MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014554	AATT	2	8	123995	124002	50 %	50 %	0 %	0 %	308179305
2002	NC_014554	AAGGAA	2	12	124048	124059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179305
2003	NC_014554	TAA	2	6	124119	124124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179305
2004	NC_014554	AAC	2	6	124199	124204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179305
2005	NC_014554	GAT	2	6	124212	124217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179305
2006	NC_014554	AAG	2	6	124345	124350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179305
2007	NC_014554	ATTA	2	8	124358	124365	50 %	50 %	0 %	0 %	308179305
2008	NC_014554	AGC	2	6	124543	124548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179306
2009	NC_014554	GT	4	8	124572	124579	0 %	50 %	50 %	0 %	308179306
2010	NC_014554	TAG	2	6	124581	124586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179306
2011	NC_014554	TCT	2	6	124677	124682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179306
2012	NC_014554	GTTG	2	8	124691	124698	0 %	50 %	50 %	0 %	308179306
2013	NC_014554	T	7	7	124707	124713	0 %	100 %	0 %	0 %	308179306
2014	NC_014554	TGG	2	6	124794	124799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179306
2015	NC_014554	TGG	2	6	124866	124871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179306
2016	NC_014554	TGG	2	6	124890	124895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179306
2017	NC_014554	TCT	2	6	124896	124901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179306
2018	NC_014554	ATC	2	6	124973	124978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179306
2019	NC_014554	GTG	2	6	124979	124984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179306
2020	NC_014554	CGG	2	6	125142	125147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179306
2021	NC_014554	GGC	2	6	125173	125178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179306
2022	NC_014554	AGTG	2	8	125218	125225	25 %	25 %	50 %	0 %	308179306
2023	NC_014554	GGC	2	6	125254	125259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179306
2024	NC_014554	GTG	2	6	125267	125272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179306
2025	NC_014554	T	6	6	125338	125343	0 %	100 %	0 %	0 %	308179306
2026	NC_014554	GTT	2	6	125849	125854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179307
2027	NC_014554	CAT	2	6	125882	125887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179307
2028	NC_014554	ATC	2	6	125943	125948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179307
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2030	NC_014554	GC	3	6	126146	126151	0 %	0 %	50 %	50 %	308179307
2031	NC_014554	ACAA	2	8	126160	126167	75 %	0 %	0 %	25 %	308179307
2032	NC_014554	ACG	2	6	126182	126187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179307
2033	NC_014554	CGT	2	6	126197	126202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179307
2034	NC_014554	AGC	2	6	126207	126212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179307
2035	NC_014554	ATG	2	6	126264	126269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179307
2036	NC_014554	GCGG	2	8	126295	126302	0 %	0 %	75 %	25 %	308179307
2037	NC_014554	CAA	3	9	126326	126334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179307
2038	NC_014554	GCA	2	6	126349	126354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179307
2039	NC_014554	CAG	2	6	126413	126418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179307
2040	NC_014554	GGC	2	6	126421	126426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179307
2041	NC_014554	ATT	2	6	126428	126433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179307
2042	NC_014554	A	6	6	126474	126479	100 %	0 %	0 %	0 %	308179307
2043	NC_014554	CCA	2	6	126485	126490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179307
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2046	NC_014554	ACG	2	6	126647	126652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179307
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2048	NC_014554	ATC	2	6	126696	126701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179307
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2052	NC_014554	CAGC	2	8	126953	126960	25 %	0 %	25 %	50 %	308179307
2053	NC_014554	GCAA	2	8	127024	127031	50 %	0 %	25 %	25 %	308179307
2054	NC_014554	GCGT	2	8	127090	127097	0 %	25 %	50 %	25 %	308179307
2055	NC_014554	ACA	2	6	127099	127104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179307
2056	NC_014554	CGGC	2	8	127246	127253	0 %	0 %	50 %	50 %	308179308
2057	NC_014554	GTG	2	6	127257	127262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179308
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2059	NC_014554	TTG	2	6	127354	127359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179308
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2062	NC_014554	ATG	2	6	127475	127480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179308
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2064	NC_014554	TAATC	2	10	127544	127553	40 %	40 %	0 %	20 %	308179308
2065	NC_014554	TTC	2	6	127609	127614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179308
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2070	NC_014554	GCG	2	6	127753	127758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179308
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2091	NC_014554	AAATT	2	10	129033	129042	60 %	40 %	0 %	0 %	308179309
2092	NC_014554	A	6	6	129046	129051	100 %	0 %	0 %	0 %	308179309
2093	NC_014554	GTT	2	6	129052	129057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179309
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2104	NC_014554	AAT	2	6	129381	129386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179309
2105	NC_014554	GC	3	6	129402	129407	0 %	0 %	50 %	50 %	308179310
2106	NC_014554	CGA	2	6	129434	129439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179310
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2108	NC_014554	CATC	2	8	129548	129555	25 %	25 %	0 %	50 %	308179310
2109	NC_014554	TGT	2	6	129643	129648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179310
2110	NC_014554	TGAT	2	8	129652	129659	25 %	50 %	25 %	0 %	308179310
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2117	NC_014554	ATC	2	6	129919	129924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179310
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2121	NC_014554	CCGG	2	8	130406	130413	0 %	0 %	50 %	50 %	308179310
2122	NC_014554	CGA	2	6	130421	130426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179310
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2239	NC_014554	AAC	3	9	138054	138062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179318
2240	NC_014554	ACG	2	6	138135	138140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179319
2241	NC_014554	GTC	2	6	138166	138171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179319
2242	NC_014554	CGC	2	6	138198	138203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179319
2243	NC_014554	TGAA	2	8	138239	138246	50 %	25 %	25 %	0 %	308179319
2244	NC_014554	GAT	2	6	138273	138278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179319
2245	NC_014554	ACG	2	6	138316	138321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179319
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2247	NC_014554	TGA	2	6	138374	138379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179319
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2249	NC_014554	ACG	2	6	138400	138405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179319
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2251	NC_014554	GAT	2	6	138418	138423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179319
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2253	NC_014554	CGGT	3	12	138452	138463	0 %	25 %	50 %	25 %	308179319
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2259	NC_014554	TGTA	2	8	138821	138828	25 %	50 %	25 %	0 %	308179319
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2331	NC_014554	CG	3	6	142470	142475	0 %	0 %	50 %	50 %	308179322
2332	NC_014554	A	6	6	142549	142554	100 %	0 %	0 %	0 %	308179322
2333	NC_014554	AGC	2	6	142571	142576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179322
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2344	NC_014554	TGA	2	6	143173	143178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179323
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2346	NC_014554	ATT	2	6	143211	143216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179323
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2348	NC_014554	GCA	2	6	143296	143301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179323
2349	NC_014554	TGACG	2	10	143308	143317	20 %	20 %	40 %	20 %	308179323
2350	NC_014554	ACGC	2	8	143360	143367	25 %	0 %	25 %	50 %	308179323
2351	NC_014554	ACA	2	6	143372	143377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179323
2352	NC_014554	CGG	2	6	143382	143387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179323
2353	NC_014554	ATA	2	6	143433	143438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179323
2354	NC_014554	ATC	2	6	143448	143453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179323
2355	NC_014554	AGC	2	6	143533	143538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179324
2356	NC_014554	A	6	6	143630	143635	100 %	0 %	0 %	0 %	308179324
2357	NC_014554	TTG	2	6	143645	143650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179324
2358	NC_014554	CAT	2	6	143691	143696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179324
2359	NC_014554	GTC	2	6	143761	143766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179324
2360	NC_014554	TAAT	2	8	143799	143806	50 %	50 %	0 %	0 %	308179324
2361	NC_014554	ATACCG	2	12	143867	143878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308179324
2362	NC_014554	TAA	2	6	143879	143884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179324
2363	NC_014554	AGC	2	6	143944	143949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179324
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2482	NC_014554	TATCT	2	10	149805	149814	20 %	60 %	0 %	20 %	308179331
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