MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	CT	3	6	576	581	0 %	50 %	0 %	50 %	258509941
2	NC_013200	GC	3	6	850	855	0 %	0 %	50 %	50 %	258509941
3	NC_013200	GC	3	6	904	909	0 %	0 %	50 %	50 %	258509941
4	NC_013200	AC	3	6	2866	2871	50 %	0 %	0 %	50 %	258509943
5	NC_013200	AT	3	6	5062	5067	50 %	50 %	0 %	0 %	258509948
6	NC_013200	AT	3	6	6451	6456	50 %	50 %	0 %	0 %	258509949
7	NC_013200	GC	3	6	7009	7014	0 %	0 %	50 %	50 %	258509951
8	NC_013200	CG	4	8	7908	7915	0 %	0 %	50 %	50 %	258509951
9	NC_013200	TC	3	6	10879	10884	0 %	50 %	0 %	50 %	258509954
10	NC_013200	TC	3	6	11311	11316	0 %	50 %	0 %	50 %	258509955
11	NC_013200	TC	4	8	11666	11673	0 %	50 %	0 %	50 %	258509956
12	NC_013200	GA	3	6	12249	12254	50 %	0 %	50 %	0 %	258509957
13	NC_013200	AC	3	6	12834	12839	50 %	0 %	0 %	50 %	258509958
14	NC_013200	AC	3	6	14429	14434	50 %	0 %	0 %	50 %	258509959
15	NC_013200	GT	3	6	15236	15241	0 %	50 %	50 %	0 %	258509960
16	NC_013200	GT	3	6	17888	17893	0 %	50 %	50 %	0 %	258509964
17	NC_013200	GA	3	6	17921	17926	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
18	NC_013200	AT	3	6	18081	18086	50 %	50 %	0 %	0 %	258509964
19	NC_013200	AG	3	6	19007	19012	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
20	NC_013200	CG	3	6	19065	19070	0 %	0 %	50 %	50 %	258509964
21	NC_013200	AT	3	6	19091	19096	50 %	50 %	0 %	0 %	258509964
22	NC_013200	GA	3	6	19436	19441	50 %	0 %	50 %	0 %	258509964
23	NC_013200	TC	3	6	20072	20077	0 %	50 %	0 %	50 %	258509965
24	NC_013200	CA	3	6	20228	20233	50 %	0 %	0 %	50 %	258509966
25	NC_013200	CT	3	6	21579	21584	0 %	50 %	0 %	50 %	258509967
26	NC_013200	AC	3	6	21900	21905	50 %	0 %	0 %	50 %	258509968
27	NC_013200	TC	3	6	22884	22889	0 %	50 %	0 %	50 %	258509968
28	NC_013200	AG	3	6	22922	22927	50 %	0 %	50 %	0 %	258509968
29	NC_013200	GT	3	6	23268	23273	0 %	50 %	50 %	0 %	258509968
30	NC_013200	GA	3	6	23658	23663	50 %	0 %	50 %	0 %	258509968
31	NC_013200	GT	3	6	24562	24567	0 %	50 %	50 %	0 %	258509969
32	NC_013200	GT	3	6	24594	24599	0 %	50 %	50 %	0 %	258509969
33	NC_013200	TC	3	6	24796	24801	0 %	50 %	0 %	50 %	258509969
34	NC_013200	GT	3	6	29394	29399	0 %	50 %	50 %	0 %	258509977
35	NC_013200	TA	3	6	30145	30150	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
36	NC_013200	CG	3	6	33015	33020	0 %	0 %	50 %	50 %	258509978
37	NC_013200	GC	3	6	41517	41522	0 %	0 %	50 %	50 %	258509989
38	NC_013200	AC	3	6	41897	41902	50 %	0 %	0 %	50 %	258509989
39	NC_013200	AT	3	6	42012	42017	50 %	50 %	0 %	0 %	258509989
40	NC_013200	TC	3	6	42621	42626	0 %	50 %	0 %	50 %	258509990
41	NC_013200	AC	3	6	42851	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
42	NC_013200	CA	3	6	42958	42963	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
43	NC_013200	AC	3	6	43073	43078	50 %	0 %	0 %	50 %	258509990
44	NC_013200	CT	3	6	43602	43607	0 %	50 %	0 %	50 %	258509991
45	NC_013200	AC	3	6	45215	45220	50 %	0 %	0 %	50 %	258509994
46	NC_013200	AT	3	6	51354	51359	50 %	50 %	0 %	0 %	258510003
47	NC_013200	TG	3	6	52742	52747	0 %	50 %	50 %	0 %	258510003
48	NC_013200	TA	3	6	53662	53667	50 %	50 %	0 %	0 %	258510004
49	NC_013200	CG	3	6	54032	54037	0 %	0 %	50 %	50 %	258510004
50	NC_013200	TA	3	6	56837	56842	50 %	50 %	0 %	0 %	258510011
51	NC_013200	AC	3	6	57817	57822	50 %	0 %	0 %	50 %	258510012
52	NC_013200	AT	3	6	58927	58932	50 %	50 %	0 %	0 %	258510013
53	NC_013200	CA	3	6	61648	61653	50 %	0 %	0 %	50 %	258510014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.