MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 1616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013767	ACT	2	6	26229	26234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803290
502	NC_013767	TTA	2	6	26235	26240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803290
503	NC_013767	A	6	6	26286	26291	100 %	0 %	0 %	0 %	284803290
504	NC_013767	A	6	6	26325	26330	100 %	0 %	0 %	0 %	284803290
505	NC_013767	AGC	2	6	26363	26368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803290
506	NC_013767	AAC	2	6	26392	26397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803290
507	NC_013767	CTA	2	6	26422	26427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803290
508	NC_013767	A	6	6	26445	26450	100 %	0 %	0 %	0 %	284803290
509	NC_013767	ACA	2	6	26456	26461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803290
510	NC_013767	TAAA	2	8	26500	26507	75 %	25 %	0 %	0 %	284803290
511	NC_013767	A	6	6	26559	26564	100 %	0 %	0 %	0 %	284803290
512	NC_013767	AGC	2	6	26570	26575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803290
513	NC_013767	AGAA	2	8	26581	26588	75 %	0 %	25 %	0 %	284803290
514	NC_013767	CAA	3	9	26592	26600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803290
515	NC_013767	CTT	2	6	26605	26610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803290
516	NC_013767	CAA	2	6	26616	26621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803290
517	NC_013767	ACAGCA	2	12	26689	26700	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284803290
518	NC_013767	TTC	2	6	26717	26722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803290
519	NC_013767	TAC	2	6	26726	26731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803290
520	NC_013767	AGT	2	6	26754	26759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803290
521	NC_013767	GAA	2	6	26762	26767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803290
522	NC_013767	GA	3	6	26842	26847	50 %	0 %	50 %	0 %	284803290
523	NC_013767	GGT	2	6	26856	26861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803290
524	NC_013767	AAT	2	6	26884	26889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803290
525	NC_013767	GCA	2	6	26986	26991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803291
526	NC_013767	AAC	2	6	27020	27025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803291
527	NC_013767	CA	3	6	27032	27037	50 %	0 %	0 %	50 %	284803291
528	NC_013767	TTA	2	6	27047	27052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803291
529	NC_013767	TTA	2	6	27077	27082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803291
530	NC_013767	TCA	2	6	27093	27098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803291
531	NC_013767	AT	3	6	27111	27116	50 %	50 %	0 %	0 %	284803291
532	NC_013767	CTT	2	6	27123	27128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803291
533	NC_013767	AAATG	2	10	27144	27153	60 %	20 %	20 %	0 %	284803291
534	NC_013767	GAG	2	6	27154	27159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803291
535	NC_013767	ATT	3	9	27163	27171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803291
536	NC_013767	GAA	2	6	27235	27240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803291
537	NC_013767	GAA	3	9	27268	27276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803291
538	NC_013767	AT	3	6	27315	27320	50 %	50 %	0 %	0 %	284803291
539	NC_013767	TGGG	2	8	27326	27333	0 %	25 %	75 %	0 %	284803292
540	NC_013767	GAA	2	6	27350	27355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803292
541	NC_013767	AATT	2	8	27384	27391	50 %	50 %	0 %	0 %	284803292
542	NC_013767	A	6	6	27412	27417	100 %	0 %	0 %	0 %	284803292
543	NC_013767	AAAT	2	8	27421	27428	75 %	25 %	0 %	0 %	284803292
544	NC_013767	AGG	2	6	27435	27440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284803292
545	NC_013767	ATG	2	6	27866	27871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803293
546	NC_013767	ATT	2	6	27901	27906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803293
547	NC_013767	AGT	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803293
548	NC_013767	T	6	6	27935	27940	0 %	100 %	0 %	0 %	284803293
549	NC_013767	ATT	2	6	27944	27949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803293
550	NC_013767	GTG	2	6	27963	27968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803293
551	NC_013767	TTG	2	6	28029	28034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284803293
552	NC_013767	TTAT	2	8	28038	28045	25 %	75 %	0 %	0 %	284803293
553	NC_013767	A	6	6	28085	28090	100 %	0 %	0 %	0 %	284803293
554	NC_013767	ATCA	2	8	28157	28164	50 %	25 %	0 %	25 %	284803293
555	NC_013767	ATTA	2	8	28213	28220	50 %	50 %	0 %	0 %	284803293
556	NC_013767	AAG	2	6	28221	28226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803293
557	NC_013767	AAC	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803293
558	NC_013767	ATG	2	6	28324	28329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803293
559	NC_013767	GATG	2	8	28347	28354	25 %	25 %	50 %	0 %	284803294
560	NC_013767	AAAG	2	8	28357	28364	75 %	0 %	25 %	0 %	284803294
561	NC_013767	T	6	6	28434	28439	0 %	100 %	0 %	0 %	284803294
562	NC_013767	AT	3	6	28460	28465	50 %	50 %	0 %	0 %	284803294
563	NC_013767	A	6	6	28475	28480	100 %	0 %	0 %	0 %	284803294
564	NC_013767	GAT	2	6	28485	28490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803294
565	NC_013767	TAT	2	6	28533	28538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803294
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567	NC_013767	T	6	6	28609	28614	0 %	100 %	0 %	0 %	284803294
568	NC_013767	AATT	2	8	28625	28632	50 %	50 %	0 %	0 %	284803294
569	NC_013767	AT	3	6	28644	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	284803294
570	NC_013767	AGT	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803294
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573	NC_013767	TAGA	2	8	28715	28722	50 %	25 %	25 %	0 %	284803294
574	NC_013767	CGT	2	6	28922	28927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803295
575	NC_013767	GCTA	2	8	28972	28979	25 %	25 %	25 %	25 %	284803295
576	NC_013767	CGAT	2	8	29124	29131	25 %	25 %	25 %	25 %	284803295
577	NC_013767	CCA	2	6	29136	29141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284803295
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580	NC_013767	AAG	2	6	29244	29249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803295
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584	NC_013767	ATT	2	6	29457	29462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803295
585	NC_013767	CAA	2	6	29502	29507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284803295
586	NC_013767	CTG	2	6	29511	29516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803295
587	NC_013767	GAC	2	6	29554	29559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803295
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589	NC_013767	TCA	2	6	29747	29752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803296
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591	NC_013767	CAAG	2	8	29827	29834	50 %	0 %	25 %	25 %	284803296
592	NC_013767	CA	3	6	29876	29881	50 %	0 %	0 %	50 %	284803296
593	NC_013767	CCA	2	6	29905	29910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284803296
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595	NC_013767	TAT	2	6	30060	30065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284803296
596	NC_013767	TGCT	2	8	30145	30152	0 %	50 %	25 %	25 %	284803296
597	NC_013767	TAC	2	6	30323	30328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803296
598	NC_013767	AGT	2	6	30345	30350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803296
599	NC_013767	GAC	2	6	30371	30376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803296
600	NC_013767	AAG	2	6	30450	30455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284803296
601	NC_013767	AAT	2	6	30516	30521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803296
602	NC_013767	GTG	2	6	30545	30550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803296
603	NC_013767	CTT	2	6	30594	30599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284803296
604	NC_013767	A	6	6	30612	30617	100 %	0 %	0 %	0 %	284803296
605	NC_013767	A	8	8	30636	30643	100 %	0 %	0 %	0 %	284803296
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607	NC_013767	A	7	7	30657	30663	100 %	0 %	0 %	0 %	284803297
608	NC_013767	TAA	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803297
609	NC_013767	ATG	2	6	30931	30936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803297
610	NC_013767	AAT	2	6	30942	30947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803297
611	NC_013767	ATGAT	2	10	30961	30970	40 %	40 %	20 %	0 %	284803297
612	NC_013767	AAT	2	6	31002	31007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803297
613	NC_013767	CTA	2	6	31034	31039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803297
614	NC_013767	ATG	2	6	31060	31065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284803297
615	NC_013767	GCG	2	6	31066	31071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284803297
616	NC_013767	TAC	2	6	31148	31153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284803297
617	NC_013767	CTG	2	6	31156	31161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284803297
618	NC_013767	GAAT	2	8	31171	31178	50 %	25 %	25 %	0 %	284803297
619	NC_013767	A	7	7	31221	31227	100 %	0 %	0 %	0 %	284803297
620	NC_013767	AGC	2	6	31259	31264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803297
621	NC_013767	TGG	2	6	31337	31342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284803297
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624	NC_013767	CAG	2	6	31447	31452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284803297
625	NC_013767	ATA	2	6	31453	31458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803297
626	NC_013767	AAT	2	6	31470	31475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284803297
627	NC_013767	CGC	2	6	31529	31534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284803297
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