MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015214	ATT	2	6	253170	253175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955961
4502	NC_015214	CTTAT	2	10	253216	253225	20 %	60 %	0 %	20 %	325955961
4503	NC_015214	GTG	2	6	253336	253341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955961
4504	NC_015214	GAT	2	6	253343	253348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955961
4505	NC_015214	TAA	2	6	253355	253360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955961
4506	NC_015214	A	7	7	253374	253380	100 %	0 %	0 %	0 %	325955961
4507	NC_015214	TAA	2	6	253498	253503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955961
4508	NC_015214	GGT	2	6	253553	253558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955961
4509	NC_015214	GGT	2	6	253563	253568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955961
4510	NC_015214	TGA	2	6	253582	253587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955961
4511	NC_015214	CTTG	2	8	253634	253641	0 %	50 %	25 %	25 %	325955961
4512	NC_015214	GAA	2	6	253755	253760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955961
4513	NC_015214	A	6	6	253766	253771	100 %	0 %	0 %	0 %	325955961
4514	NC_015214	ATT	2	6	253785	253790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955961
4515	NC_015214	TG	3	6	253969	253974	0 %	50 %	50 %	0 %	325955962
4516	NC_015214	GGTT	2	8	254047	254054	0 %	50 %	50 %	0 %	325955962
4517	NC_015214	GCT	2	6	254071	254076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955962
4518	NC_015214	TAT	2	6	254099	254104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4519	NC_015214	ATT	2	6	254128	254133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4520	NC_015214	GTG	2	6	254180	254185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955962
4521	NC_015214	TGC	2	6	254235	254240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955962
4522	NC_015214	TTA	2	6	254348	254353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4523	NC_015214	GTT	2	6	254386	254391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955962
4524	NC_015214	ATT	2	6	254611	254616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4525	NC_015214	ATG	2	6	254624	254629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955962
4526	NC_015214	ATC	2	6	254641	254646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955962
4527	NC_015214	A	6	6	254664	254669	100 %	0 %	0 %	0 %	325955962
4528	NC_015214	GTG	2	6	254690	254695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955962
4529	NC_015214	TAT	2	6	254730	254735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4530	NC_015214	TTGG	2	8	254850	254857	0 %	50 %	50 %	0 %	325955962
4531	NC_015214	TTTA	2	8	255054	255061	25 %	75 %	0 %	0 %	325955962
4532	NC_015214	TTA	2	6	255073	255078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4533	NC_015214	TTA	2	6	255086	255091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4534	NC_015214	CCGGT	2	10	255119	255128	0 %	20 %	40 %	40 %	325955962
4535	NC_015214	TGGCT	2	10	255191	255200	0 %	40 %	40 %	20 %	325955962
4536	NC_015214	TTTTG	2	10	255213	255222	0 %	80 %	20 %	0 %	325955962
4537	NC_015214	ACT	2	6	255256	255261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955962
4538	NC_015214	TAT	2	6	255307	255312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955962
4539	NC_015214	AAG	2	6	255340	255345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955962
4540	NC_015214	TGG	2	6	255361	255366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955962
4541	NC_015214	AAAATA	2	12	255551	255562	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	325955962
4542	NC_015214	TATT	2	8	255628	255635	25 %	75 %	0 %	0 %	325955963
4543	NC_015214	AC	3	6	255647	255652	50 %	0 %	0 %	50 %	325955963
4544	NC_015214	CGTTGT	2	12	255653	255664	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	325955963
4545	NC_015214	CCAG	2	8	255733	255740	25 %	0 %	25 %	50 %	325955963
4546	NC_015214	TCACCG	2	12	255763	255774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325955963
4547	NC_015214	AATT	2	8	255780	255787	50 %	50 %	0 %	0 %	325955963
4548	NC_015214	CTT	2	6	255790	255795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955963
4549	NC_015214	TTA	2	6	255838	255843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955963
4550	NC_015214	ATA	2	6	255856	255861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955963
4551	NC_015214	TCT	2	6	255896	255901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955963
4552	NC_015214	GA	3	6	255998	256003	50 %	0 %	50 %	0 %	325955963
4553	NC_015214	TCA	2	6	256006	256011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955963
4554	NC_015214	ATG	2	6	256038	256043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955963
4555	NC_015214	GTG	2	6	256058	256063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955963
4556	NC_015214	ACTA	2	8	256098	256105	50 %	25 %	0 %	25 %	325955963
4557	NC_015214	AAT	2	6	256142	256147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955963
4558	NC_015214	T	6	6	256167	256172	0 %	100 %	0 %	0 %	325955963
4559	NC_015214	GTA	2	6	256183	256188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955963
4560	NC_015214	ATC	2	6	256266	256271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955963
4561	NC_015214	CAG	2	6	256283	256288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955963
4562	NC_015214	GAC	2	6	256289	256294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955963
4563	NC_015214	AAT	2	6	256302	256307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955963
4564	NC_015214	TA	3	6	256334	256339	50 %	50 %	0 %	0 %	325955963
4565	NC_015214	TTA	2	6	256372	256377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955963
4566	NC_015214	TGG	2	6	256564	256569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955964
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4568	NC_015214	ATT	2	6	256648	256653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955964
4569	NC_015214	ATCA	2	8	256712	256719	50 %	25 %	0 %	25 %	325955964
4570	NC_015214	CAT	2	6	256822	256827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955964
4571	NC_015214	AAT	2	6	256906	256911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955964
4572	NC_015214	TAT	2	6	256924	256929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955964
4573	NC_015214	TTAC	2	8	257025	257032	25 %	50 %	0 %	25 %	325955964
4574	NC_015214	T	6	6	257035	257040	0 %	100 %	0 %	0 %	325955964
4575	NC_015214	GAA	2	6	257067	257072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955964
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4579	NC_015214	GAT	2	6	257181	257186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4580	NC_015214	GTGAT	2	10	257252	257261	20 %	40 %	40 %	0 %	325955964
4581	NC_015214	GAA	2	6	257302	257307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955964
4582	NC_015214	AATC	2	8	257356	257363	50 %	25 %	0 %	25 %	325955964
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4585	NC_015214	GATT	2	8	257454	257461	25 %	50 %	25 %	0 %	325955964
4586	NC_015214	ATG	2	6	257584	257589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4587	NC_015214	GAA	2	6	257617	257622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955964
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4590	NC_015214	ATG	2	6	257786	257791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4591	NC_015214	T	6	6	257891	257896	0 %	100 %	0 %	0 %	325955964
4592	NC_015214	ATG	2	6	257933	257938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4593	NC_015214	TAC	2	6	257995	258000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955964
4594	NC_015214	TGA	2	6	258012	258017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4595	NC_015214	TAG	2	6	258026	258031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4596	NC_015214	GAAA	2	8	258109	258116	75 %	0 %	25 %	0 %	325955964
4597	NC_015214	AGT	3	9	258173	258181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955964
4598	NC_015214	AGT	2	6	258320	258325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955965
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4601	NC_015214	GCAA	2	8	258463	258470	50 %	0 %	25 %	25 %	325955965
4602	NC_015214	TCGAA	2	10	258491	258500	40 %	20 %	20 %	20 %	325955965
4603	NC_015214	CAA	2	6	258506	258511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955965
4604	NC_015214	GAA	2	6	258524	258529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955965
4605	NC_015214	TGG	2	6	258543	258548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955966
4606	NC_015214	GCT	2	6	258566	258571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955966
4607	NC_015214	T	6	6	258571	258576	0 %	100 %	0 %	0 %	325955966
4608	NC_015214	ATTTT	2	10	258613	258622	20 %	80 %	0 %	0 %	325955966
4609	NC_015214	TA	3	6	258793	258798	50 %	50 %	0 %	0 %	325955967
4610	NC_015214	TTAA	2	8	258810	258817	50 %	50 %	0 %	0 %	325955967
4611	NC_015214	TAA	2	6	258833	258838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955967
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4617	NC_015214	GC	3	6	259350	259355	0 %	0 %	50 %	50 %	325955967
4618	NC_015214	AAG	2	6	259383	259388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955967
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4621	NC_015214	AGT	2	6	259456	259461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955967
4622	NC_015214	CTTTG	2	10	259603	259612	0 %	60 %	20 %	20 %	325955967
4623	NC_015214	TCTT	2	8	259708	259715	0 %	75 %	0 %	25 %	325955967
4624	NC_015214	TCA	2	6	259732	259737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955967
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4626	NC_015214	TCA	2	6	259887	259892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955967
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4734	NC_015214	CCAT	2	8	265894	265901	25 %	25 %	0 %	50 %	325955973
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4987	NC_015214	TGCT	2	8	277750	277757	0 %	50 %	25 %	25 %	325955983
4988	NC_015214	GGTAAG	2	12	277764	277775	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325955983
4989	NC_015214	TACG	2	8	277821	277828	25 %	25 %	25 %	25 %	325955983
4990	NC_015214	CTT	2	6	277886	277891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955983
4991	NC_015214	TTGAT	2	10	278041	278050	20 %	60 %	20 %	0 %	325955983
4992	NC_015214	ACT	2	6	278113	278118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955983
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5000	NC_015214	TGC	2	6	278423	278428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955983

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