MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2755 plasmid pLM1-2bUG1

Total Repeats: 706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014495	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
2	NC_014495	AGC	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
3	NC_014495	AAG	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069351
4	NC_014495	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307069351
5	NC_014495	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069351
6	NC_014495	ACA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069351
7	NC_014495	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069351
8	NC_014495	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069351
9	NC_014495	CTT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069351
10	NC_014495	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069351
11	NC_014495	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069351
12	NC_014495	GCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
13	NC_014495	GAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069351
14	NC_014495	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069351
15	NC_014495	TTG	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069351
16	NC_014495	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069351
17	NC_014495	AGT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069351
18	NC_014495	ACA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069352
19	NC_014495	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069352
20	NC_014495	TAT	3	9	2406	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069353
21	NC_014495	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069353
22	NC_014495	TTA	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069353
23	NC_014495	TGG	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069353
24	NC_014495	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069353
25	NC_014495	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069353
26	NC_014495	ATT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069353
27	NC_014495	AAG	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069353
28	NC_014495	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069353
29	NC_014495	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069354
30	NC_014495	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069354
31	NC_014495	CTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069354
32	NC_014495	CGA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069354
33	NC_014495	TTC	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069354
34	NC_014495	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069354
35	NC_014495	AGA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069354
36	NC_014495	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069355
37	NC_014495	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069355
38	NC_014495	TCG	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307069355
39	NC_014495	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069355
40	NC_014495	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069355
41	NC_014495	TTG	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069355
42	NC_014495	CAT	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069355
43	NC_014495	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069356
44	NC_014495	TTC	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069356
45	NC_014495	TCT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069356
46	NC_014495	CTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069356
47	NC_014495	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307069356
48	NC_014495	GAC	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069356
49	NC_014495	TAC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069356
50	NC_014495	TAC	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069357
51	NC_014495	TTC	2	6	5511	5516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069357
52	NC_014495	AAT	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069357
53	NC_014495	TTC	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069357
54	NC_014495	AGG	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307069357
55	NC_014495	ATA	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069357
56	NC_014495	GTA	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069357
57	NC_014495	TGA	2	6	6372	6377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069359
58	NC_014495	TTC	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069359
59	NC_014495	CAA	2	6	6743	6748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069359
60	NC_014495	GAA	2	6	6769	6774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
61	NC_014495	TTC	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069360
62	NC_014495	ATC	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069360
63	NC_014495	ATT	2	6	6905	6910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069360
64	NC_014495	ATT	2	6	6920	6925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069360
65	NC_014495	GAT	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069360
66	NC_014495	GTA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069360
67	NC_014495	GAT	2	6	7225	7230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069360
68	NC_014495	GAA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
69	NC_014495	TGA	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069360
70	NC_014495	AAC	2	6	7359	7364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069360
71	NC_014495	AAT	2	6	7398	7403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069360
72	NC_014495	ACA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069360
73	NC_014495	GAA	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
74	NC_014495	GAA	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
75	NC_014495	ATT	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069360
76	NC_014495	CAA	2	6	7483	7488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069360
77	NC_014495	GAA	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
78	NC_014495	ATA	2	6	7577	7582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069360
79	NC_014495	AAG	2	6	7601	7606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
80	NC_014495	GCT	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307069360
81	NC_014495	GAA	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
82	NC_014495	GAA	2	6	7644	7649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069360
83	NC_014495	ATT	2	6	8076	8081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069361
84	NC_014495	TGC	2	6	8197	8202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307069361
85	NC_014495	GGA	2	6	8206	8211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307069361
86	NC_014495	ATC	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069361
87	NC_014495	AAG	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069361
88	NC_014495	ATC	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069361
89	NC_014495	ATT	2	6	8296	8301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069361
90	NC_014495	TAT	2	6	8433	8438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069362
91	NC_014495	AAC	2	6	8456	8461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069362
92	NC_014495	GAA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069362
93	NC_014495	TCA	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307069362
94	NC_014495	AGA	3	9	8667	8675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069362
95	NC_014495	ACG	2	6	8682	8687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069362
96	NC_014495	AAG	2	6	8714	8719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069362
97	NC_014495	CAG	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069363
98	NC_014495	TGA	2	6	8875	8880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069363
99	NC_014495	GAA	3	9	8927	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
100	NC_014495	AGA	3	9	8941	8949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
101	NC_014495	CAG	2	6	9036	9041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069363
102	NC_014495	ATA	3	9	9084	9092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069363
103	NC_014495	CAA	2	6	9191	9196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069363
104	NC_014495	AGA	2	6	9232	9237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
105	NC_014495	AGC	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069363
106	NC_014495	CAA	2	6	9414	9419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069363
107	NC_014495	GTG	2	6	9462	9467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069363
108	NC_014495	TGA	2	6	9484	9489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069363
109	NC_014495	CTT	2	6	9506	9511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069363
110	NC_014495	AAG	2	6	9531	9536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
111	NC_014495	AGA	2	6	9547	9552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
112	NC_014495	GGT	2	6	9646	9651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307069363
113	NC_014495	ATT	2	6	9669	9674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069363
114	NC_014495	GCA	2	6	9679	9684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069363
115	NC_014495	AGA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
116	NC_014495	GCA	2	6	9739	9744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069363
117	NC_014495	TTC	2	6	9834	9839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307069363
118	NC_014495	ATT	2	6	9891	9896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069363
119	NC_014495	CAG	2	6	9902	9907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069363
120	NC_014495	GAA	2	6	10036	10041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
121	NC_014495	GAA	2	6	10055	10060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069363
122	NC_014495	GAT	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069364
123	NC_014495	AAG	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069364
124	NC_014495	AGT	3	9	10241	10249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307069364
125	NC_014495	GAC	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069364
126	NC_014495	AGG	2	6	10323	10328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307069364
127	NC_014495	GAA	2	6	10335	10340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307069364
128	NC_014495	ATT	2	6	10377	10382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069364
129	NC_014495	AGC	2	6	10437	10442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307069364
130	NC_014495	AAT	2	6	10503	10508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307069365
131	NC_014495	TAT	2	6	10620	10625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069365
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134	NC_014495	CAA	2	6	10885	10890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307069365
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256	NC_014495	ATT	2	6	19676	19681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069377
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385	NC_014495	TAT	2	6	29803	29808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307069383
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500	NC_014495	AGG	2	6	39139	39144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307069392

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