MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4704

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014132	CAA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100147
2	NC_014132	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
3	NC_014132	GGT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100147
4	NC_014132	ATG	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
5	NC_014132	TGA	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
6	NC_014132	AAG	2	6	763	768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
7	NC_014132	ATG	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
8	NC_014132	TGC	2	6	829	834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100147
9	NC_014132	TGA	2	6	1031	1036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100147
10	NC_014132	GAA	2	6	1127	1132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
11	NC_014132	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
12	NC_014132	GAA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100147
13	NC_014132	GAC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100147
14	NC_014132	TAT	2	6	2066	2071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100148
15	NC_014132	GTT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100148
16	NC_014132	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100148
17	NC_014132	TAA	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100148
18	NC_014132	GAT	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
19	NC_014132	AAG	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
20	NC_014132	ATG	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
21	NC_014132	GAA	2	6	2614	2619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
22	NC_014132	AGA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
23	NC_014132	GCA	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100148
24	NC_014132	GAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
25	NC_014132	GAT	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100148
26	NC_014132	AAG	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100148
27	NC_014132	TTG	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100148
28	NC_014132	CAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100149
29	NC_014132	CAA	2	6	3398	3403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100149
30	NC_014132	ATG	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100149
31	NC_014132	TTA	2	6	3490	3495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100149
32	NC_014132	TCT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100149
33	NC_014132	CAA	2	6	3532	3537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100149
34	NC_014132	AGA	2	6	3567	3572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100149
35	NC_014132	CAG	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100149
36	NC_014132	GTG	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100149
37	NC_014132	ACA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
38	NC_014132	CAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
39	NC_014132	AGA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100150
40	NC_014132	TGA	2	6	3852	3857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
41	NC_014132	GAT	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
42	NC_014132	CTG	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100150
43	NC_014132	TGA	2	6	4042	4047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
44	NC_014132	CTG	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100150
45	NC_014132	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
46	NC_014132	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
47	NC_014132	ATG	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
48	NC_014132	AAC	2	6	4283	4288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
49	NC_014132	CCA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296100150
50	NC_014132	GAC	2	6	4369	4374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
51	NC_014132	CAG	2	6	4380	4385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
52	NC_014132	TGA	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
53	NC_014132	ATG	3	9	4716	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
54	NC_014132	ATT	2	6	4873	4878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
55	NC_014132	TTA	2	6	4936	4941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
56	NC_014132	ATA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100150
57	NC_014132	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
58	NC_014132	GAT	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100150
59	NC_014132	ATT	2	6	5059	5064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
60	NC_014132	CTT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100150
61	NC_014132	ACA	2	6	5174	5179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100150
62	NC_014132	GGC	2	6	5318	5323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100150
63	NC_014132	ACG	2	6	5393	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
64	NC_014132	AGA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100150
65	NC_014132	TGT	2	6	5413	5418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100150
66	NC_014132	AGC	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100150
67	NC_014132	TAT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100150
68	NC_014132	ATT	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100151
69	NC_014132	CGA	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100151
70	NC_014132	GTT	2	6	5880	5885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100151
71	NC_014132	TGT	2	6	5979	5984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100151
72	NC_014132	CAA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100151
73	NC_014132	CAA	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100151
74	NC_014132	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100151
75	NC_014132	TGA	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
76	NC_014132	CAT	2	6	6256	6261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100151
77	NC_014132	TAA	2	6	6339	6344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100151
78	NC_014132	AAT	2	6	6385	6390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100151
79	NC_014132	TGA	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
80	NC_014132	GCG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296100151
81	NC_014132	TGG	2	6	6653	6658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100151
82	NC_014132	ATC	2	6	6717	6722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100151
83	NC_014132	TAT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100151
84	NC_014132	AGA	2	6	6885	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100151
85	NC_014132	GTG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100151
86	NC_014132	GAG	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100151
87	NC_014132	GAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
88	NC_014132	TGA	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
89	NC_014132	TTC	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100151
90	NC_014132	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100151
91	NC_014132	GAA	2	6	8451	8456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100152
92	NC_014132	CGA	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100152
93	NC_014132	ATT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100152
94	NC_014132	AAG	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100152
95	NC_014132	TGA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100152
96	NC_014132	GCA	2	6	8844	8849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100152
97	NC_014132	ATT	2	6	8928	8933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100152
98	NC_014132	TCC	2	6	9560	9565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296100153
99	NC_014132	ATT	2	6	9585	9590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100153
100	NC_014132	AAC	2	6	9592	9597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100153
101	NC_014132	AGT	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100153
102	NC_014132	AAC	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100154
103	NC_014132	GAA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100154
104	NC_014132	CTT	2	6	9891	9896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100154
105	NC_014132	TCA	2	6	9966	9971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100154
106	NC_014132	TGA	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100154
107	NC_014132	AGA	2	6	10096	10101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100154
108	NC_014132	TGG	2	6	10392	10397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100155
109	NC_014132	GCA	2	6	10417	10422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100155
110	NC_014132	TGG	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100155
111	NC_014132	AAC	2	6	10477	10482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100155
112	NC_014132	ACA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100155
113	NC_014132	TGA	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100155
114	NC_014132	CAA	2	6	10618	10623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100155
115	NC_014132	TAG	2	6	10655	10660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100155
116	NC_014132	ATT	2	6	10672	10677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100155
117	NC_014132	TAA	2	6	10689	10694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100155
118	NC_014132	GAA	2	6	10717	10722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100155
119	NC_014132	GGT	2	6	10804	10809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100155
120	NC_014132	TGA	2	6	10974	10979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100155
121	NC_014132	TGA	2	6	11022	11027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100155
122	NC_014132	AAT	2	6	11092	11097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100155
123	NC_014132	ACA	2	6	11149	11154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100155
124	NC_014132	TGG	2	6	11226	11231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100155
125	NC_014132	GTA	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100156
126	NC_014132	ATT	2	6	11626	11631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100156
127	NC_014132	ATG	2	6	11729	11734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100156
128	NC_014132	ATC	2	6	11807	11812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100156
129	NC_014132	CAA	2	6	11842	11847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100156
130	NC_014132	TGC	2	6	11859	11864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100156
131	NC_014132	AAT	2	6	11881	11886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100156
132	NC_014132	GTG	2	6	11900	11905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296100156
133	NC_014132	AAG	3	9	11948	11956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100156
134	NC_014132	AGG	2	6	11963	11968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296100156
135	NC_014132	ATA	2	6	12017	12022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100157
136	NC_014132	ATG	3	9	12023	12031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100157
137	NC_014132	AAG	2	6	12088	12093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100157
138	NC_014132	GTT	2	6	12138	12143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100158
139	NC_014132	GTT	2	6	12210	12215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100158
140	NC_014132	AGC	2	6	12281	12286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100158
141	NC_014132	ATA	2	6	12400	12405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100158
142	NC_014132	CAT	2	6	12454	12459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100158
143	NC_014132	TTG	2	6	12460	12465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100158
144	NC_014132	TAA	3	9	12485	12493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100158
145	NC_014132	CTG	2	6	12502	12507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100158
146	NC_014132	TTG	2	6	12663	12668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100158
147	NC_014132	CTG	2	6	12670	12675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296100158
148	NC_014132	TCA	2	6	12743	12748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100158
149	NC_014132	TGA	2	6	12755	12760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100158
150	NC_014132	TTA	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100158
151	NC_014132	TTG	2	6	13018	13023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296100158
152	NC_014132	ACT	2	6	13069	13074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100158
153	NC_014132	TAA	2	6	13091	13096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100158
154	NC_014132	AAC	2	6	13097	13102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100158
155	NC_014132	ATT	2	6	13201	13206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100158
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159	NC_014132	CAG	2	6	13330	13335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296100158
160	NC_014132	GAT	2	6	13338	13343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100158
161	NC_014132	GAT	2	6	13403	13408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100158
162	NC_014132	AAC	2	6	13453	13458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100158
163	NC_014132	CAA	2	6	13683	13688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296100159
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242	NC_014132	CAT	2	6	21190	21195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296100165
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246	NC_014132	TAG	2	6	21449	21454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100165
247	NC_014132	TCT	2	6	21540	21545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296100165
248	NC_014132	ATA	2	6	21635	21640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100165
249	NC_014132	GAA	2	6	21722	21727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100165
250	NC_014132	ATG	2	6	21977	21982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100165
251	NC_014132	GAA	2	6	22006	22011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296100165
252	NC_014132	ATA	2	6	22049	22054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100165
253	NC_014132	GAT	2	6	22078	22083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296100165
254	NC_014132	TAA	2	6	22167	22172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100165
255	NC_014132	AAT	2	6	22700	22705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100166
256	NC_014132	AAT	2	6	22708	22713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100166
257	NC_014132	ATT	2	6	22753	22758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296100166
258	NC_014132	ATA	2	6	22854	22859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100166
259	NC_014132	AAT	2	6	23034	23039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100167
260	NC_014132	ATA	2	6	23098	23103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296100167

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.