214	ATT	2	6	101325	101330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955818
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1689	NC_015214	TGGC	2	8	101357	101364	0 %	25 %	50 %	25 %	325955818
1690	NC_015214	ATTG	2	8	101423	101430	25 %	50 %	25 %	0 %	325955818
1691	NC_015214	TCA	2	6	101530	101535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955818
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1693	NC_015214	TTA	2	6	101591	101596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955818
1694	NC_015214	TCT	2	6	101608	101613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955818
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1702	NC_015214	GTT	2	6	102138	102143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955819
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1706	NC_015214	AAGA	2	8	102267	102274	75 %	0 %	25 %	0 %	325955819
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1713	NC_015214	ATT	2	6	102431	102436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955819
1714	NC_015214	CTAG	2	8	102438	102445	25 %	25 %	25 %	25 %	325955819
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1722	NC_015214	CTA	2	6	102797	102802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955819
1723	NC_015214	GAT	2	6	102827	102832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955819
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1731	NC_015214	TATT	2	8	103167	103174	25 %	75 %	0 %	0 %	325955820
1732	NC_015214	CGATGA	2	12	103240	103251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325955820
1733	NC_015214	GAC	2	6	103253	103258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955820
1734	NC_015214	AGT	2	6	103270	103275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955820
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1737	NC_015214	TAA	2	6	103840	103845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955820
1738	NC_015214	CAAAGC	2	12	103960	103971	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325955820
1739	NC_015214	ATG	2	6	103974	103979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955820
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1741	NC_015214	AAGTA	2	10	104088	104097	60 %	20 %	20 %	0 %	325955820
1742	NC_015214	GTT	2	6	104104	104109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955820
1743	NC_015214	AACA	2	8	104152	104159	75 %	0 %	0 %	25 %	325955820
1744	NC_015214	GCT	2	6	104217	104222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955820
1745	NC_015214	CTAAA	2	10	104245	104254	60 %	20 %	0 %	20 %	325955820
1746	NC_015214	GTTT	2	8	104286	104293	0 %	75 %	25 %	0 %	325955820
1747	NC_015214	CGC	2	6	104329	104334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955820
1748	NC_015214	A	6	6	104619	104624	100 %	0 %	0 %	0 %	325955821
1749	NC_015214	ATCG	2	8	104669	104676	25 %	25 %	25 %	25 %	325955821
1750	NC_015214	ACC	3	9	104697	104705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955821
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1862	NC_015214	GCA	2	6	110476	110481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955826
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1865	NC_015214	AGTG	2	8	110553	110560	25 %	25 %	50 %	0 %	325955826
1866	NC_015214	GTC	2	6	110561	110566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955826
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1871	NC_015214	GTG	2	6	111208	111213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955828
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1874	NC_015214	ACC	2	6	111344	111349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955828
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1883	NC_015214	CTTTTC	2	12	111701	111712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955828
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1903	NC_015214	T	6	6	112886	112891	0 %	100 %	0 %	0 %	325955830
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1985	NC_015214	GAGC	2	8	117085	117092	25 %	0 %	50 %	25 %	325955835
1986	NC_015214	GC	3	6	117246	117251	0 %	0 %	50 %	50 %	325955835
1987	NC_015214	AAG	2	6	117279	117284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955835
1988	NC_015214	GAT	2	6	117287	117292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955835
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1991	NC_015214	CTTTG	2	10	117499	117508	0 %	60 %	20 %	20 %	325955835
1992	NC_015214	TCTT	2	8	117604	117611	0 %	75 %	0 %	25 %	325955835
1993	NC_015214	TCA	2	6	117628	117633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955835
1994	NC_015214	TCT	2	6	117674	117679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955835
1995	NC_015214	TCA	2	6	117783	117788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955835
1996	NC_015214	GCT	2	6	117830	117835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955835
1997	NC_015214	TGT	2	6	118383	118388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955836
1998	NC_015214	GAA	2	6	118447	118452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955836
1999	NC_015214	TCA	2	6	118469	118474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955836
2000	NC_015214	TGC	2	6	118518	118523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955836

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