MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 35523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013504	AATA	2	8	151847	151854	75 %	25 %	0 %	0 %	268318705
3002	NC_013504	AGAAA	2	10	151909	151918	80 %	0 %	20 %	0 %	268318705
3003	NC_013504	GAT	2	6	152051	152056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318706
3004	NC_013504	CTT	2	6	152075	152080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318706
3005	NC_013504	GCTG	2	8	152228	152235	0 %	25 %	50 %	25 %	268318706
3006	NC_013504	ATT	2	6	152267	152272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3007	NC_013504	GCT	2	6	152312	152317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318706
3008	NC_013504	GGC	2	6	152369	152374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318706
3009	NC_013504	TTAA	2	8	152387	152394	50 %	50 %	0 %	0 %	268318706
3010	NC_013504	ATTT	2	8	152447	152454	25 %	75 %	0 %	0 %	268318706
3011	NC_013504	ATT	2	6	152508	152513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3012	NC_013504	ATTA	2	8	152576	152583	50 %	50 %	0 %	0 %	268318706
3013	NC_013504	ATT	2	6	152591	152596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3014	NC_013504	AGAA	2	8	152608	152615	75 %	0 %	25 %	0 %	268318706
3015	NC_013504	CTG	2	6	152661	152666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318706
3016	NC_013504	ACT	2	6	152696	152701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318706
3017	NC_013504	TA	3	6	152784	152789	50 %	50 %	0 %	0 %	268318706
3018	NC_013504	ATT	2	6	152816	152821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3019	NC_013504	TCA	2	6	152875	152880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318706
3020	NC_013504	AGT	2	6	152881	152886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318706
3021	NC_013504	TGCC	2	8	153006	153013	0 %	25 %	25 %	50 %	268318706
3022	NC_013504	TTG	2	6	153153	153158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318706
3023	NC_013504	ATG	2	6	153176	153181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318706
3024	NC_013504	ATT	2	6	153188	153193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318706
3025	NC_013504	GCA	2	6	153477	153482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318707
3026	NC_013504	CTG	2	6	153490	153495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318707
3027	NC_013504	ACA	2	6	153501	153506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318707
3028	NC_013504	TTG	2	6	153508	153513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318707
3029	NC_013504	TTA	2	6	153621	153626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318707
3030	NC_013504	ACT	2	6	153654	153659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318707
3031	NC_013504	TG	3	6	153673	153678	0 %	50 %	50 %	0 %	268318707
3032	NC_013504	ATCA	2	8	153691	153698	50 %	25 %	0 %	25 %	268318707
3033	NC_013504	ATG	2	6	153715	153720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3034	NC_013504	TTACT	2	10	153741	153750	20 %	60 %	0 %	20 %	268318707
3035	NC_013504	TGA	2	6	153767	153772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3036	NC_013504	AAG	2	6	153786	153791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3037	NC_013504	TTG	2	6	153796	153801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318707
3038	NC_013504	ATT	2	6	153851	153856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318707
3039	NC_013504	ATG	2	6	153862	153867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3040	NC_013504	TGA	2	6	153875	153880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3041	NC_013504	GAA	2	6	153936	153941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3042	NC_013504	ATG	2	6	153958	153963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3043	NC_013504	ACA	2	6	154024	154029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318707
3044	NC_013504	TGT	2	6	154031	154036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318707
3045	NC_013504	AAG	3	9	154045	154053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3046	NC_013504	ATT	2	6	154061	154066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318707
3047	NC_013504	GAA	2	6	154067	154072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3048	NC_013504	AT	3	6	154097	154102	50 %	50 %	0 %	0 %	268318707
3049	NC_013504	AGA	2	6	154127	154132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3050	NC_013504	GAA	2	6	154158	154163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3051	NC_013504	TGC	2	6	154229	154234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318707
3052	NC_013504	GAAA	2	8	154276	154283	75 %	0 %	25 %	0 %	268318707
3053	NC_013504	ATG	2	6	154300	154305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318707
3054	NC_013504	GAA	2	6	154347	154352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318707
3055	NC_013504	TAA	2	6	154353	154358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318707
3056	NC_013504	A	6	6	154485	154490	100 %	0 %	0 %	0 %	268318708
3057	NC_013504	TGC	2	6	154522	154527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3058	NC_013504	TAA	2	6	154555	154560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3059	NC_013504	A	7	7	154654	154660	100 %	0 %	0 %	0 %	268318708
3060	NC_013504	TAA	2	6	154666	154671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3061	NC_013504	CAAG	2	8	154676	154683	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3062	NC_013504	CAA	2	6	154734	154739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3063	NC_013504	CAA	2	6	154757	154762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3064	NC_013504	GAT	2	6	154793	154798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3065	NC_013504	AAGC	2	8	154799	154806	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3066	NC_013504	AGCA	2	8	154815	154822	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3067	NC_013504	AGTGCA	2	12	154838	154849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268318708
3068	NC_013504	AGCAA	2	10	154852	154861	60 %	0 %	20 %	20 %	268318708
3069	NC_013504	TGC	2	6	154900	154905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3070	NC_013504	GCT	2	6	154925	154930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3071	NC_013504	AAG	2	6	155034	155039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3072	NC_013504	CTG	2	6	155052	155057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3073	NC_013504	ATA	2	6	155058	155063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3074	NC_013504	GCT	2	6	155081	155086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3075	NC_013504	CAAAA	2	10	155112	155121	80 %	0 %	0 %	20 %	268318708
3076	NC_013504	GCT	2	6	155201	155206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3077	NC_013504	TAA	3	9	155239	155247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3078	NC_013504	TAG	2	6	155271	155276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3079	NC_013504	CAAG	2	8	155351	155358	50 %	0 %	25 %	25 %	268318708
3080	NC_013504	AGC	2	6	155362	155367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3081	NC_013504	AGA	2	6	155419	155424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3082	NC_013504	ATA	2	6	155439	155444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3083	NC_013504	TCA	2	6	155445	155450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318708
3084	NC_013504	CCAT	2	8	155608	155615	25 %	25 %	0 %	50 %	268318708
3085	NC_013504	TGA	2	6	155674	155679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3086	NC_013504	ATC	2	6	155685	155690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318708
3087	NC_013504	TTA	2	6	155696	155701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318708
3088	NC_013504	AGTA	2	8	155705	155712	50 %	25 %	25 %	0 %	268318708
3089	NC_013504	GAA	2	6	155732	155737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3090	NC_013504	AT	3	6	155739	155744	50 %	50 %	0 %	0 %	268318708
3091	NC_013504	AT	3	6	155803	155808	50 %	50 %	0 %	0 %	268318708
3092	NC_013504	GCT	2	6	155828	155833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3093	NC_013504	TA	3	6	155910	155915	50 %	50 %	0 %	0 %	268318708
3094	NC_013504	ATG	2	6	155993	155998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3095	NC_013504	AAT	2	6	155999	156004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3096	NC_013504	AATGG	2	10	156041	156050	40 %	20 %	40 %	0 %	268318708
3097	NC_013504	AAG	2	6	156102	156107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3098	NC_013504	GCA	2	6	156161	156166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3099	NC_013504	A	6	6	156229	156234	100 %	0 %	0 %	0 %	268318708
3100	NC_013504	CTA	2	6	156240	156245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318708
3101	NC_013504	GCT	2	6	156275	156280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3102	NC_013504	CAA	2	6	156311	156316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3103	NC_013504	AAC	2	6	156318	156323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3104	NC_013504	GGA	2	6	156388	156393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318708
3105	NC_013504	CTG	3	9	156462	156470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3106	NC_013504	ATG	2	6	156507	156512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3107	NC_013504	ATA	2	6	156525	156530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3108	NC_013504	GCT	2	6	156548	156553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3109	NC_013504	TCAA	2	8	156595	156602	50 %	25 %	0 %	25 %	268318708
3110	NC_013504	GCT	2	6	156611	156616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3111	NC_013504	ATG	2	6	156639	156644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318708
3112	NC_013504	CTG	2	6	156651	156656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3113	NC_013504	TAA	2	6	156658	156663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3114	NC_013504	CAA	2	6	156677	156682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318708
3115	NC_013504	AATCTA	2	12	156705	156716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268318708
3116	NC_013504	AGA	2	6	156745	156750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3117	NC_013504	AAG	2	6	156755	156760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318708
3118	NC_013504	GCAGAA	2	12	156761	156772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268318708
3119	NC_013504	GCT	2	6	156776	156781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318708
3120	NC_013504	TAA	2	6	156826	156831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318708
3121	NC_013504	GAAA	2	8	156832	156839	75 %	0 %	25 %	0 %	268318708
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3486	NC_013504	A	6	6	173386	173391	100 %	0 %	0 %	0 %	268318721
3487	NC_013504	ACT	3	9	173394	173402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318721
3488	NC_013504	ATCT	2	8	173449	173456	25 %	50 %	0 %	25 %	268318721
3489	NC_013504	GCA	2	6	173466	173471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318721
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3491	NC_013504	GAA	2	6	173541	173546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318721
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