MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4701

Total Repeats: 202

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014131	ATT	2	6	990	995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
2	NC_014131	TTA	3	9	1077	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
3	NC_014131	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987466
4	NC_014131	ATC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987466
5	NC_014131	AAG	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987466
6	NC_014131	ATA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
7	NC_014131	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
8	NC_014131	TAG	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987466
9	NC_014131	GAA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
10	NC_014131	ATG	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987467
11	NC_014131	AGA	2	6	1805	1810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
12	NC_014131	ATA	2	6	1852	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
13	NC_014131	AAT	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
14	NC_014131	TGA	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
15	NC_014131	AGT	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
16	NC_014131	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
17	NC_014131	AGA	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987468
18	NC_014131	AAT	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
19	NC_014131	AAT	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
20	NC_014131	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987469
21	NC_014131	AAT	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
22	NC_014131	TGA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
23	NC_014131	GAT	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
24	NC_014131	ACA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987469
25	NC_014131	GCT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987470
26	NC_014131	TCT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987470
27	NC_014131	TTG	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987470
28	NC_014131	AGC	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987470
29	NC_014131	TCC	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295987471
30	NC_014131	CTT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987471
31	NC_014131	AAC	2	6	4599	4604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987472
32	NC_014131	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
33	NC_014131	CGT	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
34	NC_014131	TGA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987473
35	NC_014131	AAG	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
36	NC_014131	TGC	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
37	NC_014131	GAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
38	NC_014131	AGA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
39	NC_014131	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
40	NC_014131	GAC	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987473
41	NC_014131	GTC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987474
42	NC_014131	ATA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
43	NC_014131	AAT	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
44	NC_014131	GAC	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
45	NC_014131	GAA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987474
46	NC_014131	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
47	NC_014131	GAT	2	6	7572	7577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
48	NC_014131	GAT	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
49	NC_014131	AAG	2	6	7627	7632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987474
50	NC_014131	TTG	2	6	7701	7706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987474
51	NC_014131	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987475
52	NC_014131	TAG	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987475
53	NC_014131	AAC	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
54	NC_014131	CAA	3	9	8317	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
55	NC_014131	AGA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
56	NC_014131	AAC	2	6	8394	8399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
57	NC_014131	AGA	2	6	8400	8405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
58	NC_014131	TAA	2	6	8406	8411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987475
59	NC_014131	AGA	2	6	8421	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
60	NC_014131	TGG	2	6	8473	8478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295987475
61	NC_014131	ATA	2	6	8522	8527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
62	NC_014131	GAA	2	6	8529	8534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
63	NC_014131	AAG	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
64	NC_014131	TGA	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
65	NC_014131	ACA	2	6	8959	8964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
66	NC_014131	ATA	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
67	NC_014131	AAT	2	6	9067	9072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
68	NC_014131	TGA	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
69	NC_014131	ATA	2	6	9110	9115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
70	NC_014131	TAA	2	6	9399	9404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
71	NC_014131	AAT	2	6	9448	9453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
72	NC_014131	AAT	2	6	9460	9465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
73	NC_014131	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
74	NC_014131	AAG	2	6	9646	9651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
75	NC_014131	ATG	2	6	9653	9658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
76	NC_014131	ATT	2	6	9694	9699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
77	NC_014131	ACA	2	6	9910	9915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
78	NC_014131	GCT	2	6	9921	9926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987476
79	NC_014131	CAA	2	6	10053	10058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
80	NC_014131	TGA	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
81	NC_014131	CAT	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987476
82	NC_014131	GAT	2	6	10390	10395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
83	NC_014131	ATT	2	6	10506	10511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
84	NC_014131	ATG	2	6	10541	10546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
85	NC_014131	TAA	2	6	10605	10610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
86	NC_014131	ATT	3	9	10618	10626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
87	NC_014131	CTA	2	6	10733	10738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987476
88	NC_014131	ATT	2	6	10779	10784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
89	NC_014131	TCA	2	6	10838	10843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987476
90	NC_014131	TAT	2	6	10929	10934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987476
91	NC_014131	ATG	2	6	10973	10978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
92	NC_014131	ATA	2	6	11099	11104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
93	NC_014131	AGT	2	6	11157	11162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
94	NC_014131	ATA	2	6	11303	11308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
95	NC_014131	AAT	2	6	11347	11352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
96	NC_014131	AGT	2	6	11421	11426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
97	NC_014131	ACG	2	6	11632	11637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987476
98	NC_014131	CAC	2	6	11643	11648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295987476
99	NC_014131	TAG	2	6	11726	11731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987477
100	NC_014131	ATT	2	6	11761	11766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987477
101	NC_014131	TTA	2	6	11918	11923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987477
102	NC_014131	CAT	2	6	11982	11987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987477
103	NC_014131	TAT	2	6	11989	11994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987477
104	NC_014131	TGA	2	6	12054	12059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987477
105	NC_014131	ACA	2	6	12120	12125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987477
106	NC_014131	CAA	2	6	12177	12182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987477
107	NC_014131	TAA	2	6	12207	12212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987477
108	NC_014131	AGC	2	6	12248	12253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987477
109	NC_014131	ATT	2	6	12345	12350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987478
110	NC_014131	AGA	2	6	12381	12386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987478
111	NC_014131	AGA	2	6	12480	12485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987478
112	NC_014131	ATT	2	6	12549	12554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987478
113	NC_014131	ATG	2	6	12754	12759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987478
114	NC_014131	GAT	2	6	12823	12828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987478
115	NC_014131	ATT	2	6	12849	12854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987478
116	NC_014131	TGA	2	6	13077	13082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987478
117	NC_014131	TGT	2	6	13194	13199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987478
118	NC_014131	TAA	2	6	13232	13237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987478
119	NC_014131	CTC	2	6	13238	13243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295987478
120	NC_014131	GAT	2	6	13315	13320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987478
121	NC_014131	TTA	2	6	13321	13326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987478
122	NC_014131	AGA	2	6	13366	13371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987478
123	NC_014131	TAA	2	6	13388	13393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987478
124	NC_014131	TTA	2	6	13487	13492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987478
125	NC_014131	AAC	2	6	13557	13562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987478
126	NC_014131	TCG	2	6	13692	13697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987478
127	NC_014131	TGC	2	6	13698	13703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987478
128	NC_014131	AGA	2	6	13764	13769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987478
129	NC_014131	TAG	2	6	13871	13876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987478
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.