MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 1893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	CA	3	6	672	677	50 %	0 %	0 %	50 %	301065126
2	NC_014334	GC	3	6	1180	1185	0 %	0 %	50 %	50 %	301065126
3	NC_014334	GC	4	8	5930	5937	0 %	0 %	50 %	50 %	301065130
4	NC_014334	GC	3	6	6104	6109	0 %	0 %	50 %	50 %	301065130
5	NC_014334	GC	3	6	7384	7389	0 %	0 %	50 %	50 %	301065132
6	NC_014334	AT	3	6	8395	8400	50 %	50 %	0 %	0 %	301065132
7	NC_014334	AT	3	6	9533	9538	50 %	50 %	0 %	0 %	301065133
8	NC_014334	GC	3	6	11495	11500	0 %	0 %	50 %	50 %	301065134
9	NC_014334	TG	3	6	12122	12127	0 %	50 %	50 %	0 %	301065134
10	NC_014334	GT	3	6	12625	12630	0 %	50 %	50 %	0 %	301065136
11	NC_014334	TG	3	6	13512	13517	0 %	50 %	50 %	0 %	301065138
12	NC_014334	AT	3	6	14113	14118	50 %	50 %	0 %	0 %	301065139
13	NC_014334	CA	3	6	15593	15598	50 %	0 %	0 %	50 %	301065140
14	NC_014334	AC	3	6	20282	20287	50 %	0 %	0 %	50 %	301065145
15	NC_014334	GA	3	6	23549	23554	50 %	0 %	50 %	0 %	301065150
16	NC_014334	GC	3	6	24412	24417	0 %	0 %	50 %	50 %	301065150
17	NC_014334	GC	3	6	24462	24467	0 %	0 %	50 %	50 %	301065150
18	NC_014334	AT	3	6	26240	26245	50 %	50 %	0 %	0 %	301065151
19	NC_014334	TG	3	6	27441	27446	0 %	50 %	50 %	0 %	301065153
20	NC_014334	GT	3	6	28666	28671	0 %	50 %	50 %	0 %	301065155
21	NC_014334	TC	3	6	29175	29180	0 %	50 %	0 %	50 %	301065156
22	NC_014334	TA	3	6	29479	29484	50 %	50 %	0 %	0 %	301065156
23	NC_014334	AT	3	6	30500	30505	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
24	NC_014334	AT	3	6	30725	30730	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
25	NC_014334	CG	3	6	33511	33516	0 %	0 %	50 %	50 %	301065159
26	NC_014334	TG	3	6	35547	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	301065162
27	NC_014334	GT	3	6	35682	35687	0 %	50 %	50 %	0 %	301065162
28	NC_014334	CT	3	6	35973	35978	0 %	50 %	0 %	50 %	301065162
29	NC_014334	CG	3	6	36085	36090	0 %	0 %	50 %	50 %	301065162
30	NC_014334	TC	3	6	37714	37719	0 %	50 %	0 %	50 %	301065164
31	NC_014334	CG	3	6	41054	41059	0 %	0 %	50 %	50 %	301065167
32	NC_014334	TG	3	6	41629	41634	0 %	50 %	50 %	0 %	301065168
33	NC_014334	CG	3	6	43250	43255	0 %	0 %	50 %	50 %	301065171
34	NC_014334	AT	3	6	43745	43750	50 %	50 %	0 %	0 %	301065172
35	NC_014334	TC	3	6	46256	46261	0 %	50 %	0 %	50 %	301065175
36	NC_014334	GA	4	8	48776	48783	50 %	0 %	50 %	0 %	301065179
37	NC_014334	CA	3	6	54086	54091	50 %	0 %	0 %	50 %	301065187
38	NC_014334	CT	3	6	54857	54862	0 %	50 %	0 %	50 %	301065187
39	NC_014334	GA	3	6	57042	57047	50 %	0 %	50 %	0 %	301065189
40	NC_014334	CA	3	6	58730	58735	50 %	0 %	0 %	50 %	301065190
41	NC_014334	AG	3	6	59881	59886	50 %	0 %	50 %	0 %	301065191
42	NC_014334	AG	3	6	60345	60350	50 %	0 %	50 %	0 %	301065191
43	NC_014334	GA	3	6	63959	63964	50 %	0 %	50 %	0 %	301065194
44	NC_014334	TG	3	6	64502	64507	0 %	50 %	50 %	0 %	301065194
45	NC_014334	CT	3	6	64676	64681	0 %	50 %	0 %	50 %	301065194
46	NC_014334	CT	3	6	65065	65070	0 %	50 %	0 %	50 %	301065195
47	NC_014334	TG	3	6	69339	69344	0 %	50 %	50 %	0 %	301065200
48	NC_014334	TG	3	6	70297	70302	0 %	50 %	50 %	0 %	301065201
49	NC_014334	AG	3	6	70524	70529	50 %	0 %	50 %	0 %	301065201
50	NC_014334	AG	3	6	71109	71114	50 %	0 %	50 %	0 %	301065202
51	NC_014334	AT	3	6	71120	71125	50 %	50 %	0 %	0 %	301065202
52	NC_014334	CG	3	6	71870	71875	0 %	0 %	50 %	50 %	301065204
53	NC_014334	TA	3	6	80276	80281	50 %	50 %	0 %	0 %	301065214
54	NC_014334	CG	3	6	84677	84682	0 %	0 %	50 %	50 %	301065217
55	NC_014334	GT	3	6	85614	85619	0 %	50 %	50 %	0 %	301065219
56	NC_014334	CA	3	6	86463	86468	50 %	0 %	0 %	50 %	301065220
57	NC_014334	GC	3	6	88454	88459	0 %	0 %	50 %	50 %	301065222
58	NC_014334	TC	3	6	90339	90344	0 %	50 %	0 %	50 %	301065224
59	NC_014334	AT	3	6	91003	91008	50 %	50 %	0 %	0 %	301065226
60	NC_014334	TA	3	6	91249	91254	50 %	50 %	0 %	0 %	301065227
61	NC_014334	TG	3	6	92878	92883	0 %	50 %	50 %	0 %	301065228
62	NC_014334	CA	3	6	93003	93008	50 %	0 %	0 %	50 %	301065228
63	NC_014334	GC	3	6	95903	95908	0 %	0 %	50 %	50 %	301065231
64	NC_014334	GC	3	6	97049	97054	0 %	0 %	50 %	50 %	301065232
65	NC_014334	GC	3	6	98204	98209	0 %	0 %	50 %	50 %	301065233
66	NC_014334	GC	3	6	98444	98449	0 %	0 %	50 %	50 %	301065233
67	NC_014334	GC	3	6	99740	99745	0 %	0 %	50 %	50 %	301065234
68	NC_014334	TG	3	6	101002	101007	0 %	50 %	50 %	0 %	301065235
69	NC_014334	AT	3	6	104353	104358	50 %	50 %	0 %	0 %	301065240
70	NC_014334	TA	3	6	104643	104648	50 %	50 %	0 %	0 %	301065240
71	NC_014334	GA	3	6	106745	106750	50 %	0 %	50 %	0 %	301065241
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73	NC_014334	CG	3	6	112569	112574	0 %	0 %	50 %	50 %	301065246
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79	NC_014334	CA	4	8	124022	124029	50 %	0 %	0 %	50 %	301065254
80	NC_014334	GC	3	6	125947	125952	0 %	0 %	50 %	50 %	301065255
81	NC_014334	CG	3	6	126974	126979	0 %	0 %	50 %	50 %	301065256
82	NC_014334	GC	3	6	127173	127178	0 %	0 %	50 %	50 %	301065256
83	NC_014334	AC	3	6	128068	128073	50 %	0 %	0 %	50 %	301065256
84	NC_014334	AG	3	6	128739	128744	50 %	0 %	50 %	0 %	301065256
85	NC_014334	CA	3	6	129157	129162	50 %	0 %	0 %	50 %	301065257
86	NC_014334	CG	3	6	132100	132105	0 %	0 %	50 %	50 %	301065260
87	NC_014334	CG	3	6	132599	132604	0 %	0 %	50 %	50 %	301065260
88	NC_014334	GA	3	6	133503	133508	50 %	0 %	50 %	0 %	301065261
89	NC_014334	AT	3	6	133619	133624	50 %	50 %	0 %	0 %	301065261
90	NC_014334	GC	3	6	136144	136149	0 %	0 %	50 %	50 %	301065265
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92	NC_014334	AG	3	6	141218	141223	50 %	0 %	50 %	0 %	301065269
93	NC_014334	CA	3	6	142755	142760	50 %	0 %	0 %	50 %	301065270
94	NC_014334	GC	3	6	144841	144846	0 %	0 %	50 %	50 %	301065271
95	NC_014334	AG	3	6	147513	147518	50 %	0 %	50 %	0 %	301065274
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99	NC_014334	AC	3	6	152905	152910	50 %	0 %	0 %	50 %	301065281
100	NC_014334	TG	3	6	154482	154487	0 %	50 %	50 %	0 %	301065283
101	NC_014334	CA	3	6	156655	156660	50 %	0 %	0 %	50 %	301065286
102	NC_014334	GC	3	6	156765	156770	0 %	0 %	50 %	50 %	301065286
103	NC_014334	AT	3	6	157213	157218	50 %	50 %	0 %	0 %	301065287
104	NC_014334	AC	3	6	158584	158589	50 %	0 %	0 %	50 %	301065287
105	NC_014334	CG	3	6	160030	160035	0 %	0 %	50 %	50 %	301065290
106	NC_014334	AG	3	6	160740	160745	50 %	0 %	50 %	0 %	301065291
107	NC_014334	CT	3	6	162825	162830	0 %	50 %	0 %	50 %	301065293
108	NC_014334	AT	3	6	162885	162890	50 %	50 %	0 %	0 %	301065293
109	NC_014334	AT	3	6	164125	164130	50 %	50 %	0 %	0 %	301065294
110	NC_014334	AT	3	6	164803	164808	50 %	50 %	0 %	0 %	301065294
111	NC_014334	TA	3	6	165549	165554	50 %	50 %	0 %	0 %	301065295
112	NC_014334	GT	3	6	167022	167027	0 %	50 %	50 %	0 %	301065296
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118	NC_014334	CG	3	6	178965	178970	0 %	0 %	50 %	50 %	301065308
119	NC_014334	CG	3	6	180594	180599	0 %	0 %	50 %	50 %	301065310
120	NC_014334	CA	3	6	181045	181050	50 %	0 %	0 %	50 %	301065310
121	NC_014334	GC	3	6	182022	182027	0 %	0 %	50 %	50 %	301065311
122	NC_014334	GT	3	6	183364	183369	0 %	50 %	50 %	0 %	301065312
123	NC_014334	AG	3	6	183761	183766	50 %	0 %	50 %	0 %	301065313
124	NC_014334	TG	3	6	184364	184369	0 %	50 %	50 %	0 %	301065313
125	NC_014334	GT	3	6	184791	184796	0 %	50 %	50 %	0 %	301065313
126	NC_014334	CG	3	6	184859	184864	0 %	0 %	50 %	50 %	301065313
127	NC_014334	GT	3	6	190682	190687	0 %	50 %	50 %	0 %	301065319
128	NC_014334	GT	3	6	195791	195796	0 %	50 %	50 %	0 %	301065323
129	NC_014334	AC	3	6	197095	197100	50 %	0 %	0 %	50 %	301065323
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131	NC_014334	TC	3	6	199388	199393	0 %	50 %	0 %	50 %	301065324
132	NC_014334	GC	3	6	201550	201555	0 %	0 %	50 %	50 %	301065328
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139	NC_014334	TG	3	6	207004	207009	0 %	50 %	50 %	0 %	301065332
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