MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	CGTCA	2	10	1757	1766	20 %	20 %	20 %	40 %	258509942
2	NC_013200	ACAAG	2	10	3824	3833	60 %	0 %	20 %	20 %	258509944
3	NC_013200	TACCG	2	10	6462	6471	20 %	20 %	20 %	40 %	258509949
4	NC_013200	TCGAA	2	10	18246	18255	40 %	20 %	20 %	20 %	258509964
5	NC_013200	TGAAT	2	10	25055	25064	40 %	40 %	20 %	0 %	258509969
6	NC_013200	CTTGG	2	10	30818	30827	0 %	40 %	40 %	20 %	258509977
7	NC_013200	CTCGA	2	10	32864	32873	20 %	20 %	20 %	40 %	258509978
8	NC_013200	GAACA	2	10	38144	38153	60 %	0 %	20 %	20 %	258509984
9	NC_013200	TTTTC	2	10	38188	38197	0 %	80 %	0 %	20 %	258509984
10	NC_013200	TTTGT	2	10	38644	38653	0 %	80 %	20 %	0 %	258509984
11	NC_013200	GCATG	2	10	39269	39278	20 %	20 %	40 %	20 %	258509986
12	NC_013200	ATTTG	2	10	40944	40953	20 %	60 %	20 %	0 %	258509989
13	NC_013200	CATAT	2	10	43179	43188	40 %	40 %	0 %	20 %	258509990
14	NC_013200	GCCGC	2	10	45244	45253	0 %	0 %	40 %	60 %	258509994
15	NC_013200	AATTT	2	10	47082	47091	40 %	60 %	0 %	0 %	258509996
16	NC_013200	ATTAT	2	10	47627	47636	40 %	60 %	0 %	0 %	258509996
17	NC_013200	CAAAT	2	10	51587	51596	60 %	20 %	0 %	20 %	258510003
18	NC_013200	CCATG	2	10	52394	52403	20 %	20 %	20 %	40 %	258510003
19	NC_013200	GAAGT	2	10	53508	53517	40 %	20 %	40 %	0 %	258510004
20	NC_013200	CAGAA	2	10	58965	58974	60 %	0 %	20 %	20 %	258510013
21	NC_013200	CAAAG	2	10	62083	62092	60 %	0 %	20 %	20 %	258510016
22	NC_013200	CTTCT	2	10	63432	63441	0 %	60 %	0 %	40 %	258510019

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.