MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014554	GGC	2	6	94553	94558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179276
1502	NC_014554	CGG	2	6	94576	94581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179276
1503	NC_014554	CGC	2	6	94650	94655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179276
1504	NC_014554	AAC	2	6	94846	94851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179276
1505	NC_014554	CGG	2	6	94888	94893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179276
1506	NC_014554	GAA	2	6	94917	94922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179276
1507	NC_014554	GCA	2	6	94923	94928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179276
1508	NC_014554	GTG	2	6	95023	95028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179276
1509	NC_014554	GGT	2	6	95033	95038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179276
1510	NC_014554	TGG	2	6	95081	95086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179276
1511	NC_014554	GCC	2	6	95226	95231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179276
1512	NC_014554	ATCA	2	8	95247	95254	50 %	25 %	0 %	25 %	308179276
1513	NC_014554	TTTA	2	8	95302	95309	25 %	75 %	0 %	0 %	308179277
1514	NC_014554	GCA	2	6	95429	95434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179277
1515	NC_014554	GGT	2	6	95487	95492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179277
1516	NC_014554	CAT	2	6	95520	95525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179277
1517	NC_014554	CAT	3	9	95541	95549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179277
1518	NC_014554	AGC	2	6	95663	95668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179277
1519	NC_014554	TCA	2	6	95672	95677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179277
1520	NC_014554	TTG	2	6	95728	95733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179277
1521	NC_014554	GCT	2	6	95743	95748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179277
1522	NC_014554	CAT	2	6	95780	95785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179277
1523	NC_014554	TTA	2	6	95815	95820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179277
1524	NC_014554	CAA	2	6	95895	95900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179277
1525	NC_014554	GGT	2	6	96036	96041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179277
1526	NC_014554	TAT	2	6	96061	96066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179277
1527	NC_014554	A	10	10	96070	96079	100 %	0 %	0 %	0 %	308179277
1528	NC_014554	GAT	2	6	96140	96145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179278
1529	NC_014554	TGA	2	6	96171	96176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179278
1530	NC_014554	TTA	2	6	96182	96187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179278
1531	NC_014554	CGG	2	6	96189	96194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179278
1532	NC_014554	GAA	2	6	96229	96234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179278
1533	NC_014554	CGGC	2	8	96239	96246	0 %	0 %	50 %	50 %	308179278
1534	NC_014554	ACG	3	9	96314	96322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179278
1535	NC_014554	TAT	2	6	96355	96360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179278
1536	NC_014554	GAA	2	6	96436	96441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179278
1537	NC_014554	GCA	2	6	96475	96480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179278
1538	NC_014554	GAG	2	6	96542	96547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179278
1539	NC_014554	T	6	6	96554	96559	0 %	100 %	0 %	0 %	308179279
1540	NC_014554	ATT	2	6	96603	96608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179279
1541	NC_014554	GGGT	2	8	96613	96620	0 %	25 %	75 %	0 %	308179279
1542	NC_014554	TTTA	2	8	96791	96798	25 %	75 %	0 %	0 %	308179279
1543	NC_014554	TGG	2	6	96824	96829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179279
1544	NC_014554	ATT	2	6	96971	96976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179279
1545	NC_014554	ATTT	2	8	96983	96990	25 %	75 %	0 %	0 %	308179279
1546	NC_014554	TGGGA	2	10	97073	97082	20 %	20 %	60 %	0 %	308179279
1547	NC_014554	TGG	2	6	97085	97090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179279
1548	NC_014554	GCA	2	6	97227	97232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179279
1549	NC_014554	T	6	6	97257	97262	0 %	100 %	0 %	0 %	308179279
1550	NC_014554	AATT	2	8	97265	97272	50 %	50 %	0 %	0 %	308179279
1551	NC_014554	ATT	2	6	97463	97468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179280
1552	NC_014554	GAA	2	6	97476	97481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179280
1553	NC_014554	GAA	2	6	97506	97511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179280
1554	NC_014554	ACT	2	6	97543	97548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179280
1555	NC_014554	AAC	2	6	97569	97574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179280
1556	NC_014554	GAA	2	6	97598	97603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179280
1557	NC_014554	TAA	2	6	97637	97642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179280
1558	NC_014554	ATG	2	6	97678	97683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179280
1559	NC_014554	AAG	2	6	97744	97749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179280
1560	NC_014554	TTC	2	6	97755	97760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179280
1561	NC_014554	GAC	2	6	97853	97858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179280
1562	NC_014554	GCC	2	6	97890	97895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179280
1563	NC_014554	ATGA	2	8	98085	98092	50 %	25 %	25 %	0 %	308179280
1564	NC_014554	ACG	2	6	98348	98353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179281
1565	NC_014554	GTT	2	6	98382	98387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179281
1566	NC_014554	TAA	2	6	98464	98469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179281
1567	NC_014554	GGC	2	6	98470	98475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179281
1568	NC_014554	CAC	2	6	98526	98531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179281
1569	NC_014554	TAAGC	2	10	98615	98624	40 %	20 %	20 %	20 %	308179281
1570	NC_014554	GATCA	2	10	98662	98671	40 %	20 %	20 %	20 %	308179281
1571	NC_014554	TGC	3	9	98678	98686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179281
1572	NC_014554	ATG	2	6	98719	98724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179281
1573	NC_014554	GCTT	2	8	98765	98772	0 %	50 %	25 %	25 %	308179281
1574	NC_014554	CAG	2	6	98805	98810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179281
1575	NC_014554	CCGC	2	8	98843	98850	0 %	0 %	25 %	75 %	308179281
1576	NC_014554	AGG	2	6	98900	98905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179281
1577	NC_014554	GCG	2	6	98939	98944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179281
1578	NC_014554	GCT	2	6	98945	98950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179281
1579	NC_014554	TAGC	2	8	98976	98983	25 %	25 %	25 %	25 %	308179281
1580	NC_014554	GCT	2	6	98987	98992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179281
1581	NC_014554	ATT	2	6	99022	99027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179281
1582	NC_014554	GT	4	8	99123	99130	0 %	50 %	50 %	0 %	308179281
1583	NC_014554	GGC	2	6	99142	99147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179281
1584	NC_014554	CGC	2	6	99154	99159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179281
1585	NC_014554	GGAT	2	8	99277	99284	25 %	25 %	50 %	0 %	308179281
1586	NC_014554	CAA	2	6	99291	99296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179281
1587	NC_014554	ATT	2	6	99673	99678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179282
1588	NC_014554	AAG	2	6	99798	99803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179282
1589	NC_014554	ACC	3	9	99857	99865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179282
1590	NC_014554	TGGT	2	8	99885	99892	0 %	50 %	50 %	0 %	308179282
1591	NC_014554	AAG	2	6	99963	99968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179282
1592	NC_014554	GGCA	2	8	100039	100046	25 %	0 %	50 %	25 %	308179282
1593	NC_014554	TTA	2	6	100164	100169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179282
1594	NC_014554	TCG	2	6	100254	100259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179282
1595	NC_014554	GGC	2	6	100297	100302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179282
1596	NC_014554	GCTT	2	8	100310	100317	0 %	50 %	25 %	25 %	308179282
1597	NC_014554	AGCGGG	2	12	100324	100335	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	308179282
1598	NC_014554	TTGAT	2	10	100386	100395	20 %	60 %	20 %	0 %	308179282
1599	NC_014554	AATG	2	8	100478	100485	50 %	25 %	25 %	0 %	308179283
1600	NC_014554	GTG	2	6	100522	100527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179283
1601	NC_014554	CACGT	2	10	100567	100576	20 %	20 %	20 %	40 %	308179283
1602	NC_014554	CGA	2	6	100648	100653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179283
1603	NC_014554	AGC	2	6	100682	100687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179283
1604	NC_014554	CGT	2	6	100748	100753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179283
1605	NC_014554	GGCGG	2	10	100815	100824	0 %	0 %	80 %	20 %	308179283
1606	NC_014554	TTA	2	6	100827	100832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179283
1607	NC_014554	CGA	2	6	100859	100864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179283
1608	NC_014554	TGT	2	6	100883	100888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179283
1609	NC_014554	ATT	2	6	100998	101003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179283
1610	NC_014554	TTG	2	6	101049	101054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179283
1611	NC_014554	CACGG	2	10	101109	101118	20 %	0 %	40 %	40 %	308179283
1612	NC_014554	CCG	2	6	101143	101148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179283
1613	NC_014554	CA	3	6	101313	101318	50 %	0 %	0 %	50 %	308179284
1614	NC_014554	TG	3	6	101334	101339	0 %	50 %	50 %	0 %	308179284
1615	NC_014554	GTC	2	6	101377	101382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179284
1616	NC_014554	GCA	2	6	101472	101477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179284
1617	NC_014554	TCG	2	6	101516	101521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179284
1618	NC_014554	ATG	3	9	101522	101530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179284
1619	NC_014554	GAC	2	6	101581	101586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179284
1620	NC_014554	AGT	2	6	101745	101750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179284
1621	NC_014554	TGA	2	6	101944	101949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179284
1622	NC_014554	CAC	2	6	102037	102042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179285
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1624	NC_014554	CGG	2	6	102232	102237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179285
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1746	NC_014554	GC	3	6	109306	109311	0 %	0 %	50 %	50 %	308179291
1747	NC_014554	TTG	2	6	109363	109368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179291
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1765	NC_014554	ACA	2	6	110214	110219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179292
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1866	NC_014554	TGA	2	6	115339	115344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179297
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1985	NC_014554	GCG	2	6	123258	123263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179305
1986	NC_014554	CAAT	2	8	123333	123340	50 %	25 %	0 %	25 %	308179305
1987	NC_014554	ATTA	2	8	123360	123367	50 %	50 %	0 %	0 %	308179305
1988	NC_014554	GCAAGG	2	12	123375	123386	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	308179305
1989	NC_014554	ATA	2	6	123401	123406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179305
1990	NC_014554	GAA	2	6	123502	123507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179305
1991	NC_014554	TGA	2	6	123516	123521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179305
1992	NC_014554	ACA	2	6	123581	123586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179305
1993	NC_014554	GAA	2	6	123633	123638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179305
1994	NC_014554	TTC	2	6	123679	123684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179305
1995	NC_014554	GAC	2	6	123723	123728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179305
1996	NC_014554	CAC	2	6	123765	123770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179305
1997	NC_014554	CTT	2	6	123798	123803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179305
1998	NC_014554	GTG	2	6	123856	123861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179305
1999	NC_014554	CAC	2	6	123862	123867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179305
2000	NC_014554	CTT	2	6	123918	123923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179305

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