MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 36973

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014724	TCTT	2	8	171564	171571	0 %	75 %	0 %	25 %	315037398
3002	NC_014724	AAT	2	6	171631	171636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037398
3003	NC_014724	AGTC	2	8	171757	171764	25 %	25 %	25 %	25 %	315037398
3004	NC_014724	TA	3	6	171791	171796	50 %	50 %	0 %	0 %	315037398
3005	NC_014724	TAG	2	6	171802	171807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037398
3006	NC_014724	TCT	2	6	171858	171863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3007	NC_014724	CAT	2	6	171883	171888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037398
3008	NC_014724	CTT	2	6	171934	171939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3009	NC_014724	TCT	2	6	171988	171993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3010	NC_014724	T	6	6	172017	172022	0 %	100 %	0 %	0 %	315037398
3011	NC_014724	CTT	2	6	172078	172083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3012	NC_014724	CTT	3	9	172129	172137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3013	NC_014724	ACT	2	6	172152	172157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037398
3014	NC_014724	TTC	2	6	172172	172177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3015	NC_014724	TCT	2	6	172317	172322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3016	NC_014724	AAT	2	6	172323	172328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037398
3017	NC_014724	AAGTA	2	10	172330	172339	60 %	20 %	20 %	0 %	315037398
3018	NC_014724	ATT	2	6	172388	172393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037398
3019	NC_014724	ATC	2	6	172431	172436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037398
3020	NC_014724	TCT	2	6	172449	172454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037398
3021	NC_014724	TAT	2	6	172933	172938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037399
3022	NC_014724	GCA	2	6	172943	172948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037399
3023	NC_014724	TAT	2	6	172951	172956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037399
3024	NC_014724	CTA	2	6	172980	172985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037399
3025	NC_014724	GATAG	2	10	173237	173246	40 %	20 %	40 %	0 %	315037400
3026	NC_014724	CTA	2	6	173303	173308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037400
3027	NC_014724	CAAC	2	8	173421	173428	50 %	0 %	0 %	50 %	315037400
3028	NC_014724	CAG	2	6	173451	173456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037400
3029	NC_014724	ACT	2	6	173471	173476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037400
3030	NC_014724	AC	3	6	173491	173496	50 %	0 %	0 %	50 %	315037400
3031	NC_014724	ACA	2	6	173504	173509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037400
3032	NC_014724	CAA	2	6	173790	173795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037401
3033	NC_014724	ATT	2	6	173833	173838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037401
3034	NC_014724	GAT	2	6	173873	173878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037401
3035	NC_014724	ATT	2	6	173888	173893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037401
3036	NC_014724	TGA	3	9	173917	173925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037401
3037	NC_014724	TGAA	2	8	173970	173977	50 %	25 %	25 %	0 %	315037401
3038	NC_014724	ACG	2	6	174024	174029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037401
3039	NC_014724	ATG	2	6	174191	174196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037401
3040	NC_014724	CTG	2	6	174280	174285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037401
3041	NC_014724	CTA	2	6	174369	174374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037401
3042	NC_014724	GGT	2	6	174419	174424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037401
3043	NC_014724	AGG	2	6	174492	174497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315037401
3044	NC_014724	AATT	2	8	174504	174511	50 %	50 %	0 %	0 %	315037401
3045	NC_014724	AAGA	2	8	174554	174561	75 %	0 %	25 %	0 %	315037401
3046	NC_014724	ACG	2	6	174567	174572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037401
3047	NC_014724	CTT	2	6	174660	174665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037401
3048	NC_014724	ACT	2	6	174751	174756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037401
3049	NC_014724	AAG	2	6	174767	174772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037401
3050	NC_014724	AAG	2	6	174812	174817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037401
3051	NC_014724	GTT	2	6	174986	174991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037401
3052	NC_014724	AGA	2	6	175177	175182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037401
3053	NC_014724	TCT	2	6	175263	175268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037401
3054	NC_014724	ACA	2	6	175287	175292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037401
3055	NC_014724	AAG	2	6	175325	175330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037401
3056	NC_014724	ACCACT	2	12	175371	175382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315037401
3057	NC_014724	GACC	2	8	175414	175421	25 %	0 %	25 %	50 %	315037401
3058	NC_014724	TAC	2	6	175481	175486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037401
3059	NC_014724	GCT	2	6	175568	175573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037401
3060	NC_014724	GGT	2	6	175574	175579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037401
3061	NC_014724	ACT	2	6	175587	175592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037401
3062	NC_014724	CAG	2	6	175620	175625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037401
3063	NC_014724	GAA	2	6	175856	175861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037401
3064	NC_014724	GAA	2	6	175904	175909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037401
3065	NC_014724	AAAG	2	8	175937	175944	75 %	0 %	25 %	0 %	315037401
3066	NC_014724	AAG	2	6	175957	175962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037402
3067	NC_014724	TTG	2	6	176017	176022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315037402
3068	NC_014724	AAG	2	6	176058	176063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037402
3069	NC_014724	TGTT	2	8	176208	176215	0 %	75 %	25 %	0 %	315037402
3070	NC_014724	ATC	2	6	176295	176300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037402
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3073	NC_014724	AAAG	2	8	176534	176541	75 %	0 %	25 %	0 %	315037402
3074	NC_014724	CAAC	2	8	176570	176577	50 %	0 %	0 %	50 %	315037402
3075	NC_014724	AGAT	2	8	176640	176647	50 %	25 %	25 %	0 %	315037402
3076	NC_014724	ATG	2	6	176713	176718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037403
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3078	NC_014724	A	6	6	176726	176731	100 %	0 %	0 %	0 %	315037403
3079	NC_014724	AGTT	2	8	176735	176742	25 %	50 %	25 %	0 %	315037403
3080	NC_014724	AAG	2	6	177007	177012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037403
3081	NC_014724	TGA	2	6	177027	177032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037403
3082	NC_014724	AGA	2	6	177045	177050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037403
3083	NC_014724	GCTG	2	8	177108	177115	0 %	25 %	50 %	25 %	315037403
3084	NC_014724	TATG	2	8	177141	177148	25 %	50 %	25 %	0 %	315037403
3085	NC_014724	GTAG	2	8	177193	177200	25 %	25 %	50 %	0 %	315037403
3086	NC_014724	GAA	2	6	177268	177273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037403
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3089	NC_014724	GCT	2	6	177329	177334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037404
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3092	NC_014724	AGG	2	6	177394	177399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315037404
3093	NC_014724	GCA	2	6	177432	177437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037404
3094	NC_014724	TGA	2	6	177662	177667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037404
3095	NC_014724	CGAT	2	8	177709	177716	25 %	25 %	25 %	25 %	315037404
3096	NC_014724	AAAC	2	8	177828	177835	75 %	0 %	0 %	25 %	315037404
3097	NC_014724	GAT	2	6	177917	177922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037404
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3099	NC_014724	CAT	2	6	177938	177943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037404
3100	NC_014724	AAG	2	6	177997	178002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037404
3101	NC_014724	CCA	2	6	178032	178037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037404
3102	NC_014724	AAGG	2	8	178119	178126	50 %	0 %	50 %	0 %	315037404
3103	NC_014724	AAC	2	6	178141	178146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315037404
3104	NC_014724	TCG	2	6	178186	178191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037404
3105	NC_014724	CGG	3	9	178217	178225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037404
3106	NC_014724	TCT	2	6	178270	178275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037404
3107	NC_014724	CA	3	6	178281	178286	50 %	0 %	0 %	50 %	315037404
3108	NC_014724	ATC	2	6	178302	178307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037404
3109	NC_014724	AAG	2	6	178338	178343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037404
3110	NC_014724	AAGA	2	8	178370	178377	75 %	0 %	25 %	0 %	315037404
3111	NC_014724	TAC	2	6	178401	178406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037404
3112	NC_014724	ATG	2	6	178414	178419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037404
3113	NC_014724	TGA	2	6	178633	178638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037405
3114	NC_014724	AAAC	2	8	178723	178730	75 %	0 %	0 %	25 %	315037405
3115	NC_014724	ATT	2	6	178802	178807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037405
3116	NC_014724	TGGC	2	8	178903	178910	0 %	25 %	50 %	25 %	315037405
3117	NC_014724	CTT	2	6	178942	178947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037405
3118	NC_014724	GGAAC	2	10	178956	178965	40 %	0 %	40 %	20 %	315037405
3119	NC_014724	A	6	6	178994	178999	100 %	0 %	0 %	0 %	315037405
3120	NC_014724	ACT	2	6	179122	179127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037405
3121	NC_014724	TCA	2	6	179142	179147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037405
3122	NC_014724	AAG	2	6	179207	179212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037405
3123	NC_014724	TCT	2	6	179268	179273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037405
3124	NC_014724	CAC	2	6	179275	179280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037405
3125	NC_014724	ATTCC	2	10	179351	179360	20 %	40 %	0 %	40 %	315037405
3126	NC_014724	GCTT	2	8	179370	179377	0 %	50 %	25 %	25 %	315037405
3127	NC_014724	TCA	2	6	179403	179408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037405
3128	NC_014724	ATC	2	6	179462	179467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037405
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3131	NC_014724	GCGT	2	8	179668	179675	0 %	25 %	50 %	25 %	315037405
3132	NC_014724	TGG	2	6	179689	179694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315037405
3133	NC_014724	ATC	2	6	179699	179704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037405
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3137	NC_014724	TGAA	2	8	179903	179910	50 %	25 %	25 %	0 %	315037406
3138	NC_014724	TAA	2	6	179911	179916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037406
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3141	NC_014724	TGA	2	6	180090	180095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037406
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3143	NC_014724	GAA	2	6	180151	180156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037406
3144	NC_014724	CGT	2	6	180194	180199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037406
3145	NC_014724	CTTG	2	8	180238	180245	0 %	50 %	25 %	25 %	315037406
3146	NC_014724	GGC	2	6	180298	180303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315037406
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3152	NC_014724	CAAT	2	8	180455	180462	50 %	25 %	0 %	25 %	315037406
3153	NC_014724	CTT	2	6	180467	180472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037406
3154	NC_014724	GAA	2	6	180503	180508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037406
3155	NC_014724	GAA	2	6	180566	180571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037406
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3220	NC_014724	GTTA	2	8	184696	184703	25 %	50 %	25 %	0 %	315037408
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3231	NC_014724	GCT	2	6	185162	185167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037408
3232	NC_014724	ATTC	2	8	185281	185288	25 %	50 %	0 %	25 %	315037408
3233	NC_014724	ATG	2	6	185384	185389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037408
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3235	NC_014724	AGT	2	6	185496	185501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037408
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3237	NC_014724	TTC	2	6	185546	185551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037408
3238	NC_014724	AGT	2	6	185593	185598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037408
3239	NC_014724	GCCA	2	8	185704	185711	25 %	0 %	25 %	50 %	315037408
3240	NC_014724	ATA	2	6	185780	185785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037408
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3242	NC_014724	ACC	2	6	186031	186036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037408
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3244	NC_014724	ACC	2	6	186157	186162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315037408
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3348	NC_014724	TGA	2	6	192035	192040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037415
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3357	NC_014724	TGA	2	6	192374	192379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037416
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3359	NC_014724	TC	3	6	192584	192589	0 %	50 %	0 %	50 %	315037417
3360	NC_014724	ATT	2	6	192617	192622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037417
3361	NC_014724	GTA	2	6	192632	192637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037417
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3363	NC_014724	CAT	2	6	192859	192864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037417
3364	NC_014724	CGT	2	6	192904	192909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315037417
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3366	NC_014724	T	7	7	192949	192955	0 %	100 %	0 %	0 %	315037417
3367	NC_014724	CGA	2	6	193002	193007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315037417
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3475	NC_014724	ATCAT	2	10	197880	197889	40 %	40 %	0 %	20 %	315037422
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3479	NC_014724	GTA	2	6	198027	198032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037422
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3482	NC_014724	TAA	2	6	198128	198133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037422
3483	NC_014724	AG	3	6	198342	198347	50 %	0 %	50 %	0 %	315037423
3484	NC_014724	ATT	2	6	198376	198381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315037423
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3487	NC_014724	TTTC	2	8	198642	198649	0 %	75 %	0 %	25 %	315037423
3488	NC_014724	AGA	2	6	198677	198682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037423
3489	NC_014724	TGA	2	6	198713	198718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037423
3490	NC_014724	ATA	2	6	198847	198852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037423
3491	NC_014724	GAA	2	6	198945	198950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315037423
3492	NC_014724	CTT	2	6	198975	198980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037423
3493	NC_014724	AAGTA	2	10	199041	199050	60 %	20 %	20 %	0 %	315037423
3494	NC_014724	AG	3	6	199062	199067	50 %	0 %	50 %	0 %	315037423
3495	NC_014724	TCA	2	6	199162	199167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315037423
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3497	NC_014724	ATA	2	6	199276	199281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315037423
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3499	NC_014724	TCT	2	6	199350	199355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315037423
3500	NC_014724	TGA	2	6	199373	199378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315037423

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