MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	AGGG	2	8	166	173	25 %	0 %	75 %	0 %	307069351
2	NC_014495	CGAA	2	8	813	820	50 %	0 %	25 %	25 %	307069351
3	NC_014495	AAGC	2	8	989	996	50 %	0 %	25 %	25 %	307069351
4	NC_014495	CTTG	2	8	1109	1116	0 %	50 %	25 %	25 %	307069351
5	NC_014495	TGGA	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	307069353
6	NC_014495	GTAT	2	8	2788	2795	25 %	50 %	25 %	0 %	307069353
7	NC_014495	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	307069354
8	NC_014495	GCTC	2	8	3268	3275	0 %	25 %	25 %	50 %	307069354
9	NC_014495	TTTC	2	8	3785	3792	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
10	NC_014495	AAGT	2	8	3817	3824	50 %	25 %	25 %	0 %	307069355
11	NC_014495	AACA	2	8	3968	3975	75 %	0 %	0 %	25 %	307069355
12	NC_014495	CGAT	2	8	3986	3993	25 %	25 %	25 %	25 %	307069355
13	NC_014495	CTTT	2	8	4199	4206	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
14	NC_014495	TTTC	2	8	4302	4309	0 %	75 %	0 %	25 %	307069355
15	NC_014495	CAAA	2	8	4542	4549	75 %	0 %	0 %	25 %	307069356
16	NC_014495	GATG	2	8	4702	4709	25 %	25 %	50 %	0 %	307069356
17	NC_014495	TTTG	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	307069356
18	NC_014495	TTTC	2	8	5441	5448	0 %	75 %	0 %	25 %	307069357
19	NC_014495	TCAT	2	8	5785	5792	25 %	50 %	0 %	25 %	307069357
20	NC_014495	CAAG	2	8	6064	6071	50 %	0 %	25 %	25 %	307069358
21	NC_014495	ATTA	2	8	6082	6089	50 %	50 %	0 %	0 %	307069358
22	NC_014495	ATAA	2	8	6097	6104	75 %	25 %	0 %	0 %	307069358
23	NC_014495	AAGA	2	8	6808	6815	75 %	0 %	25 %	0 %	307069360
24	NC_014495	CAAA	3	12	6829	6840	75 %	0 %	0 %	25 %	307069360
25	NC_014495	AAGT	2	8	7079	7086	50 %	25 %	25 %	0 %	307069360
26	NC_014495	TAAA	2	8	7677	7684	75 %	25 %	0 %	0 %	307069360
27	NC_014495	AAGA	2	8	8389	8396	75 %	0 %	25 %	0 %	307069362
28	NC_014495	CAAT	2	8	8423	8430	50 %	25 %	0 %	25 %	307069362
29	NC_014495	AAGA	2	8	10136	10143	75 %	0 %	25 %	0 %	307069364
30	NC_014495	TCGC	2	8	10600	10607	0 %	25 %	25 %	50 %	307069365
31	NC_014495	GAAA	2	8	10647	10654	75 %	0 %	25 %	0 %	307069365
32	NC_014495	ATCC	2	8	11005	11012	25 %	25 %	0 %	50 %	307069365
33	NC_014495	AAGT	2	8	12115	12122	50 %	25 %	25 %	0 %	307069367
34	NC_014495	TTAG	2	8	12521	12528	25 %	50 %	25 %	0 %	307069368
35	NC_014495	CAAG	2	8	12593	12600	50 %	0 %	25 %	25 %	307069368
36	NC_014495	GAAA	2	8	13697	13704	75 %	0 %	25 %	0 %	307069369
37	NC_014495	GAAA	2	8	13817	13824	75 %	0 %	25 %	0 %	307069369
38	NC_014495	ACCG	2	8	13829	13836	25 %	0 %	25 %	50 %	307069369
39	NC_014495	ATTT	2	8	13989	13996	25 %	75 %	0 %	0 %	307069369
40	NC_014495	ATGA	2	8	14489	14496	50 %	25 %	25 %	0 %	307069370
41	NC_014495	GAAA	2	8	14833	14840	75 %	0 %	25 %	0 %	307069370
42	NC_014495	TGTT	2	8	15409	15416	0 %	75 %	25 %	0 %	307069371
43	NC_014495	TTTC	2	8	15723	15730	0 %	75 %	0 %	25 %	307069372
44	NC_014495	AACC	2	8	17852	17859	50 %	0 %	0 %	50 %	307069374
45	NC_014495	ATGA	2	8	18027	18034	50 %	25 %	25 %	0 %	307069375
46	NC_014495	CCAA	2	8	18115	18122	50 %	0 %	0 %	50 %	307069375
47	NC_014495	ACAA	2	8	19137	19144	75 %	0 %	0 %	25 %	307069376
48	NC_014495	CTTT	2	8	19281	19288	0 %	75 %	0 %	25 %	307069376
49	NC_014495	AAGC	2	8	19663	19670	50 %	0 %	25 %	25 %	307069377
50	NC_014495	ATGG	2	8	19768	19775	25 %	25 %	50 %	0 %	307069377
51	NC_014495	CTAT	2	8	19880	19887	25 %	50 %	0 %	25 %	307069377
52	NC_014495	TGAT	2	8	19940	19947	25 %	50 %	25 %	0 %	307069377
53	NC_014495	ACAG	2	8	20193	20200	50 %	0 %	25 %	25 %	307069377
54	NC_014495	TTTG	2	8	20865	20872	0 %	75 %	25 %	0 %	307069378
55	NC_014495	GAAA	2	8	21186	21193	75 %	0 %	25 %	0 %	307069378
56	NC_014495	ATCG	2	8	21297	21304	25 %	25 %	25 %	25 %	307069378
57	NC_014495	AGAA	2	8	22154	22161	75 %	0 %	25 %	0 %	307069378
58	NC_014495	ATTT	2	8	22961	22968	25 %	75 %	0 %	0 %	307069379
59	NC_014495	TTTC	2	8	23175	23182	0 %	75 %	0 %	25 %	307069379
60	NC_014495	AATA	2	8	24343	24350	75 %	25 %	0 %	0 %	307069380
61	NC_014495	TAGC	2	8	24408	24415	25 %	25 %	25 %	25 %	307069380
62	NC_014495	TCAT	2	8	24443	24450	25 %	50 %	0 %	25 %	307069380
63	NC_014495	CTTC	2	8	24623	24630	0 %	50 %	0 %	50 %	307069380
64	NC_014495	ACTT	2	8	24868	24875	25 %	50 %	0 %	25 %	307069380
65	NC_014495	AATC	2	8	25188	25195	50 %	25 %	0 %	25 %	307069380
66	NC_014495	TAAT	2	8	26119	26126	50 %	50 %	0 %	0 %	307069381
67	NC_014495	TTTC	2	8	26254	26261	0 %	75 %	0 %	25 %	307069381
68	NC_014495	CATA	2	8	26383	26390	50 %	25 %	0 %	25 %	307069381
69	NC_014495	TAAA	2	8	26546	26553	75 %	25 %	0 %	0 %	307069381
70	NC_014495	CCGG	2	8	27386	27393	0 %	0 %	50 %	50 %	307069382
71	NC_014495	TTGA	2	8	27576	27583	25 %	50 %	25 %	0 %	307069382
72	NC_014495	CCTA	2	8	27609	27616	25 %	25 %	0 %	50 %	307069382
73	NC_014495	AATC	2	8	27662	27669	50 %	25 %	0 %	25 %	307069382
74	NC_014495	TGAT	2	8	28677	28684	25 %	50 %	25 %	0 %	307069383
75	NC_014495	AGTA	2	8	29029	29036	50 %	25 %	25 %	0 %	307069383
76	NC_014495	AAAG	2	8	29648	29655	75 %	0 %	25 %	0 %	307069383
77	NC_014495	AAAG	2	8	29795	29802	75 %	0 %	25 %	0 %	307069383
78	NC_014495	GAAA	2	8	30299	30306	75 %	0 %	25 %	0 %	307069385
79	NC_014495	GAAA	2	8	30351	30358	75 %	0 %	25 %	0 %	307069385
80	NC_014495	TGGA	2	8	30637	30644	25 %	25 %	50 %	0 %	307069385
81	NC_014495	AATT	2	8	31106	31113	50 %	50 %	0 %	0 %	307069385
82	NC_014495	AAGC	2	8	32101	32108	50 %	0 %	25 %	25 %	307069386
83	NC_014495	ATTG	2	8	32179	32186	25 %	50 %	25 %	0 %	307069386
84	NC_014495	ATTC	2	8	32458	32465	25 %	50 %	0 %	25 %	307069386
85	NC_014495	AGTG	2	8	32776	32783	25 %	25 %	50 %	0 %	307069386
86	NC_014495	CTTC	2	8	32840	32847	0 %	50 %	0 %	50 %	307069386
87	NC_014495	ATTT	2	8	33022	33029	25 %	75 %	0 %	0 %	307069386
88	NC_014495	ATCA	2	8	33274	33281	50 %	25 %	0 %	25 %	307069386
89	NC_014495	GATC	2	8	33405	33412	25 %	25 %	25 %	25 %	307069386
90	NC_014495	ATTG	2	8	33553	33560	25 %	50 %	25 %	0 %	307069386
91	NC_014495	ATTG	2	8	33909	33916	25 %	50 %	25 %	0 %	307069386
92	NC_014495	TGGA	2	8	34067	34074	25 %	25 %	50 %	0 %	307069386
93	NC_014495	GTTG	2	8	34155	34162	0 %	50 %	50 %	0 %	307069386
94	NC_014495	AGAA	2	8	34231	34238	75 %	0 %	25 %	0 %	307069386
95	NC_014495	AGTT	2	8	34283	34290	25 %	50 %	25 %	0 %	307069387
96	NC_014495	TTCC	2	8	34292	34299	0 %	50 %	0 %	50 %	307069387
97	NC_014495	ATTG	2	8	34400	34407	25 %	50 %	25 %	0 %	307069387
98	NC_014495	TCAA	2	8	34616	34623	50 %	25 %	0 %	25 %	307069387
99	NC_014495	ACTC	2	8	34813	34820	25 %	25 %	0 %	50 %	307069387
100	NC_014495	TCTG	2	8	35229	35236	0 %	50 %	25 %	25 %	307069388
101	NC_014495	AGAA	2	8	35680	35687	75 %	0 %	25 %	0 %	307069389
102	NC_014495	TATT	2	8	35830	35837	25 %	75 %	0 %	0 %	307069389
103	NC_014495	AAGG	2	8	35871	35878	50 %	0 %	50 %	0 %	307069389
104	NC_014495	GATG	2	8	36173	36180	25 %	25 %	50 %	0 %	307069389
105	NC_014495	TCAA	2	8	36208	36215	50 %	25 %	0 %	25 %	307069389
106	NC_014495	GCCA	2	8	36428	36435	25 %	0 %	25 %	50 %	307069389
107	NC_014495	CATC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	0 %	50 %	307069389
108	NC_014495	AGTG	2	8	36992	36999	25 %	25 %	50 %	0 %	307069389
109	NC_014495	GCAA	2	8	37172	37179	50 %	0 %	25 %	25 %	307069389
110	NC_014495	GGTG	2	8	37190	37197	0 %	25 %	75 %	0 %	307069389
111	NC_014495	ATTA	2	8	37609	37616	50 %	50 %	0 %	0 %	307069389
112	NC_014495	GATT	2	8	38580	38587	25 %	50 %	25 %	0 %	307069391
113	NC_014495	CTTG	2	8	38619	38626	0 %	50 %	25 %	25 %	307069391
114	NC_014495	AAAC	2	8	38877	38884	75 %	0 %	0 %	25 %	307069392
115	NC_014495	GAAT	2	8	39424	39431	50 %	25 %	25 %	0 %	307069393
116	NC_014495	TTTG	2	8	39622	39629	0 %	75 %	25 %	0 %	307069393
117	NC_014495	GAAA	2	8	39780	39787	75 %	0 %	25 %	0 %	307069393
118	NC_014495	ATTA	2	8	39806	39813	50 %	50 %	0 %	0 %	307069393
119	NC_014495	ATTT	2	8	39866	39873	25 %	75 %	0 %	0 %	307069394
120	NC_014495	AAAG	2	8	39891	39898	75 %	0 %	25 %	0 %	307069394
121	NC_014495	CTTT	2	8	40511	40518	0 %	75 %	0 %	25 %	307069395
122	NC_014495	CTTG	2	8	40545	40552	0 %	50 %	25 %	25 %	307069395
123	NC_014495	ACAT	2	8	40700	40707	50 %	25 %	0 %	25 %	307069395
124	NC_014495	GAAT	2	8	41517	41524	50 %	25 %	25 %	0 %	307069397
125	NC_014495	GAAA	2	8	42606	42613	75 %	0 %	25 %	0 %	307069399
126	NC_014495	AAAT	2	8	42864	42871	75 %	25 %	0 %	0 %	307069399
127	NC_014495	TAGG	2	8	42993	43000	25 %	25 %	50 %	0 %	307069399
128	NC_014495	ATTT	2	8	43049	43056	25 %	75 %	0 %	0 %	307069399
129	NC_014495	ATAA	2	8	43239	43246	75 %	25 %	0 %	0 %	307069401
130	NC_014495	CTTT	2	8	43356	43363	0 %	75 %	0 %	25 %	307069401
131	NC_014495	TTGA	2	8	43687	43694	25 %	50 %	25 %	0 %	307069401
132	NC_014495	CTTT	2	8	43957	43964	0 %	75 %	0 %	25 %	307069401
133	NC_014495	TTTC	2	8	44141	44148	0 %	75 %	0 %	25 %	307069402
134	NC_014495	GTTT	2	8	44305	44312	0 %	75 %	25 %	0 %	307069402
135	NC_014495	CCTT	2	8	44348	44355	0 %	50 %	0 %	50 %	307069402
136	NC_014495	TTGT	2	8	45162	45169	0 %	75 %	25 %	0 %	307069403
137	NC_014495	TCAA	2	8	45618	45625	50 %	25 %	0 %	25 %	307069403
138	NC_014495	AATA	2	8	45711	45718	75 %	25 %	0 %	0 %	307069403
139	NC_014495	AATT	2	8	45837	45844	50 %	50 %	0 %	0 %	307069403
140	NC_014495	TATG	2	8	45987	45994	25 %	50 %	25 %	0 %	307069403
141	NC_014495	TAAT	2	8	46529	46536	50 %	50 %	0 %	0 %	307069403
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.