MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 1411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	GCAAG	2	10	3836	3845	40 %	0 %	40 %	20 %	258538196
2	NC_013199	GATCG	2	10	4026	4035	20 %	20 %	40 %	20 %	258538196
3	NC_013199	GAAAA	2	10	7758	7767	80 %	0 %	20 %	0 %	258538198
4	NC_013199	CCGGT	2	10	15918	15927	0 %	20 %	40 %	40 %	258538208
5	NC_013199	TGGTG	2	10	22404	22413	0 %	40 %	60 %	0 %	258538214
6	NC_013199	AACTG	2	10	25063	25072	40 %	20 %	20 %	20 %	258538216
7	NC_013199	GATGC	2	10	25313	25322	20 %	20 %	40 %	20 %	258538216
8	NC_013199	GAATA	2	10	25784	25793	60 %	20 %	20 %	0 %	258538217
9	NC_013199	AAAAC	2	10	28635	28644	80 %	0 %	0 %	20 %	258538218
10	NC_013199	ATGAC	2	10	29317	29326	40 %	20 %	20 %	20 %	258538219
11	NC_013199	CTGAT	2	10	30082	30091	20 %	40 %	20 %	20 %	258538220
12	NC_013199	TTTTC	2	10	36912	36921	0 %	80 %	0 %	20 %	258538228
13	NC_013199	GATCG	2	10	43989	43998	20 %	20 %	40 %	20 %	258538233
14	NC_013199	AAAGC	2	10	45425	45434	60 %	0 %	20 %	20 %	258538234
15	NC_013199	AGACA	2	10	48412	48421	60 %	0 %	20 %	20 %	258538234
16	NC_013199	AGCCA	2	10	48619	48628	40 %	0 %	20 %	40 %	258538234
17	NC_013199	ACAGT	2	10	49095	49104	40 %	20 %	20 %	20 %	258538234
18	NC_013199	CATCG	2	10	52412	52421	20 %	20 %	20 %	40 %	258538237
19	NC_013199	AGCCC	2	10	55441	55450	20 %	0 %	20 %	60 %	258538239
20	NC_013199	TTGGC	2	10	55524	55533	0 %	40 %	40 %	20 %	258538239
21	NC_013199	CCGAT	2	10	58751	58760	20 %	20 %	20 %	40 %	258538241
22	NC_013199	GGCGT	2	10	61228	61237	0 %	20 %	60 %	20 %	258538243
23	NC_013199	AAGTG	2	10	62605	62614	40 %	20 %	40 %	0 %	258538244
24	NC_013199	CATAG	2	10	68212	68221	40 %	20 %	20 %	20 %	258538248
25	NC_013199	CTGAG	2	10	71336	71345	20 %	20 %	40 %	20 %	258538251
26	NC_013199	TTGGA	2	10	71818	71827	20 %	40 %	40 %	0 %	258538251
27	NC_013199	AATGG	2	10	73593	73602	40 %	20 %	40 %	0 %	258538252
28	NC_013199	GATCC	2	10	76225	76234	20 %	20 %	20 %	40 %	258538255
29	NC_013199	GTGGC	2	10	77566	77575	0 %	20 %	60 %	20 %	258538257
30	NC_013199	GCCAA	2	10	78501	78510	40 %	0 %	20 %	40 %	258538258
31	NC_013199	AGTTC	2	10	78735	78744	20 %	40 %	20 %	20 %	258538259
32	NC_013199	AAACC	2	10	78963	78972	60 %	0 %	0 %	40 %	258538259
33	NC_013199	AGATC	2	10	80977	80986	40 %	20 %	20 %	20 %	258538261
34	NC_013199	CGTTT	2	10	84475	84484	0 %	60 %	20 %	20 %	258538264
35	NC_013199	TGGGA	2	10	88179	88188	20 %	20 %	60 %	0 %	258538268
36	NC_013199	GAAAA	2	10	88993	89002	80 %	0 %	20 %	0 %	258538270
37	NC_013199	GAATC	2	10	90248	90257	40 %	20 %	20 %	20 %	258538270
38	NC_013199	ATCGC	2	10	93570	93579	20 %	20 %	20 %	40 %	258538272
39	NC_013199	GTTTT	2	10	100319	100328	0 %	80 %	20 %	0 %	258538282
40	NC_013199	CGAAG	2	10	101041	101050	40 %	0 %	40 %	20 %	258538282
41	NC_013199	CCCAT	2	10	101057	101066	20 %	20 %	0 %	60 %	258538282
42	NC_013199	AGTCG	2	10	101195	101204	20 %	20 %	40 %	20 %	258538282
43	NC_013199	GCTTG	2	10	105004	105013	0 %	40 %	40 %	20 %	258538285
44	NC_013199	GTTTC	2	10	105936	105945	0 %	60 %	20 %	20 %	258538286
45	NC_013199	TGGGC	2	10	113455	113464	0 %	20 %	60 %	20 %	258538295
46	NC_013199	AGGGC	2	10	113508	113517	20 %	0 %	60 %	20 %	258538295
47	NC_013199	GCTTT	2	10	114162	114171	0 %	60 %	20 %	20 %	258538295
48	NC_013199	TAACG	2	10	117446	117455	40 %	20 %	20 %	20 %	258538297
49	NC_013199	CCTTG	2	10	117954	117963	0 %	40 %	20 %	40 %	258538298
50	NC_013199	TCTTT	2	10	120336	120345	0 %	80 %	0 %	20 %	258538301
51	NC_013199	ATTGT	2	10	121902	121911	20 %	60 %	20 %	0 %	258538302
52	NC_013199	AGCTG	2	10	125801	125810	20 %	20 %	40 %	20 %	258538306
53	NC_013199	AAAAC	2	10	126755	126764	80 %	0 %	0 %	20 %	258538307
54	NC_013199	CGTGG	2	10	132288	132297	0 %	20 %	60 %	20 %	258538311
55	NC_013199	ACCGC	2	10	134656	134665	20 %	0 %	20 %	60 %	258538313
56	NC_013199	GCATC	2	10	136085	136094	20 %	20 %	20 %	40 %	258538314
57	NC_013199	AGGCT	2	10	136338	136347	20 %	20 %	40 %	20 %	258538314
58	NC_013199	GAATC	2	10	136911	136920	40 %	20 %	20 %	20 %	258538315
59	NC_013199	TGGCG	2	10	137106	137115	0 %	20 %	60 %	20 %	258538315
60	NC_013199	AATCA	2	10	138644	138653	60 %	20 %	0 %	20 %	258538316
61	NC_013199	TTTTC	2	10	138961	138970	0 %	80 %	0 %	20 %	258538316
62	NC_013199	GTTTG	2	10	139701	139710	0 %	60 %	40 %	0 %	258538317
63	NC_013199	GGTCA	2	10	140216	140225	20 %	20 %	40 %	20 %	258538318
64	NC_013199	CAGCT	2	10	140439	140448	20 %	20 %	20 %	40 %	258538318
65	NC_013199	CAGCA	2	10	143019	143028	40 %	0 %	20 %	40 %	258538319
66	NC_013199	GGGAT	2	10	144343	144352	20 %	20 %	60 %	0 %	258538320
67	NC_013199	CTCAA	2	10	146490	146499	40 %	20 %	0 %	40 %	258538321
68	NC_013199	GTGCC	2	10	148100	148109	0 %	20 %	40 %	40 %	258538324
69	NC_013199	TAATT	2	10	151684	151693	40 %	60 %	0 %	0 %	258538327
70	NC_013199	ATCGG	2	10	152673	152682	20 %	20 %	40 %	20 %	258538328
71	NC_013199	GTTCG	2	10	154202	154211	0 %	40 %	40 %	20 %	258538330
72	NC_013199	CGGTG	2	10	155161	155170	0 %	20 %	60 %	20 %	258538331
73	NC_013199	TGCTG	2	10	164711	164720	0 %	40 %	40 %	20 %	258538341
74	NC_013199	ACGCT	2	10	164748	164757	20 %	20 %	20 %	40 %	258538341
75	NC_013199	ATTGC	2	10	166970	166979	20 %	40 %	20 %	20 %	258538343
76	NC_013199	GCAAT	2	10	168786	168795	40 %	20 %	20 %	20 %	258538345
77	NC_013199	GCGTG	2	10	171776	171785	0 %	20 %	60 %	20 %	258538350
78	NC_013199	GAAGA	2	10	172008	172017	60 %	0 %	40 %	0 %	258538350
79	NC_013199	CAAAC	2	10	173223	173232	60 %	0 %	0 %	40 %	258538351
80	NC_013199	AATTT	2	10	173959	173968	40 %	60 %	0 %	0 %	258538351
81	NC_013199	GGCAA	3	15	175040	175054	40 %	0 %	40 %	20 %	258538352
82	NC_013199	AATCA	2	10	175834	175843	60 %	20 %	0 %	20 %	258538353
83	NC_013199	TTGGT	2	10	177485	177494	0 %	60 %	40 %	0 %	258538356
84	NC_013199	TCACT	2	10	180721	180730	20 %	40 %	0 %	40 %	258538360
85	NC_013199	TTCAT	2	10	182272	182281	20 %	60 %	0 %	20 %	258538361
86	NC_013199	TCGAC	2	10	182749	182758	20 %	20 %	20 %	40 %	258538361
87	NC_013199	CAAGC	2	10	185759	185768	40 %	0 %	20 %	40 %	258538364
88	NC_013199	CACAA	2	10	190701	190710	60 %	0 %	0 %	40 %	258538369
89	NC_013199	AATAA	2	10	191150	191159	80 %	20 %	0 %	0 %	258538370
90	NC_013199	GTGAT	2	10	192327	192336	20 %	40 %	40 %	0 %	258538370
91	NC_013199	TGGTC	2	10	193557	193566	0 %	40 %	40 %	20 %	258538372
92	NC_013199	TTCGG	2	10	195769	195778	0 %	40 %	40 %	20 %	258538373
93	NC_013199	GGCCG	2	10	196617	196626	0 %	0 %	60 %	40 %	258538374
94	NC_013199	ATGCG	2	10	198793	198802	20 %	20 %	40 %	20 %	258538376
95	NC_013199	GCCGA	2	10	199383	199392	20 %	0 %	40 %	40 %	258538377
96	NC_013199	CCGTT	2	10	199456	199465	0 %	40 %	20 %	40 %	258538377
97	NC_013199	TTGTT	2	10	203026	203035	0 %	80 %	20 %	0 %	258538381
98	NC_013199	CAGCC	2	10	209179	209188	20 %	0 %	20 %	60 %	258538386
99	NC_013199	GCTAT	2	10	210376	210385	20 %	40 %	20 %	20 %	258538387
100	NC_013199	TTATT	2	10	210930	210939	20 %	80 %	0 %	0 %	258538388
101	NC_013199	CAGAT	2	10	212666	212675	40 %	20 %	20 %	20 %	258538390
102	NC_013199	TCTTT	2	10	217181	217190	0 %	80 %	0 %	20 %	258538395
103	NC_013199	CAAAG	2	10	222840	222849	60 %	0 %	20 %	20 %	258538402
104	NC_013199	TTCAT	2	10	223459	223468	20 %	60 %	0 %	20 %	258538403
105	NC_013199	TGATC	2	10	226179	226188	20 %	40 %	20 %	20 %	258538410
106	NC_013199	GTTGC	2	10	230978	230987	0 %	40 %	40 %	20 %	258538418
107	NC_013199	AGAGA	2	10	236177	236186	60 %	0 %	40 %	0 %	258538425
108	NC_013199	CGATT	2	10	236621	236630	20 %	40 %	20 %	20 %	258538426
109	NC_013199	AAAGC	2	10	244366	244375	60 %	0 %	20 %	20 %	258538435
110	NC_013199	TCCGG	2	10	244443	244452	0 %	20 %	40 %	40 %	258538435
111	NC_013199	CGAAC	2	10	244539	244548	40 %	0 %	20 %	40 %	258538435
112	NC_013199	GGTTT	2	10	245685	245694	0 %	60 %	40 %	0 %	258538436
113	NC_013199	ACGGT	2	10	248428	248437	20 %	20 %	40 %	20 %	258538439
114	NC_013199	ACCGT	2	10	251450	251459	20 %	20 %	20 %	40 %	258538442
115	NC_013199	GCATC	2	10	251565	251574	20 %	20 %	20 %	40 %	258538442
116	NC_013199	CGGTT	2	10	255767	255776	0 %	40 %	40 %	20 %	258538445
117	NC_013199	AAATG	2	10	259736	259745	60 %	20 %	20 %	0 %	258538448
118	NC_013199	AGTCA	2	10	259837	259846	40 %	20 %	20 %	20 %	258538448
119	NC_013199	GGTTA	2	10	264888	264897	20 %	40 %	40 %	0 %	258538454
120	NC_013199	AATCT	2	10	265272	265281	40 %	40 %	0 %	20 %	258538454
121	NC_013199	TTTGA	2	10	267027	267036	20 %	60 %	20 %	0 %	258538456
122	NC_013199	CCGGT	2	10	267424	267433	0 %	20 %	40 %	40 %	258538456
123	NC_013199	CATTT	2	10	274913	274922	20 %	60 %	0 %	20 %	258538464
124	NC_013199	AAAGA	2	10	277761	277770	80 %	0 %	20 %	0 %	258538466
125	NC_013199	GTGGA	2	10	277981	277990	20 %	20 %	60 %	0 %	258538466
126	NC_013199	GACCA	2	10	279111	279120	40 %	0 %	20 %	40 %	258538468
127	NC_013199	AGCTT	2	10	280012	280021	20 %	40 %	20 %	20 %	258538468
128	NC_013199	CGGCA	2	10	282651	282660	20 %	0 %	40 %	40 %	258538470
129	NC_013199	TGATG	2	10	283218	283227	20 %	40 %	40 %	0 %	258538471
130	NC_013199	GGGAT	2	10	283233	283242	20 %	20 %	60 %	0 %	258538471
131	NC_013199	AATGA	2	10	287019	287028	60 %	20 %	20 %	0 %	258538476
132	NC_013199	AGGTG	2	10	289253	289262	20 %	20 %	60 %	0 %	258538477
133	NC_013199	TCGCA	2	10	291531	291540	20 %	20 %	20 %	40 %	258538482
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