MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014334	GCC	2	6	63439	63444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065194
1002	NC_014334	AGGT	2	8	63491	63498	25 %	25 %	50 %	0 %	301065194
1003	NC_014334	TCA	2	6	63506	63511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065194
1004	NC_014334	GTT	2	6	63566	63571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1005	NC_014334	AAT	2	6	63591	63596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065194
1006	NC_014334	GTT	2	6	63655	63660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1007	NC_014334	TTGG	2	8	63673	63680	0 %	50 %	50 %	0 %	301065194
1008	NC_014334	GAT	2	6	63703	63708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
1009	NC_014334	TGA	2	6	63726	63731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
1010	NC_014334	GAA	2	6	63838	63843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065194
1011	NC_014334	AGC	2	6	63857	63862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065194
1012	NC_014334	GA	3	6	63959	63964	50 %	0 %	50 %	0 %	301065194
1013	NC_014334	CCA	2	6	63986	63991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065194
1014	NC_014334	TCGT	2	8	64017	64024	0 %	50 %	25 %	25 %	301065194
1015	NC_014334	GGC	2	6	64042	64047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065194
1016	NC_014334	GTC	2	6	64054	64059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065194
1017	NC_014334	ATG	3	9	64163	64171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
1018	NC_014334	AGC	2	6	64205	64210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065194
1019	NC_014334	ATG	2	6	64244	64249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
1020	NC_014334	AATGAA	2	12	64255	64266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	301065194
1021	NC_014334	GTC	2	6	64321	64326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065194
1022	NC_014334	TG	3	6	64502	64507	0 %	50 %	50 %	0 %	301065194
1023	NC_014334	CAGT	2	8	64581	64588	25 %	25 %	25 %	25 %	301065194
1024	NC_014334	T	6	6	64588	64593	0 %	100 %	0 %	0 %	301065194
1025	NC_014334	TTG	2	6	64601	64606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1026	NC_014334	ATT	2	6	64636	64641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065194
1027	NC_014334	CTTT	2	8	64647	64654	0 %	75 %	0 %	25 %	301065194
1028	NC_014334	CT	3	6	64676	64681	0 %	50 %	0 %	50 %	301065194
1029	NC_014334	ATG	3	9	64754	64762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
1030	NC_014334	TGACGA	2	12	64793	64804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065194
1031	NC_014334	T	6	6	64858	64863	0 %	100 %	0 %	0 %	301065195
1032	NC_014334	GTT	3	9	64907	64915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065195
1033	NC_014334	TGC	2	6	64946	64951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065195
1034	NC_014334	AGC	2	6	65055	65060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065195
1035	NC_014334	CT	3	6	65065	65070	0 %	50 %	0 %	50 %	301065195
1036	NC_014334	CAGTT	2	10	65112	65121	20 %	40 %	20 %	20 %	301065195
1037	NC_014334	ATG	2	6	65233	65238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065195
1038	NC_014334	GAT	2	6	65382	65387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065195
1039	NC_014334	T	6	6	65414	65419	0 %	100 %	0 %	0 %	301065195
1040	NC_014334	CTC	2	6	65743	65748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065196
1041	NC_014334	GCC	2	6	65780	65785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065196
1042	NC_014334	GGC	2	6	65896	65901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065196
1043	NC_014334	A	6	6	65909	65914	100 %	0 %	0 %	0 %	301065196
1044	NC_014334	TAAG	2	8	65925	65932	50 %	25 %	25 %	0 %	301065196
1045	NC_014334	GCG	2	6	66169	66174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065197
1046	NC_014334	AAG	2	6	66179	66184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065197
1047	NC_014334	GAT	2	6	66202	66207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065197
1048	NC_014334	GAT	2	6	66241	66246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065197
1049	NC_014334	GCC	2	6	66250	66255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065197
1050	NC_014334	GTTG	2	8	66256	66263	0 %	50 %	50 %	0 %	301065197
1051	NC_014334	ATG	2	6	66281	66286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065197
1052	NC_014334	ACC	2	6	66295	66300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065197
1053	NC_014334	CGA	2	6	66306	66311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065197
1054	NC_014334	GACA	2	8	66373	66380	50 %	0 %	25 %	25 %	301065197
1055	NC_014334	CATGCC	2	12	66424	66435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	301065197
1056	NC_014334	CATC	2	8	66444	66451	25 %	25 %	0 %	50 %	301065197
1057	NC_014334	TGA	2	6	66492	66497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065197
1058	NC_014334	GCA	2	6	66501	66506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065197
1059	NC_014334	ATG	2	6	66563	66568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065197
1060	NC_014334	ACA	2	6	66573	66578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065197
1061	NC_014334	GAT	2	6	66676	66681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065197
1062	NC_014334	GGC	2	6	66682	66687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065197
1063	NC_014334	ATT	2	6	66751	66756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065197
1064	NC_014334	TGC	2	6	66776	66781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065197
1065	NC_014334	GTC	2	6	66804	66809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065198
1066	NC_014334	ATC	2	6	66876	66881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065198
1067	NC_014334	T	6	6	66963	66968	0 %	100 %	0 %	0 %	301065198
1068	NC_014334	TGT	2	6	66977	66982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065198
1069	NC_014334	GAC	2	6	66984	66989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065198
1070	NC_014334	GAA	2	6	67011	67016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065198
1071	NC_014334	TTG	2	6	67096	67101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065198
1072	NC_014334	CTTT	2	8	67247	67254	0 %	75 %	0 %	25 %	301065198
1073	NC_014334	ATC	2	6	67486	67491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065198
1074	NC_014334	CAC	2	6	67500	67505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065198
1075	NC_014334	GTT	2	6	67521	67526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065198
1076	NC_014334	AAT	2	6	67572	67577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065198
1077	NC_014334	GCC	2	6	67644	67649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065198
1078	NC_014334	AGCCGC	2	12	67661	67672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	301065198
1079	NC_014334	CCT	2	6	67738	67743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065199
1080	NC_014334	CAG	2	6	67787	67792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065199
1081	NC_014334	GCC	2	6	67892	67897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065199
1082	NC_014334	ATG	2	6	67965	67970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065199
1083	NC_014334	ATTG	2	8	68004	68011	25 %	50 %	25 %	0 %	301065199
1084	NC_014334	CATGCC	2	12	68021	68032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	301065199
1085	NC_014334	AGC	2	6	68036	68041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065199
1086	NC_014334	ATCA	2	8	68042	68049	50 %	25 %	0 %	25 %	301065199
1087	NC_014334	AGC	2	6	68100	68105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065199
1088	NC_014334	CAA	2	6	68171	68176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065199
1089	NC_014334	GCT	2	6	68314	68319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065199
1090	NC_014334	CCT	2	6	68379	68384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065200
1091	NC_014334	AGC	2	6	68416	68421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065200
1092	NC_014334	ACA	2	6	68516	68521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065200
1093	NC_014334	GCT	2	6	68531	68536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065200
1094	NC_014334	ACA	2	6	68573	68578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065200
1095	NC_014334	GAT	2	6	68736	68741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065200
1096	NC_014334	CAG	2	6	68758	68763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065200
1097	NC_014334	CAG	2	6	68788	68793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065200
1098	NC_014334	GGC	2	6	68827	68832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065200
1099	NC_014334	GGT	2	6	68860	68865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065200
1100	NC_014334	CGA	2	6	68913	68918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065200
1101	NC_014334	TTG	2	6	68921	68926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065200
1102	NC_014334	AAT	2	6	68965	68970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065200
1103	NC_014334	ATCAGA	2	12	69134	69145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301065200
1104	NC_014334	GCT	2	6	69155	69160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065200
1105	NC_014334	TGT	2	6	69185	69190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065200
1106	NC_014334	GCC	2	6	69193	69198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065200
1107	NC_014334	TCT	2	6	69230	69235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065200
1108	NC_014334	TTC	2	6	69283	69288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065200
1109	NC_014334	TG	3	6	69339	69344	0 %	50 %	50 %	0 %	301065200
1110	NC_014334	GCC	2	6	69439	69444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065200
1111	NC_014334	ATC	2	6	69467	69472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065200
1112	NC_014334	GACA	2	8	69513	69520	50 %	0 %	25 %	25 %	301065200
1113	NC_014334	GTT	2	6	69612	69617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065200
1114	NC_014334	GCA	2	6	70258	70263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065201
1115	NC_014334	TG	3	6	70297	70302	0 %	50 %	50 %	0 %	301065201
1116	NC_014334	AAG	2	6	70364	70369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065201
1117	NC_014334	CAA	2	6	70384	70389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065201
1118	NC_014334	AAT	2	6	70465	70470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065201
1119	NC_014334	AG	3	6	70524	70529	50 %	0 %	50 %	0 %	301065201
1120	NC_014334	GAC	2	6	70575	70580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065201
1121	NC_014334	ATT	2	6	70619	70624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065201
1122	NC_014334	ACA	2	6	70641	70646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065201
1123	NC_014334	GTT	2	6	70705	70710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065201
1124	NC_014334	GAA	2	6	70716	70721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065201
1125	NC_014334	CAATAA	2	12	70774	70785	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	301065201
1126	NC_014334	TAA	2	6	70796	70801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065201
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1159	NC_014334	GGCA	2	8	72550	72557	25 %	0 %	50 %	25 %	301065204
1160	NC_014334	CCTA	2	8	72565	72572	25 %	25 %	0 %	50 %	301065204
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1374	NC_014334	GTTTC	2	10	85974	85983	0 %	60 %	20 %	20 %	301065219
1375	NC_014334	TTG	2	6	86011	86016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065219
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1389	NC_014334	TGC	2	6	87123	87128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065220
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1393	NC_014334	GTCC	2	8	87322	87329	0 %	25 %	25 %	50 %	301065220
1394	NC_014334	TGT	2	6	87396	87401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065220
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1398	NC_014334	CAAG	2	8	87590	87597	50 %	0 %	25 %	25 %	301065221
1399	NC_014334	TAG	2	6	87635	87640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065221
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1401	NC_014334	TAA	2	6	87695	87700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065221
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1411	NC_014334	TGC	2	6	88159	88164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065221
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1481	NC_014334	GGTTG	2	10	92844	92853	0 %	40 %	60 %	0 %	301065228
1482	NC_014334	ACTG	2	8	92872	92879	25 %	25 %	25 %	25 %	301065228
1483	NC_014334	TG	3	6	92878	92883	0 %	50 %	50 %	0 %	301065228
1484	NC_014334	CA	3	6	93003	93008	50 %	0 %	0 %	50 %	301065228
1485	NC_014334	ATCA	2	8	93043	93050	50 %	25 %	0 %	25 %	301065228
1486	NC_014334	GGC	2	6	93060	93065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065228
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1488	NC_014334	A	6	6	93649	93654	100 %	0 %	0 %	0 %	301065229
1489	NC_014334	CCAAC	2	10	93659	93668	40 %	0 %	0 %	60 %	301065229
1490	NC_014334	TCA	2	6	93676	93681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065229
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1495	NC_014334	GCA	2	6	93997	94002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065229
1496	NC_014334	GCT	2	6	94003	94008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065229
1497	NC_014334	TCA	2	6	94019	94024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065229
1498	NC_014334	CTG	2	6	94031	94036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065229
1499	NC_014334	TTGGCA	2	12	94075	94086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301065229
1500	NC_014334	CGA	2	6	94133	94138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065229

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