MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014554	GAA	2	6	218892	218897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179388
3502	NC_014554	GGC	2	6	218941	218946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179388
3503	NC_014554	TCT	2	6	219026	219031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179388
3504	NC_014554	CAA	2	6	219049	219054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179388
3505	NC_014554	TGA	2	6	219090	219095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179388
3506	NC_014554	GCTGGT	2	12	219136	219147	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	308179388
3507	NC_014554	ACG	2	6	219508	219513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179389
3508	NC_014554	GAA	2	6	219643	219648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179389
3509	NC_014554	CG	3	6	219663	219668	0 %	0 %	50 %	50 %	308179389
3510	NC_014554	TTA	2	6	219669	219674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179389
3511	NC_014554	GACGCA	2	12	219697	219708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179389
3512	NC_014554	CGGT	2	8	219723	219730	0 %	25 %	50 %	25 %	308179389
3513	NC_014554	TTAT	2	8	219838	219845	25 %	75 %	0 %	0 %	308179389
3514	NC_014554	ATT	2	6	219876	219881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179389
3515	NC_014554	CTA	2	6	219900	219905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179389
3516	NC_014554	ATG	2	6	220071	220076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179389
3517	NC_014554	TGT	2	6	220123	220128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179389
3518	NC_014554	AAAT	2	8	220137	220144	75 %	25 %	0 %	0 %	308179389
3519	NC_014554	AAT	2	6	220881	220886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179390
3520	NC_014554	TCG	2	6	221157	221162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179390
3521	NC_014554	ATT	2	6	221175	221180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179390
3522	NC_014554	ATT	2	6	221186	221191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179390
3523	NC_014554	ACC	2	6	221255	221260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179390
3524	NC_014554	GTT	2	6	221312	221317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179390
3525	NC_014554	TTC	2	6	221351	221356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179390
3526	NC_014554	GTTT	2	8	221407	221414	0 %	75 %	25 %	0 %	308179390
3527	NC_014554	GGT	2	6	221415	221420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179390
3528	NC_014554	TGG	2	6	221612	221617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179390
3529	NC_014554	GTTG	2	8	221636	221643	0 %	50 %	50 %	0 %	308179390
3530	NC_014554	TGT	2	6	221644	221649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179390
3531	NC_014554	ATT	2	6	221730	221735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179390
3532	NC_014554	TGA	2	6	221752	221757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179390
3533	NC_014554	TAT	2	6	221780	221785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179390
3534	NC_014554	AGCTT	2	10	221805	221814	20 %	40 %	20 %	20 %	308179390
3535	NC_014554	CGT	2	6	221834	221839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179390
3536	NC_014554	GAT	3	9	221843	221851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179390
3537	NC_014554	TTA	2	6	221893	221898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179390
3538	NC_014554	CT	3	6	221928	221933	0 %	50 %	0 %	50 %	308179390
3539	NC_014554	TAT	2	6	221964	221969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179390
3540	NC_014554	AGC	2	6	222044	222049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179391
3541	NC_014554	G	6	6	222082	222087	0 %	0 %	100 %	0 %	308179391
3542	NC_014554	GGCT	2	8	222174	222181	0 %	25 %	50 %	25 %	308179391
3543	NC_014554	TAG	2	6	222205	222210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179391
3544	NC_014554	ATTT	2	8	222216	222223	25 %	75 %	0 %	0 %	308179391
3545	NC_014554	CAA	2	6	222226	222231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179391
3546	NC_014554	ATT	2	6	222452	222457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179392
3547	NC_014554	CAC	2	6	222481	222486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179392
3548	NC_014554	GT	3	6	222525	222530	0 %	50 %	50 %	0 %	308179392
3549	NC_014554	AAG	2	6	222606	222611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179392
3550	NC_014554	TGAAC	2	10	222646	222655	40 %	20 %	20 %	20 %	308179392
3551	NC_014554	ACG	2	6	222663	222668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179392
3552	NC_014554	T	6	6	222769	222774	0 %	100 %	0 %	0 %	308179392
3553	NC_014554	CAA	2	6	222843	222848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179392
3554	NC_014554	ATG	2	6	222867	222872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179392
3555	NC_014554	GTACAG	2	12	222914	222925	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308179392
3556	NC_014554	GC	3	6	223005	223010	0 %	0 %	50 %	50 %	308179392
3557	NC_014554	GCG	2	6	223099	223104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179392
3558	NC_014554	TGT	2	6	223207	223212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179392
3559	NC_014554	CA	4	8	223269	223276	50 %	0 %	0 %	50 %	308179392
3560	NC_014554	GAA	2	6	223285	223290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179392
3561	NC_014554	TGG	2	6	223293	223298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179392
3562	NC_014554	TAT	2	6	223323	223328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179392
3563	NC_014554	TA	3	6	223384	223389	50 %	50 %	0 %	0 %	308179393
3564	NC_014554	ACTGA	2	10	223464	223473	40 %	20 %	20 %	20 %	308179393
3565	NC_014554	GCTG	2	8	223524	223531	0 %	25 %	50 %	25 %	308179393
3566	NC_014554	TGA	2	6	223535	223540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179393
3567	NC_014554	TAT	2	6	223572	223577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179393
3568	NC_014554	GAC	2	6	223578	223583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179393
3569	NC_014554	ACC	2	6	223614	223619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179393
3570	NC_014554	CAG	2	6	223668	223673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179393
3571	NC_014554	CTA	2	6	223687	223692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179393
3572	NC_014554	AGT	2	6	223844	223849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179393
3573	NC_014554	GTA	2	6	223936	223941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179393
3574	NC_014554	GGC	2	6	223955	223960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179393
3575	NC_014554	TAT	2	6	223961	223966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179393
3576	NC_014554	AC	3	6	223995	224000	50 %	0 %	0 %	50 %	308179393
3577	NC_014554	CAG	2	6	224128	224133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179393
3578	NC_014554	TAT	2	6	224184	224189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179393
3579	NC_014554	TG	3	6	224229	224234	0 %	50 %	50 %	0 %	308179393
3580	NC_014554	CTA	2	6	224241	224246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179393
3581	NC_014554	ATT	2	6	224271	224276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179393
3582	NC_014554	ACC	2	6	224286	224291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179393
3583	NC_014554	GTT	2	6	224391	224396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179393
3584	NC_014554	CCCA	2	8	224424	224431	25 %	0 %	0 %	75 %	308179393
3585	NC_014554	GTG	2	6	224476	224481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179393
3586	NC_014554	TAAT	2	8	224596	224603	50 %	50 %	0 %	0 %	308179394
3587	NC_014554	GCC	2	6	224658	224663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179394
3588	NC_014554	T	6	6	224685	224690	0 %	100 %	0 %	0 %	308179394
3589	NC_014554	TAT	2	6	224804	224809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179394
3590	NC_014554	ATG	2	6	224890	224895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179394
3591	NC_014554	TGATG	2	10	224915	224924	20 %	40 %	40 %	0 %	308179394
3592	NC_014554	ATC	2	6	225097	225102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179394
3593	NC_014554	TCG	2	6	225143	225148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179394
3594	NC_014554	TGT	2	6	225170	225175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179394
3595	NC_014554	ACGT	2	8	225237	225244	25 %	25 %	25 %	25 %	308179394
3596	NC_014554	ACA	2	6	225257	225262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179394
3597	NC_014554	TTGGT	2	10	225310	225319	0 %	60 %	40 %	0 %	308179394
3598	NC_014554	AAC	2	6	225341	225346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179394
3599	NC_014554	TTG	2	6	225613	225618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179394
3600	NC_014554	ATT	2	6	225633	225638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179394
3601	NC_014554	GAG	2	6	225639	225644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179394
3602	NC_014554	ATT	2	6	225669	225674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179395
3603	NC_014554	TTTG	2	8	225687	225694	0 %	75 %	25 %	0 %	308179395
3604	NC_014554	GTG	2	6	225755	225760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179395
3605	NC_014554	TGA	2	6	225790	225795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179395
3606	NC_014554	GCG	2	6	225814	225819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179395
3607	NC_014554	GGTT	2	8	225850	225857	0 %	50 %	50 %	0 %	308179395
3608	NC_014554	CAA	2	6	225875	225880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179395
3609	NC_014554	TGG	2	6	225888	225893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179395
3610	NC_014554	GTG	2	6	226011	226016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179395
3611	NC_014554	GAA	2	6	226163	226168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179395
3612	NC_014554	GCG	2	6	226184	226189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179395
3613	NC_014554	AACC	2	8	226215	226222	50 %	0 %	0 %	50 %	308179395
3614	NC_014554	CGC	2	6	226270	226275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179395
3615	NC_014554	ATT	2	6	226289	226294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179395
3616	NC_014554	ACT	2	6	226325	226330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179395
3617	NC_014554	TGA	2	6	226472	226477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179396
3618	NC_014554	AGT	2	6	226518	226523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179396
3619	NC_014554	AC	3	6	226527	226532	50 %	0 %	0 %	50 %	308179396
3620	NC_014554	ACT	2	6	226550	226555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179396
3621	NC_014554	GTC	2	6	226558	226563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179396
3622	NC_014554	AGC	2	6	226589	226594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179396
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3655	NC_014554	AAT	2	6	228012	228017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179397
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3741	NC_014554	TAT	2	6	234239	234244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179405
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