MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013200	TTC	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509941
2	NC_013200	AAC	2	6	586	591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509941
3	NC_013200	AGC	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509941
4	NC_013200	TGC	2	6	846	851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509941
5	NC_013200	TGC	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509941
6	NC_013200	ATA	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509941
7	NC_013200	CTA	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509941
8	NC_013200	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509941
9	NC_013200	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509941
10	NC_013200	ACG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509941
11	NC_013200	GAT	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509941
12	NC_013200	CAA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509941
13	NC_013200	TTC	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509941
14	NC_013200	AAC	2	6	1375	1380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509941
15	NC_013200	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509941
16	NC_013200	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509941
17	NC_013200	TGA	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509942
18	NC_013200	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509942
19	NC_013200	ATG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509942
20	NC_013200	TGA	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509942
21	NC_013200	AGA	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509942
22	NC_013200	AGC	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509943
23	NC_013200	ACA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509943
24	NC_013200	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509943
25	NC_013200	ATA	2	6	2232	2237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509943
26	NC_013200	TAA	2	6	2599	2604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509943
27	NC_013200	GCT	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509943
28	NC_013200	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509943
29	NC_013200	GTG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509943
30	NC_013200	AGC	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509943
31	NC_013200	ATG	2	6	3222	3227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509944
32	NC_013200	CAA	2	6	3290	3295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509944
33	NC_013200	CGC	2	6	3335	3340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509944
34	NC_013200	GTC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509944
35	NC_013200	TGA	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509944
36	NC_013200	TTA	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509944
37	NC_013200	AAG	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509944
38	NC_013200	AAC	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509944
39	NC_013200	ATG	2	6	3801	3806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509944
40	NC_013200	TCA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509944
41	NC_013200	AGT	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509945
42	NC_013200	ATC	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509945
43	NC_013200	CAA	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509946
44	NC_013200	CAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509947
45	NC_013200	GAT	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509947
46	NC_013200	ATC	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509947
47	NC_013200	TTG	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509947
48	NC_013200	AGG	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509947
49	NC_013200	TGC	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509948
50	NC_013200	CAA	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
51	NC_013200	CAA	3	9	5153	5161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
52	NC_013200	AAC	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
53	NC_013200	TTG	2	6	5240	5245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509948
54	NC_013200	GTC	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509948
55	NC_013200	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509948
56	NC_013200	GGT	3	9	5408	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509948
57	NC_013200	AAG	2	6	5481	5486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
58	NC_013200	CAA	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509949
59	NC_013200	ATC	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
60	NC_013200	CTG	2	6	5866	5871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509949
61	NC_013200	ACA	2	6	5890	5895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509949
62	NC_013200	AAG	2	6	6012	6017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
63	NC_013200	TCA	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
64	NC_013200	AGC	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509949
65	NC_013200	ACA	3	9	6217	6225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509949
66	NC_013200	GAG	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509949
67	NC_013200	ACT	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
68	NC_013200	AAG	2	6	6370	6375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
69	NC_013200	AAG	2	6	6475	6480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
70	NC_013200	CAT	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509949
71	NC_013200	AAG	3	9	6630	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509949
72	NC_013200	CAG	2	6	6645	6650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509949
73	NC_013200	CCA	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509950
74	NC_013200	GCA	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509950
75	NC_013200	GAG	2	6	6923	6928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509950
76	NC_013200	GCA	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
77	NC_013200	GTC	2	6	7156	7161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509951
78	NC_013200	AAG	2	6	7209	7214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
79	NC_013200	AGA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
80	NC_013200	TTG	2	6	7264	7269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509951
81	NC_013200	TTA	2	6	7339	7344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509951
82	NC_013200	TCA	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
83	NC_013200	TGA	2	6	7445	7450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509951
84	NC_013200	AAG	2	6	7612	7617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
85	NC_013200	ACT	2	6	7675	7680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
86	NC_013200	GCG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509951
87	NC_013200	AGG	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509951
88	NC_013200	TAC	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
89	NC_013200	GGT	3	9	8058	8066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509951
90	NC_013200	CCA	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509951
91	NC_013200	AGC	2	6	8174	8179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
92	NC_013200	ACT	2	6	8188	8193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
93	NC_013200	CGC	2	6	8420	8425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509951
94	NC_013200	ACA	2	6	8522	8527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509951
95	NC_013200	GTG	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509951
96	NC_013200	TCA	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
97	NC_013200	AGC	2	6	8795	8800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
98	NC_013200	CAA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509951
99	NC_013200	CAG	2	6	8874	8879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
100	NC_013200	AGC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
101	NC_013200	TCA	2	6	8986	8991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
102	NC_013200	CAG	2	6	9012	9017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
103	NC_013200	TAC	2	6	9099	9104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509951
104	NC_013200	TTC	2	6	9133	9138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509951
105	NC_013200	CAA	2	6	9196	9201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509951
106	NC_013200	CAG	2	6	9207	9212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
107	NC_013200	TCG	2	6	9227	9232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509951
108	NC_013200	CAG	2	6	9297	9302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
109	NC_013200	AGT	2	6	9311	9316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509951
110	NC_013200	AGA	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509951
111	NC_013200	CAG	2	6	9438	9443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
112	NC_013200	GCA	2	6	9459	9464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509951
113	NC_013200	TTG	2	6	10275	10280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509952
114	NC_013200	GTA	2	6	10298	10303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509952
115	NC_013200	TCG	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509952
116	NC_013200	GTC	2	6	10631	10636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509953
117	NC_013200	ACA	2	6	10857	10862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509954
118	NC_013200	TTC	2	6	10868	10873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509954
119	NC_013200	CAA	2	6	10891	10896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509954
120	NC_013200	TTG	2	6	10954	10959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509954
121	NC_013200	ATA	2	6	11007	11012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509954
122	NC_013200	GAT	2	6	11020	11025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509954
123	NC_013200	TTC	2	6	11100	11105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509955
124	NC_013200	TCA	2	6	11197	11202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509955
125	NC_013200	GTG	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509955
126	NC_013200	CCT	2	6	11382	11387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509956
127	NC_013200	TGA	2	6	11442	11447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509956
128	NC_013200	CCG	2	6	11511	11516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509956
129	NC_013200	CTT	2	6	11557	11562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509956
130	NC_013200	TAA	2	6	11609	11614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509956
131	NC_013200	CTC	2	6	11785	11790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509956
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133	NC_013200	CCG	2	6	12065	12070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509957
134	NC_013200	GTA	2	6	12191	12196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509957
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136	NC_013200	TCG	2	6	12560	12565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509958
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138	NC_013200	TAC	2	6	12718	12723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509958
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140	NC_013200	GAA	2	6	12802	12807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509958
141	NC_013200	GAA	2	6	13072	13077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509958
142	NC_013200	TCC	2	6	13127	13132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509958
143	NC_013200	CGG	2	6	13195	13200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509958
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253	NC_013200	TGA	2	6	23872	23877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509968
254	NC_013200	AAC	2	6	23878	23883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509968
255	NC_013200	ATA	2	6	23967	23972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509968
256	NC_013200	TGA	2	6	24025	24030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509968
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292	NC_013200	CCA	3	9	27190	27198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509975
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