MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 1517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	CAAAC	2	10	580	589	60 %	0 %	0 %	40 %	301065126
2	NC_014334	CAACG	2	10	1693	1702	40 %	0 %	20 %	40 %	301065127
3	NC_014334	GAAGA	2	10	6740	6749	60 %	0 %	40 %	0 %	301065132
4	NC_014334	GGCAC	2	10	7226	7235	20 %	0 %	40 %	40 %	301065132
5	NC_014334	GACAA	2	10	7500	7509	60 %	0 %	20 %	20 %	301065132
6	NC_014334	GAAAA	2	10	9585	9594	80 %	0 %	20 %	0 %	301065133
7	NC_014334	CATTT	2	10	11825	11834	20 %	60 %	0 %	20 %	301065134
8	NC_014334	ATTGA	2	10	19388	19397	40 %	40 %	20 %	0 %	301065144
9	NC_014334	CAACC	2	10	20721	20730	40 %	0 %	0 %	60 %	301065146
10	NC_014334	TGGCT	2	10	22309	22318	0 %	40 %	40 %	20 %	301065149
11	NC_014334	GCTTT	2	10	23861	23870	0 %	60 %	20 %	20 %	301065150
12	NC_014334	CAGCG	2	10	24508	24517	20 %	0 %	40 %	40 %	301065150
13	NC_014334	TCCTG	2	10	27433	27442	0 %	40 %	20 %	40 %	301065153
14	NC_014334	TTGTT	2	10	28222	28231	0 %	80 %	20 %	0 %	301065154
15	NC_014334	AAGCC	2	10	32808	32817	40 %	0 %	20 %	40 %	301065158
16	NC_014334	CAAAG	2	10	33652	33661	60 %	0 %	20 %	20 %	301065159
17	NC_014334	AGCGA	2	10	41914	41923	40 %	0 %	40 %	20 %	301065168
18	NC_014334	TTTCT	2	10	42161	42170	0 %	80 %	0 %	20 %	301065169
19	NC_014334	GTTTG	2	10	47806	47815	0 %	60 %	40 %	0 %	301065177
20	NC_014334	TGGAT	2	10	47871	47880	20 %	40 %	40 %	0 %	301065177
21	NC_014334	GAAAA	2	10	50164	50173	80 %	0 %	20 %	0 %	301065182
22	NC_014334	TTGAA	2	10	50589	50598	40 %	40 %	20 %	0 %	301065182
23	NC_014334	ATAAA	2	10	50735	50744	80 %	20 %	0 %	0 %	301065182
24	NC_014334	TCAAT	2	10	51600	51609	40 %	40 %	0 %	20 %	301065183
25	NC_014334	ATGAA	2	10	52350	52359	60 %	20 %	20 %	0 %	301065184
26	NC_014334	TTTCT	2	10	54512	54521	0 %	80 %	0 %	20 %	301065187
27	NC_014334	TTCTT	2	10	55460	55469	0 %	80 %	0 %	20 %	301065188
28	NC_014334	TGTTT	2	10	58622	58631	0 %	80 %	20 %	0 %	301065190
29	NC_014334	TGATC	2	10	62613	62622	20 %	40 %	20 %	20 %	301065194
30	NC_014334	CAGTT	2	10	65112	65121	20 %	40 %	20 %	20 %	301065195
31	NC_014334	TTGAT	2	10	72136	72145	20 %	60 %	20 %	0 %	301065204
32	NC_014334	TTGCT	2	10	72229	72238	0 %	60 %	20 %	20 %	301065204
33	NC_014334	CGTTT	2	10	74129	74138	0 %	60 %	20 %	20 %	301065206
34	NC_014334	TAAGT	2	10	77987	77996	40 %	40 %	20 %	0 %	301065211
35	NC_014334	TCATC	2	10	79536	79545	20 %	40 %	0 %	40 %	301065213
36	NC_014334	TGGCA	2	10	83193	83202	20 %	20 %	40 %	20 %	301065216
37	NC_014334	GTTTC	2	10	85974	85983	0 %	60 %	20 %	20 %	301065219
38	NC_014334	TGTGC	2	10	87100	87109	0 %	40 %	40 %	20 %	301065220
39	NC_014334	AAATA	2	10	87554	87563	80 %	20 %	0 %	0 %	301065221
40	NC_014334	TGCTT	2	10	88171	88180	0 %	60 %	20 %	20 %	301065221
41	NC_014334	ATCCA	2	10	88634	88643	40 %	20 %	0 %	40 %	301065222
42	NC_014334	AACCA	2	10	89009	89018	60 %	0 %	0 %	40 %	301065222
43	NC_014334	TACTC	2	10	91304	91313	20 %	40 %	0 %	40 %	301065227
44	NC_014334	GGAAC	2	10	92659	92668	40 %	0 %	40 %	20 %	301065228
45	NC_014334	GGTTG	2	10	92844	92853	0 %	40 %	60 %	0 %	301065228
46	NC_014334	CCAAC	2	10	93659	93668	40 %	0 %	0 %	60 %	301065229
47	NC_014334	TCCCA	2	10	94706	94715	20 %	20 %	0 %	60 %	301065230
48	NC_014334	GCTTT	2	10	98347	98356	0 %	60 %	20 %	20 %	301065233
49	NC_014334	ATTGA	2	10	101601	101610	40 %	40 %	20 %	0 %	301065235
50	NC_014334	CAAAA	2	10	104275	104284	80 %	0 %	0 %	20 %	301065240
51	NC_014334	ATTTC	2	10	104801	104810	20 %	60 %	0 %	20 %	301065240
52	NC_014334	GAAGA	2	10	111127	111136	60 %	0 %	40 %	0 %	301065245
53	NC_014334	GAAAA	2	10	111145	111154	80 %	0 %	20 %	0 %	301065245
54	NC_014334	CAAAG	2	10	111211	111220	60 %	0 %	20 %	20 %	301065245
55	NC_014334	TGACA	2	10	118268	118277	40 %	20 %	20 %	20 %	301065250
56	NC_014334	GTTTT	2	10	119851	119860	0 %	80 %	20 %	0 %	301065252
57	NC_014334	AGACC	2	10	123051	123060	40 %	0 %	20 %	40 %	301065253
58	NC_014334	GCTTC	2	10	123151	123160	0 %	40 %	20 %	40 %	301065253
59	NC_014334	CGGCC	2	10	125681	125690	0 %	0 %	40 %	60 %	301065255
60	NC_014334	CGTCA	2	10	125993	126002	20 %	20 %	20 %	40 %	301065255
61	NC_014334	CTCAA	2	10	126264	126273	40 %	20 %	0 %	40 %	301065255
62	NC_014334	ACCAA	2	10	126535	126544	60 %	0 %	0 %	40 %	301065255
63	NC_014334	CAAGT	2	10	127495	127504	40 %	20 %	20 %	20 %	301065256
64	NC_014334	GACCC	2	10	128943	128952	20 %	0 %	20 %	60 %	301065257
65	NC_014334	TTGGC	2	10	131047	131056	0 %	40 %	40 %	20 %	301065258
66	NC_014334	TGTGT	2	10	132584	132593	0 %	60 %	40 %	0 %	301065260
67	NC_014334	ATACT	2	10	139397	139406	40 %	40 %	0 %	20 %	301065267
68	NC_014334	AGCCA	2	10	142800	142809	40 %	0 %	20 %	40 %	301065270
69	NC_014334	TGATC	2	10	144395	144404	20 %	40 %	20 %	20 %	301065271
70	NC_014334	CATGC	2	10	145525	145534	20 %	20 %	20 %	40 %	301065272
71	NC_014334	CGATC	2	10	150708	150717	20 %	20 %	20 %	40 %	301065278
72	NC_014334	ATTTG	2	10	153488	153497	20 %	60 %	20 %	0 %	301065281
73	NC_014334	AAAGC	2	10	156772	156781	60 %	0 %	20 %	20 %	301065286
74	NC_014334	GGGAT	2	10	157934	157943	20 %	20 %	60 %	0 %	301065287
75	NC_014334	GCTCA	2	10	158269	158278	20 %	20 %	20 %	40 %	301065287
76	NC_014334	AGTCG	2	10	163122	163131	20 %	20 %	40 %	20 %	301065293
77	NC_014334	ATATT	2	10	163791	163800	40 %	60 %	0 %	0 %	301065293
78	NC_014334	TGAAC	2	10	163807	163816	40 %	20 %	20 %	20 %	301065293
79	NC_014334	ATTAC	2	10	166059	166068	40 %	40 %	0 %	20 %	301065295
80	NC_014334	GTCTT	2	10	166934	166943	0 %	60 %	20 %	20 %	301065296
81	NC_014334	TTGGC	2	10	166973	166982	0 %	40 %	40 %	20 %	301065296
82	NC_014334	TTTTC	2	10	170504	170513	0 %	80 %	0 %	20 %	301065300
83	NC_014334	CAAGC	2	10	171894	171903	40 %	0 %	20 %	40 %	301065301
84	NC_014334	AATGA	2	10	173194	173203	60 %	20 %	20 %	0 %	301065302
85	NC_014334	CCAAC	2	10	173762	173771	40 %	0 %	0 %	60 %	301065303
86	NC_014334	GCCTT	2	10	175653	175662	0 %	40 %	20 %	40 %	301065305
87	NC_014334	GTAAG	2	10	179789	179798	40 %	20 %	40 %	0 %	301065309
88	NC_014334	CACAA	2	10	181223	181232	60 %	0 %	0 %	40 %	301065310
89	NC_014334	GACCA	2	10	183338	183347	40 %	0 %	20 %	40 %	301065312
90	NC_014334	TGGTC	2	10	183792	183801	0 %	40 %	40 %	20 %	301065313
91	NC_014334	AAAAG	2	10	185276	185285	80 %	0 %	20 %	0 %	301065314
92	NC_014334	TGAAT	2	10	188187	188196	40 %	40 %	20 %	0 %	301065316
93	NC_014334	ATCAA	2	10	189640	189649	60 %	20 %	0 %	20 %	301065318
94	NC_014334	CCGTC	2	10	190409	190418	0 %	20 %	20 %	60 %	301065319
95	NC_014334	AGTTG	2	10	191422	191431	20 %	40 %	40 %	0 %	301065319
96	NC_014334	CCGTT	2	10	193688	193697	0 %	40 %	20 %	40 %	301065321
97	NC_014334	CCAAC	2	10	196097	196106	40 %	0 %	0 %	60 %	301065323
98	NC_014334	GAACC	2	10	197348	197357	40 %	0 %	20 %	40 %	301065323
99	NC_014334	TGAAG	2	10	198746	198755	40 %	20 %	40 %	0 %	301065324
100	NC_014334	CAGCC	2	10	199658	199667	20 %	0 %	20 %	60 %	301065324
101	NC_014334	GCGGT	2	10	200791	200800	0 %	20 %	60 %	20 %	301065327
102	NC_014334	TCCTT	2	10	203530	203539	0 %	60 %	0 %	40 %	301065330
103	NC_014334	GTTGA	2	10	208292	208301	20 %	40 %	40 %	0 %	301065333
104	NC_014334	CGTTG	2	10	210517	210526	0 %	40 %	40 %	20 %	301065335
105	NC_014334	AGATG	2	10	211493	211502	40 %	20 %	40 %	0 %	301065336
106	NC_014334	TTCAT	2	10	213980	213989	20 %	60 %	0 %	20 %	301065340
107	NC_014334	GGCAT	2	10	216884	216893	20 %	20 %	40 %	20 %	301065345
108	NC_014334	CGGCA	2	10	217488	217497	20 %	0 %	40 %	40 %	301065346
109	NC_014334	GCCAA	2	10	222474	222483	40 %	0 %	20 %	40 %	301065354
110	NC_014334	CTGGG	2	10	225241	225250	0 %	20 %	60 %	20 %	301065358
111	NC_014334	ACTTC	2	10	227403	227412	20 %	40 %	0 %	40 %	301065360
112	NC_014334	GTAGA	2	10	227849	227858	40 %	20 %	40 %	0 %	301065361
113	NC_014334	CGTCA	2	10	233618	233627	20 %	20 %	20 %	40 %	301065367
114	NC_014334	TCAAT	2	10	233742	233751	40 %	40 %	0 %	20 %	301065367
115	NC_014334	AAATC	2	10	240622	240631	60 %	20 %	0 %	20 %	301065373
116	NC_014334	TGGAA	2	10	241687	241696	40 %	20 %	40 %	0 %	301065374
117	NC_014334	CAGAA	2	10	242191	242200	60 %	0 %	20 %	20 %	301065374
118	NC_014334	ATTTG	2	10	245416	245425	20 %	60 %	20 %	0 %	301065377
119	NC_014334	AAATG	2	10	248845	248854	60 %	20 %	20 %	0 %	301065379
120	NC_014334	CAAAA	2	10	249365	249374	80 %	0 %	0 %	20 %	301065379
121	NC_014334	ACTGG	2	10	249557	249566	20 %	20 %	40 %	20 %	301065380
122	NC_014334	CCATG	2	10	250761	250770	20 %	20 %	20 %	40 %	301065381
123	NC_014334	GAGTC	2	10	252527	252536	20 %	20 %	40 %	20 %	301065383
124	NC_014334	ACTCA	2	10	253500	253509	40 %	20 %	0 %	40 %	301065384
125	NC_014334	ATTTG	2	10	254146	254155	20 %	60 %	20 %	0 %	301065385
126	NC_014334	TTTGA	2	10	258039	258048	20 %	60 %	20 %	0 %	301065387
127	NC_014334	AGTTG	2	10	260805	260814	20 %	40 %	40 %	0 %	301065391
128	NC_014334	TGATT	2	10	261584	261593	20 %	60 %	20 %	0 %	301065392
129	NC_014334	TGTCA	2	10	261828	261837	20 %	40 %	20 %	20 %	301065392
130	NC_014334	TGATC	2	10	265632	265641	20 %	40 %	20 %	20 %	301065395
131	NC_014334	AACTT	2	10	267651	267660	40 %	40 %	0 %	20 %	301065396
132	NC_014334	CAAAC	2	10	271318	271327	60 %	0 %	0 %	40 %	301065400
133	NC_014334	GATCG	2	10	272582	272591	20 %	20 %	40 %	20 %	301065402
134	NC_014334	AGATC	2	10	274688	274697	40 %	20 %	20 %	20 %	301065403
135	NC_014334	GCACT	2	10	274921	274930	20 %	20 %	20 %	40 %	301065403
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138	NC_014334	ATGGC	2	10	284529	284538	20 %	20 %	40 %	20 %	301065409
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141	NC_014334	ACATG	2	10	287418	287427	40 %	20 %	20 %	20 %	301065412
142	NC_014334	ATGGC	2	10	287751	287760	20 %	20 %	40 %	20 %	301065413
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165	NC_014334	GCACA	2	10	330356	330365	40 %	0 %	20 %	40 %	301065453
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169	NC_014334	CAGAT	2	10	332456	332465	40 %	20 %	20 %	20 %	301065456
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251	NC_014334	ACAAT	2	10	485115	485124	60 %	20 %	0 %	20 %	301065602
252	NC_014334	TTAAC	2	10	486780	486789	40 %	40 %	0 %	20 %	301065602
253	NC_014334	AGCGT	2	10	487538	487547	20 %	20 %	40 %	20 %	301065602
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255	NC_014334	AATTA	2	10	491766	491775	60 %	40 %	0 %	0 %	301065607
256	NC_014334	TGATT	2	10	493469	493478	20 %	60 %	20 %	0 %	301065608
257	NC_014334	TAAAA	2	10	495602	495611	80 %	20 %	0 %	0 %	301065610
258	NC_014334	AGCCA	2	10	497514	497523	40 %	0 %	20 %	40 %	301065612
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260	NC_014334	TTTTG	2	10	499661	499670	0 %	80 %	20 %	0 %	301065614
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262	NC_014334	GTTCC	2	10	502014	502023	0 %	40 %	20 %	40 %	301065615
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384	NC_014334	GTTCC	2	10	713901	713910	0 %	40 %	20 %	40 %	301065822
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389	NC_014334	TTGAT	2	10	727696	727705	20 %	60 %	20 %	0 %	301065835
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