MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014554	TTGA	2	8	185894	185901	25 %	50 %	25 %	0 %	308179353
3002	NC_014554	TTA	2	6	185946	185951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179353
3003	NC_014554	TTG	2	6	185969	185974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179353
3004	NC_014554	TTA	2	6	186000	186005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179353
3005	NC_014554	GTC	3	9	186027	186035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179353
3006	NC_014554	T	6	6	186077	186082	0 %	100 %	0 %	0 %	308179353
3007	NC_014554	GAA	2	6	186230	186235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179353
3008	NC_014554	AAT	2	6	186252	186257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179353
3009	NC_014554	ACG	2	6	186422	186427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179353
3010	NC_014554	CTT	2	6	186586	186591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179353
3011	NC_014554	ATC	2	6	186603	186608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179353
3012	NC_014554	GGT	2	6	186647	186652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179353
3013	NC_014554	CGA	2	6	186754	186759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179353
3014	NC_014554	AAT	2	6	186801	186806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179353
3015	NC_014554	AT	3	6	186816	186821	50 %	50 %	0 %	0 %	308179353
3016	NC_014554	GTGATA	2	12	187045	187056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179354
3017	NC_014554	TAATTG	2	12	187093	187104	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	308179354
3018	NC_014554	ATG	2	6	187105	187110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179354
3019	NC_014554	CAT	2	6	187161	187166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179354
3020	NC_014554	TTG	2	6	187294	187299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179354
3021	NC_014554	AGT	2	6	187305	187310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179354
3022	NC_014554	TTG	2	6	187488	187493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179355
3023	NC_014554	GCT	2	6	187496	187501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3024	NC_014554	GTC	2	6	187506	187511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3025	NC_014554	ATG	2	6	187519	187524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179355
3026	NC_014554	GCG	2	6	187546	187551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179355
3027	NC_014554	GCT	2	6	187582	187587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3028	NC_014554	GC	3	6	187731	187736	0 %	0 %	50 %	50 %	308179355
3029	NC_014554	TG	3	6	187741	187746	0 %	50 %	50 %	0 %	308179355
3030	NC_014554	CCA	2	6	187777	187782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179355
3031	NC_014554	TTGG	2	8	187809	187816	0 %	50 %	50 %	0 %	308179355
3032	NC_014554	GTA	2	6	187842	187847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179355
3033	NC_014554	TCA	2	6	187877	187882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179355
3034	NC_014554	CGA	2	6	187895	187900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3035	NC_014554	AAT	2	6	187913	187918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179355
3036	NC_014554	AAT	2	6	187921	187926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179355
3037	NC_014554	GGC	2	6	187944	187949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179355
3038	NC_014554	TTA	2	6	187960	187965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179355
3039	NC_014554	GT	3	6	187976	187981	0 %	50 %	50 %	0 %	308179355
3040	NC_014554	CGCT	2	8	188046	188053	0 %	25 %	25 %	50 %	308179355
3041	NC_014554	GATA	2	8	188089	188096	50 %	25 %	25 %	0 %	308179355
3042	NC_014554	TGC	2	6	188133	188138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3043	NC_014554	GAT	2	6	188319	188324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179355
3044	NC_014554	TGT	2	6	188405	188410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179355
3045	NC_014554	GC	3	6	188425	188430	0 %	0 %	50 %	50 %	308179355
3046	NC_014554	TAAG	2	8	188487	188494	50 %	25 %	25 %	0 %	308179355
3047	NC_014554	GATT	2	8	188509	188516	25 %	50 %	25 %	0 %	308179355
3048	NC_014554	CAG	2	6	188528	188533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179355
3049	NC_014554	AGC	2	6	188625	188630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179356
3050	NC_014554	TAA	2	6	188724	188729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179356
3051	NC_014554	AAT	2	6	188836	188841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179356
3052	NC_014554	GGC	2	6	188871	188876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179356
3053	NC_014554	GGC	2	6	188968	188973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179356
3054	NC_014554	ATC	2	6	189051	189056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179356
3055	NC_014554	TTC	2	6	189094	189099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179356
3056	NC_014554	TGA	2	6	189159	189164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179356
3057	NC_014554	TCA	2	6	189209	189214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179356
3058	NC_014554	TAT	2	6	189230	189235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179356
3059	NC_014554	GAC	2	6	189279	189284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179356
3060	NC_014554	CGG	2	6	189362	189367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179356
3061	NC_014554	GAT	2	6	189407	189412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179356
3062	NC_014554	AGA	2	6	189467	189472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179356
3063	NC_014554	AAAT	2	8	189543	189550	75 %	25 %	0 %	0 %	308179356
3064	NC_014554	ATG	2	6	189596	189601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179356
3065	NC_014554	TGA	2	6	189623	189628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179356
3066	NC_014554	CAG	2	6	189653	189658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179356
3067	NC_014554	AGC	2	6	190167	190172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179357
3068	NC_014554	CGG	2	6	190254	190259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179357
3069	NC_014554	CAA	2	6	190454	190459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179357
3070	NC_014554	ACA	2	6	190481	190486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179357
3071	NC_014554	CCGA	2	8	190568	190575	25 %	0 %	25 %	50 %	308179357
3072	NC_014554	TGG	2	6	190623	190628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179357
3073	NC_014554	ATG	2	6	190942	190947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179358
3074	NC_014554	CAG	2	6	190955	190960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179358
3075	NC_014554	AAT	2	6	191134	191139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179358
3076	NC_014554	TGA	2	6	191211	191216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179358
3077	NC_014554	TCA	2	6	191222	191227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179358
3078	NC_014554	GAT	2	6	191475	191480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179358
3079	NC_014554	TGG	2	6	191600	191605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179358
3080	NC_014554	ATT	2	6	191628	191633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179358
3081	NC_014554	CGAA	2	8	191680	191687	50 %	0 %	25 %	25 %	308179358
3082	NC_014554	ATTT	2	8	191693	191700	25 %	75 %	0 %	0 %	308179358
3083	NC_014554	TGGCTT	2	12	191783	191794	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	308179358
3084	NC_014554	CTA	2	6	191797	191802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179358
3085	NC_014554	GTC	2	6	191812	191817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179358
3086	NC_014554	TCA	2	6	191825	191830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179358
3087	NC_014554	TGA	3	9	191895	191903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179358
3088	NC_014554	CGT	2	6	192461	192466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179359
3089	NC_014554	TCA	2	6	192519	192524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179359
3090	NC_014554	GAC	2	6	192550	192555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179359
3091	NC_014554	CAG	2	6	192556	192561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179359
3092	NC_014554	T	7	7	192563	192569	0 %	100 %	0 %	0 %	308179359
3093	NC_014554	TGG	2	6	192643	192648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179359
3094	NC_014554	GAC	2	6	192689	192694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179360
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3096	NC_014554	CGTG	2	8	193072	193079	0 %	25 %	50 %	25 %	308179361
3097	NC_014554	GAC	2	6	193173	193178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179361
3098	NC_014554	GAT	2	6	193233	193238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179361
3099	NC_014554	CAC	2	6	193272	193277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179361
3100	NC_014554	AGT	2	6	193290	193295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179361
3101	NC_014554	GGT	2	6	193320	193325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179361
3102	NC_014554	GAC	2	6	193332	193337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179361
3103	NC_014554	CGTG	2	8	193368	193375	0 %	25 %	50 %	25 %	308179361
3104	NC_014554	GCG	2	6	193381	193386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179361
3105	NC_014554	GCA	2	6	193445	193450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179361
3106	NC_014554	GCG	2	6	193469	193474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179361
3107	NC_014554	GCT	2	6	193502	193507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179361
3108	NC_014554	TTG	2	6	193555	193560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179361
3109	NC_014554	AAT	2	6	193602	193607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179361
3110	NC_014554	AAT	2	6	193621	193626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179361
3111	NC_014554	T	6	6	193630	193635	0 %	100 %	0 %	0 %	308179361
3112	NC_014554	TGG	2	6	193658	193663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179361
3113	NC_014554	CGA	2	6	193683	193688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179361
3114	NC_014554	ATG	2	6	193690	193695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179361
3115	NC_014554	CAGG	2	8	193761	193768	25 %	0 %	50 %	25 %	308179361
3116	NC_014554	GTG	2	6	193810	193815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179361
3117	NC_014554	GTC	2	6	193862	193867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179361
3118	NC_014554	A	6	6	194050	194055	100 %	0 %	0 %	0 %	308179362
3119	NC_014554	ATTA	2	8	194057	194064	50 %	50 %	0 %	0 %	308179362
3120	NC_014554	TCA	2	6	194079	194084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179362
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3223	NC_014554	AGT	2	6	200623	200628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179369
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3230	NC_014554	ACTTG	2	10	201409	201418	20 %	40 %	20 %	20 %	308179370
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3233	NC_014554	CAAT	2	8	201553	201560	50 %	25 %	0 %	25 %	308179370
3234	NC_014554	TCA	2	6	201562	201567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179370
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3236	NC_014554	TTAC	2	8	201678	201685	25 %	50 %	0 %	25 %	308179370
3237	NC_014554	GGC	2	6	201694	201699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179370
3238	NC_014554	CGGC	2	8	201785	201792	0 %	0 %	50 %	50 %	308179370
3239	NC_014554	AGC	2	6	201802	201807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179370
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3241	NC_014554	TACGT	2	10	201906	201915	20 %	40 %	20 %	20 %	308179371
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3483	NC_014554	GCT	2	6	217426	217431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179387
3484	NC_014554	A	6	6	217452	217457	100 %	0 %	0 %	0 %	308179387
3485	NC_014554	GGC	2	6	217476	217481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179387
3486	NC_014554	GAC	2	6	217524	217529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179387
3487	NC_014554	GGT	2	6	217579	217584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179387
3488	NC_014554	TATT	2	8	217774	217781	25 %	75 %	0 %	0 %	308179387
3489	NC_014554	TGT	2	6	217808	217813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179387
3490	NC_014554	ATT	2	6	217834	217839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179387
3491	NC_014554	TTC	2	6	217886	217891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179387
3492	NC_014554	GCC	2	6	217984	217989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179387
3493	NC_014554	CGG	2	6	218216	218221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179387
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3496	NC_014554	TACT	2	8	218584	218591	25 %	50 %	0 %	25 %	308179388
3497	NC_014554	GAA	2	6	218607	218612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179388
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3500	NC_014554	CAG	2	6	218882	218887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179388

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