MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_014554	TGG	2	6	2378797	2378802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181407
38002	NC_014554	GTC	2	6	2378810	2378815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181407
38003	NC_014554	CAATAA	2	12	2378872	2378883	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	308181407
38004	NC_014554	GGT	2	6	2378989	2378994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181407
38005	NC_014554	TGA	3	9	2379061	2379069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181407
38006	NC_014554	AAC	2	6	2379093	2379098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181407
38007	NC_014554	T	6	6	2379215	2379220	0 %	100 %	0 %	0 %	308181408
38008	NC_014554	CGT	2	6	2379234	2379239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181408
38009	NC_014554	T	7	7	2379252	2379258	0 %	100 %	0 %	0 %	308181408
38010	NC_014554	CTTT	2	8	2379266	2379273	0 %	75 %	0 %	25 %	308181408
38011	NC_014554	TGC	2	6	2379297	2379302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181408
38012	NC_014554	AT	3	6	2379540	2379545	50 %	50 %	0 %	0 %	308181409
38013	NC_014554	CCG	2	6	2379593	2379598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181409
38014	NC_014554	TTG	2	6	2379626	2379631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181409
38015	NC_014554	CTT	2	6	2379699	2379704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181409
38016	NC_014554	TTG	2	6	2379764	2379769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181409
38017	NC_014554	CTA	2	6	2379787	2379792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181409
38018	NC_014554	TTG	2	6	2379967	2379972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181409
38019	NC_014554	TCG	2	6	2379989	2379994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181409
38020	NC_014554	CAT	2	6	2379996	2380001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181409
38021	NC_014554	TGG	2	6	2380023	2380028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181409
38022	NC_014554	TCA	2	6	2380046	2380051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181409
38023	NC_014554	CCG	2	6	2380052	2380057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181409
38024	NC_014554	TAT	2	6	2380077	2380082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181409
38025	NC_014554	AC	3	6	2380147	2380152	50 %	0 %	0 %	50 %	308181409
38026	NC_014554	TTC	2	6	2380198	2380203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181409
38027	NC_014554	TTGG	2	8	2380234	2380241	0 %	50 %	50 %	0 %	308181409
38028	NC_014554	TGG	2	6	2380262	2380267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181409
38029	NC_014554	GTG	2	6	2380313	2380318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181409
38030	NC_014554	CGA	2	6	2380358	2380363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181409
38031	NC_014554	CGC	2	6	2380449	2380454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181409
38032	NC_014554	TC	3	6	2380460	2380465	0 %	50 %	0 %	50 %	308181409
38033	NC_014554	AT	3	6	2380545	2380550	50 %	50 %	0 %	0 %	308181409
38034	NC_014554	ATG	2	6	2380600	2380605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181409
38035	NC_014554	CTA	2	6	2380606	2380611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181409
38036	NC_014554	TCT	2	6	2380649	2380654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181409
38037	NC_014554	GAT	2	6	2380713	2380718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181409
38038	NC_014554	GTC	2	6	2380720	2380725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181409
38039	NC_014554	CTA	2	6	2380851	2380856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181410
38040	NC_014554	TTG	2	6	2380869	2380874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181410
38041	NC_014554	TCA	2	6	2381056	2381061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181410
38042	NC_014554	TCA	2	6	2381137	2381142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181410
38043	NC_014554	TCGGT	2	10	2381174	2381183	0 %	40 %	40 %	20 %	308181410
38044	NC_014554	GTT	2	6	2381359	2381364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181410
38045	NC_014554	ATA	2	6	2381377	2381382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181410
38046	NC_014554	CAC	2	6	2381442	2381447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181410
38047	NC_014554	CGG	2	6	2381474	2381479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181410
38048	NC_014554	ATC	2	6	2381517	2381522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181410
38049	NC_014554	CGC	2	6	2381526	2381531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181410
38050	NC_014554	TCA	2	6	2381596	2381601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181410
38051	NC_014554	ACT	2	6	2381643	2381648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181410
38052	NC_014554	TGA	2	6	2381659	2381664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181410
38053	NC_014554	TGA	2	6	2381666	2381671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181410
38054	NC_014554	TTA	2	6	2381780	2381785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181410
38055	NC_014554	TACT	2	8	2382144	2382151	25 %	50 %	0 %	25 %	308181411
38056	NC_014554	CAA	2	6	2382174	2382179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181411
38057	NC_014554	ATG	2	6	2382191	2382196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181411
38058	NC_014554	CAA	2	6	2382274	2382279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181411
38059	NC_014554	ACC	2	6	2382303	2382308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181411
38060	NC_014554	CACTTC	2	12	2382320	2382331	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	308181411
38061	NC_014554	TGA	2	6	2382375	2382380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181411
38062	NC_014554	ATCA	2	8	2382393	2382400	50 %	25 %	0 %	25 %	308181411
38063	NC_014554	ATC	2	6	2382418	2382423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181411
38064	NC_014554	AC	3	6	2382494	2382499	50 %	0 %	0 %	50 %	308181411
38065	NC_014554	ACCA	2	8	2382506	2382513	50 %	0 %	0 %	50 %	308181411
38066	NC_014554	CGT	2	6	2382514	2382519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181411
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38068	NC_014554	CTGG	2	8	2382696	2382703	0 %	25 %	50 %	25 %	308181411
38069	NC_014554	CT	3	6	2382730	2382735	0 %	50 %	0 %	50 %	308181411
38070	NC_014554	TCTAAT	2	12	2382753	2382764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	308181411
38071	NC_014554	CAAT	2	8	2382845	2382852	50 %	25 %	0 %	25 %	308181411
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38074	NC_014554	GC	3	6	2383533	2383538	0 %	0 %	50 %	50 %	308181412
38075	NC_014554	TGA	3	9	2383570	2383578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181412
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38082	NC_014554	ACG	2	6	2383872	2383877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181412
38083	NC_014554	TGA	2	6	2383905	2383910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181412
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38088	NC_014554	CG	3	6	2384150	2384155	0 %	0 %	50 %	50 %	308181412
38089	NC_014554	TGG	2	6	2384190	2384195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181412
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38099	NC_014554	CGT	2	6	2384644	2384649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181412
38100	NC_014554	TG	3	6	2385007	2385012	0 %	50 %	50 %	0 %	308181413
38101	NC_014554	TGG	2	6	2385109	2385114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181413
38102	NC_014554	TGAT	2	8	2385150	2385157	25 %	50 %	25 %	0 %	308181413
38103	NC_014554	GC	4	8	2385172	2385179	0 %	0 %	50 %	50 %	308181413
38104	NC_014554	CCA	2	6	2385247	2385252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181413
38105	NC_014554	TGATT	2	10	2385254	2385263	20 %	60 %	20 %	0 %	308181413
38106	NC_014554	CCA	2	6	2385393	2385398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181413
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38108	NC_014554	AGC	2	6	2385447	2385452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181413
38109	NC_014554	TCC	2	6	2385454	2385459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181413
38110	NC_014554	CGC	2	6	2385474	2385479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181413
38111	NC_014554	GTT	2	6	2385493	2385498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181413
38112	NC_014554	CAT	3	9	2385564	2385572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181413
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38114	NC_014554	TGC	2	6	2385868	2385873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38115	NC_014554	CAT	2	6	2385901	2385906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181414
38116	NC_014554	AGC	2	6	2386021	2386026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38117	NC_014554	ACG	2	6	2386031	2386036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38118	NC_014554	CGT	2	6	2386051	2386056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38119	NC_014554	CGA	2	6	2386095	2386100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38120	NC_014554	TAA	2	6	2386132	2386137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181414
38121	NC_014554	TCG	2	6	2386263	2386268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38122	NC_014554	AAT	2	6	2386273	2386278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181414
38123	NC_014554	CGGT	2	8	2386395	2386402	0 %	25 %	50 %	25 %	308181414
38124	NC_014554	CAC	2	6	2386419	2386424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181414
38125	NC_014554	TCG	2	6	2386533	2386538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38126	NC_014554	TTGG	2	8	2386723	2386730	0 %	50 %	50 %	0 %	308181414
38127	NC_014554	GCCAG	2	10	2386742	2386751	20 %	0 %	40 %	40 %	308181414
38128	NC_014554	CAA	2	6	2386767	2386772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181414
38129	NC_014554	CGA	2	6	2386800	2386805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181414
38130	NC_014554	CAT	2	6	2386948	2386953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181414
38131	NC_014554	ACC	4	12	2386978	2386989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181414
38132	NC_014554	ACT	2	6	2386991	2386996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181414
38133	NC_014554	GTG	2	6	2387055	2387060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181415
38134	NC_014554	TAC	2	6	2387113	2387118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181415
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38136	NC_014554	GCA	2	6	2387154	2387159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181415
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38141	NC_014554	CCT	2	6	2387446	2387451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181415
38142	NC_014554	GTA	2	6	2387455	2387460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181415
38143	NC_014554	TCA	2	6	2387524	2387529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181415
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38145	NC_014554	TCA	2	6	2387571	2387576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181415
38146	NC_014554	AAT	3	9	2387588	2387596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181415
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38149	NC_014554	TCT	2	6	2387617	2387622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181415
38150	NC_014554	AATCG	2	10	2387678	2387687	40 %	20 %	20 %	20 %	308181415
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38154	NC_014554	GGC	2	6	2387804	2387809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181415
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38193	NC_014554	CATA	2	8	2389740	2389747	50 %	25 %	0 %	25 %	308181417
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38215	NC_014554	AGGC	2	8	2390682	2390689	25 %	0 %	50 %	25 %	308181418
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38219	NC_014554	GC	3	6	2390984	2390989	0 %	0 %	50 %	50 %	308181418
38220	NC_014554	ACG	2	6	2391004	2391009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181418
38221	NC_014554	CCCG	2	8	2391012	2391019	0 %	0 %	25 %	75 %	308181418
38222	NC_014554	CGA	2	6	2391032	2391037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181418
38223	NC_014554	TAG	2	6	2391090	2391095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181418
38224	NC_014554	TAAG	2	8	2391096	2391103	50 %	25 %	25 %	0 %	308181418
38225	NC_014554	TGC	2	6	2391156	2391161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181418
38226	NC_014554	CGC	2	6	2391241	2391246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181418
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38228	NC_014554	CAA	2	6	2391429	2391434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181418
38229	NC_014554	CTT	2	6	2391491	2391496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181418
38230	NC_014554	GCG	2	6	2391541	2391546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181418
38231	NC_014554	TTC	2	6	2391579	2391584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181418
38232	NC_014554	CTT	2	6	2391592	2391597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181418
38233	NC_014554	CCT	2	6	2393821	2393826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181419
38234	NC_014554	CCGT	2	8	2393862	2393869	0 %	25 %	25 %	50 %	308181419
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38238	NC_014554	GAT	2	6	2393993	2393998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181419
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38259	NC_014554	GGT	2	6	2394908	2394913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181421
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38328	NC_014554	AT	3	6	2399492	2399497	50 %	50 %	0 %	0 %	308181424
38329	NC_014554	CAA	2	6	2399500	2399505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181424
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38331	NC_014554	ATCAA	2	10	2399806	2399815	60 %	20 %	0 %	20 %	308181425
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38333	NC_014554	ACG	2	6	2399920	2399925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181425
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38338	NC_014554	AATCC	2	10	2400069	2400078	40 %	20 %	0 %	40 %	308181425
38339	NC_014554	TTG	2	6	2400093	2400098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181425
38340	NC_014554	TGC	2	6	2400105	2400110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
38341	NC_014554	TCGG	2	8	2400301	2400308	0 %	25 %	50 %	25 %	308181425
38342	NC_014554	CAT	2	6	2400344	2400349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181425
38343	NC_014554	CTT	2	6	2400411	2400416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181425
38344	NC_014554	ATCA	2	8	2400420	2400427	50 %	25 %	0 %	25 %	308181425
38345	NC_014554	TCG	2	6	2400449	2400454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
38346	NC_014554	CGT	2	6	2400530	2400535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
38347	NC_014554	TAA	2	6	2400542	2400547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181425
38348	NC_014554	TCA	2	6	2400571	2400576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181425
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38438	NC_014554	GAATTG	2	12	2406496	2406507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181431
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38447	NC_014554	GCTA	2	8	2407283	2407290	25 %	25 %	25 %	25 %	308181431
38448	NC_014554	TCTG	2	8	2407310	2407317	0 %	50 %	25 %	25 %	308181431
38449	NC_014554	TTC	2	6	2407420	2407425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181431
38450	NC_014554	CTAC	2	8	2407538	2407545	25 %	25 %	0 %	50 %	308181431
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38452	NC_014554	TTA	2	6	2407652	2407657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181432
38453	NC_014554	GTC	3	9	2407685	2407693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181432
38454	NC_014554	CTC	2	6	2407804	2407809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181432
38455	NC_014554	CT	3	6	2407813	2407818	0 %	50 %	0 %	50 %	308181432
38456	NC_014554	TGC	2	6	2407827	2407832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181432
38457	NC_014554	GATC	2	8	2407836	2407843	25 %	25 %	25 %	25 %	308181432
38458	NC_014554	CAA	2	6	2407870	2407875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181432
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38460	NC_014554	CAA	2	6	2408155	2408160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181433
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38464	NC_014554	CAAAC	2	10	2408363	2408372	60 %	0 %	0 %	40 %	308181434
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38484	NC_014554	TTAT	2	8	2409186	2409193	25 %	75 %	0 %	0 %	308181435
38485	NC_014554	GGT	2	6	2409218	2409223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181435
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38490	NC_014554	CTT	2	6	2409342	2409347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181435
38491	NC_014554	TCAC	2	8	2409370	2409377	25 %	25 %	0 %	50 %	308181435
38492	NC_014554	TCA	3	9	2409476	2409484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181435
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38494	NC_014554	TGA	2	6	2409545	2409550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181435
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