MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014554	CAAG	2	8	28268	28275	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
502	NC_014554	TCAAA	2	10	28340	28349	60 %	20 %	0 %	20 %	308179213
503	NC_014554	ATC	2	6	28420	28425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179213
504	NC_014554	GGC	2	6	28469	28474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
505	NC_014554	GTC	2	6	28518	28523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179213
506	NC_014554	CGC	2	6	28619	28624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179213
507	NC_014554	AAG	2	6	28657	28662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179213
508	NC_014554	GCG	2	6	28749	28754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179213
509	NC_014554	CGC	2	6	28829	28834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179213
510	NC_014554	TGAT	2	8	28882	28889	25 %	50 %	25 %	0 %	308179213
511	NC_014554	ATG	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179213
512	NC_014554	CAA	2	6	28995	29000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
513	NC_014554	CAG	2	6	29001	29006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179213
514	NC_014554	CAA	2	6	29040	29045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179213
515	NC_014554	ACGA	2	8	29134	29141	50 %	0 %	25 %	25 %	308179213
516	NC_014554	GATT	2	8	29284	29291	25 %	50 %	25 %	0 %	308179214
517	NC_014554	ATG	2	6	29304	29309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
518	NC_014554	GAT	2	6	29318	29323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
519	NC_014554	CTA	2	6	29404	29409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
520	NC_014554	TTA	2	6	29440	29445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
521	NC_014554	TGG	2	6	29458	29463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
522	NC_014554	TGG	2	6	29467	29472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
523	NC_014554	TTG	2	6	29586	29591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179214
524	NC_014554	AAT	2	6	29600	29605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179214
525	NC_014554	TTTA	2	8	29648	29655	25 %	75 %	0 %	0 %	308179214
526	NC_014554	CGTG	2	8	29683	29690	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
527	NC_014554	GGT	2	6	29726	29731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
528	NC_014554	ATT	2	6	29786	29791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
529	NC_014554	CAG	2	6	29815	29820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179214
530	NC_014554	ATC	2	6	29823	29828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
531	NC_014554	GTC	2	6	29864	29869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179214
532	NC_014554	TAC	2	6	30032	30037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
533	NC_014554	CATT	3	12	30048	30059	25 %	50 %	0 %	25 %	308179214
534	NC_014554	TGG	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
535	NC_014554	ATT	2	6	30168	30173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
536	NC_014554	TGGC	2	8	30193	30200	0 %	25 %	50 %	25 %	308179214
537	NC_014554	GGA	2	6	30298	30303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179214
538	NC_014554	ACT	2	6	30339	30344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
539	NC_014554	GCG	2	6	30351	30356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179214
540	NC_014554	TCCGC	2	10	30379	30388	0 %	20 %	20 %	60 %	308179214
541	NC_014554	ATT	2	6	30395	30400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179214
542	NC_014554	TGG	2	6	30434	30439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
543	NC_014554	ACG	2	6	30476	30481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179214
544	NC_014554	ACT	2	6	30577	30582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
545	NC_014554	TGA	2	6	30619	30624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
546	NC_014554	TGA	2	6	30630	30635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179214
547	NC_014554	G	8	8	30637	30644	0 %	0 %	100 %	0 %	308179214
548	NC_014554	ACT	2	6	30845	30850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179214
549	NC_014554	GTG	2	6	30888	30893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
550	NC_014554	GTG	2	6	30948	30953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179214
551	NC_014554	AGT	2	6	31329	31334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179215
552	NC_014554	T	6	6	31336	31341	0 %	100 %	0 %	0 %	308179215
553	NC_014554	TGGA	2	8	31346	31353	25 %	25 %	50 %	0 %	308179215
554	NC_014554	CAG	2	6	31386	31391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179215
555	NC_014554	TGA	2	6	31475	31480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179215
556	NC_014554	ACG	2	6	31483	31488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179215
557	NC_014554	TTA	2	6	31623	31628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179215
558	NC_014554	TAA	2	6	31629	31634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179215
559	NC_014554	CAGA	2	8	31692	31699	50 %	0 %	25 %	25 %	308179215
560	NC_014554	CGCAC	2	10	31710	31719	20 %	0 %	20 %	60 %	308179215
561	NC_014554	GCG	2	6	31771	31776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179215
562	NC_014554	TAA	2	6	31818	31823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179215
563	NC_014554	CG	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	308179215
564	NC_014554	ACA	2	6	32033	32038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179215
565	NC_014554	CGG	2	6	32043	32048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179215
566	NC_014554	TGATT	2	10	32073	32082	20 %	60 %	20 %	0 %	308179215
567	NC_014554	TTAGT	2	10	32237	32246	20 %	60 %	20 %	0 %	308179216
568	NC_014554	GCC	2	6	32301	32306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179216
569	NC_014554	GCC	2	6	32373	32378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179216
570	NC_014554	AGT	2	6	32497	32502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179216
571	NC_014554	T	6	6	32538	32543	0 %	100 %	0 %	0 %	308179216
572	NC_014554	AGCC	2	8	32569	32576	25 %	0 %	25 %	50 %	308179216
573	NC_014554	GTT	2	6	32577	32582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179216
574	NC_014554	AAT	2	6	32650	32655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179216
575	NC_014554	TAGC	2	8	32671	32678	25 %	25 %	25 %	25 %	308179216
576	NC_014554	ATCC	2	8	32744	32751	25 %	25 %	0 %	50 %	308179216
577	NC_014554	TGC	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179216
578	NC_014554	TGA	2	6	33029	33034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
579	NC_014554	GTC	2	6	33161	33166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179217
580	NC_014554	CA	3	6	33180	33185	50 %	0 %	0 %	50 %	308179217
581	NC_014554	GTC	2	6	33212	33217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179217
582	NC_014554	CGTCAT	2	12	33273	33284	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308179217
583	NC_014554	GA	3	6	33323	33328	50 %	0 %	50 %	0 %	308179217
584	NC_014554	GC	3	6	33346	33351	0 %	0 %	50 %	50 %	308179217
585	NC_014554	T	6	6	33405	33410	0 %	100 %	0 %	0 %	308179217
586	NC_014554	AAT	2	6	33412	33417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179217
587	NC_014554	TGA	2	6	33641	33646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
588	NC_014554	TCG	2	6	33651	33656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179217
589	NC_014554	AGC	2	6	33712	33717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179217
590	NC_014554	TTC	2	6	33791	33796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179217
591	NC_014554	CGAT	2	8	33915	33922	25 %	25 %	25 %	25 %	308179217
592	NC_014554	CCATA	2	10	33933	33942	40 %	20 %	0 %	40 %	308179217
593	NC_014554	GTA	2	6	33976	33981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
594	NC_014554	TAT	2	6	34032	34037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179217
595	NC_014554	AGTG	2	8	34068	34075	25 %	25 %	50 %	0 %	308179217
596	NC_014554	TCA	2	6	34088	34093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179217
597	NC_014554	GTT	2	6	34194	34199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179217
598	NC_014554	CGGT	2	8	34210	34217	0 %	25 %	50 %	25 %	308179217
599	NC_014554	GAAAC	2	10	34340	34349	60 %	0 %	20 %	20 %	308179217
600	NC_014554	GC	3	6	34415	34420	0 %	0 %	50 %	50 %	308179217
601	NC_014554	ACTGG	2	10	34468	34477	20 %	20 %	40 %	20 %	308179217
602	NC_014554	GAC	2	6	34537	34542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179217
603	NC_014554	GTT	2	6	34611	34616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179217
604	NC_014554	TAGT	2	8	34656	34663	25 %	50 %	25 %	0 %	308179217
605	NC_014554	TGA	2	6	34690	34695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
606	NC_014554	AGC	2	6	34726	34731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179217
607	NC_014554	GAT	2	6	34755	34760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
608	NC_014554	ACG	2	6	34799	34804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179217
609	NC_014554	GTC	2	6	34961	34966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179217
610	NC_014554	TGA	2	6	35039	35044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
611	NC_014554	TTC	2	6	35096	35101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179217
612	NC_014554	TGG	2	6	35105	35110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179217
613	NC_014554	GTG	2	6	35123	35128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179217
614	NC_014554	CTT	2	6	35241	35246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179217
615	NC_014554	ATT	2	6	35251	35256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179217
616	NC_014554	GTA	2	6	35278	35283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
617	NC_014554	CTA	2	6	35328	35333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179217
618	NC_014554	CGA	2	6	35427	35432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179217
619	NC_014554	AGC	2	6	35473	35478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179217
620	NC_014554	GAT	2	6	35592	35597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179217
621	NC_014554	TAA	2	6	35634	35639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179217
622	NC_014554	TCA	2	6	36093	36098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179218
623	NC_014554	TTGA	2	8	36110	36117	25 %	50 %	25 %	0 %	308179218
624	NC_014554	TGC	2	6	36161	36166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179218
625	NC_014554	GTT	2	6	36311	36316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179218
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627	NC_014554	TTC	2	6	36346	36351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179218
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877	NC_014554	A	7	7	51742	51748	100 %	0 %	0 %	0 %	308179234
878	NC_014554	ATT	2	6	52019	52024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179235
879	NC_014554	GGAC	2	8	52030	52037	25 %	0 %	50 %	25 %	308179235
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