MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015214	GTT	2	6	278436	278441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955983
5002	NC_015214	GAA	2	6	278568	278573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5003	NC_015214	ATT	2	6	278634	278639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955983
5004	NC_015214	CTT	2	6	278645	278650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955983
5005	NC_015214	GAA	2	6	278664	278669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5006	NC_015214	TTG	2	6	278674	278679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955983
5007	NC_015214	CAC	2	6	278716	278721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955983
5008	NC_015214	AAG	2	6	278727	278732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5009	NC_015214	CAT	2	6	278774	278779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955983
5010	NC_015214	GAA	2	6	278784	278789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5011	NC_015214	GAC	2	6	278823	278828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955983
5012	NC_015214	GAA	2	6	278856	278861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5013	NC_015214	ACG	2	6	278875	278880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955983
5014	NC_015214	GGT	2	6	278940	278945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955983
5015	NC_015214	CAA	2	6	279019	279024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955983
5016	NC_015214	AAG	2	6	279078	279083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5017	NC_015214	AAG	2	6	279087	279092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955983
5018	NC_015214	AAAG	2	8	279363	279370	75 %	0 %	25 %	0 %	325955984
5019	NC_015214	AAGA	2	8	279373	279380	75 %	0 %	25 %	0 %	325955984
5020	NC_015214	GAA	2	6	279400	279405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955984
5021	NC_015214	AAG	2	6	279413	279418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955984
5022	NC_015214	TTG	2	6	279469	279474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955984
5023	NC_015214	CAG	2	6	279476	279481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955984
5024	NC_015214	A	7	7	279543	279549	100 %	0 %	0 %	0 %	325955984
5025	NC_015214	CAA	2	6	279589	279594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955984
5026	NC_015214	ATT	2	6	279600	279605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955984
5027	NC_015214	GAA	2	6	279607	279612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955984
5028	NC_015214	A	8	8	279623	279630	100 %	0 %	0 %	0 %	325955984
5029	NC_015214	ATG	2	6	279680	279685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955984
5030	NC_015214	A	6	6	279728	279733	100 %	0 %	0 %	0 %	325955984
5031	NC_015214	TGG	2	6	279750	279755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955984
5032	NC_015214	AAG	2	6	279818	279823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955984
5033	NC_015214	ATT	3	9	279850	279858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955984
5034	NC_015214	TCC	2	6	279864	279869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955984
5035	NC_015214	TAAGAA	2	12	279909	279920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	325955984
5036	NC_015214	TGT	2	6	279945	279950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955984
5037	NC_015214	TGA	2	6	280041	280046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955984
5038	NC_015214	TGA	2	6	280077	280082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955984
5039	NC_015214	AT	3	6	280095	280100	50 %	50 %	0 %	0 %	325955984
5040	NC_015214	AGA	2	6	280144	280149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955984
5041	NC_015214	ATA	2	6	280181	280186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955984
5042	NC_015214	ATG	2	6	280244	280249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955984
5043	NC_015214	AAT	2	6	280296	280301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955984
5044	NC_015214	TAT	2	6	280347	280352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955984
5045	NC_015214	AAAT	2	8	280416	280423	75 %	25 %	0 %	0 %	325955984
5046	NC_015214	AGT	2	6	280443	280448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955984
5047	NC_015214	ATTA	2	8	280476	280483	50 %	50 %	0 %	0 %	325955984
5048	NC_015214	A	6	6	280489	280494	100 %	0 %	0 %	0 %	325955984
5049	NC_015214	AAGT	2	8	280524	280531	50 %	25 %	25 %	0 %	325955985
5050	NC_015214	TA	3	6	280551	280556	50 %	50 %	0 %	0 %	325955985
5051	NC_015214	TAA	2	6	280599	280604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955985
5052	NC_015214	ATTT	2	8	280700	280707	25 %	75 %	0 %	0 %	325955985
5053	NC_015214	TAA	2	6	280708	280713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955985
5054	NC_015214	TGA	3	9	280717	280725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955985
5055	NC_015214	ACA	2	6	280747	280752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955985
5056	NC_015214	CTAT	2	8	280974	280981	25 %	50 %	0 %	25 %	325955985
5057	NC_015214	CTAAAG	2	12	280998	281009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325955985
5058	NC_015214	ACT	2	6	281085	281090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955985
5059	NC_015214	ATTGG	2	10	281101	281110	20 %	40 %	40 %	0 %	325955985
5060	NC_015214	ATA	2	6	281160	281165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955985
5061	NC_015214	TGA	2	6	281308	281313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955985
5062	NC_015214	CTA	2	6	281424	281429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955985
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5065	NC_015214	AAT	2	6	281651	281656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955985
5066	NC_015214	TAG	2	6	282208	282213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955986
5067	NC_015214	AAGTT	2	10	282250	282259	40 %	40 %	20 %	0 %	325955986
5068	NC_015214	TAG	2	6	282322	282327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955986
5069	NC_015214	CAA	2	6	282350	282355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955986
5070	NC_015214	TGA	2	6	282416	282421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955986
5071	NC_015214	GAC	2	6	282481	282486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955987
5072	NC_015214	CAA	2	6	282502	282507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955987
5073	NC_015214	ATG	2	6	282527	282532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955987
5074	NC_015214	ATT	2	6	282590	282595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955987
5075	NC_015214	ATG	2	6	282605	282610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955987
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5078	NC_015214	CTT	2	6	282708	282713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955987
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5080	NC_015214	ATT	3	9	282841	282849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955987
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5082	NC_015214	A	7	7	282946	282952	100 %	0 %	0 %	0 %	325955987
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5089	NC_015214	AGA	2	6	283167	283172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955987
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5092	NC_015214	TAA	2	6	283238	283243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955987
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5098	NC_015214	A	7	7	283510	283516	100 %	0 %	0 %	0 %	325955988
5099	NC_015214	T	7	7	283520	283526	0 %	100 %	0 %	0 %	325955988
5100	NC_015214	ACA	2	6	283530	283535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955988
5101	NC_015214	AAT	2	6	283567	283572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955988
5102	NC_015214	AAG	2	6	283574	283579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955988
5103	NC_015214	ATT	3	9	283601	283609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955988
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5105	NC_015214	AAT	2	6	283689	283694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955988
5106	NC_015214	AAAAG	2	10	283752	283761	80 %	0 %	20 %	0 %	325955988
5107	NC_015214	ATT	2	6	283798	283803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955988
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5109	NC_015214	CAA	2	6	283830	283835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955988
5110	NC_015214	CAA	2	6	283853	283858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955988
5111	NC_015214	TGG	2	6	283864	283869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955988
5112	NC_015214	ATA	2	6	283880	283885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955988
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5116	NC_015214	ATGT	2	8	284213	284220	25 %	50 %	25 %	0 %	325955989
5117	NC_015214	GAT	2	6	284321	284326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955989
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5122	NC_015214	ATG	2	6	284490	284495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955989
5123	NC_015214	ATG	2	6	284508	284513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955989
5124	NC_015214	ACTTTG	2	12	284532	284543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325955989
5125	NC_015214	A	6	6	284547	284552	100 %	0 %	0 %	0 %	325955989
5126	NC_015214	GAAA	2	8	284554	284561	75 %	0 %	25 %	0 %	325955989
5127	NC_015214	GAA	2	6	284636	284641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955989
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5131	NC_015214	TCT	2	6	284941	284946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955989
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5133	NC_015214	TGA	2	6	285147	285152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955989
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5140	NC_015214	A	7	7	285552	285558	100 %	0 %	0 %	0 %	325955991
5141	NC_015214	GGT	2	6	285559	285564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955991
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5143	NC_015214	TCAT	2	8	285653	285660	25 %	50 %	0 %	25 %	325955991
5144	NC_015214	GAT	2	6	285667	285672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955991
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5148	NC_015214	AGA	2	6	285945	285950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955991
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5243	NC_015214	TGC	2	6	291847	291852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955995
5244	NC_015214	TGA	2	6	291936	291941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955995
5245	NC_015214	TTCA	2	8	291952	291959	25 %	50 %	0 %	25 %	325955995
5246	NC_015214	GTC	2	6	292044	292049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955995
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