MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 plasmid pLC1

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013200	AAG	2	6	31431	31436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509977
502	NC_013200	CAAA	2	8	31521	31528	75 %	0 %	0 %	25 %	258509977
503	NC_013200	GCA	2	6	31813	31818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509977
504	NC_013200	T	7	7	31898	31904	0 %	100 %	0 %	0 %	258509977
505	NC_013200	ATTA	2	8	31931	31938	50 %	50 %	0 %	0 %	258509977
506	NC_013200	CAC	2	6	32012	32017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509977
507	NC_013200	ACC	2	6	32033	32038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509977
508	NC_013200	AAC	2	6	32058	32063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
509	NC_013200	CAT	2	6	32089	32094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509977
510	NC_013200	CGG	2	6	32128	32133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509977
511	NC_013200	GCT	2	6	32145	32150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509977
512	NC_013200	GTTATT	2	12	32234	32245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258509977
513	NC_013200	ATTG	2	8	32314	32321	25 %	50 %	25 %	0 %	258509977
514	NC_013200	AAC	2	6	32342	32347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509977
515	NC_013200	CAA	2	6	32726	32731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509978
516	NC_013200	GCT	2	6	32771	32776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509978
517	NC_013200	CTCGA	2	10	32864	32873	20 %	20 %	20 %	40 %	258509978
518	NC_013200	TTC	2	6	32978	32983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509978
519	NC_013200	CG	3	6	33015	33020	0 %	0 %	50 %	50 %	258509978
520	NC_013200	GCT	2	6	33112	33117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509978
521	NC_013200	ACA	2	6	33126	33131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509978
522	NC_013200	AAG	2	6	33143	33148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509978
523	NC_013200	CGC	2	6	33155	33160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509978
524	NC_013200	AAG	2	6	33197	33202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509978
525	NC_013200	TGA	2	6	33301	33306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509978
526	NC_013200	ATC	2	6	33350	33355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509978
527	NC_013200	CGA	2	6	33412	33417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509978
528	NC_013200	TTAT	2	8	34300	34307	25 %	75 %	0 %	0 %	258509979
529	NC_013200	ATTC	2	8	34312	34319	25 %	50 %	0 %	25 %	258509979
530	NC_013200	TGAT	2	8	34349	34356	25 %	50 %	25 %	0 %	258509979
531	NC_013200	AGG	2	6	34416	34421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509979
532	NC_013200	AAC	2	6	34494	34499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509979
533	NC_013200	CAA	2	6	34552	34557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509979
534	NC_013200	ACA	2	6	34608	34613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509979
535	NC_013200	TGA	2	6	34616	34621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509979
536	NC_013200	TTA	2	6	34761	34766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509979
537	NC_013200	GAC	2	6	34792	34797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509979
538	NC_013200	TTG	2	6	34820	34825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509979
539	NC_013200	GTG	2	6	34838	34843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509979
540	NC_013200	TGG	2	6	34932	34937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509979
541	NC_013200	CCCATC	2	12	34943	34954	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	258509979
542	NC_013200	T	6	6	34990	34995	0 %	100 %	0 %	0 %	258509979
543	NC_013200	TGCCGA	2	12	35028	35039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509979
544	NC_013200	TCA	2	6	35046	35051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509979
545	NC_013200	AAG	2	6	35068	35073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509979
546	NC_013200	ATT	2	6	35079	35084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509979
547	NC_013200	GCT	2	6	35104	35109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509979
548	NC_013200	TGG	2	6	35265	35270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509980
549	NC_013200	TCA	2	6	35331	35336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509980
550	NC_013200	A	6	6	35339	35344	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
551	NC_013200	GGC	2	6	35425	35430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509980
552	NC_013200	TCT	2	6	35477	35482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509980
553	NC_013200	CCG	2	6	35492	35497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509980
554	NC_013200	ATG	2	6	35519	35524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509980
555	NC_013200	GGT	2	6	35530	35535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509980
556	NC_013200	GATT	2	8	35543	35550	25 %	50 %	25 %	0 %	258509980
557	NC_013200	GAA	2	6	35617	35622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509980
558	NC_013200	CCAA	2	8	35662	35669	50 %	0 %	0 %	50 %	258509980
559	NC_013200	ACA	2	6	35744	35749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509980
560	NC_013200	TTC	2	6	35801	35806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509980
561	NC_013200	TGG	2	6	35826	35831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509980
562	NC_013200	GTC	2	6	35857	35862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509980
563	NC_013200	GAT	2	6	35869	35874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509980
564	NC_013200	A	6	6	35885	35890	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
565	NC_013200	TGG	2	6	35913	35918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509980
566	NC_013200	TATC	2	8	36019	36026	25 %	50 %	0 %	25 %	258509980
567	NC_013200	TAC	2	6	36052	36057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509980
568	NC_013200	AAC	2	6	36070	36075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509980
569	NC_013200	A	6	6	36094	36099	100 %	0 %	0 %	0 %	258509980
570	NC_013200	GGAC	2	8	36141	36148	25 %	0 %	50 %	25 %	258509980
571	NC_013200	AAC	2	6	36170	36175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509980
572	NC_013200	TGA	2	6	36239	36244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509980
573	NC_013200	GCC	2	6	36554	36559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509981
574	NC_013200	AGG	2	6	36701	36706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258509981
575	NC_013200	A	6	6	36736	36741	100 %	0 %	0 %	0 %	258509981
576	NC_013200	CATT	2	8	36747	36754	25 %	50 %	0 %	25 %	258509981
577	NC_013200	TAA	2	6	36944	36949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509981
578	NC_013200	CGT	2	6	37191	37196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509982
579	NC_013200	TAC	2	6	37238	37243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509982
580	NC_013200	A	7	7	37364	37370	100 %	0 %	0 %	0 %	258509982
581	NC_013200	CGT	2	6	37413	37418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509982
582	NC_013200	TGG	2	6	37648	37653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509983
583	NC_013200	GAC	2	6	37705	37710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509983
584	NC_013200	CAG	2	6	37834	37839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509983
585	NC_013200	GAACA	2	10	38144	38153	60 %	0 %	20 %	20 %	258509984
586	NC_013200	T	6	6	38180	38185	0 %	100 %	0 %	0 %	258509984
587	NC_013200	TTTTC	2	10	38188	38197	0 %	80 %	0 %	20 %	258509984
588	NC_013200	TCC	2	6	38213	38218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509984
589	NC_013200	CAG	2	6	38272	38277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509984
590	NC_013200	TTA	2	6	38469	38474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509984
591	NC_013200	CAAT	2	8	38521	38528	50 %	25 %	0 %	25 %	258509984
592	NC_013200	CTT	2	6	38548	38553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509984
593	NC_013200	CAA	2	6	38554	38559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509984
594	NC_013200	TTTGT	2	10	38644	38653	0 %	80 %	20 %	0 %	258509984
595	NC_013200	CCA	2	6	38685	38690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509984
596	NC_013200	TGA	2	6	38708	38713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509984
597	NC_013200	CCA	2	6	38790	38795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509984
598	NC_013200	TTG	2	6	38894	38899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509984
599	NC_013200	CAC	2	6	38908	38913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509984
600	NC_013200	TTA	2	6	38919	38924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509984
601	NC_013200	GAA	2	6	38971	38976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509984
602	NC_013200	T	6	6	39051	39056	0 %	100 %	0 %	0 %	258509985
603	NC_013200	AAG	2	6	39105	39110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509985
604	NC_013200	TAA	2	6	39150	39155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509985
605	NC_013200	TTC	2	6	39166	39171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509985
606	NC_013200	GCATG	2	10	39269	39278	20 %	20 %	40 %	20 %	258509986
607	NC_013200	TCGC	2	8	39320	39327	0 %	25 %	25 %	50 %	258509986
608	NC_013200	AGA	2	6	39667	39672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509987
609	NC_013200	AATT	2	8	39734	39741	50 %	50 %	0 %	0 %	258509987
610	NC_013200	TTG	2	6	39746	39751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509987
611	NC_013200	CTT	2	6	39837	39842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509988
612	NC_013200	CAT	2	6	39908	39913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509988
613	NC_013200	CCT	2	6	40136	40141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509988
614	NC_013200	T	7	7	40184	40190	0 %	100 %	0 %	0 %	258509988
615	NC_013200	TTG	2	6	40193	40198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509988
616	NC_013200	ATT	2	6	40487	40492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509989
617	NC_013200	CAG	2	6	40502	40507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509989
618	NC_013200	TCA	2	6	40529	40534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509989
619	NC_013200	TCAA	2	8	40742	40749	50 %	25 %	0 %	25 %	258509989
620	NC_013200	ACA	2	6	40787	40792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509989
621	NC_013200	TAT	2	6	40848	40853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509989
622	NC_013200	AGA	2	6	40872	40877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509989
623	NC_013200	ATTTG	2	10	40944	40953	20 %	60 %	20 %	0 %	258509989
624	NC_013200	CTG	2	6	41012	41017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509989
625	NC_013200	GTG	2	6	41144	41149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509989
626	NC_013200	ACT	2	6	41161	41166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509989
627	NC_013200	CAC	2	6	41303	41308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509989
628	NC_013200	GTC	2	6	41371	41376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509989
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755	NC_013200	ACGA	2	8	51092	51099	50 %	0 %	25 %	25 %	258510002
756	NC_013200	TCA	2	6	51107	51112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510002
757	NC_013200	GCT	2	6	51343	51348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510003
758	NC_013200	AT	3	6	51354	51359	50 %	50 %	0 %	0 %	258510003
759	NC_013200	ATC	3	9	51397	51405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510003
760	NC_013200	ATG	2	6	51421	51426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510003
761	NC_013200	TGAC	2	8	51554	51561	25 %	25 %	25 %	25 %	258510003
762	NC_013200	CAAAT	2	10	51587	51596	60 %	20 %	0 %	20 %	258510003
763	NC_013200	TAC	2	6	51742	51747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510003
764	NC_013200	CGC	2	6	51926	51931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510003
765	NC_013200	TCT	2	6	51989	51994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510003
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770	NC_013200	TGG	2	6	52146	52151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510003
771	NC_013200	TCA	2	6	52178	52183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510003
772	NC_013200	TTC	2	6	52303	52308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510003
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774	NC_013200	CCATG	2	10	52394	52403	20 %	20 %	20 %	40 %	258510003
775	NC_013200	CATT	2	8	52508	52515	25 %	50 %	0 %	25 %	258510003
776	NC_013200	GAA	2	6	52543	52548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510003
777	NC_013200	GAC	2	6	52573	52578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510003
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780	NC_013200	TG	3	6	52742	52747	0 %	50 %	50 %	0 %	258510003
781	NC_013200	TGG	3	9	52749	52757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510003
782	NC_013200	AAAC	2	8	52785	52792	75 %	0 %	0 %	25 %	258510003
783	NC_013200	GCC	3	9	52822	52830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510003
784	NC_013200	A	6	6	52917	52922	100 %	0 %	0 %	0 %	258510003
785	NC_013200	CAA	2	6	52955	52960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510003
786	NC_013200	CAA	2	6	52986	52991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510003
787	NC_013200	TTG	2	6	53012	53017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510003
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789	NC_013200	CCA	2	6	53125	53130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510004
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793	NC_013200	CAT	2	6	53373	53378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510004
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850	NC_013200	ACT	2	6	57007	57012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510011
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867	NC_013200	CCA	2	6	59113	59118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510013
868	NC_013200	TAT	2	6	59162	59167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510013
869	NC_013200	TTGATT	2	12	59267	59278	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258510013
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871	NC_013200	ATTG	2	8	59321	59328	25 %	50 %	25 %	0 %	258510013
872	NC_013200	TAG	2	6	59471	59476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
873	NC_013200	ACC	2	6	59496	59501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510013
874	NC_013200	TAA	2	6	59519	59524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510013
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879	NC_013200	CTG	2	6	59759	59764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
880	NC_013200	ATT	2	6	59796	59801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510013
881	NC_013200	ATG	2	6	59803	59808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
882	NC_013200	CAA	2	6	59937	59942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510013
883	NC_013200	CTG	2	6	60032	60037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
884	NC_013200	AAC	2	6	60096	60101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510013
885	NC_013200	TGC	2	6	60159	60164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510013
886	NC_013200	ATAA	2	8	60246	60253	75 %	25 %	0 %	0 %	258510013
887	NC_013200	T	6	6	60313	60318	0 %	100 %	0 %	0 %	258510013
888	NC_013200	TCC	2	6	60447	60452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510013
889	NC_013200	CAAT	2	8	60467	60474	50 %	25 %	0 %	25 %	258510013
890	NC_013200	ATT	2	6	60522	60527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510013
891	NC_013200	CCA	2	6	60589	60594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510013
892	NC_013200	GTA	2	6	60727	60732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510013
893	NC_013200	TAA	2	6	60797	60802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258510013
894	NC_013200	A	6	6	60806	60811	100 %	0 %	0 %	0 %	258510013
895	NC_013200	GGT	2	6	61536	61541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510014
896	NC_013200	CA	3	6	61648	61653	50 %	0 %	0 %	50 %	258510014
897	NC_013200	GCT	2	6	61669	61674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510014
898	NC_013200	TCC	2	6	61682	61687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510014
899	NC_013200	AGTA	2	8	61690	61697	50 %	25 %	25 %	0 %	258510014
900	NC_013200	GGT	2	6	61918	61923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510015
901	NC_013200	CAT	2	6	61924	61929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510015
902	NC_013200	TTGG	2	8	62017	62024	0 %	50 %	50 %	0 %	258510016
903	NC_013200	GTC	2	6	62027	62032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510016
904	NC_013200	CAAAG	2	10	62083	62092	60 %	0 %	20 %	20 %	258510016
905	NC_013200	TAT	2	6	62453	62458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258510017
906	NC_013200	A	7	7	62521	62527	100 %	0 %	0 %	0 %	258510017
907	NC_013200	CAC	2	6	62712	62717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510018
908	NC_013200	GCT	2	6	62740	62745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510018
909	NC_013200	GGC	2	6	62806	62811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510018
910	NC_013200	TCA	2	6	62864	62869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510018
911	NC_013200	TGGC	2	8	62937	62944	0 %	25 %	50 %	25 %	258510018
912	NC_013200	ATG	2	6	63001	63006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510018
913	NC_013200	TTC	2	6	63020	63025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510018
914	NC_013200	GTT	2	6	63287	63292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510019
915	NC_013200	CTTCT	2	10	63432	63441	0 %	60 %	0 %	40 %	258510019
916	NC_013200	AGC	2	6	63499	63504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510019
917	NC_013200	T	6	6	63507	63512	0 %	100 %	0 %	0 %	258510019
918	NC_013200	ATG	2	6	63549	63554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510019

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