MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	A	7	7	1366	1372	100 %	0 %	0 %	0 %	258509941
2	NC_013200	A	6	6	1632	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	258509942
3	NC_013200	A	6	6	3531	3536	100 %	0 %	0 %	0 %	258509944
4	NC_013200	T	7	7	4733	4739	0 %	100 %	0 %	0 %	258509947
5	NC_013200	A	6	6	8021	8026	100 %	0 %	0 %	0 %	258509951
6	NC_013200	A	7	7	8410	8416	100 %	0 %	0 %	0 %	258509951
7	NC_013200	A	6	6	11150	11155	100 %	0 %	0 %	0 %	258509955
8	NC_013200	T	6	6	11824	11829	0 %	100 %	0 %	0 %	258509956
9	NC_013200	A	6	6	12059	12064	100 %	0 %	0 %	0 %	258509957
10	NC_013200	T	6	6	12848	12853	0 %	100 %	0 %	0 %	258509958
11	NC_013200	A	6	6	14292	14297	100 %	0 %	0 %	0 %	258509959
12	NC_013200	A	6	6	14735	14740	100 %	0 %	0 %	0 %	258509960
13	NC_013200	T	6	6	14867	14872	0 %	100 %	0 %	0 %	258509960
14	NC_013200	A	6	6	15248	15253	100 %	0 %	0 %	0 %	258509960
15	NC_013200	A	6	6	15804	15809	100 %	0 %	0 %	0 %	258509962
16	NC_013200	A	6	6	17822	17827	100 %	0 %	0 %	0 %	258509964
17	NC_013200	A	6	6	19690	19695	100 %	0 %	0 %	0 %	258509964
18	NC_013200	T	6	6	24679	24684	0 %	100 %	0 %	0 %	258509969
19	NC_013200	T	7	7	25921	25927	0 %	100 %	0 %	0 %	258509972
20	NC_013200	A	6	6	26352	26357	100 %	0 %	0 %	0 %	258509973
21	NC_013200	A	6	6	26445	26450	100 %	0 %	0 %	0 %	258509973
22	NC_013200	T	7	7	26729	26735	0 %	100 %	0 %	0 %	258509974
23	NC_013200	T	6	6	27036	27041	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
24	NC_013200	T	6	6	27116	27121	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
25	NC_013200	T	6	6	27334	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	258509975
26	NC_013200	T	6	6	27849	27854	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
27	NC_013200	C	6	6	28068	28073	0 %	0 %	0 %	100 %	258509976
28	NC_013200	T	6	6	28585	28590	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
29	NC_013200	A	6	6	29073	29078	100 %	0 %	0 %	0 %	258509976
30	NC_013200	T	6	6	29181	29186	0 %	100 %	0 %	0 %	258509976
31	NC_013200	T	7	7	29461	29467	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
32	NC_013200	T	7	7	31252	31258	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
33	NC_013200	T	7	7	31898	31904	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
34	NC_013200	T	6	6	34990	34995	0 %	100 %	0 %	0 %	258509979
35	NC_013200	A	6	6	35339	35344	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
36	NC_013200	A	6	6	35885	35890	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
37	NC_013200	A	6	6	36094	36099	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
38	NC_013200	A	6	6	36736	36741	100 %	0 %	0 %	0 %	258509981
39	NC_013200	A	7	7	37364	37370	100 %	0 %	0 %	0 %	258509982
40	NC_013200	T	6	6	38180	38185	0 %	100 %	0 %	0 %	258509984
41	NC_013200	T	6	6	39051	39056	0 %	100 %	0 %	0 %	258509985
42	NC_013200	T	7	7	40184	40190	0 %	100 %	0 %	0 %	258509988
43	NC_013200	T	6	6	41786	41791	0 %	100 %	0 %	0 %	258509989
44	NC_013200	A	7	7	44669	44675	100 %	0 %	0 %	0 %	258509992
45	NC_013200	T	6	6	46366	46371	0 %	100 %	0 %	0 %	258509995
46	NC_013200	A	6	6	48091	48096	100 %	0 %	0 %	0 %	258509996
47	NC_013200	A	7	7	49119	49125	100 %	0 %	0 %	0 %	258509998
48	NC_013200	A	6	6	50490	50495	100 %	0 %	0 %	0 %	258510002
49	NC_013200	A	6	6	50757	50762	100 %	0 %	0 %	0 %	258510002
50	NC_013200	A	6	6	52917	52922	100 %	0 %	0 %	0 %	258510003
51	NC_013200	T	7	7	55922	55928	0 %	100 %	0 %	0 %	258510008
52	NC_013200	T	8	8	58916	58923	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
53	NC_013200	A	6	6	59008	59013	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
54	NC_013200	T	7	7	59650	59656	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
55	NC_013200	T	6	6	60313	60318	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
56	NC_013200	A	6	6	60806	60811	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
57	NC_013200	A	7	7	62521	62527	100 %	0 %	0 %	0 %	258510017
58	NC_013200	T	6	6	63507	63512	0 %	100 %	0 %	0 %	258510019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.