MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 60814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013766	GAA	2	6	22739	22744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800278
502	NC_013766	A	6	6	22765	22770	100 %	0 %	0 %	0 %	284800278
503	NC_013766	GGA	2	6	22829	22834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800278
504	NC_013766	CTT	2	6	22888	22893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800278
505	NC_013766	T	6	6	22935	22940	0 %	100 %	0 %	0 %	284800278
506	NC_013766	AGG	2	6	22952	22957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800278
507	NC_013766	TTG	2	6	23065	23070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800278
508	NC_013766	A	6	6	23131	23136	100 %	0 %	0 %	0 %	284800278
509	NC_013766	TTG	2	6	23137	23142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800278
510	NC_013766	AAT	2	6	23194	23199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800279
511	NC_013766	TAAA	2	8	23226	23233	75 %	25 %	0 %	0 %	284800279
512	NC_013766	GCGT	2	8	23271	23278	0 %	25 %	50 %	25 %	284800279
513	NC_013766	GAA	2	6	23288	23293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800279
514	NC_013766	G	7	7	23326	23332	0 %	0 %	100 %	0 %	284800279
515	NC_013766	CA	3	6	23474	23479	50 %	0 %	0 %	50 %	284800279
516	NC_013766	A	6	6	23522	23527	100 %	0 %	0 %	0 %	284800279
517	NC_013766	AGC	2	6	23560	23565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800279
518	NC_013766	TGC	2	6	23578	23583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800279
519	NC_013766	GCG	2	6	23607	23612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800279
520	NC_013766	CAA	2	6	23648	23653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800279
521	NC_013766	TGA	2	6	23701	23706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800279
522	NC_013766	CAA	2	6	23763	23768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800279
523	NC_013766	A	6	6	23777	23782	100 %	0 %	0 %	0 %	284800279
524	NC_013766	ATGA	2	8	23999	24006	50 %	25 %	25 %	0 %	284800279
525	NC_013766	GAT	2	6	24065	24070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800279
526	NC_013766	T	6	6	24126	24131	0 %	100 %	0 %	0 %	284800279
527	NC_013766	AAC	2	6	24189	24194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800279
528	NC_013766	GAAA	2	8	24229	24236	75 %	0 %	25 %	0 %	284800279
529	NC_013766	CGA	2	6	24240	24245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800279
530	NC_013766	GAA	2	6	24299	24304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800279
531	NC_013766	GCA	2	6	24317	24322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800279
532	NC_013766	CAT	2	6	24374	24379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800279
533	NC_013766	GCG	2	6	24419	24424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800279
534	NC_013766	GCT	2	6	24463	24468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800279
535	NC_013766	GAC	2	6	24516	24521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800279
536	NC_013766	ATA	3	9	24570	24578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800279
537	NC_013766	A	6	6	24675	24680	100 %	0 %	0 %	0 %	284800279
538	NC_013766	GAT	2	6	24722	24727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800279
539	NC_013766	GGC	2	6	24769	24774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800279
540	NC_013766	CTA	2	6	24794	24799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800279
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542	NC_013766	AAG	2	6	24813	24818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800279
543	NC_013766	GAAC	2	8	24820	24827	50 %	0 %	25 %	25 %	284800279
544	NC_013766	AGCA	2	8	24840	24847	50 %	0 %	25 %	25 %	284800279
545	NC_013766	TGT	2	6	24858	24863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800279
546	NC_013766	AAG	2	6	25020	25025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800279
547	NC_013766	TCAT	2	8	25054	25061	25 %	50 %	0 %	25 %	284800279
548	NC_013766	TC	3	6	25085	25090	0 %	50 %	0 %	50 %	284800279
549	NC_013766	GGT	2	6	25108	25113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800279
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554	NC_013766	A	7	7	25534	25540	100 %	0 %	0 %	0 %	284800280
555	NC_013766	A	6	6	25609	25614	100 %	0 %	0 %	0 %	284800280
556	NC_013766	CGA	2	6	25658	25663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800280
557	NC_013766	A	6	6	25726	25731	100 %	0 %	0 %	0 %	284800280
558	NC_013766	ATT	3	9	25744	25752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800280
559	NC_013766	TGG	2	6	25758	25763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800280
560	NC_013766	ATA	2	6	25832	25837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800280
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565	NC_013766	TCCA	2	8	26370	26377	25 %	25 %	0 %	50 %	284800280
566	NC_013766	GAAA	2	8	26409	26416	75 %	0 %	25 %	0 %	284800280
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570	NC_013766	TCA	2	6	26521	26526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800281
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595	NC_013766	TTC	2	6	28146	28151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800283
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600	NC_013766	ATT	2	6	28508	28513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800284
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602	NC_013766	AAG	2	6	28589	28594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800284
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610	NC_013766	ATTT	2	8	28946	28953	25 %	75 %	0 %	0 %	284800285
611	NC_013766	TGC	2	6	28955	28960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800285
612	NC_013766	ATG	2	6	28976	28981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800285
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614	NC_013766	AGA	2	6	29139	29144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800285
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617	NC_013766	AAGAC	2	10	29333	29342	60 %	0 %	20 %	20 %	284800286
618	NC_013766	TA	3	6	29388	29393	50 %	50 %	0 %	0 %	284800286
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626	NC_013766	TATT	2	8	29847	29854	25 %	75 %	0 %	0 %	284800286
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