MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015214	GGA	2	6	29422	29427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325955748
502	NC_015214	AGA	2	6	29492	29497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
503	NC_015214	TGG	2	6	29564	29569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955748
504	NC_015214	GAA	2	6	29585	29590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
505	NC_015214	GAA	2	6	29593	29598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
506	NC_015214	GAT	3	9	29755	29763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955748
507	NC_015214	AAG	2	6	29768	29773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
508	NC_015214	CTT	2	6	29810	29815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955748
509	NC_015214	ATC	2	6	29863	29868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955748
510	NC_015214	A	6	6	29910	29915	100 %	0 %	0 %	0 %	325955748
511	NC_015214	ATT	2	6	30040	30045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955749
512	NC_015214	T	6	6	30052	30057	0 %	100 %	0 %	0 %	325955749
513	NC_015214	AT	3	6	30091	30096	50 %	50 %	0 %	0 %	325955749
514	NC_015214	ATC	2	6	30110	30115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
515	NC_015214	TTTG	2	8	30135	30142	0 %	75 %	25 %	0 %	325955749
516	NC_015214	TAC	2	6	30174	30179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
517	NC_015214	TCT	2	6	30215	30220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955749
518	NC_015214	TCG	2	6	30230	30235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955749
519	NC_015214	CTA	2	6	30388	30393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
520	NC_015214	TGGT	2	8	30453	30460	0 %	50 %	50 %	0 %	325955749
521	NC_015214	ACG	2	6	30662	30667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955749
522	NC_015214	AAAG	2	8	30762	30769	75 %	0 %	25 %	0 %	325955749
523	NC_015214	CAAA	2	8	30794	30801	75 %	0 %	0 %	25 %	325955749
524	NC_015214	GCT	2	6	30808	30813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955749
525	NC_015214	T	6	6	30830	30835	0 %	100 %	0 %	0 %	325955750
526	NC_015214	T	7	7	30850	30856	0 %	100 %	0 %	0 %	325955750
527	NC_015214	CCA	2	6	31060	31065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955750
528	NC_015214	TCT	2	6	31120	31125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955750
529	NC_015214	TG	3	6	31129	31134	0 %	50 %	50 %	0 %	325955750
530	NC_015214	T	7	7	31138	31144	0 %	100 %	0 %	0 %	325955750
531	NC_015214	CAC	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955750
532	NC_015214	TCC	2	6	31405	31410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955751
533	NC_015214	TA	3	6	31444	31449	50 %	50 %	0 %	0 %	325955751
534	NC_015214	GGTA	2	8	31483	31490	25 %	25 %	50 %	0 %	325955751
535	NC_015214	ACC	2	6	31535	31540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955751
536	NC_015214	GTG	2	6	31630	31635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955751
537	NC_015214	AAAT	2	8	31716	31723	75 %	25 %	0 %	0 %	325955751
538	NC_015214	AGC	2	6	31745	31750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955751
539	NC_015214	ATC	2	6	31791	31796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955751
540	NC_015214	AAT	2	6	31832	31837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955751
541	NC_015214	TTGT	2	8	31976	31983	0 %	75 %	25 %	0 %	325955752
542	NC_015214	TAA	2	6	32071	32076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955752
543	NC_015214	TAT	2	6	32242	32247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955752
544	NC_015214	ATA	2	6	32293	32298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955752
545	NC_015214	TGTT	2	8	32310	32317	0 %	75 %	25 %	0 %	325955752
546	NC_015214	ATC	2	6	32404	32409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955753
547	NC_015214	TTTGC	2	10	32412	32421	0 %	60 %	20 %	20 %	325955753
548	NC_015214	CTT	2	6	32427	32432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955753
549	NC_015214	CAT	2	6	32436	32441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955753
550	NC_015214	AGC	2	6	32452	32457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955753
551	NC_015214	TCTT	2	8	32458	32465	0 %	75 %	0 %	25 %	325955753
552	NC_015214	TCT	2	6	32472	32477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955753
553	NC_015214	GCTT	2	8	32498	32505	0 %	50 %	25 %	25 %	325955753
554	NC_015214	ACC	2	6	32512	32517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955753
555	NC_015214	GTA	2	6	32518	32523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955753
556	NC_015214	GAA	2	6	32526	32531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955753
557	NC_015214	GT	3	6	32549	32554	0 %	50 %	50 %	0 %	325955753
558	NC_015214	GAA	2	6	32565	32570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955753
559	NC_015214	AGC	2	6	32722	32727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955753
560	NC_015214	AC	3	6	32883	32888	50 %	0 %	0 %	50 %	325955753
561	NC_015214	TGGG	2	8	32941	32948	0 %	25 %	75 %	0 %	325955753
562	NC_015214	ACT	2	6	33092	33097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955753
563	NC_015214	AGC	2	6	33116	33121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955753
564	NC_015214	AAT	2	6	33169	33174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955753
565	NC_015214	CT	3	6	33213	33218	0 %	50 %	0 %	50 %	325955753
566	NC_015214	CCT	2	6	33246	33251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955753
567	NC_015214	CAA	2	6	33387	33392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955753
568	NC_015214	ATT	2	6	33475	33480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955753
569	NC_015214	TGT	2	6	33504	33509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955753
570	NC_015214	GGT	2	6	33522	33527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955753
571	NC_015214	GTC	2	6	33571	33576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955753
572	NC_015214	ACG	2	6	33604	33609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955753
573	NC_015214	CAA	2	6	33621	33626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955753
574	NC_015214	CAG	2	6	33666	33671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955753
575	NC_015214	GTT	2	6	33703	33708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955753
576	NC_015214	CCG	2	6	33755	33760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955753
577	NC_015214	TTGG	2	8	33833	33840	0 %	50 %	50 %	0 %	325955753
578	NC_015214	GTA	2	6	33907	33912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955753
579	NC_015214	CGT	2	6	33918	33923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955753
580	NC_015214	TTGA	2	8	33974	33981	25 %	50 %	25 %	0 %	325955753
581	NC_015214	TGC	2	6	33996	34001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955753
582	NC_015214	ACA	2	6	34013	34018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955753
583	NC_015214	TTA	2	6	34034	34039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955753
584	NC_015214	AAC	2	6	34069	34074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955753
585	NC_015214	CGC	3	9	34086	34094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325955753
586	NC_015214	AGGA	2	8	34115	34122	50 %	0 %	50 %	0 %	325955753
587	NC_015214	AAG	2	6	34161	34166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955753
588	NC_015214	CAG	2	6	34214	34219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955753
589	NC_015214	TAAAC	2	10	34304	34313	60 %	20 %	0 %	20 %	325955753
590	NC_015214	AAT	2	6	34316	34321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955753
591	NC_015214	CTT	2	6	34353	34358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955753
592	NC_015214	TAG	2	6	34563	34568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955753
593	NC_015214	TTGT	2	8	34914	34921	0 %	75 %	25 %	0 %	325955754
594	NC_015214	ATG	2	6	34936	34941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955754
595	NC_015214	ATTT	2	8	34959	34966	25 %	75 %	0 %	0 %	325955754
596	NC_015214	TTAC	2	8	34967	34974	25 %	50 %	0 %	25 %	325955754
597	NC_015214	ATA	2	6	35032	35037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955754
598	NC_015214	GTC	2	6	35041	35046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955754
599	NC_015214	CGTA	2	8	35180	35187	25 %	25 %	25 %	25 %	325955754
600	NC_015214	TTGA	2	8	35212	35219	25 %	50 %	25 %	0 %	325955754
601	NC_015214	CTA	2	6	35258	35263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955754
602	NC_015214	AGA	2	6	35333	35338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955754
603	NC_015214	GA	3	6	35340	35345	50 %	0 %	50 %	0 %	325955754
604	NC_015214	A	6	6	35413	35418	100 %	0 %	0 %	0 %	325955754
605	NC_015214	GGC	2	6	35620	35625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955754
606	NC_015214	ATT	2	6	35662	35667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955754
607	NC_015214	TCT	2	6	35813	35818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955754
608	NC_015214	AAG	3	9	35854	35862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955754
609	NC_015214	ATT	2	6	35879	35884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955755
610	NC_015214	CAT	2	6	35900	35905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955755
611	NC_015214	CGCA	2	8	35906	35913	25 %	0 %	25 %	50 %	325955755
612	NC_015214	AGA	2	6	35924	35929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955755
613	NC_015214	A	6	6	35951	35956	100 %	0 %	0 %	0 %	325955755
614	NC_015214	T	6	6	36015	36020	0 %	100 %	0 %	0 %	325955755
615	NC_015214	TGA	2	6	36212	36217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955755
616	NC_015214	AGC	2	6	36223	36228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955755
617	NC_015214	TAG	2	6	36247	36252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955755
618	NC_015214	GAA	2	6	36273	36278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955755
619	NC_015214	AAG	2	6	36345	36350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955755
620	NC_015214	ATG	2	6	36370	36375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955755
621	NC_015214	ATTG	2	8	36416	36423	25 %	50 %	25 %	0 %	325955755
622	NC_015214	A	6	6	36445	36450	100 %	0 %	0 %	0 %	325955755
623	NC_015214	AATTA	2	10	36481	36490	60 %	40 %	0 %	0 %	325955756
624	NC_015214	ACA	2	6	36505	36510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955756
625	NC_015214	CCAC	2	8	36513	36520	25 %	0 %	0 %	75 %	325955756
626	NC_015214	AATC	2	8	36569	36576	50 %	25 %	0 %	25 %	325955756
627	NC_015214	AAG	2	6	36588	36593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955756
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629	NC_015214	GAT	2	6	36925	36930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955757
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