MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 38382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014106	GTG	2	6	165061	165066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692023
3002	NC_014106	CTT	2	6	165150	165155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692023
3003	NC_014106	TGA	2	6	165317	165322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3004	NC_014106	TTG	2	6	165466	165471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692023
3005	NC_014106	ACAT	2	8	165484	165491	50 %	25 %	0 %	25 %	295692023
3006	NC_014106	ACC	2	6	165531	165536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692023
3007	NC_014106	GAA	2	6	165588	165593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692023
3008	NC_014106	AAG	2	6	165598	165603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692023
3009	NC_014106	TTC	2	6	165628	165633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692023
3010	NC_014106	GCT	2	6	165700	165705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692023
3011	NC_014106	TAG	2	6	165746	165751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3012	NC_014106	GGAA	2	8	165774	165781	50 %	0 %	50 %	0 %	295692023
3013	NC_014106	TGAA	2	8	165866	165873	50 %	25 %	25 %	0 %	295692023
3014	NC_014106	CAG	2	6	165902	165907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692023
3015	NC_014106	ATG	2	6	165922	165927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3016	NC_014106	CCG	2	6	165979	165984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692023
3017	NC_014106	GTT	2	6	166005	166010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692023
3018	NC_014106	AGT	2	6	166034	166039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3019	NC_014106	AAT	2	6	166077	166082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3020	NC_014106	AGT	2	6	166131	166136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692023
3021	NC_014106	GACT	2	8	166184	166191	25 %	25 %	25 %	25 %	295692023
3022	NC_014106	AAT	2	6	166192	166197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3023	NC_014106	GATT	2	8	166214	166221	25 %	50 %	25 %	0 %	295692023
3024	NC_014106	A	6	6	166273	166278	100 %	0 %	0 %	0 %	295692023
3025	NC_014106	T	6	6	166334	166339	0 %	100 %	0 %	0 %	295692023
3026	NC_014106	GCC	2	6	166413	166418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692023
3027	NC_014106	TGTAAC	2	12	166452	166463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295692023
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3029	NC_014106	TAA	2	6	166626	166631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692023
3030	NC_014106	GCC	2	6	166695	166700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692023
3031	NC_014106	CATAA	2	10	166722	166731	60 %	20 %	0 %	20 %	295692023
3032	NC_014106	AGCC	2	8	166781	166788	25 %	0 %	25 %	50 %	295692023
3033	NC_014106	TAT	2	6	166808	166813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692023
3034	NC_014106	TCA	2	6	166814	166819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692023
3035	NC_014106	TGA	2	6	167048	167053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692024
3036	NC_014106	TAAG	2	8	167100	167107	50 %	25 %	25 %	0 %	295692024
3037	NC_014106	TCT	2	6	167112	167117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692024
3038	NC_014106	TTC	2	6	167135	167140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692024
3039	NC_014106	CAAC	2	8	167194	167201	50 %	0 %	0 %	50 %	295692024
3040	NC_014106	TGT	2	6	167221	167226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692024
3041	NC_014106	TGT	2	6	167254	167259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692024
3042	NC_014106	GTT	2	6	167347	167352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692024
3043	NC_014106	TTC	2	6	167360	167365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692024
3044	NC_014106	TAG	2	6	167374	167379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692024
3045	NC_014106	GTC	2	6	167411	167416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692024
3046	NC_014106	TTC	2	6	167420	167425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692024
3047	NC_014106	AGCTTG	2	12	167438	167449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	295692024
3048	NC_014106	TTCTT	2	10	167454	167463	0 %	80 %	0 %	20 %	295692024
3049	NC_014106	TGA	2	6	167867	167872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692025
3050	NC_014106	AAGTG	2	10	167969	167978	40 %	20 %	40 %	0 %	295692025
3051	NC_014106	CTT	2	6	168008	168013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692025
3052	NC_014106	CGGA	2	8	168018	168025	25 %	0 %	50 %	25 %	295692025
3053	NC_014106	ATG	2	6	168125	168130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692026
3054	NC_014106	ATA	2	6	168188	168193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692026
3055	NC_014106	A	6	6	168221	168226	100 %	0 %	0 %	0 %	295692026
3056	NC_014106	ATTA	2	8	168258	168265	50 %	50 %	0 %	0 %	295692026
3057	NC_014106	AAT	2	6	168285	168290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692026
3058	NC_014106	TTCA	2	8	168331	168338	25 %	50 %	0 %	25 %	295692026
3059	NC_014106	ATG	2	6	168347	168352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692026
3060	NC_014106	TAT	2	6	168432	168437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692027
3061	NC_014106	AGCT	2	8	168452	168459	25 %	25 %	25 %	25 %	295692027
3062	NC_014106	GAA	2	6	168478	168483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692027
3063	NC_014106	AAG	2	6	168517	168522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692027
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3065	NC_014106	GGA	2	6	168570	168575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295692027
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3070	NC_014106	A	6	6	168798	168803	100 %	0 %	0 %	0 %	295692028
3071	NC_014106	TTG	2	6	168814	168819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692028
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3079	NC_014106	TTTA	2	8	169322	169329	25 %	75 %	0 %	0 %	295692029
3080	NC_014106	ATA	2	6	169422	169427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692029
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3089	NC_014106	TTGA	2	8	169656	169663	25 %	50 %	25 %	0 %	295692030
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3101	NC_014106	CAA	2	6	170142	170147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692031
3102	NC_014106	GAA	2	6	170181	170186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692031
3103	NC_014106	AAG	2	6	170249	170254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692031
3104	NC_014106	TGA	2	6	170262	170267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692031
3105	NC_014106	CAG	2	6	170300	170305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692031
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3107	NC_014106	ACT	2	6	170360	170365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692032
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3109	NC_014106	CTC	2	6	170526	170531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295692032
3110	NC_014106	CAG	2	6	170580	170585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692032
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3118	NC_014106	ACT	2	6	171262	171267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692033
3119	NC_014106	CTTAA	2	10	171283	171292	40 %	40 %	0 %	20 %	295692033
3120	NC_014106	GTA	2	6	171302	171307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692033
3121	NC_014106	TGC	2	6	171318	171323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692033
3122	NC_014106	ATC	2	6	171339	171344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692033
3123	NC_014106	TAA	2	6	171375	171380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692033
3124	NC_014106	CTG	2	6	171389	171394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692033
3125	NC_014106	TGG	2	6	171405	171410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692033
3126	NC_014106	ATC	2	6	171444	171449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692033
3127	NC_014106	GCT	2	6	171463	171468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692033
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3130	NC_014106	GTT	2	6	171553	171558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692033
3131	NC_014106	ACTCTT	2	12	171574	171585	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	295692033
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3133	NC_014106	ACTGTT	2	12	171628	171639	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295692033
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3135	NC_014106	TAC	2	6	171813	171818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692033
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3137	NC_014106	AGT	2	6	171940	171945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692033
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3141	NC_014106	TAG	2	6	172112	172117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692033
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3145	NC_014106	TAC	2	6	172192	172197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692033
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3152	NC_014106	AAG	2	6	172429	172434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692033
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3182	NC_014106	TAAA	2	8	173995	174002	75 %	25 %	0 %	0 %	295692034
3183	NC_014106	A	6	6	174024	174029	100 %	0 %	0 %	0 %	295692034
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3194	NC_014106	T	6	6	174528	174533	0 %	100 %	0 %	0 %	295692035
3195	NC_014106	TCAT	2	8	174541	174548	25 %	50 %	0 %	25 %	295692035
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3229	NC_014106	TGGTT	2	10	177114	177123	0 %	60 %	40 %	0 %	295692038
3230	NC_014106	AGA	2	6	177128	177133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692038
3231	NC_014106	AAG	2	6	177213	177218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692038
3232	NC_014106	AAG	2	6	177231	177236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692038
3233	NC_014106	AAG	2	6	177238	177243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692038
3234	NC_014106	ATC	2	6	177246	177251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692038
3235	NC_014106	GACGAT	2	12	177345	177356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	295692038
3236	NC_014106	TCG	2	6	177362	177367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692038
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3238	NC_014106	CCA	2	6	177410	177415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692038
3239	NC_014106	ATT	2	6	177450	177455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692038
3240	NC_014106	AT	3	6	177535	177540	50 %	50 %	0 %	0 %	295692038
3241	NC_014106	AATG	2	8	177692	177699	50 %	25 %	25 %	0 %	295692038
3242	NC_014106	TAT	2	6	177722	177727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692038
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3480	NC_014106	TAC	2	6	190181	190186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692050
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3483	NC_014106	ATTTT	2	10	190329	190338	20 %	80 %	0 %	0 %	295692051
3484	NC_014106	CTT	2	6	190368	190373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692051
3485	NC_014106	TTC	2	6	190435	190440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692051
3486	NC_014106	CGT	2	6	190448	190453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692051
3487	NC_014106	TGATA	2	10	190484	190493	40 %	40 %	20 %	0 %	295692051
3488	NC_014106	AAT	2	6	190584	190589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692051
3489	NC_014106	TTG	2	6	190606	190611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692051
3490	NC_014106	T	6	6	190901	190906	0 %	100 %	0 %	0 %	295692051
3491	NC_014106	ATTC	2	8	190916	190923	25 %	50 %	0 %	25 %	295692051
3492	NC_014106	AAG	2	6	190925	190930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692051
3493	NC_014106	TGTTT	2	10	190998	191007	0 %	80 %	20 %	0 %	295692051
3494	NC_014106	AGT	2	6	191038	191043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692051
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3497	NC_014106	AT	3	6	191086	191091	50 %	50 %	0 %	0 %	295692051
3498	NC_014106	GGTTG	2	10	191306	191315	0 %	40 %	60 %	0 %	295692052
3499	NC_014106	GAA	2	6	191342	191347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692052
3500	NC_014106	AAG	2	6	191351	191356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692052

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