MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014554	GTTA	2	8	60959	60966	25 %	50 %	25 %	0 %	308179241
1002	NC_014554	ATG	2	6	60981	60986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179241
1003	NC_014554	GTG	2	6	61033	61038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179241
1004	NC_014554	ACA	2	6	61108	61113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179241
1005	NC_014554	TCT	2	6	61252	61257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179241
1006	NC_014554	GAT	3	9	61389	61397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179241
1007	NC_014554	AC	3	6	61471	61476	50 %	0 %	0 %	50 %	308179241
1008	NC_014554	TGC	2	6	61496	61501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179241
1009	NC_014554	ACA	2	6	61503	61508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179241
1010	NC_014554	TTC	2	6	61545	61550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179241
1011	NC_014554	ATT	2	6	61572	61577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179241
1012	NC_014554	A	6	6	61622	61627	100 %	0 %	0 %	0 %	308179242
1013	NC_014554	TGA	2	6	61709	61714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179242
1014	NC_014554	GAT	2	6	61724	61729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179242
1015	NC_014554	GCC	2	6	61737	61742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179242
1016	NC_014554	GTC	2	6	61782	61787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179242
1017	NC_014554	TGA	2	6	61828	61833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179242
1018	NC_014554	CTT	2	6	61982	61987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179242
1019	NC_014554	CTT	2	6	62015	62020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179242
1020	NC_014554	CGA	2	6	62032	62037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179242
1021	NC_014554	GTT	2	6	62063	62068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179242
1022	NC_014554	ATG	2	6	62092	62097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179242
1023	NC_014554	GAT	2	6	62129	62134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179242
1024	NC_014554	AGC	2	6	62195	62200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179242
1025	NC_014554	TTG	2	6	62528	62533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179243
1026	NC_014554	GTCG	2	8	62628	62635	0 %	25 %	50 %	25 %	308179243
1027	NC_014554	ATT	2	6	62697	62702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179243
1028	NC_014554	ACA	2	6	62724	62729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179243
1029	NC_014554	AGC	2	6	62745	62750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179243
1030	NC_014554	ATCA	2	8	62752	62759	50 %	25 %	0 %	25 %	308179243
1031	NC_014554	CGG	2	6	62780	62785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179243
1032	NC_014554	TTA	2	6	62818	62823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179243
1033	NC_014554	ATT	2	6	62839	62844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179243
1034	NC_014554	ACG	2	6	62878	62883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179243
1035	NC_014554	GCTG	2	8	62936	62943	0 %	25 %	50 %	25 %	308179243
1036	NC_014554	T	6	6	62976	62981	0 %	100 %	0 %	0 %	308179243
1037	NC_014554	CGG	2	6	63014	63019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179243
1038	NC_014554	ACT	2	6	63114	63119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179243
1039	NC_014554	GTTA	2	8	63153	63160	25 %	50 %	25 %	0 %	308179243
1040	NC_014554	TTA	2	6	63202	63207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179243
1041	NC_014554	TTA	2	6	63211	63216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179243
1042	NC_014554	AAC	2	6	63260	63265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179243
1043	NC_014554	GAT	2	6	63327	63332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179243
1044	NC_014554	CAG	2	6	63337	63342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179243
1045	NC_014554	TGA	2	6	63356	63361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179243
1046	NC_014554	CAA	2	6	63400	63405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179243
1047	NC_014554	TG	3	6	63406	63411	0 %	50 %	50 %	0 %	308179243
1048	NC_014554	GCA	2	6	63468	63473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179243
1049	NC_014554	AAGC	2	8	63481	63488	50 %	0 %	25 %	25 %	308179243
1050	NC_014554	GAAC	2	8	63559	63566	50 %	0 %	25 %	25 %	308179243
1051	NC_014554	T	6	6	63599	63604	0 %	100 %	0 %	0 %	308179243
1052	NC_014554	TTA	2	6	63668	63673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179243
1053	NC_014554	TGT	2	6	63689	63694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179243
1054	NC_014554	GCT	2	6	63883	63888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179243
1055	NC_014554	ATT	2	6	64016	64021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179244
1056	NC_014554	AAT	2	6	64051	64056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179244
1057	NC_014554	GCC	2	6	64060	64065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179244
1058	NC_014554	CGG	2	6	64079	64084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179244
1059	NC_014554	GTC	2	6	64106	64111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179244
1060	NC_014554	TCAC	2	8	64367	64374	25 %	25 %	0 %	50 %	308179245
1061	NC_014554	GAA	2	6	64419	64424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179245
1062	NC_014554	GGT	2	6	64485	64490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179245
1063	NC_014554	CTT	2	6	64607	64612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179245
1064	NC_014554	GCTTG	2	10	64784	64793	0 %	40 %	40 %	20 %	308179245
1065	NC_014554	GAA	2	6	64800	64805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179245
1066	NC_014554	ACTTC	2	10	64912	64921	20 %	40 %	0 %	40 %	308179245
1067	NC_014554	AACGG	2	10	65129	65138	40 %	0 %	40 %	20 %	308179246
1068	NC_014554	TAA	2	6	65149	65154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179246
1069	NC_014554	GTTAA	2	10	65162	65171	40 %	40 %	20 %	0 %	308179246
1070	NC_014554	TGA	2	6	65219	65224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179246
1071	NC_014554	GGC	2	6	65272	65277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179246
1072	NC_014554	AAGT	2	8	65323	65330	50 %	25 %	25 %	0 %	308179246
1073	NC_014554	TGT	3	9	65341	65349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179246
1074	NC_014554	AAG	2	6	65375	65380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179246
1075	NC_014554	ATTT	2	8	65475	65482	25 %	75 %	0 %	0 %	308179246
1076	NC_014554	TACT	2	8	65513	65520	25 %	50 %	0 %	25 %	308179246
1077	NC_014554	TTA	2	6	65576	65581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179246
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1079	NC_014554	CGG	2	6	65616	65621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179246
1080	NC_014554	TGA	2	6	65640	65645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179246
1081	NC_014554	GTG	2	6	65655	65660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179246
1082	NC_014554	TTAA	2	8	65669	65676	50 %	50 %	0 %	0 %	308179246
1083	NC_014554	CTA	2	6	65687	65692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179246
1084	NC_014554	CGA	2	6	65760	65765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179246
1085	NC_014554	TGC	2	6	65839	65844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179246
1086	NC_014554	CCGT	2	8	65870	65877	0 %	25 %	25 %	50 %	308179246
1087	NC_014554	GTG	2	6	65927	65932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179246
1088	NC_014554	ATA	2	6	65978	65983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179246
1089	NC_014554	AAG	2	6	66023	66028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179246
1090	NC_014554	CAT	2	6	66384	66389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179247
1091	NC_014554	TTG	2	6	66469	66474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179247
1092	NC_014554	TGT	2	6	66493	66498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179247
1093	NC_014554	TCA	2	6	66611	66616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179247
1094	NC_014554	TAT	2	6	66637	66642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179247
1095	NC_014554	TGCA	2	8	66742	66749	25 %	25 %	25 %	25 %	308179247
1096	NC_014554	TGA	2	6	66755	66760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179247
1097	NC_014554	TCT	2	6	66835	66840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179247
1098	NC_014554	TGG	2	6	66845	66850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179247
1099	NC_014554	GAT	2	6	66863	66868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179247
1100	NC_014554	GAC	2	6	66932	66937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179247
1101	NC_014554	GCTTA	2	10	67138	67147	20 %	40 %	20 %	20 %	308179247
1102	NC_014554	TCG	2	6	67177	67182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179247
1103	NC_014554	TTA	2	6	67260	67265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179247
1104	NC_014554	AAT	2	6	67304	67309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179247
1105	NC_014554	A	6	6	67324	67329	100 %	0 %	0 %	0 %	308179247
1106	NC_014554	TTGAC	2	10	67387	67396	20 %	40 %	20 %	20 %	308179247
1107	NC_014554	CGGCCG	2	12	67408	67419	0 %	0 %	50 %	50 %	308179247
1108	NC_014554	GGT	2	6	67457	67462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179247
1109	NC_014554	TA	3	6	67531	67536	50 %	50 %	0 %	0 %	308179247
1110	NC_014554	AAT	2	6	67563	67568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179247
1111	NC_014554	ATC	2	6	67611	67616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179247
1112	NC_014554	GCGT	2	8	67646	67653	0 %	25 %	50 %	25 %	308179247
1113	NC_014554	GGT	2	6	67864	67869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179248
1114	NC_014554	TGA	2	6	68007	68012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179248
1115	NC_014554	TCA	2	6	68016	68021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179248
1116	NC_014554	ACGA	2	8	68086	68093	50 %	0 %	25 %	25 %	308179248
1117	NC_014554	GAT	2	6	68109	68114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179248
1118	NC_014554	TAG	2	6	68115	68120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179248
1119	NC_014554	CTA	2	6	68212	68217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179248
1120	NC_014554	ACT	2	6	68235	68240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179248
1121	NC_014554	GCC	2	6	68281	68286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179248
1122	NC_014554	GCT	2	6	68362	68367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179248
1123	NC_014554	CAA	2	6	68371	68376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179248
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1125	NC_014554	TGA	2	6	68406	68411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179248
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1247	NC_014554	CACC	2	8	76813	76820	25 %	0 %	0 %	75 %	308179255
1248	NC_014554	TCT	2	6	76935	76940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179255
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