MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015214	CAGT	2	8	63571	63578	25 %	25 %	25 %	25 %	325955777
1002	NC_015214	CTA	2	6	63583	63588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955777
1003	NC_015214	CGG	2	6	63638	63643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955777
1004	NC_015214	GAA	2	6	63651	63656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955777
1005	NC_015214	GAA	2	6	63702	63707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955777
1006	NC_015214	TAC	2	6	63710	63715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955777
1007	NC_015214	GTA	2	6	63720	63725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955777
1008	NC_015214	GGT	2	6	63738	63743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1009	NC_015214	GCTGG	2	10	63744	63753	0 %	20 %	60 %	20 %	325955777
1010	NC_015214	GC	3	6	63762	63767	0 %	0 %	50 %	50 %	325955777
1011	NC_015214	GGC	2	6	63819	63824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955777
1012	NC_015214	TGG	2	6	63839	63844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1013	NC_015214	AATG	2	8	63848	63855	50 %	25 %	25 %	0 %	325955777
1014	NC_015214	AAG	2	6	63876	63881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955777
1015	NC_015214	ATT	2	6	64018	64023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955777
1016	NC_015214	TGG	2	6	64064	64069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1017	NC_015214	CTTG	2	8	64334	64341	0 %	50 %	25 %	25 %	325955777
1018	NC_015214	AGT	2	6	64355	64360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955777
1019	NC_015214	GTT	2	6	64365	64370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955777
1020	NC_015214	GGT	2	6	64431	64436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1021	NC_015214	ACA	2	6	64468	64473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955777
1022	NC_015214	AAG	2	6	64552	64557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955777
1023	NC_015214	ATT	2	6	64625	64630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955777
1024	NC_015214	TAAA	2	8	64669	64676	75 %	25 %	0 %	0 %	325955777
1025	NC_015214	GGA	2	6	64743	64748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325955777
1026	NC_015214	CAC	2	6	65028	65033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955777
1027	NC_015214	GGT	2	6	65040	65045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1028	NC_015214	GGT	2	6	65127	65132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1029	NC_015214	TGG	2	6	65153	65158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955777
1030	NC_015214	A	6	6	65218	65223	100 %	0 %	0 %	0 %	325955777
1031	NC_015214	ACT	2	6	65230	65235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955777
1032	NC_015214	TTTA	2	8	65305	65312	25 %	75 %	0 %	0 %	325955778
1033	NC_015214	TTG	2	6	65329	65334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955778
1034	NC_015214	GAC	2	6	65486	65491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955778
1035	NC_015214	CAT	2	6	65501	65506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955778
1036	NC_015214	T	6	6	65632	65637	0 %	100 %	0 %	0 %	325955779
1037	NC_015214	CAT	2	6	65747	65752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955779
1038	NC_015214	TGG	2	6	65754	65759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955779
1039	NC_015214	T	7	7	65847	65853	0 %	100 %	0 %	0 %	325955779
1040	NC_015214	CAA	2	6	65878	65883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955779
1041	NC_015214	TAG	2	6	65922	65927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955779
1042	NC_015214	CCA	2	6	65963	65968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955779
1043	NC_015214	GTT	2	6	65999	66004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955779
1044	NC_015214	TCA	2	6	66091	66096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955779
1045	NC_015214	GAG	2	6	66173	66178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325955779
1046	NC_015214	CCA	2	6	66231	66236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955779
1047	NC_015214	GTT	2	6	66329	66334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955779
1048	NC_015214	AGT	2	6	66367	66372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955779
1049	NC_015214	TCA	2	6	66393	66398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955779
1050	NC_015214	T	6	6	66458	66463	0 %	100 %	0 %	0 %	325955779
1051	NC_015214	GTT	2	6	66612	66617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955780
1052	NC_015214	TCG	2	6	66650	66655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955780
1053	NC_015214	AAT	2	6	66687	66692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955780
1054	NC_015214	GAA	2	6	66727	66732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955780
1055	NC_015214	TCGGT	2	10	66765	66774	0 %	40 %	40 %	20 %	325955780
1056	NC_015214	GAA	2	6	66813	66818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955780
1057	NC_015214	CTT	2	6	66967	66972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955780
1058	NC_015214	ATTGA	2	10	67023	67032	40 %	40 %	20 %	0 %	325955780
1059	NC_015214	TCG	2	6	67094	67099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955780
1060	NC_015214	AAC	2	6	67102	67107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955780
1061	NC_015214	GAA	2	6	67189	67194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955780
1062	NC_015214	AAG	2	6	67205	67210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955780
1063	NC_015214	GTC	2	6	67246	67251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955780
1064	NC_015214	T	6	6	67303	67308	0 %	100 %	0 %	0 %	325955780
1065	NC_015214	TCA	2	6	67313	67318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955780
1066	NC_015214	TCA	2	6	67415	67420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955780
1067	NC_015214	A	6	6	67431	67436	100 %	0 %	0 %	0 %	325955780
1068	NC_015214	CCAT	2	8	67543	67550	25 %	25 %	0 %	50 %	325955781
1069	NC_015214	TGC	2	6	67602	67607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955781
1070	NC_015214	AGT	2	6	67651	67656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955781
1071	NC_015214	GAA	2	6	67691	67696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955781
1072	NC_015214	AGT	2	6	67855	67860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955781
1073	NC_015214	CGA	2	6	67870	67875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955781
1074	NC_015214	GTT	2	6	67919	67924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955781
1075	NC_015214	AAT	2	6	68069	68074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955781
1076	NC_015214	AAT	2	6	68115	68120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955781
1077	NC_015214	AGA	2	6	68140	68145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955781
1078	NC_015214	AGT	2	6	68173	68178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955781
1079	NC_015214	TGT	2	6	68242	68247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955781
1080	NC_015214	TCA	2	6	68280	68285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955781
1081	NC_015214	CTT	2	6	68321	68326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955781
1082	NC_015214	ATTGA	2	10	68350	68359	40 %	40 %	20 %	0 %	325955781
1083	NC_015214	A	6	6	68398	68403	100 %	0 %	0 %	0 %	325955781
1084	NC_015214	TAT	2	6	68435	68440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955782
1085	NC_015214	ATT	2	6	68449	68454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955782
1086	NC_015214	ATC	2	6	68482	68487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955782
1087	NC_015214	TAG	2	6	68577	68582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955782
1088	NC_015214	GCG	2	6	68632	68637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955782
1089	NC_015214	CAGC	2	8	68658	68665	25 %	0 %	25 %	50 %	325955782
1090	NC_015214	TTA	2	6	68666	68671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955782
1091	NC_015214	T	7	7	68697	68703	0 %	100 %	0 %	0 %	325955782
1092	NC_015214	CAT	2	6	68710	68715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955782
1093	NC_015214	GTTT	2	8	68741	68748	0 %	75 %	25 %	0 %	325955782
1094	NC_015214	CAG	2	6	68767	68772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955782
1095	NC_015214	GAA	2	6	68821	68826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955782
1096	NC_015214	AGT	2	6	68838	68843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955782
1097	NC_015214	CGA	2	6	68853	68858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955782
1098	NC_015214	TCG	2	6	68918	68923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955782
1099	NC_015214	GCT	2	6	69024	69029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955782
1100	NC_015214	TAA	2	6	69088	69093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955782
1101	NC_015214	GAT	2	6	69129	69134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955782
1102	NC_015214	TAA	2	6	69205	69210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955782
1103	NC_015214	TCT	2	6	69236	69241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955782
1104	NC_015214	A	6	6	69258	69263	100 %	0 %	0 %	0 %	325955782
1105	NC_015214	ATT	2	6	69460	69465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955783
1106	NC_015214	TGA	2	6	69500	69505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955783
1107	NC_015214	ATTTTA	2	12	69510	69521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955783
1108	NC_015214	T	6	6	69549	69554	0 %	100 %	0 %	0 %	325955783
1109	NC_015214	ATG	2	6	69631	69636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955783
1110	NC_015214	A	7	7	69638	69644	100 %	0 %	0 %	0 %	325955783
1111	NC_015214	GAT	2	6	69741	69746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955783
1112	NC_015214	GCA	2	6	69759	69764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955783
1113	NC_015214	T	6	6	69786	69791	0 %	100 %	0 %	0 %	325955783
1114	NC_015214	ATGA	2	8	69807	69814	50 %	25 %	25 %	0 %	325955783
1115	NC_015214	ATG	2	6	69865	69870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955783
1116	NC_015214	ATG	2	6	69885	69890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955783
1117	NC_015214	ATTA	2	8	69960	69967	50 %	50 %	0 %	0 %	325955783
1118	NC_015214	TCT	2	6	70064	70069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955783
1119	NC_015214	AG	3	6	70071	70076	50 %	0 %	50 %	0 %	325955783
1120	NC_015214	TATTTT	2	12	70086	70097	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	325955783
1121	NC_015214	GAT	2	6	70110	70115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955783
1122	NC_015214	GAA	2	6	70122	70127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955783
1123	NC_015214	ATCA	2	8	70144	70151	50 %	25 %	0 %	25 %	325955783
1124	NC_015214	A	7	7	70158	70164	100 %	0 %	0 %	0 %	325955783
1125	NC_015214	AAGA	2	8	70290	70297	75 %	0 %	25 %	0 %	325955784
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1372	NC_015214	A	6	6	85211	85216	100 %	0 %	0 %	0 %	325955800
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1498	NC_015214	CAA	2	6	91137	91142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955806
1499	NC_015214	GTA	2	6	91147	91152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955806
1500	NC_015214	AAT	2	6	91219	91224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955807

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