MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 33852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538192
2	NC_013199	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538192
3	NC_013199	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538192
4	NC_013199	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538192
5	NC_013199	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538192
6	NC_013199	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538192
7	NC_013199	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538192
8	NC_013199	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
9	NC_013199	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
10	NC_013199	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538192
11	NC_013199	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538192
12	NC_013199	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
13	NC_013199	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538192
14	NC_013199	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538192
15	NC_013199	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538192
16	NC_013199	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
17	NC_013199	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
18	NC_013199	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538193
19	NC_013199	AAC	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538193
20	NC_013199	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
21	NC_013199	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538193
22	NC_013199	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538193
23	NC_013199	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538193
24	NC_013199	CGT	2	6	2384	2389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538193
25	NC_013199	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538193
26	NC_013199	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538193
27	NC_013199	GCA	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538194
28	NC_013199	ATG	2	6	2878	2883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538194
29	NC_013199	CGA	3	9	3521	3529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538195
30	NC_013199	CAC	2	6	3546	3551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538195
31	NC_013199	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538195
32	NC_013199	CGT	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538195
33	NC_013199	GAT	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538195
34	NC_013199	CAA	2	6	3899	3904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538196
35	NC_013199	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538196
36	NC_013199	TCA	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538196
37	NC_013199	CGG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538196
38	NC_013199	GGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538196
39	NC_013199	TGC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538196
40	NC_013199	TGC	3	9	4355	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538196
41	NC_013199	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538196
42	NC_013199	AGC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
43	NC_013199	GAT	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538196
44	NC_013199	CAG	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
45	NC_013199	CAC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538196
46	NC_013199	GAC	3	9	4763	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538196
47	NC_013199	ATC	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538196
48	NC_013199	GAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
49	NC_013199	GCA	2	6	4933	4938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538197
50	NC_013199	ATG	2	6	4943	4948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
51	NC_013199	CAT	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538197
52	NC_013199	GTC	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
53	NC_013199	GGT	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538197
54	NC_013199	CGG	2	6	5262	5267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
55	NC_013199	GTT	2	6	5326	5331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
56	NC_013199	CGG	2	6	5334	5339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
57	NC_013199	TGA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
58	NC_013199	GCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
59	NC_013199	GGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
60	NC_013199	GAA	3	9	5628	5636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
61	NC_013199	CTG	2	6	5644	5649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
62	NC_013199	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
63	NC_013199	GTT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
64	NC_013199	GGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538197
65	NC_013199	CAA	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
66	NC_013199	ATT	2	6	6049	6054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538197
67	NC_013199	GCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538197
68	NC_013199	AAG	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
69	NC_013199	ACA	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
70	NC_013199	GGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
71	NC_013199	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
72	NC_013199	ATC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538197
73	NC_013199	GTT	2	6	6459	6464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
74	NC_013199	ATG	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538197
75	NC_013199	GCC	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538197
76	NC_013199	ACC	2	6	6685	6690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538197
77	NC_013199	CGG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538197
78	NC_013199	GAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538197
79	NC_013199	TTG	2	6	6821	6826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538197
80	NC_013199	AAC	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538197
81	NC_013199	GAT	2	6	6915	6920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
82	NC_013199	AAG	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
83	NC_013199	TCG	2	6	7120	7125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
84	NC_013199	GCG	3	9	7263	7271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
85	NC_013199	CAA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
86	NC_013199	GTT	2	6	7383	7388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538198
87	NC_013199	CTG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
88	NC_013199	ACC	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538198
89	NC_013199	CCG	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
90	NC_013199	ATC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538198
91	NC_013199	CCA	2	6	7522	7527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538198
92	NC_013199	CCG	2	6	7528	7533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
93	NC_013199	GGT	2	6	7572	7577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
94	NC_013199	TTA	2	6	7690	7695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538198
95	NC_013199	CAA	2	6	7715	7720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
96	NC_013199	TGG	2	6	7729	7734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
97	NC_013199	TGA	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
98	NC_013199	CCG	2	6	7832	7837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538198
99	NC_013199	AAT	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538198
100	NC_013199	TGG	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
101	NC_013199	CGG	3	9	7998	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
102	NC_013199	GAA	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
103	NC_013199	TGA	2	6	8081	8086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
104	NC_013199	ATT	2	6	8097	8102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538198
105	NC_013199	ATT	2	6	8310	8315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538198
106	NC_013199	ATG	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
107	NC_013199	CTG	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
108	NC_013199	AAG	2	6	8419	8424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
109	NC_013199	GGT	2	6	8499	8504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538198
110	NC_013199	GAT	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
111	NC_013199	TCG	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538198
112	NC_013199	ATG	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
113	NC_013199	CTT	2	6	8585	8590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538198
114	NC_013199	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538198
115	NC_013199	GCA	2	6	8614	8619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
116	NC_013199	ATG	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
117	NC_013199	GCA	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
118	NC_013199	CGG	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538198
119	NC_013199	GAA	2	6	9149	9154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538198
120	NC_013199	CGA	2	6	9296	9301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
121	NC_013199	CGA	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
122	NC_013199	GAC	2	6	9354	9359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
123	NC_013199	AGC	2	6	9360	9365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538198
124	NC_013199	TGA	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538198
125	NC_013199	CTG	3	9	9800	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538199
126	NC_013199	ATG	2	6	10217	10222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538200
127	NC_013199	TGG	2	6	10279	10284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538200
128	NC_013199	TAA	2	6	10312	10317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538200
129	NC_013199	TTG	2	6	10335	10340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538200
130	NC_013199	TGG	2	6	10351	10356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538200
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258	NC_013199	GAT	2	6	21807	21812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538214
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