MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 51609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_014554	ACTA	2	8	3218263	3218270	50 %	25 %	0 %	25 %	308182153
51002	NC_014554	TGC	2	6	3218287	3218292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182153
51003	NC_014554	ACT	2	6	3218317	3218322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182153
51004	NC_014554	TAA	2	6	3218332	3218337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182153
51005	NC_014554	TGA	2	6	3218353	3218358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182153
51006	NC_014554	GTT	2	6	3218366	3218371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182153
51007	NC_014554	CAA	2	6	3218454	3218459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182154
51008	NC_014554	TAT	2	6	3218461	3218466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182154
51009	NC_014554	TG	3	6	3218523	3218528	0 %	50 %	50 %	0 %	308182154
51010	NC_014554	TAC	2	6	3218561	3218566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182154
51011	NC_014554	ACT	2	6	3218591	3218596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182154
51012	NC_014554	ATT	2	6	3218600	3218605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182154
51013	NC_014554	GCC	2	6	3218662	3218667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182154
51014	NC_014554	GAC	2	6	3218684	3218689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182154
51015	NC_014554	A	6	6	3218693	3218698	100 %	0 %	0 %	0 %	308182154
51016	NC_014554	ACT	2	6	3218705	3218710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182154
51017	NC_014554	CA	3	6	3218933	3218938	50 %	0 %	0 %	50 %	308182154
51018	NC_014554	ACCA	2	8	3218957	3218964	50 %	0 %	0 %	50 %	308182154
51019	NC_014554	AAC	2	6	3218977	3218982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182154
51020	NC_014554	ATT	2	6	3218984	3218989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182154
51021	NC_014554	TAG	2	6	3219023	3219028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182154
51022	NC_014554	TC	3	6	3219089	3219094	0 %	50 %	0 %	50 %	308182154
51023	NC_014554	AGC	2	6	3219112	3219117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182154
51024	NC_014554	CG	3	6	3219123	3219128	0 %	0 %	50 %	50 %	308182154
51025	NC_014554	AGC	2	6	3219158	3219163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182154
51026	NC_014554	TACTC	2	10	3219188	3219197	20 %	40 %	0 %	40 %	308182154
51027	NC_014554	ATCGA	2	10	3219199	3219208	40 %	20 %	20 %	20 %	308182154
51028	NC_014554	GAT	2	6	3219249	3219254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182154
51029	NC_014554	TTA	2	6	3219289	3219294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182154
51030	NC_014554	CCT	2	6	3219647	3219652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308182155
51031	NC_014554	CCA	2	6	3219712	3219717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182155
51032	NC_014554	CTG	2	6	3219719	3219724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182155
51033	NC_014554	CTG	2	6	3219764	3219769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182155
51034	NC_014554	ATA	2	6	3219799	3219804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182155
51035	NC_014554	AAG	2	6	3219809	3219814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182155
51036	NC_014554	TCA	2	6	3219835	3219840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182155
51037	NC_014554	ATA	2	6	3219845	3219850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182155
51038	NC_014554	TGCCA	2	10	3219852	3219861	20 %	20 %	20 %	40 %	308182155
51039	NC_014554	CAG	2	6	3219875	3219880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182155
51040	NC_014554	TTG	2	6	3219905	3219910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182155
51041	NC_014554	TC	3	6	3219921	3219926	0 %	50 %	0 %	50 %	308182155
51042	NC_014554	TCA	2	6	3219932	3219937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182155
51043	NC_014554	ATTT	2	8	3219964	3219971	25 %	75 %	0 %	0 %	308182156
51044	NC_014554	TA	3	6	3220037	3220042	50 %	50 %	0 %	0 %	308182156
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51047	NC_014554	AAAT	2	8	3220268	3220275	75 %	25 %	0 %	0 %	308182156
51048	NC_014554	TAA	2	6	3220355	3220360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182156
51049	NC_014554	AAT	2	6	3220365	3220370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182156
51050	NC_014554	AAT	2	6	3220395	3220400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182156
51051	NC_014554	TAA	2	6	3220406	3220411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182156
51052	NC_014554	CCAATC	2	12	3220468	3220479	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308182156
51053	NC_014554	T	6	6	3220498	3220503	0 %	100 %	0 %	0 %	308182156
51054	NC_014554	TAT	2	6	3220526	3220531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182156
51055	NC_014554	CTC	3	9	3220599	3220607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308182156
51056	NC_014554	TTCA	2	8	3220659	3220666	25 %	50 %	0 %	25 %	308182156
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51059	NC_014554	TCA	2	6	3220789	3220794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182156
51060	NC_014554	CAA	2	6	3220853	3220858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182156
51061	NC_014554	TTA	2	6	3220867	3220872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182156
51062	NC_014554	TAA	2	6	3220916	3220921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182156
51063	NC_014554	GCC	2	6	3220929	3220934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182156
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51067	NC_014554	TGT	2	6	3221069	3221074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182157
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51070	NC_014554	TCT	2	6	3221407	3221412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182157
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51073	NC_014554	TCA	2	6	3221440	3221445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182157
51074	NC_014554	AAT	2	6	3221471	3221476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182157
51075	NC_014554	CATC	2	8	3221483	3221490	25 %	25 %	0 %	50 %	308182157
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51083	NC_014554	TGA	2	6	3221974	3221979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182158
51084	NC_014554	AAAT	2	8	3222058	3222065	75 %	25 %	0 %	0 %	308182158
51085	NC_014554	TCA	2	6	3222108	3222113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182159
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51087	NC_014554	A	7	7	3222228	3222234	100 %	0 %	0 %	0 %	308182159
51088	NC_014554	TAC	2	6	3222260	3222265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182159
51089	NC_014554	TAC	2	6	3222355	3222360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182159
51090	NC_014554	TTG	2	6	3222365	3222370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182159
51091	NC_014554	TGT	2	6	3222417	3222422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182159
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51093	NC_014554	T	6	6	3222440	3222445	0 %	100 %	0 %	0 %	308182159
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51098	NC_014554	A	6	6	3222621	3222626	100 %	0 %	0 %	0 %	308182159
51099	NC_014554	A	6	6	3222634	3222639	100 %	0 %	0 %	0 %	308182159
51100	NC_014554	ATC	3	9	3222704	3222712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182159
51101	NC_014554	TTTC	2	8	3222718	3222725	0 %	75 %	0 %	25 %	308182159
51102	NC_014554	AAT	2	6	3222788	3222793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182159
51103	NC_014554	TTC	2	6	3222809	3222814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182159
51104	NC_014554	AACC	2	8	3222844	3222851	50 %	0 %	0 %	50 %	308182159
51105	NC_014554	TACT	2	8	3222930	3222937	25 %	50 %	0 %	25 %	308182159
51106	NC_014554	ATA	2	6	3223000	3223005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182159
51107	NC_014554	AACT	2	8	3223121	3223128	50 %	25 %	0 %	25 %	308182159
51108	NC_014554	ATC	2	6	3223133	3223138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182159
51109	NC_014554	AAG	2	6	3223256	3223261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182159
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51112	NC_014554	TAA	2	6	3223318	3223323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182159
51113	NC_014554	ATT	2	6	3223358	3223363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182159
51114	NC_014554	T	6	6	3223373	3223378	0 %	100 %	0 %	0 %	308182159
51115	NC_014554	GTA	2	6	3223433	3223438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182159
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51117	NC_014554	TAA	2	6	3223536	3223541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182159
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51234	NC_014554	TCG	2	6	3230687	3230692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182165
51235	NC_014554	ACC	2	6	3230769	3230774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
51236	NC_014554	AGC	2	6	3230775	3230780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182165
51237	NC_014554	CATCA	2	10	3230796	3230805	40 %	20 %	0 %	40 %	308182165
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51337	NC_014554	CCAT	2	8	3237965	3237972	25 %	25 %	0 %	50 %	308182173
51338	NC_014554	CGT	2	6	3238036	3238041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182173
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51343	NC_014554	TAA	2	6	3238318	3238323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182173
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51349	NC_014554	GCGT	2	8	3239136	3239143	0 %	25 %	50 %	25 %	308182174
51350	NC_014554	TCCA	2	8	3239253	3239260	25 %	25 %	0 %	50 %	308182174
51351	NC_014554	CGA	2	6	3239300	3239305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182174
51352	NC_014554	GTA	2	6	3239324	3239329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182174
51353	NC_014554	ATA	2	6	3239338	3239343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182174
51354	NC_014554	TCA	2	6	3239357	3239362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182174
51355	NC_014554	TCA	2	6	3239566	3239571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182175
51356	NC_014554	TGC	2	6	3239677	3239682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182175
51357	NC_014554	TTG	2	6	3239695	3239700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182175
51358	NC_014554	TG	3	6	3239714	3239719	0 %	50 %	50 %	0 %	308182175
51359	NC_014554	TCA	2	6	3239748	3239753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182175
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51361	NC_014554	ATA	2	6	3239904	3239909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182175
51362	NC_014554	TG	3	6	3239919	3239924	0 %	50 %	50 %	0 %	308182175
51363	NC_014554	CAT	2	6	3240051	3240056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182175
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51365	NC_014554	ACA	2	6	3240206	3240211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182175
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51368	NC_014554	ATC	2	6	3240382	3240387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182175
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51376	NC_014554	TTA	2	6	3240671	3240676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182175
51377	NC_014554	ATT	2	6	3240751	3240756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182175
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51380	NC_014554	TG	3	6	3240933	3240938	0 %	50 %	50 %	0 %	308182175
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51452	NC_014554	CTT	2	6	3244703	3244708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182179
51453	NC_014554	ATCTT	2	10	3244725	3244734	20 %	60 %	0 %	20 %	308182179
51454	NC_014554	CGAT	2	8	3244735	3244742	25 %	25 %	25 %	25 %	308182179
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51459	NC_014554	ATT	2	6	3245057	3245062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182179
51460	NC_014554	GAA	2	6	3245070	3245075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182179
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51465	NC_014554	CAA	2	6	3245194	3245199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182179
51466	NC_014554	GT	3	6	3245253	3245258	0 %	50 %	50 %	0 %	308182179
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51468	NC_014554	ACC	2	6	3245426	3245431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182179
51469	NC_014554	CCA	2	6	3245458	3245463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182179
51470	NC_014554	TGC	2	6	3245519	3245524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182179
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51493	NC_014554	CAA	2	6	3246832	3246837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182180
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