MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 26497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014724	ACG	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037231
2	NC_014724	TAC	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037231
3	NC_014724	AAC	2	6	370	375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037231
4	NC_014724	TGC	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037231
5	NC_014724	AGT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037231
6	NC_014724	TTA	2	6	634	639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037231
7	NC_014724	TTA	2	6	696	701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037231
8	NC_014724	AAG	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037231
9	NC_014724	TTC	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037231
10	NC_014724	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037231
11	NC_014724	CTC	2	6	889	894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315037231
12	NC_014724	GAA	2	6	925	930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037231
13	NC_014724	TGA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037231
14	NC_014724	CTA	2	6	1045	1050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037231
15	NC_014724	TCA	2	6	1652	1657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037232
16	NC_014724	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037232
17	NC_014724	AGA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037232
18	NC_014724	AGT	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037232
19	NC_014724	AAT	2	6	1937	1942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037232
20	NC_014724	CAT	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037232
21	NC_014724	ATT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037232
22	NC_014724	ATT	2	6	2216	2221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037232
23	NC_014724	CAA	2	6	2434	2439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037232
24	NC_014724	AGA	3	9	2515	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037232
25	NC_014724	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037232
26	NC_014724	TCA	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037232
27	NC_014724	AGA	2	6	2671	2676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037232
28	NC_014724	TTA	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037232
29	NC_014724	TAT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037233
30	NC_014724	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315037233
31	NC_014724	AGC	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037233
32	NC_014724	AAT	2	6	3337	3342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037234
33	NC_014724	TTA	2	6	3382	3387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037234
34	NC_014724	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037234
35	NC_014724	AGA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037234
36	NC_014724	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037234
37	NC_014724	CGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315037234
38	NC_014724	ATC	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037234
39	NC_014724	ATA	2	6	3881	3886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037234
40	NC_014724	ACT	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037234
41	NC_014724	GAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037234
42	NC_014724	GCA	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037234
43	NC_014724	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037234
44	NC_014724	GTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037234
45	NC_014724	CTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037234
46	NC_014724	TTA	2	6	4199	4204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037234
47	NC_014724	AAG	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037234
48	NC_014724	GGT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037235
49	NC_014724	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037235
50	NC_014724	CCA	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037235
51	NC_014724	GAT	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037235
52	NC_014724	GTC	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037235
53	NC_014724	TTC	2	6	4640	4645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037235
54	NC_014724	CGG	2	6	4650	4655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037235
55	NC_014724	GGT	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037235
56	NC_014724	GTT	2	6	4714	4719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037235
57	NC_014724	AAG	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037235
58	NC_014724	GAC	2	6	4903	4908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037235
59	NC_014724	GGT	2	6	5020	5025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037235
60	NC_014724	AAG	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037235
61	NC_014724	TGA	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037235
62	NC_014724	AAC	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037235
63	NC_014724	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037235
64	NC_014724	CTG	2	6	5402	5407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037235
65	NC_014724	CTG	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037235
66	NC_014724	ACA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037235
67	NC_014724	TCG	2	6	5627	5632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037235
68	NC_014724	GGT	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037235
69	NC_014724	CTT	2	6	5884	5889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037235
70	NC_014724	GAA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037235
71	NC_014724	ACT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037235
72	NC_014724	AGT	2	6	6054	6059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037235
73	NC_014724	AAC	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037235
74	NC_014724	AAC	2	6	6108	6113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037235
75	NC_014724	AGG	2	6	6266	6271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315037235
76	NC_014724	ATG	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
77	NC_014724	CTT	2	6	6346	6351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037236
78	NC_014724	CGT	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037236
79	NC_014724	AAG	2	6	6476	6481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037236
80	NC_014724	TTG	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037236
81	NC_014724	TCA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
82	NC_014724	TGA	2	6	6628	6633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
83	NC_014724	GAT	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
84	NC_014724	AGT	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
85	NC_014724	TTA	2	6	6855	6860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037236
86	NC_014724	TGA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
87	NC_014724	CTA	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
88	NC_014724	TGA	2	6	6909	6914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
89	NC_014724	GTT	2	6	7007	7012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037236
90	NC_014724	ATC	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
91	NC_014724	TGA	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
92	NC_014724	GTT	2	6	7226	7231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037236
93	NC_014724	AAC	2	6	7235	7240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037236
94	NC_014724	TTG	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037236
95	NC_014724	CAC	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037236
96	NC_014724	TAC	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
97	NC_014724	AAG	2	6	7356	7361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037236
98	NC_014724	TGT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037236
99	NC_014724	ACA	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037236
100	NC_014724	CAT	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
101	NC_014724	TGA	2	6	7531	7536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
102	NC_014724	GTT	2	6	7757	7762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037236
103	NC_014724	GTG	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037236
104	NC_014724	AAG	2	6	7988	7993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037236
105	NC_014724	AGT	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
106	NC_014724	GAT	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037236
107	NC_014724	ACT	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
108	NC_014724	GTG	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037236
109	NC_014724	CAT	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
110	NC_014724	TAC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037236
111	NC_014724	CAT	2	6	8991	8996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037237
112	NC_014724	ACA	2	6	9017	9022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037237
113	NC_014724	GGT	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037237
114	NC_014724	CGT	2	6	9103	9108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037237
115	NC_014724	CTG	2	6	9164	9169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037237
116	NC_014724	TTG	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037238
117	NC_014724	TAC	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037238
118	NC_014724	CAG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037238
119	NC_014724	ATA	2	6	9551	9556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
120	NC_014724	GTT	3	9	9586	9594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037238
121	NC_014724	TGG	2	6	9648	9653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037238
122	NC_014724	AAT	2	6	9664	9669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
123	NC_014724	ATA	2	6	9674	9679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
124	NC_014724	AAT	2	6	9706	9711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
125	NC_014724	AAT	2	6	9727	9732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
126	NC_014724	AAT	2	6	9739	9744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
127	NC_014724	AAT	2	6	9754	9759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037238
128	NC_014724	TGA	3	9	9804	9812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037238
129	NC_014724	CAA	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037239
130	NC_014724	AGA	2	6	9866	9871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037239
131	NC_014724	CGT	4	12	9878	9889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037239
132	NC_014724	CGT	2	6	9989	9994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037239
133	NC_014724	TTA	2	6	10296	10301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037240
134	NC_014724	AAG	2	6	10515	10520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037240
135	NC_014724	GCT	2	6	10663	10668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037240
136	NC_014724	TCG	2	6	10707	10712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037240
137	NC_014724	TGG	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037240
138	NC_014724	AAG	2	6	10937	10942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037240
139	NC_014724	TGA	2	6	10966	10971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037240
140	NC_014724	GTT	2	6	11186	11191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037240
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143	NC_014724	GTA	2	6	11375	11380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037240
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150	NC_014724	AGA	2	6	11911	11916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037240
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152	NC_014724	ATT	2	6	12008	12013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037240
153	NC_014724	ATC	2	6	12020	12025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037240
154	NC_014724	ATT	2	6	12149	12154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037240
155	NC_014724	CGG	2	6	12166	12171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037240
156	NC_014724	TGG	2	6	12172	12177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037240
157	NC_014724	TGA	2	6	12253	12258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037240
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159	NC_014724	CTA	2	6	12410	12415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037241
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162	NC_014724	ATT	2	6	12750	12755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037241
163	NC_014724	ATA	2	6	12783	12788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037242
164	NC_014724	CAA	2	6	12797	12802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037242
165	NC_014724	ATT	2	6	12923	12928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037242
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167	NC_014724	AGA	2	6	13121	13126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037242
168	NC_014724	ATT	2	6	13148	13153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037242
169	NC_014724	TGA	2	6	13195	13200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037242
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173	NC_014724	ATA	3	9	13311	13319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037242
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235	NC_014724	AAT	2	6	17555	17560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037246
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237	NC_014724	GAT	2	6	17673	17678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037246
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240	NC_014724	GGT	2	6	17835	17840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037247
241	NC_014724	TTG	2	6	17875	17880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037247
242	NC_014724	TAG	2	6	17977	17982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037247
243	NC_014724	TTC	2	6	18000	18005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037247
244	NC_014724	ATC	2	6	18094	18099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037248
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247	NC_014724	GGC	2	6	18397	18402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037249
248	NC_014724	GAT	2	6	18418	18423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037249
249	NC_014724	AAC	2	6	18456	18461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037249
250	NC_014724	ATT	2	6	18814	18819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037250
251	NC_014724	GTA	2	6	18829	18834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037250
252	NC_014724	TTC	2	6	18908	18913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037250
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