MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 1616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013767	TTC	2	6	71818	71823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803341
1502	NC_013767	TA	3	6	71833	71838	50 %	50 %	0 %	0 %	284803341
1503	NC_013767	ATTT	2	8	71899	71906	25 %	75 %	0 %	0 %	284803341
1504	NC_013767	CGT	2	6	71907	71912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803341
1505	NC_013767	TA	3	6	71980	71985	50 %	50 %	0 %	0 %	284803341
1506	NC_013767	GCT	2	6	72096	72101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803341
1507	NC_013767	TTTC	2	8	72113	72120	0 %	75 %	0 %	25 %	284803341
1508	NC_013767	TCT	2	6	72241	72246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803341
1509	NC_013767	ATA	2	6	72254	72259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803341
1510	NC_013767	GTA	2	6	72297	72302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803341
1511	NC_013767	ATT	2	6	72874	72879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1512	NC_013767	ATT	2	6	72882	72887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1513	NC_013767	T	7	7	72886	72892	0 %	100 %	0 %	0 %	284803342
1514	NC_013767	TA	3	6	72894	72899	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1515	NC_013767	T	7	7	72903	72909	0 %	100 %	0 %	0 %	284803342
1516	NC_013767	AT	3	6	73048	73053	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1517	NC_013767	AT	3	6	73067	73072	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1518	NC_013767	ATC	2	6	73080	73085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1519	NC_013767	TAC	2	6	73115	73120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1520	NC_013767	AC	3	6	73168	73173	50 %	0 %	0 %	50 %	284803342
1521	NC_013767	CTT	2	6	73196	73201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803342
1522	NC_013767	AT	3	6	73217	73222	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1523	NC_013767	TAT	2	6	73250	73255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1524	NC_013767	TA	3	6	73260	73265	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1525	NC_013767	CTT	2	6	73274	73279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803342
1526	NC_013767	AATA	2	8	73281	73288	75 %	25 %	0 %	0 %	284803342
1527	NC_013767	T	8	8	73308	73315	0 %	100 %	0 %	0 %	284803342
1528	NC_013767	ATT	2	6	73339	73344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1529	NC_013767	TAGC	2	8	73346	73353	25 %	25 %	25 %	25 %	284803342
1530	NC_013767	TCAT	2	8	73381	73388	25 %	50 %	0 %	25 %	284803342
1531	NC_013767	A	7	7	73437	73443	100 %	0 %	0 %	0 %	284803342
1532	NC_013767	CTA	2	6	73480	73485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1533	NC_013767	CTA	2	6	73496	73501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1534	NC_013767	CTTC	2	8	73561	73568	0 %	50 %	0 %	50 %	284803342
1535	NC_013767	A	6	6	73597	73602	100 %	0 %	0 %	0 %	284803342
1536	NC_013767	TTA	2	6	73603	73608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1537	NC_013767	TTC	2	6	73641	73646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803342
1538	NC_013767	A	6	6	73675	73680	100 %	0 %	0 %	0 %	284803342
1539	NC_013767	GAT	2	6	73683	73688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803342
1540	NC_013767	T	6	6	73688	73693	0 %	100 %	0 %	0 %	284803342
1541	NC_013767	T	6	6	73742	73747	0 %	100 %	0 %	0 %	284803342
1542	NC_013767	CAT	2	6	73748	73753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1543	NC_013767	ATA	2	6	73796	73801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803342
1544	NC_013767	ACTT	2	8	73806	73813	25 %	50 %	0 %	25 %	284803342
1545	NC_013767	GAT	2	6	73831	73836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803342
1546	NC_013767	TAG	2	6	73862	73867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803342
1547	NC_013767	TAT	2	6	73904	73909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1548	NC_013767	GAAAA	2	10	73912	73921	80 %	0 %	20 %	0 %	284803342
1549	NC_013767	ACT	2	6	73927	73932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1550	NC_013767	T	6	6	73964	73969	0 %	100 %	0 %	0 %	284803342
1551	NC_013767	ATC	2	6	73995	74000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1552	NC_013767	ATT	3	9	74076	74084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1553	NC_013767	TTC	2	6	74085	74090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803342
1554	NC_013767	AATC	2	8	74126	74133	50 %	25 %	0 %	25 %	284803342
1555	NC_013767	AAT	2	6	74159	74164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803342
1556	NC_013767	AT	4	8	74175	74182	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1557	NC_013767	ATT	2	6	74188	74193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1558	NC_013767	A	6	6	74253	74258	100 %	0 %	0 %	0 %	284803342
1559	NC_013767	TTC	2	6	74388	74393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803342
1560	NC_013767	A	6	6	74445	74450	100 %	0 %	0 %	0 %	284803342
1561	NC_013767	ATT	2	6	74457	74462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1562	NC_013767	CTA	2	6	74497	74502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803342
1563	NC_013767	ATA	2	6	74555	74560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803342
1564	NC_013767	TC	3	6	74612	74617	0 %	50 %	0 %	50 %	284803342
1565	NC_013767	CAA	2	6	74618	74623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803342
1566	NC_013767	TA	3	6	74646	74651	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
1567	NC_013767	TAT	2	6	74660	74665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1568	NC_013767	TAA	2	6	74696	74701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803342
1569	NC_013767	ATT	2	6	74724	74729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803342
1570	NC_013767	TCC	2	6	74740	74745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284803343
1571	NC_013767	T	6	6	74790	74795	0 %	100 %	0 %	0 %	284803343
1572	NC_013767	TTC	2	6	74806	74811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803343
1573	NC_013767	CAA	2	6	74838	74843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803343
1574	NC_013767	ATT	2	6	74845	74850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803343
1575	NC_013767	ATTTT	2	10	74861	74870	20 %	80 %	0 %	0 %	284803343
1576	NC_013767	T	6	6	74867	74872	0 %	100 %	0 %	0 %	284803343
1577	NC_013767	CTA	2	6	74891	74896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803343
1578	NC_013767	TCA	2	6	74939	74944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803343
1579	NC_013767	ATT	2	6	74947	74952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803343
1580	NC_013767	GAT	2	6	74974	74979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803343
1581	NC_013767	AAG	2	6	74988	74993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803343
1582	NC_013767	ATT	2	6	75004	75009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803343
1583	NC_013767	TAT	2	6	75013	75018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803343
1584	NC_013767	TCG	2	6	75032	75037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803343
1585	NC_013767	TAAT	2	8	75057	75064	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
1586	NC_013767	AT	3	6	75157	75162	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
1587	NC_013767	TTTC	2	8	75192	75199	0 %	75 %	0 %	25 %	284803343
1588	NC_013767	AT	3	6	75211	75216	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
1589	NC_013767	T	7	7	75228	75234	0 %	100 %	0 %	0 %	284803343
1590	NC_013767	CATA	2	8	75321	75328	50 %	25 %	0 %	25 %	284803343
1591	NC_013767	AT	3	6	75359	75364	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
1592	NC_013767	TAT	2	6	75381	75386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803343
1593	NC_013767	ATTCA	2	10	75394	75403	40 %	40 %	0 %	20 %	284803343
1594	NC_013767	GAA	2	6	75470	75475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803343
1595	NC_013767	TAAA	2	8	75484	75491	75 %	25 %	0 %	0 %	284803343
1596	NC_013767	T	6	6	75556	75561	0 %	100 %	0 %	0 %	284803343
1597	NC_013767	TTC	2	6	75646	75651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803343
1598	NC_013767	TCT	2	6	75671	75676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803343
1599	NC_013767	GCT	2	6	75752	75757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803343
1600	NC_013767	T	6	6	75840	75845	0 %	100 %	0 %	0 %	284803343
1601	NC_013767	T	7	7	75862	75868	0 %	100 %	0 %	0 %	284803343
1602	NC_013767	TTA	2	6	75872	75877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803343
1603	NC_013767	GTA	2	6	75886	75891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803343
1604	NC_013767	TCA	2	6	75902	75907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803343
1605	NC_013767	TTG	2	6	76203	76208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803344
1606	NC_013767	GTT	2	6	76224	76229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803344
1607	NC_013767	GCA	2	6	76248	76253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803344
1608	NC_013767	TCT	2	6	76305	76310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803344
1609	NC_013767	CCGG	2	8	76324	76331	0 %	0 %	50 %	50 %	284803344
1610	NC_013767	CCA	2	6	76332	76337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284803344
1611	NC_013767	AGC	2	6	76355	76360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803344
1612	NC_013767	CTG	2	6	76369	76374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803344
1613	NC_013767	AGC	2	6	76415	76420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803344
1614	NC_013767	TTGA	2	8	76514	76521	25 %	50 %	25 %	0 %	284803344
1615	NC_013767	CCTA	2	8	76547	76554	25 %	25 %	0 %	50 %	284803344
1616	NC_013767	AATC	2	8	76600	76607	50 %	25 %	0 %	25 %	284803344

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.