MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014334	CAG	2	6	378465	378470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065504
6002	NC_014334	TGC	2	6	378544	378549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065504
6003	NC_014334	GATG	2	8	378658	378665	25 %	25 %	50 %	0 %	301065504
6004	NC_014334	GAA	2	6	378703	378708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065504
6005	NC_014334	TTA	2	6	378753	378758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065504
6006	NC_014334	CCG	2	6	378819	378824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065504
6007	NC_014334	GTT	2	6	378836	378841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065504
6008	NC_014334	A	6	6	378846	378851	100 %	0 %	0 %	0 %	301065504
6009	NC_014334	GCG	3	9	378860	378868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065504
6010	NC_014334	GTA	2	6	378898	378903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065504
6011	NC_014334	ATG	2	6	379499	379504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065505
6012	NC_014334	GAAG	2	8	379513	379520	50 %	0 %	50 %	0 %	301065505
6013	NC_014334	ACTG	2	8	379546	379553	25 %	25 %	25 %	25 %	301065505
6014	NC_014334	CTAA	2	8	379585	379592	50 %	25 %	0 %	25 %	301065505
6015	NC_014334	ATC	2	6	379640	379645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065505
6016	NC_014334	GA	3	6	379890	379895	50 %	0 %	50 %	0 %	301065505
6017	NC_014334	A	7	7	379961	379967	100 %	0 %	0 %	0 %	301065505
6018	NC_014334	TGCT	2	8	380133	380140	0 %	50 %	25 %	25 %	301065505
6019	NC_014334	ACC	2	6	380192	380197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065505
6020	NC_014334	TGT	2	6	380199	380204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065505
6021	NC_014334	TGA	2	6	380205	380210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065505
6022	NC_014334	TCGC	2	8	380225	380232	0 %	25 %	25 %	50 %	301065505
6023	NC_014334	GGGC	2	8	380495	380502	0 %	0 %	75 %	25 %	301065506
6024	NC_014334	TTA	2	6	380527	380532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065506
6025	NC_014334	AAT	2	6	380535	380540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065506
6026	NC_014334	TCA	3	9	380549	380557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065506
6027	NC_014334	CTT	2	6	380613	380618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065506
6028	NC_014334	ATT	3	9	380620	380628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065506
6029	NC_014334	ATT	2	6	380650	380655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065506
6030	NC_014334	ATTT	2	8	380664	380671	25 %	75 %	0 %	0 %	301065506
6031	NC_014334	ATG	2	6	380828	380833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065507
6032	NC_014334	A	8	8	380836	380843	100 %	0 %	0 %	0 %	301065507
6033	NC_014334	ACG	2	6	380869	380874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065507
6034	NC_014334	GAA	2	6	380875	380880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065507
6035	NC_014334	ACA	2	6	381495	381500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065508
6036	NC_014334	A	6	6	381514	381519	100 %	0 %	0 %	0 %	301065508
6037	NC_014334	CTC	2	6	381662	381667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065508
6038	NC_014334	A	6	6	381668	381673	100 %	0 %	0 %	0 %	301065508
6039	NC_014334	GCA	2	6	381757	381762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065508
6040	NC_014334	CTA	2	6	381770	381775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065508
6041	NC_014334	GTG	2	6	381779	381784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065508
6042	NC_014334	AAT	2	6	381799	381804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065508
6043	NC_014334	TAA	2	6	381813	381818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065508
6044	NC_014334	AAT	2	6	381829	381834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065508
6045	NC_014334	TTC	2	6	381852	381857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065508
6046	NC_014334	CTC	2	6	381942	381947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065508
6047	NC_014334	ATT	2	6	381997	382002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065508
6048	NC_014334	GGA	2	6	382087	382092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065508
6049	NC_014334	CAA	2	6	382124	382129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065508
6050	NC_014334	ACC	2	6	382168	382173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065508
6051	NC_014334	ATA	2	6	382268	382273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065508
6052	NC_014334	AAC	2	6	382276	382281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065508
6053	NC_014334	GTT	2	6	382288	382293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065508
6054	NC_014334	GGA	2	6	382339	382344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065508
6055	NC_014334	ATT	2	6	382406	382411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065508
6056	NC_014334	AAT	2	6	382414	382419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065508
6057	NC_014334	TGG	2	6	382425	382430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065508
6058	NC_014334	TA	5	10	382453	382462	50 %	50 %	0 %	0 %	301065508
6059	NC_014334	GGCT	2	8	382485	382492	0 %	25 %	50 %	25 %	301065508
6060	NC_014334	TCT	2	6	382507	382512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065508
6061	NC_014334	T	7	7	382707	382713	0 %	100 %	0 %	0 %	301065508
6062	NC_014334	ATCTGA	2	12	382896	382907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301065508
6063	NC_014334	TGC	2	6	383007	383012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065508
6064	NC_014334	ACA	3	9	383065	383073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065508
6065	NC_014334	TGGC	2	8	383132	383139	0 %	25 %	50 %	25 %	301065508
6066	NC_014334	GCG	2	6	383158	383163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065508
6067	NC_014334	GATT	2	8	383202	383209	25 %	50 %	25 %	0 %	301065508
6068	NC_014334	CCAA	2	8	383242	383249	50 %	0 %	0 %	50 %	301065508
6069	NC_014334	GTT	2	6	383326	383331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065508
6070	NC_014334	TGGC	2	8	383372	383379	0 %	25 %	50 %	25 %	301065508
6071	NC_014334	GATT	2	8	383442	383449	25 %	50 %	25 %	0 %	301065508
6072	NC_014334	CCAA	2	8	383482	383489	50 %	0 %	0 %	50 %	301065508
6073	NC_014334	GTT	2	6	383566	383571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065508
6074	NC_014334	TGGC	2	8	383612	383619	0 %	25 %	50 %	25 %	301065508
6075	NC_014334	GATT	2	8	383682	383689	25 %	50 %	25 %	0 %	301065508
6076	NC_014334	CGC	2	6	383877	383882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065509
6077	NC_014334	CA	3	6	384098	384103	50 %	0 %	0 %	50 %	301065509
6078	NC_014334	AGCCA	2	10	384143	384152	40 %	0 %	20 %	40 %	301065509
6079	NC_014334	AGA	2	6	384181	384186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065509
6080	NC_014334	GGT	2	6	384298	384303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065509
6081	NC_014334	GCT	2	6	384316	384321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065509
6082	NC_014334	TGG	2	6	384419	384424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065509
6083	NC_014334	CTA	2	6	384582	384587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065509
6084	NC_014334	CAA	2	6	384634	384639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065509
6085	NC_014334	GGT	2	6	384722	384727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065509
6086	NC_014334	GAT	2	6	384813	384818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
6087	NC_014334	TTG	2	6	384916	384921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065510
6088	NC_014334	ATG	2	6	384970	384975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
6089	NC_014334	GTG	2	6	385078	385083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065510
6090	NC_014334	GAAA	2	8	385235	385242	75 %	0 %	25 %	0 %	301065510
6091	NC_014334	ACT	2	6	385248	385253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065510
6092	NC_014334	TGCA	2	8	385254	385261	25 %	25 %	25 %	25 %	301065510
6093	NC_014334	TGA	2	6	385388	385393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
6094	NC_014334	ATC	2	6	385465	385470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065510
6095	NC_014334	TTC	2	6	385518	385523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065510
6096	NC_014334	ATG	2	6	385540	385545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
6097	NC_014334	CAT	2	6	385598	385603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065510
6098	NC_014334	AACC	2	8	385616	385623	50 %	0 %	0 %	50 %	301065510
6099	NC_014334	GAT	2	6	385742	385747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
6100	NC_014334	CA	3	6	385753	385758	50 %	0 %	0 %	50 %	301065510
6101	NC_014334	CTA	2	6	385793	385798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065510
6102	NC_014334	CGC	2	6	385857	385862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065510
6103	NC_014334	GAA	2	6	385895	385900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065510
6104	NC_014334	AAG	2	6	386002	386007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065510
6105	NC_014334	TGA	2	6	386051	386056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
6106	NC_014334	ATT	2	6	386067	386072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065510
6107	NC_014334	CAGC	2	8	386094	386101	25 %	0 %	25 %	50 %	301065510
6108	NC_014334	GCT	2	6	386129	386134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065510
6109	NC_014334	GTT	2	6	386216	386221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065511
6110	NC_014334	ATAG	2	8	386228	386235	50 %	25 %	25 %	0 %	301065511
6111	NC_014334	TGAAT	2	10	386260	386269	40 %	40 %	20 %	0 %	301065511
6112	NC_014334	AGTG	2	8	386323	386330	25 %	25 %	50 %	0 %	301065511
6113	NC_014334	CGG	2	6	386338	386343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065511
6114	NC_014334	CTTCA	2	10	386358	386367	20 %	40 %	0 %	40 %	301065511
6115	NC_014334	TACTT	2	10	386438	386447	20 %	60 %	0 %	20 %	301065511
6116	NC_014334	GTT	2	6	386492	386497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065511
6117	NC_014334	CCCAG	2	10	386516	386525	20 %	0 %	20 %	60 %	301065511
6118	NC_014334	CAA	2	6	386582	386587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065511
6119	NC_014334	TGG	2	6	386614	386619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065511
6120	NC_014334	TGG	2	6	386635	386640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065511
6121	NC_014334	GC	3	6	386653	386658	0 %	0 %	50 %	50 %	301065511
6122	NC_014334	ACA	2	6	386679	386684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065511
6123	NC_014334	CTT	2	6	386693	386698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065511
6124	NC_014334	GAA	2	6	386699	386704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065511
6125	NC_014334	AGC	2	6	386722	386727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065511
6126	NC_014334	TCAA	2	8	386729	386736	50 %	25 %	0 %	25 %	301065511
6127	NC_014334	TGA	2	6	386769	386774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065511
6128	NC_014334	GCG	2	6	386811	386816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065511
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6130	NC_014334	GGT	2	6	386915	386920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065511
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6137	NC_014334	CAAA	2	8	387178	387185	75 %	0 %	0 %	25 %	301065511
6138	NC_014334	ACA	2	6	387300	387305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065511
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6145	NC_014334	CTG	2	6	387626	387631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065512
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6147	NC_014334	TTCT	2	8	387722	387729	0 %	75 %	0 %	25 %	301065512
6148	NC_014334	AAG	2	6	387827	387832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065512
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6153	NC_014334	ATC	2	6	388163	388168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065512
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6155	NC_014334	AAG	2	6	388222	388227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065512
6156	NC_014334	TGC	2	6	388296	388301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065512
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6200	NC_014334	GTT	2	6	390531	390536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065513
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6202	NC_014334	GCA	2	6	390569	390574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
6203	NC_014334	TTTA	2	8	390579	390586	25 %	75 %	0 %	0 %	301065513
6204	NC_014334	ATGA	2	8	390616	390623	50 %	25 %	25 %	0 %	301065513
6205	NC_014334	TTG	2	6	390680	390685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065513
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6210	NC_014334	CGA	2	6	390876	390881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
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6212	NC_014334	CGG	2	6	390960	390965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065513
6213	NC_014334	TCA	2	6	391010	391015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065513
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6215	NC_014334	TCG	2	6	391050	391055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065513
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6217	NC_014334	GAC	2	6	391152	391157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
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6220	NC_014334	GAT	2	6	391405	391410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
6221	NC_014334	ACCA	2	8	391451	391458	50 %	0 %	0 %	50 %	301065513
6222	NC_014334	AC	4	8	391468	391475	50 %	0 %	0 %	50 %	301065513
6223	NC_014334	GAT	2	6	391519	391524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
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6227	NC_014334	CAG	2	6	391651	391656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
6228	NC_014334	TTC	2	6	391816	391821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065513
6229	NC_014334	GCT	2	6	391822	391827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065513
6230	NC_014334	ATG	2	6	391880	391885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
6231	NC_014334	GAAG	2	8	391944	391951	50 %	0 %	50 %	0 %	301065513
6232	NC_014334	AAG	2	6	391970	391975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065513
6233	NC_014334	TCA	2	6	392041	392046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065514
6234	NC_014334	CAA	2	6	392130	392135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065514
6235	NC_014334	TCA	2	6	392242	392247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065514
6236	NC_014334	GAT	2	6	392313	392318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065514
6237	NC_014334	TGA	2	6	392332	392337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065514
6238	NC_014334	CTT	2	6	392357	392362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065514
6239	NC_014334	AGA	2	6	392371	392376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065514
6240	NC_014334	GTTA	2	8	392414	392421	25 %	50 %	25 %	0 %	301065514
6241	NC_014334	TCG	2	6	392606	392611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065514
6242	NC_014334	AGG	2	6	392614	392619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065514
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6244	NC_014334	ATG	2	6	392631	392636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065514
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6367	NC_014334	TG	3	6	399977	399982	0 %	50 %	50 %	0 %	301065520
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6369	NC_014334	TTGA	2	8	400159	400166	25 %	50 %	25 %	0 %	301065520
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6380	NC_014334	TGA	2	6	400711	400716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065520
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6393	NC_014334	GAT	2	6	401606	401611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065521
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6395	NC_014334	AGC	2	6	401653	401658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065521
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6397	NC_014334	CGG	2	6	401740	401745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065521
6398	NC_014334	GAC	2	6	401929	401934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065521
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6480	NC_014334	TGGAC	2	10	406412	406421	20 %	20 %	40 %	20 %	301065526
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6483	NC_014334	TTGGC	2	10	406723	406732	0 %	40 %	40 %	20 %	301065526
6484	NC_014334	TGAGC	2	10	406800	406809	20 %	20 %	40 %	20 %	301065526
6485	NC_014334	ACA	2	6	406828	406833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065526
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