MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014334	GGC	2	6	344681	344686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065468
5502	NC_014334	AAG	2	6	344691	344696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065468
5503	NC_014334	GTC	2	6	344847	344852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065469
5504	NC_014334	CGG	2	6	344998	345003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065469
5505	NC_014334	TTGC	2	8	345177	345184	0 %	50 %	25 %	25 %	301065469
5506	NC_014334	GTC	2	6	345195	345200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065469
5507	NC_014334	GCT	2	6	345215	345220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065469
5508	NC_014334	A	7	7	345276	345282	100 %	0 %	0 %	0 %	301065469
5509	NC_014334	GCG	2	6	345309	345314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065469
5510	NC_014334	ATT	2	6	345348	345353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065469
5511	NC_014334	CAC	2	6	345430	345435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065469
5512	NC_014334	AGC	2	6	345521	345526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065469
5513	NC_014334	AAG	2	6	345649	345654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065469
5514	NC_014334	AAG	3	9	346039	346047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065471
5515	NC_014334	CGG	2	6	346059	346064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065471
5516	NC_014334	TTA	2	6	346099	346104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065471
5517	NC_014334	T	6	6	346126	346131	0 %	100 %	0 %	0 %	301065471
5518	NC_014334	GTT	3	9	346158	346166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065471
5519	NC_014334	GAC	2	6	346229	346234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065471
5520	NC_014334	TGA	2	6	346247	346252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065471
5521	NC_014334	GAT	2	6	346388	346393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065471
5522	NC_014334	CTG	2	6	346443	346448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065471
5523	NC_014334	TAT	2	6	346457	346462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065471
5524	NC_014334	TATT	2	8	346468	346475	25 %	75 %	0 %	0 %	301065471
5525	NC_014334	GCG	2	6	346530	346535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065471
5526	NC_014334	CGG	2	6	346570	346575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065471
5527	NC_014334	GCAT	2	8	346591	346598	25 %	25 %	25 %	25 %	301065471
5528	NC_014334	CAA	2	6	346603	346608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065471
5529	NC_014334	A	6	6	346734	346739	100 %	0 %	0 %	0 %	301065471
5530	NC_014334	T	6	6	346781	346786	0 %	100 %	0 %	0 %	301065471
5531	NC_014334	GAT	2	6	346842	346847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065471
5532	NC_014334	AATG	2	8	346853	346860	50 %	25 %	25 %	0 %	301065471
5533	NC_014334	TTA	2	6	346865	346870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065471
5534	NC_014334	TTGA	2	8	346971	346978	25 %	50 %	25 %	0 %	301065471
5535	NC_014334	GTT	2	6	347033	347038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065471
5536	NC_014334	CAAG	2	8	347048	347055	50 %	0 %	25 %	25 %	301065471
5537	NC_014334	TTGCTG	2	12	347103	347114	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	301065471
5538	NC_014334	TCA	2	6	347260	347265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065471
5539	NC_014334	GTT	2	6	347352	347357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065471
5540	NC_014334	TGA	2	6	347389	347394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065471
5541	NC_014334	ATC	2	6	347397	347402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065471
5542	NC_014334	TCA	2	6	347431	347436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065471
5543	NC_014334	A	6	6	347463	347468	100 %	0 %	0 %	0 %	301065471
5544	NC_014334	ATG	2	6	347788	347793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065472
5545	NC_014334	GCT	2	6	347929	347934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065473
5546	NC_014334	ATC	2	6	347935	347940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065473
5547	NC_014334	CAT	2	6	347943	347948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065473
5548	NC_014334	A	6	6	347977	347982	100 %	0 %	0 %	0 %	301065473
5549	NC_014334	ATGAA	2	10	347984	347993	60 %	20 %	20 %	0 %	301065473
5550	NC_014334	CTT	2	6	348006	348011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065473
5551	NC_014334	AGA	2	6	349534	349539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065474
5552	NC_014334	GTCA	2	8	349574	349581	25 %	25 %	25 %	25 %	301065474
5553	NC_014334	TGCT	2	8	349645	349652	0 %	50 %	25 %	25 %	301065474
5554	NC_014334	AAG	2	6	349656	349661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065474
5555	NC_014334	TGGT	2	8	349699	349706	0 %	50 %	50 %	0 %	301065474
5556	NC_014334	CTT	2	6	349754	349759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065474
5557	NC_014334	ATT	2	6	349852	349857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065474
5558	NC_014334	GGC	2	6	349901	349906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065474
5559	NC_014334	TGA	2	6	350015	350020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065474
5560	NC_014334	ATC	2	6	350047	350052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065474
5561	NC_014334	CCG	2	6	350069	350074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065474
5562	NC_014334	GGCG	2	8	350208	350215	0 %	0 %	75 %	25 %	301065474
5563	NC_014334	TAT	2	6	350255	350260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065474
5564	NC_014334	ATG	3	9	350269	350277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065474
5565	NC_014334	CAT	2	6	350310	350315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065474
5566	NC_014334	GTT	2	6	350340	350345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065474
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5568	NC_014334	CG	3	6	350427	350432	0 %	0 %	50 %	50 %	301065474
5569	NC_014334	TTGA	2	8	350502	350509	25 %	50 %	25 %	0 %	301065474
5570	NC_014334	A	6	6	350598	350603	100 %	0 %	0 %	0 %	301065475
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5573	NC_014334	GAA	2	6	350759	350764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065475
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5578	NC_014334	GAA	2	6	351173	351178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065476
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5583	NC_014334	ACA	2	6	351445	351450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065476
5584	NC_014334	GGC	2	6	351515	351520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065476
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5586	NC_014334	ATC	2	6	351639	351644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065476
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5589	NC_014334	GAA	2	6	351756	351761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065476
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5592	NC_014334	TGGT	2	8	351862	351869	0 %	50 %	50 %	0 %	301065476
5593	NC_014334	TTA	2	6	352083	352088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065476
5594	NC_014334	AGA	2	6	352184	352189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065476
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5597	NC_014334	GCG	2	6	352342	352347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065476
5598	NC_014334	TGA	2	6	352462	352467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065476
5599	NC_014334	GAA	2	6	352689	352694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065477
5600	NC_014334	TGG	2	6	352727	352732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065477
5601	NC_014334	CGG	2	6	352857	352862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065477
5602	NC_014334	TGTC	2	8	352871	352878	0 %	50 %	25 %	25 %	301065477
5603	NC_014334	GACCAT	2	12	353046	353057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301065477
5604	NC_014334	CAG	2	6	353118	353123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065477
5605	NC_014334	ATC	2	6	353179	353184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065477
5606	NC_014334	TGTT	2	8	353207	353214	0 %	75 %	25 %	0 %	301065477
5607	NC_014334	GCT	2	6	353341	353346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065477
5608	NC_014334	ATC	2	6	353356	353361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065477
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5610	NC_014334	GTC	2	6	353431	353436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065477
5611	NC_014334	GGC	2	6	353440	353445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065477
5612	NC_014334	GCTG	2	8	353451	353458	0 %	25 %	50 %	25 %	301065477
5613	NC_014334	ATC	2	6	353500	353505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065477
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5616	NC_014334	TCT	2	6	353608	353613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065477
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5619	NC_014334	GCG	2	6	353755	353760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065478
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5621	NC_014334	AAG	2	6	353985	353990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065478
5622	NC_014334	ATC	2	6	354003	354008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065478
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5985	NC_014334	ATT	2	6	377420	377425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065503
5986	NC_014334	CTGG	2	8	377493	377500	0 %	25 %	50 %	25 %	301065503
5987	NC_014334	CTG	2	6	377522	377527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065503
5988	NC_014334	AAC	2	6	377546	377551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065503
5989	NC_014334	GCT	2	6	377615	377620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065503
5990	NC_014334	ATG	2	6	377630	377635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065503
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5999	NC_014334	CTTAC	2	10	378219	378228	20 %	40 %	0 %	40 %	301065504
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