MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4726

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014134	ATT	2	6	160	165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100304
2	NC_014134	GAA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
3	NC_014134	TGG	2	6	258	263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100304
4	NC_014134	TAA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
5	NC_014134	GCG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100304
6	NC_014134	CTG	2	6	434	439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100304
7	NC_014134	GAT	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
8	NC_014134	TTA	2	6	512	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100304
9	NC_014134	TCA	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100304
10	NC_014134	CAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100304
11	NC_014134	AGA	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
12	NC_014134	ACT	2	6	888	893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100304
13	NC_014134	GTC	2	6	905	910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100304
14	NC_014134	ATG	2	6	983	988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
15	NC_014134	TGG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100304
16	NC_014134	GAT	2	6	1066	1071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
17	NC_014134	ATT	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100304
18	NC_014134	TAA	2	6	1086	1091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
19	NC_014134	TAA	2	6	1101	1106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
20	NC_014134	TAG	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100304
21	NC_014134	GAA	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
22	NC_014134	AAG	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
23	NC_014134	TCA	2	6	1311	1316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100304
24	NC_014134	ACA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100304
25	NC_014134	GAA	2	6	1342	1347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100304
26	NC_014134	CAA	2	6	1433	1438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100304
27	NC_014134	TAA	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100304
28	NC_014134	ATC	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100305
29	NC_014134	TTA	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100305
30	NC_014134	TCA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100305
31	NC_014134	GTC	2	6	1822	1827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100305
32	NC_014134	CAC	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100305
33	NC_014134	GAC	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100305
34	NC_014134	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100305
35	NC_014134	AGA	2	6	2363	2368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100305
36	NC_014134	CAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100305
37	NC_014134	CAG	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100305
38	NC_014134	GTC	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100306
39	NC_014134	GGT	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100306
40	NC_014134	ATT	2	6	2816	2821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100306
41	NC_014134	ATT	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100306
42	NC_014134	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100306
43	NC_014134	GAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100306
44	NC_014134	GTT	2	6	3008	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100306
45	NC_014134	GAA	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100306
46	NC_014134	GTT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100307
47	NC_014134	AAC	2	6	3574	3579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100307
48	NC_014134	TTG	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100308
49	NC_014134	CGA	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100308
50	NC_014134	TCG	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100308
51	NC_014134	ATA	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100310
52	NC_014134	TAT	2	6	4948	4953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
53	NC_014134	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100310
54	NC_014134	AAC	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100310
55	NC_014134	TGA	2	6	5236	5241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100310
56	NC_014134	AGA	2	6	5245	5250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100310
57	NC_014134	ACT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100310
58	NC_014134	TAT	2	6	5398	5403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
59	NC_014134	ATT	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
60	NC_014134	AGA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100310
61	NC_014134	ATT	2	6	5804	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
62	NC_014134	AGG	3	9	5826	5834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100310
63	NC_014134	ATC	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100310
64	NC_014134	GTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100310
65	NC_014134	TGA	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100310
66	NC_014134	TAT	2	6	6207	6212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100310
67	NC_014134	GAC	2	6	6315	6320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100310
68	NC_014134	CGT	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100310
69	NC_014134	ATA	2	6	6551	6556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100310
70	NC_014134	TAG	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100310
71	NC_014134	CAT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100311
72	NC_014134	CTG	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100311
73	NC_014134	TGA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100311
74	NC_014134	TCA	2	6	7043	7048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100312
75	NC_014134	CAA	2	6	7255	7260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100312
76	NC_014134	TTC	2	6	7298	7303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100312
77	NC_014134	CTG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100312
78	NC_014134	TAG	2	6	7342	7347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100312
79	NC_014134	GAA	3	9	7401	7409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100312
80	NC_014134	ATG	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100312
81	NC_014134	TAA	2	6	7487	7492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100312
82	NC_014134	AGA	2	6	7502	7507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100312
83	NC_014134	ATC	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100313
84	NC_014134	ATC	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100313
85	NC_014134	ATG	2	6	7616	7621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100313
86	NC_014134	TAT	2	6	7679	7684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100313
87	NC_014134	CGA	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100313
88	NC_014134	ATT	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100313
89	NC_014134	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100313
90	NC_014134	ATT	3	9	8220	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100313
91	NC_014134	ACG	2	6	9038	9043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100314
92	NC_014134	ATC	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100314
93	NC_014134	TTA	2	6	9116	9121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100314
94	NC_014134	TCG	2	6	9321	9326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100314
95	NC_014134	TTG	2	6	9429	9434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100314
96	NC_014134	ATT	3	9	9459	9467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100314
97	NC_014134	TGG	2	6	10161	10166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100315
98	NC_014134	ATG	2	6	10176	10181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100315
99	NC_014134	TTA	2	6	10280	10285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100316
100	NC_014134	CAA	2	6	10601	10606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100316
101	NC_014134	TTG	2	6	10610	10615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100316
102	NC_014134	TCA	2	6	10723	10728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100316
103	NC_014134	GCA	2	6	10741	10746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100316
104	NC_014134	TTG	2	6	10862	10867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100316
105	NC_014134	CAT	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100317
106	NC_014134	TAA	2	6	11516	11521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100317
107	NC_014134	ATC	2	6	11598	11603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100317
108	NC_014134	TTG	2	6	11622	11627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100317
109	NC_014134	ACA	2	6	11673	11678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100317
110	NC_014134	CGA	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100317
111	NC_014134	GCC	2	6	11763	11768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296100317
112	NC_014134	TAT	2	6	11782	11787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100317
113	NC_014134	GCA	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100318
114	NC_014134	TTA	2	6	11942	11947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100318
115	NC_014134	TAA	2	6	11977	11982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100318
116	NC_014134	CAC	2	6	12036	12041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100318
117	NC_014134	ATT	2	6	12091	12096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100318
118	NC_014134	GTT	2	6	12192	12197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100318
119	NC_014134	GCC	2	6	12216	12221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296100318
120	NC_014134	TAA	2	6	12310	12315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100318
121	NC_014134	CAC	2	6	12327	12332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100318
122	NC_014134	CAT	2	6	12384	12389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100318
123	NC_014134	ACA	2	6	12485	12490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100319
124	NC_014134	GGA	2	6	12620	12625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100319
125	NC_014134	ATT	2	6	12651	12656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100319
126	NC_014134	GTT	2	6	13011	13016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100320
127	NC_014134	CAC	2	6	13110	13115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100320
128	NC_014134	TAA	2	6	13122	13127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100320
129	NC_014134	AAT	2	6	13146	13151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100320
130	NC_014134	AGT	2	6	13170	13175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100320
131	NC_014134	CTA	2	6	13178	13183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100320
132	NC_014134	TCA	2	6	13549	13554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100321
133	NC_014134	GAA	2	6	13641	13646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100321
134	NC_014134	TAA	2	6	13762	13767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100321
135	NC_014134	TAT	2	6	13835	13840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100322
136	NC_014134	TGA	2	6	13841	13846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100322
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138	NC_014134	ATT	2	6	13932	13937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100322
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141	NC_014134	ATT	2	6	14150	14155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100322
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143	NC_014134	TAA	2	6	14251	14256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100322
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155	NC_014134	TGA	2	6	15431	15436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100324
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159	NC_014134	TCC	2	6	16051	16056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296100326
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163	NC_014134	ATC	2	6	16807	16812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100327
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252	NC_014134	ATA	2	6	24104	24109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100335
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254	NC_014134	AAG	2	6	24224	24229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100335
255	NC_014134	CTA	2	6	24989	24994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100336
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259	NC_014134	TGG	2	6	25478	25483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100337
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271	NC_014134	TTC	2	6	28819	28824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100339

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.