MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013199	AGC	2	6	246735	246740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538438
4002	NC_013199	GAC	2	6	246852	246857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538438
4003	NC_013199	GCCG	2	8	246858	246865	0 %	0 %	50 %	50 %	258538438
4004	NC_013199	GAT	2	6	246913	246918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538438
4005	NC_013199	CAG	2	6	246950	246955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538438
4006	NC_013199	CAC	2	6	246992	246997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538438
4007	NC_013199	AGC	2	6	247002	247007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538438
4008	NC_013199	TCG	2	6	247011	247016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538438
4009	NC_013199	CAT	2	6	247018	247023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538438
4010	NC_013199	AGTC	2	8	247106	247113	25 %	25 %	25 %	25 %	258538438
4011	NC_013199	AGC	2	6	247115	247120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538438
4012	NC_013199	TAT	2	6	247354	247359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538439
4013	NC_013199	TTA	2	6	247374	247379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538439
4014	NC_013199	GAT	2	6	247644	247649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538439
4015	NC_013199	TTGT	2	8	247650	247657	0 %	75 %	25 %	0 %	258538439
4016	NC_013199	CCG	2	6	247690	247695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538439
4017	NC_013199	CCA	2	6	247753	247758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538439
4018	NC_013199	ACC	2	6	247809	247814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538439
4019	NC_013199	ATG	2	6	247933	247938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538439
4020	NC_013199	CTT	3	9	247943	247951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538439
4021	NC_013199	GTT	2	6	248024	248029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538439
4022	NC_013199	GC	3	6	248037	248042	0 %	0 %	50 %	50 %	258538439
4023	NC_013199	AGT	2	6	248045	248050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538439
4024	NC_013199	GCA	2	6	248091	248096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538439
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4026	NC_013199	ATTT	2	8	248121	248128	25 %	75 %	0 %	0 %	258538439
4027	NC_013199	CGA	2	6	248159	248164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538439
4028	NC_013199	ATTGAT	2	12	248166	248177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258538439
4029	NC_013199	AAG	2	6	248194	248199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538439
4030	NC_013199	AGC	2	6	248246	248251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538439
4031	NC_013199	ATT	2	6	248272	248277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538439
4032	NC_013199	CAG	2	6	248317	248322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538439
4033	NC_013199	CTG	2	6	248359	248364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538439
4034	NC_013199	ACGGT	2	10	248428	248437	20 %	20 %	40 %	20 %	258538439
4035	NC_013199	AAC	2	6	248612	248617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538439
4036	NC_013199	GAT	2	6	248619	248624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538439
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4040	NC_013199	A	6	6	248797	248802	100 %	0 %	0 %	0 %	258538439
4041	NC_013199	AC	3	6	248815	248820	50 %	0 %	0 %	50 %	258538439
4042	NC_013199	TGG	2	6	248908	248913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538440
4043	NC_013199	CTG	2	6	248948	248953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538440
4044	NC_013199	ACGC	2	8	248959	248966	25 %	0 %	25 %	50 %	258538440
4045	NC_013199	ATG	2	6	249009	249014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538440
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4048	NC_013199	ACT	2	6	249147	249152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538440
4049	NC_013199	GCT	2	6	249167	249172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538440
4050	NC_013199	GCGA	2	8	249225	249232	25 %	0 %	50 %	25 %	258538440
4051	NC_013199	GAG	2	6	249242	249247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538440
4052	NC_013199	ATC	2	6	249417	249422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538440
4053	NC_013199	GAT	2	6	249443	249448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538440
4054	NC_013199	ATC	2	6	249513	249518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538440
4055	NC_013199	TGAT	2	8	249528	249535	25 %	50 %	25 %	0 %	258538440
4056	NC_013199	TAT	2	6	249544	249549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538440
4057	NC_013199	TTG	2	6	249611	249616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538440
4058	NC_013199	ATG	2	6	249623	249628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538440
4059	NC_013199	GAA	2	6	249958	249963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538441
4060	NC_013199	GAA	2	6	250192	250197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538441
4061	NC_013199	TCT	2	6	250304	250309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538441
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4064	NC_013199	TGC	2	6	250431	250436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538441
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4068	NC_013199	TCA	2	6	250566	250571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538441
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4074	NC_013199	TGC	2	6	251068	251073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538442
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4080	NC_013199	TCAA	2	8	251315	251322	50 %	25 %	0 %	25 %	258538442
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4085	NC_013199	ACCGT	2	10	251450	251459	20 %	20 %	20 %	40 %	258538442
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4087	NC_013199	GCATC	2	10	251565	251574	20 %	20 %	20 %	40 %	258538442
4088	NC_013199	GTT	2	6	252034	252039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538443
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4093	NC_013199	TCG	2	6	252362	252367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538443
4094	NC_013199	ACCG	2	8	252393	252400	25 %	0 %	25 %	50 %	258538443
4095	NC_013199	CA	3	6	252516	252521	50 %	0 %	0 %	50 %	258538443
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4099	NC_013199	A	6	6	252776	252781	100 %	0 %	0 %	0 %	258538443
4100	NC_013199	AAG	2	6	252806	252811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538443
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4102	NC_013199	GCA	2	6	252891	252896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538443
4103	NC_013199	TCG	2	6	252899	252904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538443
4104	NC_013199	ATG	2	6	252916	252921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538443
4105	NC_013199	TAT	2	6	252922	252927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538443
4106	NC_013199	CAC	2	6	252930	252935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538443
4107	NC_013199	ATT	2	6	253161	253166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538443
4108	NC_013199	ATCT	2	8	253174	253181	25 %	50 %	0 %	25 %	258538443
4109	NC_013199	TTC	2	6	253186	253191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538443
4110	NC_013199	CTG	2	6	253222	253227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538443
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4114	NC_013199	CAG	2	6	253421	253426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538443
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4120	NC_013199	TTA	2	6	253937	253942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538444
4121	NC_013199	AGC	2	6	254070	254075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538444
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4140	NC_013199	CATT	2	8	255271	255278	25 %	50 %	0 %	25 %	258538444
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4240	NC_013199	CAT	2	6	261156	261161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538449
4241	NC_013199	GAA	2	6	261214	261219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538449
4242	NC_013199	CGG	2	6	261266	261271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538449
4243	NC_013199	CG	3	6	261313	261318	0 %	0 %	50 %	50 %	258538449
4244	NC_013199	AGGT	2	8	261362	261369	25 %	25 %	50 %	0 %	258538449
4245	NC_013199	ATG	2	6	261417	261422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538450
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4249	NC_013199	GAA	2	6	261614	261619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538450
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4255	NC_013199	CTTC	2	8	262060	262067	0 %	50 %	0 %	50 %	258538450
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4363	NC_013199	CA	3	6	269165	269170	50 %	0 %	0 %	50 %	258538457
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