MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013199	CTA	2	6	183775	183780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538362
3002	NC_013199	TTG	2	6	183805	183810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538362
3003	NC_013199	ACAA	2	8	183826	183833	75 %	0 %	0 %	25 %	258538362
3004	NC_013199	GAA	2	6	183841	183846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538362
3005	NC_013199	TTAAGT	2	12	183961	183972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258538363
3006	NC_013199	CCGA	2	8	184035	184042	25 %	0 %	25 %	50 %	258538363
3007	NC_013199	TGG	2	6	184055	184060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538363
3008	NC_013199	TCGA	2	8	184092	184099	25 %	25 %	25 %	25 %	258538363
3009	NC_013199	CA	3	6	184178	184183	50 %	0 %	0 %	50 %	258538363
3010	NC_013199	GCT	2	6	184443	184448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538363
3011	NC_013199	GAT	2	6	184485	184490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538363
3012	NC_013199	ACC	2	6	184644	184649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538363
3013	NC_013199	GAA	2	6	184802	184807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538364
3014	NC_013199	A	6	6	184806	184811	100 %	0 %	0 %	0 %	258538364
3015	NC_013199	TGCC	2	8	184849	184856	0 %	25 %	25 %	50 %	258538364
3016	NC_013199	TGC	2	6	184886	184891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538364
3017	NC_013199	CCA	2	6	185038	185043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538364
3018	NC_013199	GTG	2	6	185058	185063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538364
3019	NC_013199	TTCA	2	8	185442	185449	25 %	50 %	0 %	25 %	258538364
3020	NC_013199	CAAGC	2	10	185759	185768	40 %	0 %	20 %	40 %	258538364
3021	NC_013199	ATC	2	6	185823	185828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538364
3022	NC_013199	GCG	2	6	185849	185854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538364
3023	NC_013199	CTT	2	6	185872	185877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538364
3024	NC_013199	AGA	2	6	185977	185982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538365
3025	NC_013199	GAT	2	6	185986	185991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538365
3026	NC_013199	GGC	2	6	186093	186098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538365
3027	NC_013199	TTG	2	6	186143	186148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538365
3028	NC_013199	A	7	7	186214	186220	100 %	0 %	0 %	0 %	258538366
3029	NC_013199	AAG	2	6	186228	186233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538366
3030	NC_013199	CTA	2	6	186314	186319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538366
3031	NC_013199	GAT	2	6	186375	186380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538366
3032	NC_013199	ATA	2	6	186430	186435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538366
3033	NC_013199	CTG	2	6	186492	186497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538366
3034	NC_013199	TGA	2	6	186502	186507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538366
3035	NC_013199	CAA	2	6	186510	186515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538366
3036	NC_013199	GCT	2	6	186668	186673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538366
3037	NC_013199	TGG	2	6	186688	186693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538366
3038	NC_013199	CA	3	6	186695	186700	50 %	0 %	0 %	50 %	258538366
3039	NC_013199	AAC	2	6	186767	186772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538366
3040	NC_013199	AAG	2	6	186871	186876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538366
3041	NC_013199	TGG	2	6	186886	186891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538366
3042	NC_013199	ATT	2	6	187023	187028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538366
3043	NC_013199	AGC	2	6	187063	187068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538366
3044	NC_013199	GAT	2	6	187206	187211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538366
3045	NC_013199	CTT	2	6	187229	187234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538366
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3047	NC_013199	TGTT	2	8	187332	187339	0 %	75 %	25 %	0 %	258538366
3048	NC_013199	CGC	2	6	187346	187351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538366
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3050	NC_013199	ATT	2	6	187506	187511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538366
3051	NC_013199	CCG	2	6	187569	187574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538366
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3053	NC_013199	AAG	2	6	187633	187638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538366
3054	NC_013199	TTTC	2	8	187889	187896	0 %	75 %	0 %	25 %	258538367
3055	NC_013199	TGG	2	6	187938	187943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538367
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3057	NC_013199	CAT	2	6	188042	188047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538367
3058	NC_013199	ATT	3	9	188063	188071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538367
3059	NC_013199	CGG	2	6	188118	188123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538367
3060	NC_013199	GTG	2	6	188147	188152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538367
3061	NC_013199	TTG	2	6	188214	188219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538367
3062	NC_013199	TTG	2	6	188239	188244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538367
3063	NC_013199	TCA	2	6	188260	188265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538367
3064	NC_013199	CTG	2	6	188268	188273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538367
3065	NC_013199	GCA	2	6	188326	188331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538367
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3068	NC_013199	CAGT	2	8	188408	188415	25 %	25 %	25 %	25 %	258538367
3069	NC_013199	TGG	2	6	188418	188423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538367
3070	NC_013199	ATT	2	6	188445	188450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538367
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3073	NC_013199	ATC	2	6	188535	188540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538367
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3075	NC_013199	TGCT	2	8	188617	188624	0 %	50 %	25 %	25 %	258538367
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3091	NC_013199	TGA	2	6	189811	189816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538369
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3101	NC_013199	CG	3	6	190397	190402	0 %	0 %	50 %	50 %	258538369
3102	NC_013199	TTAC	2	8	190534	190541	25 %	50 %	0 %	25 %	258538369
3103	NC_013199	TGC	2	6	190586	190591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538369
3104	NC_013199	CACAA	2	10	190701	190710	60 %	0 %	0 %	40 %	258538369
3105	NC_013199	ATC	2	6	190768	190773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538369
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3107	NC_013199	GTTG	2	8	191248	191255	0 %	50 %	50 %	0 %	258538370
3108	NC_013199	AAG	2	6	191343	191348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538370
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3110	NC_013199	GTT	3	9	191462	191470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538370
3111	NC_013199	GAT	2	6	191471	191476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538370
3112	NC_013199	TGC	2	6	191484	191489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538370
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3115	NC_013199	TA	3	6	191637	191642	50 %	50 %	0 %	0 %	258538370
3116	NC_013199	TGC	2	6	191725	191730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538370
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3119	NC_013199	CAA	2	6	191962	191967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538370
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3121	NC_013199	GCT	2	6	192104	192109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538370
3122	NC_013199	ATGG	2	8	192113	192120	25 %	25 %	50 %	0 %	258538370
3123	NC_013199	GCT	2	6	192289	192294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538370
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3155	NC_013199	TGG	2	6	194599	194604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538372
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3229	NC_013199	ACG	2	6	199609	199614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538377
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3236	NC_013199	CAAT	2	8	199953	199960	50 %	25 %	0 %	25 %	258538377
3237	NC_013199	CGC	2	6	199980	199985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538377
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3240	NC_013199	CCAA	2	8	200100	200107	50 %	0 %	0 %	50 %	258538377
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3242	NC_013199	ATG	2	6	200181	200186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538377
3243	NC_013199	CG	4	8	200231	200238	0 %	0 %	50 %	50 %	258538377
3244	NC_013199	GCG	2	6	200260	200265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538377
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3485	NC_013199	ACGC	2	8	214726	214733	25 %	0 %	25 %	50 %	258538393
3486	NC_013199	CGG	2	6	214774	214779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538393
3487	NC_013199	CG	3	6	214832	214837	0 %	0 %	50 %	50 %	258538393
3488	NC_013199	GCT	2	6	214872	214877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538393
3489	NC_013199	CGG	2	6	214925	214930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538393
3490	NC_013199	CAT	2	6	215125	215130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538394
3491	NC_013199	GTG	2	6	215154	215159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538394
3492	NC_013199	AGA	2	6	215191	215196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538394
3493	NC_013199	GT	3	6	215307	215312	0 %	50 %	50 %	0 %	258538394
3494	NC_013199	AGC	2	6	215328	215333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538394
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3497	NC_013199	CTGA	2	8	215609	215616	25 %	25 %	25 %	25 %	258538394
3498	NC_013199	GC	3	6	215674	215679	0 %	0 %	50 %	50 %	258538394
3499	NC_013199	CTT	2	6	215713	215718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538394
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