MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014334	TGGA	2	8	94140	94147	25 %	25 %	50 %	0 %	301065229
1502	NC_014334	GCA	2	6	94177	94182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065229
1503	NC_014334	CAC	2	6	94379	94384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065229
1504	NC_014334	CAA	2	6	94394	94399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065229
1505	NC_014334	CTG	2	6	94472	94477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065230
1506	NC_014334	TGGC	2	8	94479	94486	0 %	25 %	50 %	25 %	301065230
1507	NC_014334	GTA	2	6	94495	94500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065230
1508	NC_014334	TTGG	2	8	94551	94558	0 %	50 %	50 %	0 %	301065230
1509	NC_014334	GCC	2	6	94584	94589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065230
1510	NC_014334	GGC	2	6	94616	94621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065230
1511	NC_014334	GCG	2	6	94650	94655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065230
1512	NC_014334	TCCCA	2	10	94706	94715	20 %	20 %	0 %	60 %	301065230
1513	NC_014334	CGT	2	6	94771	94776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065230
1514	NC_014334	ATG	2	6	94791	94796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065230
1515	NC_014334	TGT	2	6	94906	94911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065230
1516	NC_014334	GCA	2	6	94938	94943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065230
1517	NC_014334	TTG	2	6	94983	94988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065230
1518	NC_014334	TAA	2	6	94989	94994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065230
1519	NC_014334	ACA	2	6	94998	95003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065230
1520	NC_014334	GGC	2	6	95051	95056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065230
1521	NC_014334	GTT	2	6	95069	95074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065230
1522	NC_014334	T	6	6	95143	95148	0 %	100 %	0 %	0 %	301065230
1523	NC_014334	GGT	2	6	95177	95182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065230
1524	NC_014334	CGA	2	6	95188	95193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065230
1525	NC_014334	TCG	2	6	95259	95264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065230
1526	NC_014334	ATG	2	6	95313	95318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065230
1527	NC_014334	CGG	2	6	95499	95504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065231
1528	NC_014334	ATAG	2	8	95613	95620	50 %	25 %	25 %	0 %	301065231
1529	NC_014334	ATC	2	6	95674	95679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065231
1530	NC_014334	TCA	2	6	95682	95687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065231
1531	NC_014334	ATT	2	6	95716	95721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065231
1532	NC_014334	TAG	2	6	95732	95737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065231
1533	NC_014334	GGC	2	6	95779	95784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065231
1534	NC_014334	GTT	2	6	95811	95816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065231
1535	NC_014334	CTG	3	9	95830	95838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065231
1536	NC_014334	GC	3	6	95903	95908	0 %	0 %	50 %	50 %	301065231
1537	NC_014334	CTGA	2	8	95974	95981	25 %	25 %	25 %	25 %	301065231
1538	NC_014334	GCC	3	9	95990	95998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065231
1539	NC_014334	GCA	2	6	96029	96034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065231
1540	NC_014334	TCA	2	6	96152	96157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065231
1541	NC_014334	GCC	2	6	96202	96207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065231
1542	NC_014334	GAA	2	6	96232	96237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065231
1543	NC_014334	T	6	6	96366	96371	0 %	100 %	0 %	0 %	301065231
1544	NC_014334	GCGT	2	8	96527	96534	0 %	25 %	50 %	25 %	301065231
1545	NC_014334	GGC	2	6	96576	96581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065231
1546	NC_014334	TGA	2	6	96588	96593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065231
1547	NC_014334	CTTC	2	8	96600	96607	0 %	50 %	0 %	50 %	301065231
1548	NC_014334	TCG	2	6	96633	96638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065232
1549	NC_014334	TGA	2	6	96679	96684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065232
1550	NC_014334	CAG	2	6	96745	96750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065232
1551	NC_014334	CGA	2	6	96901	96906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065232
1552	NC_014334	CCA	2	6	96915	96920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065232
1553	NC_014334	CAT	2	6	96986	96991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065232
1554	NC_014334	AAT	2	6	97028	97033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065232
1555	NC_014334	GC	3	6	97049	97054	0 %	0 %	50 %	50 %	301065232
1556	NC_014334	GCC	2	6	97059	97064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065232
1557	NC_014334	CGGC	2	8	97095	97102	0 %	0 %	50 %	50 %	301065232
1558	NC_014334	CAA	2	6	97108	97113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065232
1559	NC_014334	T	6	6	97133	97138	0 %	100 %	0 %	0 %	301065232
1560	NC_014334	T	7	7	97267	97273	0 %	100 %	0 %	0 %	301065232
1561	NC_014334	TGG	2	6	97285	97290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065232
1562	NC_014334	T	6	6	97297	97302	0 %	100 %	0 %	0 %	301065232
1563	NC_014334	CCT	2	6	97328	97333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065233
1564	NC_014334	GCT	2	6	97373	97378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065233
1565	NC_014334	GCG	2	6	97387	97392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065233
1566	NC_014334	CGG	2	6	97475	97480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065233
1567	NC_014334	ACA	2	6	97540	97545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065233
1568	NC_014334	CAT	2	6	97580	97585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065233
1569	NC_014334	GCA	2	6	97645	97650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065233
1570	NC_014334	TGGC	2	8	97832	97839	0 %	25 %	50 %	25 %	301065233
1571	NC_014334	TGG	2	6	97905	97910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065233
1572	NC_014334	CTTG	2	8	97922	97929	0 %	50 %	25 %	25 %	301065233
1573	NC_014334	GCC	3	9	97947	97955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065233
1574	NC_014334	TTA	2	6	97999	98004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065233
1575	NC_014334	GCA	2	6	98012	98017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065233
1576	NC_014334	GAT	2	6	98096	98101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065233
1577	NC_014334	GGC	2	6	98121	98126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065233
1578	NC_014334	GC	3	6	98204	98209	0 %	0 %	50 %	50 %	301065233
1579	NC_014334	ATC	2	6	98268	98273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065233
1580	NC_014334	ATG	2	6	98305	98310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065233
1581	NC_014334	GCTTT	2	10	98347	98356	0 %	60 %	20 %	20 %	301065233
1582	NC_014334	TGT	2	6	98357	98362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065233
1583	NC_014334	CCG	2	6	98378	98383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065233
1584	NC_014334	CCG	2	6	98422	98427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065233
1585	NC_014334	GC	3	6	98444	98449	0 %	0 %	50 %	50 %	301065233
1586	NC_014334	CTT	2	6	98528	98533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065233
1587	NC_014334	CTGG	2	8	98619	98626	0 %	25 %	50 %	25 %	301065233
1588	NC_014334	CCG	2	6	98635	98640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065233
1589	NC_014334	CGTG	2	8	99391	99398	0 %	25 %	50 %	25 %	301065234
1590	NC_014334	TTG	2	6	99594	99599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065234
1591	NC_014334	GAT	2	6	99632	99637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065234
1592	NC_014334	GAA	2	6	99671	99676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065234
1593	NC_014334	ATT	2	6	99717	99722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065234
1594	NC_014334	GC	3	6	99740	99745	0 %	0 %	50 %	50 %	301065234
1595	NC_014334	ATC	2	6	99846	99851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065234
1596	NC_014334	ATG	2	6	99855	99860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065234
1597	NC_014334	CGA	2	6	99902	99907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065234
1598	NC_014334	GTG	2	6	99978	99983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065234
1599	NC_014334	GCT	2	6	100067	100072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065234
1600	NC_014334	GTG	2	6	100082	100087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065234
1601	NC_014334	GGC	2	6	100145	100150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065234
1602	NC_014334	ATG	2	6	100164	100169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065234
1603	NC_014334	ATC	2	6	100224	100229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065234
1604	NC_014334	CTG	2	6	100230	100235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065234
1605	NC_014334	TGA	2	6	100429	100434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065234
1606	NC_014334	ATT	2	6	100442	100447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065234
1607	NC_014334	GAT	2	6	100451	100456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065234
1608	NC_014334	GCG	2	6	100505	100510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065234
1609	NC_014334	TGA	2	6	100537	100542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065234
1610	NC_014334	ATC	2	6	100550	100555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065234
1611	NC_014334	GATT	2	8	100590	100597	25 %	50 %	25 %	0 %	301065234
1612	NC_014334	CCG	2	6	100623	100628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065234
1613	NC_014334	T	7	7	100732	100738	0 %	100 %	0 %	0 %	301065234
1614	NC_014334	TTTC	2	8	100811	100818	0 %	75 %	0 %	25 %	301065235
1615	NC_014334	AACG	2	8	100886	100893	50 %	0 %	25 %	25 %	301065235
1616	NC_014334	CGG	2	6	100939	100944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065235
1617	NC_014334	GGT	2	6	100970	100975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065235
1618	NC_014334	TG	3	6	101002	101007	0 %	50 %	50 %	0 %	301065235
1619	NC_014334	A	6	6	101044	101049	100 %	0 %	0 %	0 %	301065235
1620	NC_014334	GCT	2	6	101517	101522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065235
1621	NC_014334	AGG	2	6	101552	101557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065235
1622	NC_014334	CAT	2	6	101577	101582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065235
1623	NC_014334	ATTGA	2	10	101601	101610	40 %	40 %	20 %	0 %	301065235
1624	NC_014334	CGA	2	6	101632	101637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065235
1625	NC_014334	CAA	2	6	101676	101681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065235
1626	NC_014334	GTT	2	6	101805	101810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065236
1627	NC_014334	TGG	2	6	101848	101853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065236
1628	NC_014334	GTCT	2	8	101876	101883	0 %	50 %	25 %	25 %	301065236
1629	NC_014334	GAC	2	6	101954	101959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065236
1630	NC_014334	GAT	2	6	101961	101966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065236
1631	NC_014334	CTG	2	6	101998	102003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065236
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1633	NC_014334	CGA	2	6	102172	102177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065236
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1641	NC_014334	GAT	2	6	102588	102593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065236
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1643	NC_014334	GAC	2	6	102636	102641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065236
1644	NC_014334	GCA	2	6	102682	102687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065236
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1653	NC_014334	TGG	2	6	103066	103071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065238
1654	NC_014334	GCC	2	6	103086	103091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065238
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1715	NC_014334	TTTG	2	8	106996	107003	0 %	75 %	25 %	0 %	301065241
1716	NC_014334	ATT	2	6	107031	107036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065241
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1718	NC_014334	GATC	2	8	107843	107850	25 %	25 %	25 %	25 %	301065242
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1722	NC_014334	ATG	2	6	107974	107979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065242
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1739	NC_014334	TGC	2	6	109088	109093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065244
1740	NC_014334	T	6	6	109121	109126	0 %	100 %	0 %	0 %	301065244
1741	NC_014334	AAG	2	6	109202	109207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065244
1742	NC_014334	GCA	2	6	109358	109363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065244
1743	NC_014334	AGA	2	6	109491	109496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065244
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1745	NC_014334	GAT	2	6	109558	109563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065244
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1865	NC_014334	TGA	2	6	116183	116188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065248
1866	NC_014334	TAA	2	6	116201	116206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065248
1867	NC_014334	TGGT	2	8	116219	116226	0 %	50 %	50 %	0 %	301065248
1868	NC_014334	CGA	2	6	116288	116293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065248
1869	NC_014334	AGC	2	6	116337	116342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065248
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1871	NC_014334	GATT	2	8	116413	116420	25 %	50 %	25 %	0 %	301065248
1872	NC_014334	TTG	2	6	116503	116508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065248
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1880	NC_014334	AGT	2	6	116783	116788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065249
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1887	NC_014334	TCG	2	6	116943	116948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065249
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1889	NC_014334	GCTG	2	8	117111	117118	0 %	25 %	50 %	25 %	301065249
1890	NC_014334	GCA	2	6	117155	117160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065249
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1897	NC_014334	TCTT	2	8	117449	117456	0 %	75 %	0 %	25 %	301065249
1898	NC_014334	TTG	2	6	117505	117510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065249
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1902	NC_014334	ACTT	2	8	117877	117884	25 %	50 %	0 %	25 %	301065250
1903	NC_014334	TGAT	2	8	117930	117937	25 %	50 %	25 %	0 %	301065250
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1905	NC_014334	GTA	2	6	117960	117965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065250
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1909	NC_014334	TGC	2	6	118233	118238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065250
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1984	NC_014334	CAA	2	6	121546	121551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065253
1985	NC_014334	CAA	2	6	121627	121632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065253
1986	NC_014334	CGG	2	6	121671	121676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065253
1987	NC_014334	GCCA	2	8	121738	121745	25 %	0 %	25 %	50 %	301065253
1988	NC_014334	CAAT	2	8	121770	121777	50 %	25 %	0 %	25 %	301065253
1989	NC_014334	CAG	2	6	121794	121799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065253
1990	NC_014334	GCT	2	6	121861	121866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065253
1991	NC_014334	GCA	2	6	121920	121925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065253
1992	NC_014334	GGC	2	6	121953	121958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065253
1993	NC_014334	CAA	3	9	122005	122013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065253
1994	NC_014334	CAAG	2	8	122064	122071	50 %	0 %	25 %	25 %	301065253
1995	NC_014334	AGA	2	6	122102	122107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065253
1996	NC_014334	CCTA	2	8	122170	122177	25 %	25 %	0 %	50 %	301065253
1997	NC_014334	GCA	2	6	122293	122298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065253
1998	NC_014334	CAC	2	6	122310	122315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065253
1999	NC_014334	CGT	2	6	122380	122385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065253
2000	NC_014334	TCA	2	6	122390	122395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065253

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