MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 6290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258538192
2	NC_013199	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258538192
3	NC_013199	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258538192
4	NC_013199	GCCT	2	8	746	753	0 %	25 %	25 %	50 %	258538192
5	NC_013199	ATAG	2	8	2895	2902	50 %	25 %	25 %	0 %	258538194
6	NC_013199	TGAT	2	8	3593	3600	25 %	50 %	25 %	0 %	258538195
7	NC_013199	TTTG	2	8	4079	4086	0 %	75 %	25 %	0 %	258538196
8	NC_013199	AAGA	2	8	4897	4904	75 %	0 %	25 %	0 %	258538197
9	NC_013199	AAGA	2	8	4918	4925	75 %	0 %	25 %	0 %	258538197
10	NC_013199	GCCA	2	8	6667	6674	25 %	0 %	25 %	50 %	258538197
11	NC_013199	ACGT	2	8	7021	7028	25 %	25 %	25 %	25 %	258538198
12	NC_013199	ATGA	2	8	7068	7075	50 %	25 %	25 %	0 %	258538198
13	NC_013199	GATT	2	8	7340	7347	25 %	50 %	25 %	0 %	258538198
14	NC_013199	TATT	2	8	8748	8755	25 %	75 %	0 %	0 %	258538198
15	NC_013199	GCAC	2	8	8905	8912	25 %	0 %	25 %	50 %	258538198
16	NC_013199	CGAA	2	8	10302	10309	50 %	0 %	25 %	25 %	258538200
17	NC_013199	GCCG	2	8	11597	11604	0 %	0 %	50 %	50 %	258538202
18	NC_013199	CTGG	2	8	11680	11687	0 %	25 %	50 %	25 %	258538202
19	NC_013199	TTCA	2	8	12342	12349	25 %	50 %	0 %	25 %	258538204
20	NC_013199	TTGG	2	8	12469	12476	0 %	50 %	50 %	0 %	258538204
21	NC_013199	AGCG	2	8	13134	13141	25 %	0 %	50 %	25 %	258538205
22	NC_013199	GGAC	2	8	13600	13607	25 %	0 %	50 %	25 %	258538206
23	NC_013199	TGAA	2	8	13651	13658	50 %	25 %	25 %	0 %	258538206
24	NC_013199	TTTG	2	8	13856	13863	0 %	75 %	25 %	0 %	258538206
25	NC_013199	TCAA	2	8	13876	13883	50 %	25 %	0 %	25 %	258538206
26	NC_013199	TCGG	2	8	14462	14469	0 %	25 %	50 %	25 %	258538207
27	NC_013199	CTGG	2	8	15500	15507	0 %	25 %	50 %	25 %	258538207
28	NC_013199	CAAT	2	8	16081	16088	50 %	25 %	0 %	25 %	258538208
29	NC_013199	TGTT	2	8	16128	16135	0 %	75 %	25 %	0 %	258538208
30	NC_013199	TTTA	2	8	16562	16569	25 %	75 %	0 %	0 %	258538208
31	NC_013199	GTTT	2	8	17273	17280	0 %	75 %	25 %	0 %	258538210
32	NC_013199	AAGA	2	8	17517	17524	75 %	0 %	25 %	0 %	258538210
33	NC_013199	CAAC	2	8	18733	18740	50 %	0 %	0 %	50 %	258538211
34	NC_013199	TACA	2	8	19384	19391	50 %	25 %	0 %	25 %	258538212
35	NC_013199	TAAA	2	8	20052	20059	75 %	25 %	0 %	0 %	258538212
36	NC_013199	GAAA	2	8	20273	20280	75 %	0 %	25 %	0 %	258538213
37	NC_013199	TTGA	2	8	20447	20454	25 %	50 %	25 %	0 %	258538213
38	NC_013199	GCTG	2	8	20663	20670	0 %	25 %	50 %	25 %	258538213
39	NC_013199	ATCA	2	8	20840	20847	50 %	25 %	0 %	25 %	258538213
40	NC_013199	TTGT	2	8	21749	21756	0 %	75 %	25 %	0 %	258538214
41	NC_013199	GTTG	2	8	21878	21885	0 %	50 %	50 %	0 %	258538214
42	NC_013199	GGCA	2	8	22302	22309	25 %	0 %	50 %	25 %	258538214
43	NC_013199	AGTT	2	8	22754	22761	25 %	50 %	25 %	0 %	258538214
44	NC_013199	GACG	2	8	23604	23611	25 %	0 %	50 %	25 %	258538215
45	NC_013199	TGCC	2	8	24450	24457	0 %	25 %	25 %	50 %	258538216
46	NC_013199	GTTG	2	8	24601	24608	0 %	50 %	50 %	0 %	258538216
47	NC_013199	CTTT	2	8	25077	25084	0 %	75 %	0 %	25 %	258538216
48	NC_013199	ACGA	2	8	26147	26154	50 %	0 %	25 %	25 %	258538217
49	NC_013199	TGAA	2	8	26752	26759	50 %	25 %	25 %	0 %	258538217
50	NC_013199	GGCA	2	8	27383	27390	25 %	0 %	50 %	25 %	258538217
51	NC_013199	CAGG	2	8	27598	27605	25 %	0 %	50 %	25 %	258538217
52	NC_013199	GATT	2	8	27859	27866	25 %	50 %	25 %	0 %	258538217
53	NC_013199	TGAC	2	8	27961	27968	25 %	25 %	25 %	25 %	258538217
54	NC_013199	AGCC	2	8	28576	28583	25 %	0 %	25 %	50 %	258538218
55	NC_013199	ATCC	2	8	28736	28743	25 %	25 %	0 %	50 %	258538218
56	NC_013199	GTCC	2	8	29424	29431	0 %	25 %	25 %	50 %	258538219
57	NC_013199	GAAA	2	8	29669	29676	75 %	0 %	25 %	0 %	258538220
58	NC_013199	TCAA	2	8	29773	29780	50 %	25 %	0 %	25 %	258538220
59	NC_013199	CCGG	2	8	30170	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	258538220
60	NC_013199	CTTA	2	8	30585	30592	25 %	50 %	0 %	25 %	258538221
61	NC_013199	CAAT	2	8	31478	31485	50 %	25 %	0 %	25 %	258538222
62	NC_013199	AACC	2	8	31586	31593	50 %	0 %	0 %	50 %	258538222
63	NC_013199	ATTT	2	8	32295	32302	25 %	75 %	0 %	0 %	258538223
64	NC_013199	GCGA	2	8	32321	32328	25 %	0 %	50 %	25 %	258538223
65	NC_013199	TTAT	2	8	32402	32409	25 %	75 %	0 %	0 %	258538223
66	NC_013199	TTCA	2	8	32978	32985	25 %	50 %	0 %	25 %	258538224
67	NC_013199	GATT	2	8	34600	34607	25 %	50 %	25 %	0 %	258538226
68	NC_013199	GCAG	2	8	34723	34730	25 %	0 %	50 %	25 %	258538226
69	NC_013199	CTGG	2	8	35029	35036	0 %	25 %	50 %	25 %	258538226
70	NC_013199	TTAT	2	8	35815	35822	25 %	75 %	0 %	0 %	258538227
71	NC_013199	TTGG	2	8	35870	35877	0 %	50 %	50 %	0 %	258538227
72	NC_013199	AAAT	2	8	38046	38053	75 %	25 %	0 %	0 %	258538229
73	NC_013199	AGCT	2	8	39750	39757	25 %	25 %	25 %	25 %	258538230
74	NC_013199	AGTC	2	8	39780	39787	25 %	25 %	25 %	25 %	258538230
75	NC_013199	AAAC	2	8	40265	40272	75 %	0 %	0 %	25 %	258538230
76	NC_013199	CGAC	2	8	40613	40620	25 %	0 %	25 %	50 %	258538230
77	NC_013199	ATGA	2	8	41900	41907	50 %	25 %	25 %	0 %	258538231
78	NC_013199	GATC	2	8	42449	42456	25 %	25 %	25 %	25 %	258538231
79	NC_013199	CTGT	2	8	42568	42575	0 %	50 %	25 %	25 %	258538231
80	NC_013199	CTGC	2	8	42825	42832	0 %	25 %	25 %	50 %	258538232
81	NC_013199	TGGA	2	8	43231	43238	25 %	25 %	50 %	0 %	258538233
82	NC_013199	GCCG	2	8	43613	43620	0 %	0 %	50 %	50 %	258538233
83	NC_013199	AAAG	2	8	44123	44130	75 %	0 %	25 %	0 %	258538233
84	NC_013199	GGCT	2	8	44633	44640	0 %	25 %	50 %	25 %	258538233
85	NC_013199	AAGT	2	8	44982	44989	50 %	25 %	25 %	0 %	258538233
86	NC_013199	AAAC	2	8	45948	45955	75 %	0 %	0 %	25 %	258538234
87	NC_013199	TATC	2	8	46456	46463	25 %	50 %	0 %	25 %	258538234
88	NC_013199	TTGG	2	8	46602	46609	0 %	50 %	50 %	0 %	258538234
89	NC_013199	AGTA	2	8	46772	46779	50 %	25 %	25 %	0 %	258538234
90	NC_013199	TCAA	2	8	46964	46971	50 %	25 %	0 %	25 %	258538234
91	NC_013199	CGGG	2	8	47334	47341	0 %	0 %	75 %	25 %	258538234
92	NC_013199	CAGT	3	12	47545	47556	25 %	25 %	25 %	25 %	258538234
93	NC_013199	GGCA	2	8	48708	48715	25 %	0 %	50 %	25 %	258538234
94	NC_013199	GGCA	2	8	48924	48931	25 %	0 %	50 %	25 %	258538234
95	NC_013199	ACCA	2	8	49106	49113	50 %	0 %	0 %	50 %	258538234
96	NC_013199	AGCA	2	8	49587	49594	50 %	0 %	25 %	25 %	258538234
97	NC_013199	TTAC	2	8	50230	50237	25 %	50 %	0 %	25 %	258538235
98	NC_013199	TTAA	2	8	50846	50853	50 %	50 %	0 %	0 %	258538235
99	NC_013199	GGCT	2	8	51073	51080	0 %	25 %	50 %	25 %	258538236
100	NC_013199	TTGA	2	8	51269	51276	25 %	50 %	25 %	0 %	258538236
101	NC_013199	CGAT	2	8	51349	51356	25 %	25 %	25 %	25 %	258538236
102	NC_013199	CAGC	2	8	51487	51494	25 %	0 %	25 %	50 %	258538236
103	NC_013199	GCCA	2	8	51821	51828	25 %	0 %	25 %	50 %	258538236
104	NC_013199	CATT	2	8	51915	51922	25 %	50 %	0 %	25 %	258538236
105	NC_013199	GCTG	2	8	52892	52899	0 %	25 %	50 %	25 %	258538237
106	NC_013199	CATG	2	8	53757	53764	25 %	25 %	25 %	25 %	258538238
107	NC_013199	CAAG	2	8	55111	55118	50 %	0 %	25 %	25 %	258538239
108	NC_013199	ATCA	2	8	55360	55367	50 %	25 %	0 %	25 %	258538239
109	NC_013199	GTCA	2	8	55648	55655	25 %	25 %	25 %	25 %	258538239
110	NC_013199	GGCA	2	8	55861	55868	25 %	0 %	50 %	25 %	258538239
111	NC_013199	ATCA	2	8	56799	56806	50 %	25 %	0 %	25 %	258538240
112	NC_013199	TGGC	2	8	57164	57171	0 %	25 %	50 %	25 %	258538240
113	NC_013199	CTGG	2	8	57568	57575	0 %	25 %	50 %	25 %	258538240
114	NC_013199	ATCA	2	8	57747	57754	50 %	25 %	0 %	25 %	258538240
115	NC_013199	ACAA	2	8	58218	58225	75 %	0 %	0 %	25 %	258538241
116	NC_013199	ATTT	2	8	60661	60668	25 %	75 %	0 %	0 %	258538243
117	NC_013199	ATTA	2	8	61303	61310	50 %	50 %	0 %	0 %	258538243
118	NC_013199	GGCA	2	8	61932	61939	25 %	0 %	50 %	25 %	258538244
119	NC_013199	ATGG	2	8	63074	63081	25 %	25 %	50 %	0 %	258538244
120	NC_013199	CCAG	2	8	64353	64360	25 %	0 %	25 %	50 %	258538245
121	NC_013199	TTGG	2	8	64398	64405	0 %	50 %	50 %	0 %	258538245
122	NC_013199	ATGT	2	8	64510	64517	25 %	50 %	25 %	0 %	258538245
123	NC_013199	ATGA	2	8	64802	64809	50 %	25 %	25 %	0 %	258538246
124	NC_013199	GCTG	2	8	65527	65534	0 %	25 %	50 %	25 %	258538247
125	NC_013199	GTGA	2	8	65704	65711	25 %	25 %	50 %	0 %	258538247
126	NC_013199	AGCC	2	8	65850	65857	25 %	0 %	25 %	50 %	258538247
127	NC_013199	ATAA	2	8	67314	67321	75 %	25 %	0 %	0 %	258538248
128	NC_013199	GTAA	2	8	67348	67355	50 %	25 %	25 %	0 %	258538248
129	NC_013199	CAAC	2	8	67597	67604	50 %	0 %	0 %	50 %	258538248
130	NC_013199	AGTA	2	8	67811	67818	50 %	25 %	25 %	0 %	258538248
131	NC_013199	CAAA	2	8	68196	68203	75 %	0 %	0 %	25 %	258538248
132	NC_013199	AATA	2	8	68494	68501	75 %	25 %	0 %	0 %	258538249
133	NC_013199	TCGC	2	8	68772	68779	0 %	25 %	25 %	50 %	258538249
134	NC_013199	TTGA	2	8	68834	68841	25 %	50 %	25 %	0 %	258538249
135	NC_013199	TGTC	2	8	69889	69896	0 %	50 %	25 %	25 %	258538251
136	NC_013199	CAGC	2	8	69965	69972	25 %	0 %	25 %	50 %	258538251
137	NC_013199	AACG	2	8	70309	70316	50 %	0 %	25 %	25 %	258538251
138	NC_013199	GTTC	2	8	70366	70373	0 %	50 %	25 %	25 %	258538251
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