MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	AATA	2	8	950	957	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
2	NC_013657	TGAT	2	8	1057	1064	25 %	50 %	25 %	0 %	281427969
3	NC_013657	AAAT	2	8	1811	1818	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
4	NC_013657	AATG	2	8	1907	1914	50 %	25 %	25 %	0 %	281427969
5	NC_013657	TAAA	2	8	1928	1935	75 %	25 %	0 %	0 %	281427969
6	NC_013657	TTGA	2	8	2793	2800	25 %	50 %	25 %	0 %	281427970
7	NC_013657	ATTC	2	8	2995	3002	25 %	50 %	0 %	25 %	281427970
8	NC_013657	ATCA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	0 %	25 %	281427970
9	NC_013657	ATTG	2	8	3665	3672	25 %	50 %	25 %	0 %	281427971
10	NC_013657	CTCG	2	8	3817	3824	0 %	25 %	25 %	50 %	281427971
11	NC_013657	TTGA	2	8	4158	4165	25 %	50 %	25 %	0 %	281427971
12	NC_013657	TTTA	2	8	4206	4213	25 %	75 %	0 %	0 %	281427972
13	NC_013657	ATTT	2	8	4321	4328	25 %	75 %	0 %	0 %	281427972
14	NC_013657	AAAG	2	8	4753	4760	75 %	0 %	25 %	0 %	281427973
15	NC_013657	TTGC	2	8	4957	4964	0 %	50 %	25 %	25 %	281427973
16	NC_013657	GTTT	2	8	5228	5235	0 %	75 %	25 %	0 %	281427973
17	NC_013657	GCAA	2	8	5377	5384	50 %	0 %	25 %	25 %	281427973
18	NC_013657	GAAT	2	8	8372	8379	50 %	25 %	25 %	0 %	281427975
19	NC_013657	AAAT	2	8	8381	8388	75 %	25 %	0 %	0 %	281427975
20	NC_013657	ATTA	2	8	8622	8629	50 %	50 %	0 %	0 %	281427975
21	NC_013657	CAAA	2	8	8985	8992	75 %	0 %	0 %	25 %	281427976
22	NC_013657	TAAT	2	8	9103	9110	50 %	50 %	0 %	0 %	281427976
23	NC_013657	TACA	2	8	9703	9710	50 %	25 %	0 %	25 %	281427977
24	NC_013657	TTTA	2	8	10109	10116	25 %	75 %	0 %	0 %	281427977
25	NC_013657	CTTT	2	8	10930	10937	0 %	75 %	0 %	25 %	281427978
26	NC_013657	ATTA	2	8	10940	10947	50 %	50 %	0 %	0 %	281427978
27	NC_013657	TTGA	2	8	11717	11724	25 %	50 %	25 %	0 %	281427979
28	NC_013657	TAAT	2	8	12436	12443	50 %	50 %	0 %	0 %	281427980
29	NC_013657	ATAA	2	8	12576	12583	75 %	25 %	0 %	0 %	281427980
30	NC_013657	AATA	2	8	12629	12636	75 %	25 %	0 %	0 %	281427980
31	NC_013657	GTTT	2	8	13300	13307	0 %	75 %	25 %	0 %	281427981
32	NC_013657	AACT	2	8	13411	13418	50 %	25 %	0 %	25 %	281427981
33	NC_013657	TTTG	2	8	14533	14540	0 %	75 %	25 %	0 %	281427983
34	NC_013657	TCGT	2	8	16480	16487	0 %	50 %	25 %	25 %	281427985
35	NC_013657	ATCA	2	8	16618	16625	50 %	25 %	0 %	25 %	281427985
36	NC_013657	CTTT	2	8	17095	17102	0 %	75 %	0 %	25 %	281427985
37	NC_013657	TCTA	2	8	17637	17644	25 %	50 %	0 %	25 %	281427985
38	NC_013657	TTTA	2	8	17785	17792	25 %	75 %	0 %	0 %	281427985
39	NC_013657	CAAA	2	8	17912	17919	75 %	0 %	0 %	25 %	281427985
40	NC_013657	CAAA	2	8	18314	18321	75 %	0 %	0 %	25 %	281427985
41	NC_013657	GTTT	2	8	23111	23118	0 %	75 %	25 %	0 %	281427987
42	NC_013657	ATGT	2	8	23949	23956	25 %	50 %	25 %	0 %	281427988
43	NC_013657	CAGT	2	8	24396	24403	25 %	25 %	25 %	25 %	281427988
44	NC_013657	AATT	2	8	24461	24468	50 %	50 %	0 %	0 %	281427988
45	NC_013657	TTTG	2	8	24858	24865	0 %	75 %	25 %	0 %	281427988
46	NC_013657	TCCA	2	8	25484	25491	25 %	25 %	0 %	50 %	281427988
47	NC_013657	ATTT	2	8	25615	25622	25 %	75 %	0 %	0 %	281427988
48	NC_013657	ACCC	2	8	26501	26508	25 %	0 %	0 %	75 %	281427989
49	NC_013657	TACT	2	8	28507	28514	25 %	50 %	0 %	25 %	281427990
50	NC_013657	AAAG	2	8	30711	30718	75 %	0 %	25 %	0 %	281427992
51	NC_013657	TATT	2	8	31294	31301	25 %	75 %	0 %	0 %	281427992
52	NC_013657	AATT	2	8	32993	33000	50 %	50 %	0 %	0 %	281427995
53	NC_013657	AGTC	2	8	33406	33413	25 %	25 %	25 %	25 %	281427995
54	NC_013657	CAAT	2	8	35224	35231	50 %	25 %	0 %	25 %	281427997
55	NC_013657	ATCA	2	8	35366	35373	50 %	25 %	0 %	25 %	281427997

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.