MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014554	ACCG	2	8	377671	377678	25 %	0 %	25 %	50 %	308179548
6002	NC_014554	GTC	2	6	377750	377755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179548
6003	NC_014554	CGGC	2	8	377763	377770	0 %	0 %	50 %	50 %	308179548
6004	NC_014554	GTA	2	6	377803	377808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179548
6005	NC_014554	GC	3	6	377825	377830	0 %	0 %	50 %	50 %	308179548
6006	NC_014554	TCG	2	6	377903	377908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179548
6007	NC_014554	GAT	3	9	378664	378672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179549
6008	NC_014554	TCGC	2	8	378749	378756	0 %	25 %	25 %	50 %	308179549
6009	NC_014554	GTC	2	6	378784	378789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179549
6010	NC_014554	AGC	2	6	378963	378968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179549
6011	NC_014554	GGC	2	6	379028	379033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179549
6012	NC_014554	TGG	2	6	379116	379121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179549
6013	NC_014554	GGT	2	6	379165	379170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179549
6014	NC_014554	A	7	7	379716	379722	100 %	0 %	0 %	0 %	308179550
6015	NC_014554	AT	3	6	379827	379832	50 %	50 %	0 %	0 %	308179550
6016	NC_014554	A	6	6	379880	379885	100 %	0 %	0 %	0 %	308179550
6017	NC_014554	TTA	2	6	379897	379902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179550
6018	NC_014554	ACT	2	6	379916	379921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179550
6019	NC_014554	ATG	2	6	379990	379995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179550
6020	NC_014554	GC	3	6	380023	380028	0 %	0 %	50 %	50 %	308179550
6021	NC_014554	CAGT	2	8	380111	380118	25 %	25 %	25 %	25 %	308179550
6022	NC_014554	CGA	2	6	380147	380152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179550
6023	NC_014554	CCA	2	6	380266	380271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179550
6024	NC_014554	GAA	3	9	380367	380375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179550
6025	NC_014554	TCATAT	2	12	380403	380414	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	308179550
6026	NC_014554	GCC	2	6	380503	380508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179550
6027	NC_014554	TGG	2	6	380517	380522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179550
6028	NC_014554	AGCGAA	2	12	380652	380663	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	308179550
6029	NC_014554	AATT	2	8	380709	380716	50 %	50 %	0 %	0 %	308179550
6030	NC_014554	TAAA	2	8	380721	380728	75 %	25 %	0 %	0 %	308179550
6031	NC_014554	GTT	2	6	381284	381289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179551
6032	NC_014554	CGT	2	6	381291	381296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179551
6033	NC_014554	TAT	2	6	381317	381322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179551
6034	NC_014554	AAC	2	6	381325	381330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179551
6035	NC_014554	GAA	2	6	381341	381346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179551
6036	NC_014554	CAA	2	6	381456	381461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179551
6037	NC_014554	CGA	2	6	381479	381484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179551
6038	NC_014554	GTG	2	6	381495	381500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179551
6039	NC_014554	GTC	2	6	381561	381566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179551
6040	NC_014554	GCA	2	6	381590	381595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179551
6041	NC_014554	CTT	2	6	381608	381613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179551
6042	NC_014554	CAC	2	6	381641	381646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179551
6043	NC_014554	CAAT	2	8	381736	381743	50 %	25 %	0 %	25 %	308179551
6044	NC_014554	TTC	2	6	381783	381788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179551
6045	NC_014554	CTA	2	6	381809	381814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179551
6046	NC_014554	TAT	2	6	381914	381919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179552
6047	NC_014554	AACA	2	8	381942	381949	75 %	0 %	0 %	25 %	308179552
6048	NC_014554	GGT	2	6	381985	381990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179552
6049	NC_014554	ATG	2	6	382032	382037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179552
6050	NC_014554	TGG	2	6	382241	382246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179552
6051	NC_014554	TCA	2	6	382267	382272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179552
6052	NC_014554	CTA	2	6	382327	382332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179552
6053	NC_014554	ACTTCA	2	12	382390	382401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179552
6054	NC_014554	TGA	2	6	382477	382482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179552
6055	NC_014554	GCC	2	6	382557	382562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179552
6056	NC_014554	ATT	2	6	382584	382589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179552
6057	NC_014554	ATT	2	6	382641	382646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179552
6058	NC_014554	TTC	2	6	382722	382727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179552
6059	NC_014554	TGG	2	6	382871	382876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179552
6060	NC_014554	TAT	2	6	382894	382899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179552
6061	NC_014554	TAG	2	6	382900	382905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179552
6062	NC_014554	GAC	2	6	382929	382934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179552
6063	NC_014554	CGTT	2	8	383038	383045	0 %	50 %	25 %	25 %	308179552
6064	NC_014554	GCT	2	6	383079	383084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179552
6065	NC_014554	TGGG	2	8	383093	383100	0 %	25 %	75 %	0 %	308179552
6066	NC_014554	ATT	2	6	383192	383197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179552
6067	NC_014554	GCC	2	6	383202	383207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179552
6068	NC_014554	CAA	2	6	383246	383251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179552
6069	NC_014554	CAG	2	6	383260	383265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179552
6070	NC_014554	ATT	2	6	383330	383335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179553
6071	NC_014554	GCA	2	6	383409	383414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179553
6072	NC_014554	TCG	2	6	383419	383424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179553
6073	NC_014554	CCA	2	6	383456	383461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179553
6074	NC_014554	ATTAA	2	10	383470	383479	60 %	40 %	0 %	0 %	308179553
6075	NC_014554	ATT	2	6	383498	383503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179554
6076	NC_014554	CG	3	6	383526	383531	0 %	0 %	50 %	50 %	308179554
6077	NC_014554	CAG	2	6	383542	383547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179554
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6079	NC_014554	AAG	2	6	383779	383784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179554
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6081	NC_014554	CGC	2	6	383836	383841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179554
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6083	NC_014554	ATG	2	6	383851	383856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179554
6084	NC_014554	GCT	2	6	383866	383871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179554
6085	NC_014554	ATG	2	6	384106	384111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179555
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6087	NC_014554	GTTA	2	8	384237	384244	25 %	50 %	25 %	0 %	308179555
6088	NC_014554	TAAT	2	8	384248	384255	50 %	50 %	0 %	0 %	308179555
6089	NC_014554	T	6	6	384263	384268	0 %	100 %	0 %	0 %	308179555
6090	NC_014554	T	6	6	384310	384315	0 %	100 %	0 %	0 %	308179555
6091	NC_014554	TTA	2	6	384340	384345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179555
6092	NC_014554	TAAC	2	8	384353	384360	50 %	25 %	0 %	25 %	308179555
6093	NC_014554	TGG	2	6	384398	384403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179555
6094	NC_014554	TGA	2	6	384432	384437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179555
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6096	NC_014554	TGTT	2	8	384548	384555	0 %	75 %	25 %	0 %	308179555
6097	NC_014554	TAG	2	6	384563	384568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179555
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6102	NC_014554	ATT	2	6	384820	384825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179555
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6104	NC_014554	TTA	2	6	384932	384937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179555
6105	NC_014554	GT	3	6	384983	384988	0 %	50 %	50 %	0 %	308179555
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6108	NC_014554	ATT	2	6	385039	385044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179555
6109	NC_014554	TTGG	2	8	385207	385214	0 %	50 %	50 %	0 %	308179555
6110	NC_014554	ACA	2	6	385273	385278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179555
6111	NC_014554	TGG	2	6	385308	385313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179555
6112	NC_014554	TTGGC	2	10	385317	385326	0 %	40 %	40 %	20 %	308179555
6113	NC_014554	ATT	2	6	385330	385335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179555
6114	NC_014554	TTTG	3	12	385339	385350	0 %	75 %	25 %	0 %	308179555
6115	NC_014554	GAT	2	6	385398	385403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179555
6116	NC_014554	GATACG	2	12	385429	385440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308179555
6117	NC_014554	GGT	2	6	385554	385559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179556
6118	NC_014554	GGC	2	6	385569	385574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179556
6119	NC_014554	ACGG	2	8	385635	385642	25 %	0 %	50 %	25 %	308179556
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6121	NC_014554	TAT	2	6	385659	385664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179556
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6238	NC_014554	CAAG	2	8	392802	392809	50 %	0 %	25 %	25 %	308179562
6239	NC_014554	CGA	2	6	393018	393023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179562
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6491	NC_014554	GC	3	6	406376	406381	0 %	0 %	50 %	50 %	308179577
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