MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2123	NC_013199	GATC	2	8	131714	131721	25 %	25 %	25 %	25 %	258538311
2124	NC_013199	ATT	2	6	131814	131819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538311
2125	NC_013199	GGC	2	6	131822	131827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538311
2126	NC_013199	AAC	2	6	131932	131937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538311
2127	NC_013199	TGT	2	6	131950	131955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538311
2128	NC_013199	GCA	2	6	131965	131970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538311
2129	NC_013199	TGAA	2	8	132001	132008	50 %	25 %	25 %	0 %	258538311
2130	NC_013199	GAA	3	9	132006	132014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538311
2131	NC_013199	ATT	2	6	132027	132032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538311
2132	NC_013199	TCA	3	9	132148	132156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538311
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2135	NC_013199	CGATGA	2	12	132416	132427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258538311
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2139	NC_013199	CAT	2	6	132479	132484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538311
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2142	NC_013199	GAT	2	6	132722	132727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538312
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2144	NC_013199	GAT	2	6	132857	132862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538312
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2147	NC_013199	GAAA	2	8	132925	132932	75 %	0 %	25 %	0 %	258538312
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2151	NC_013199	GAT	2	6	133003	133008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538312
2152	NC_013199	TGG	2	6	133011	133016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538312
2153	NC_013199	TTG	2	6	133017	133022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538312
2154	NC_013199	GAT	2	6	133067	133072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538312
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2212	NC_013199	CCAC	2	8	135868	135875	25 %	0 %	0 %	75 %	258538313
2213	NC_013199	TCT	2	6	135923	135928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538313
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2216	NC_013199	GGT	2	6	135997	136002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538314
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2218	NC_013199	GCATC	2	10	136085	136094	20 %	20 %	20 %	40 %	258538314
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2223	NC_013199	GCTG	2	8	136311	136318	0 %	25 %	50 %	25 %	258538314
2224	NC_013199	AGGCT	2	10	136338	136347	20 %	20 %	40 %	20 %	258538314
2225	NC_013199	GCG	2	6	136355	136360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538314
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2228	NC_013199	CAAT	2	8	136536	136543	50 %	25 %	0 %	25 %	258538314
2229	NC_013199	A	6	6	136635	136640	100 %	0 %	0 %	0 %	258538314
2230	NC_013199	GGC	2	6	136641	136646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538314
2231	NC_013199	AAG	2	6	136659	136664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538314
2232	NC_013199	CAT	2	6	136897	136902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538315
2233	NC_013199	GAATC	2	10	136911	136920	40 %	20 %	20 %	20 %	258538315
2234	NC_013199	TAT	2	6	137054	137059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538315
2235	NC_013199	TGC	2	6	137069	137074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538315
2236	NC_013199	CGGGGA	2	12	137077	137088	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258538315
2237	NC_013199	TGGCG	2	10	137106	137115	0 %	20 %	60 %	20 %	258538315
2238	NC_013199	GGC	2	6	137171	137176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538315
2239	NC_013199	GATC	2	8	137306	137313	25 %	25 %	25 %	25 %	258538315
2240	NC_013199	GCA	2	6	137338	137343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538315
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2242	NC_013199	AAAT	2	8	137420	137427	75 %	25 %	0 %	0 %	258538315
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2355	NC_013199	A	6	6	144281	144286	100 %	0 %	0 %	0 %	258538320
2356	NC_013199	GGGAT	2	10	144343	144352	20 %	20 %	60 %	0 %	258538320
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2359	NC_013199	ATG	2	6	144588	144593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538320
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2361	NC_013199	AAAG	2	8	144679	144686	75 %	0 %	25 %	0 %	258538320
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2363	NC_013199	ACC	2	6	144779	144784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538320
2364	NC_013199	CTT	2	6	144814	144819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538320
2365	NC_013199	TGC	2	6	144892	144897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538320
2366	NC_013199	AGC	2	6	144906	144911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538320
2367	NC_013199	CTG	2	6	144960	144965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538320
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2398	NC_013199	GCT	2	6	147295	147300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538324
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2481	NC_013199	CGG	2	6	152178	152183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538327
2482	NC_013199	GCTG	2	8	152200	152207	0 %	25 %	50 %	25 %	258538327
2483	NC_013199	CGC	2	6	152261	152266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538327
2484	NC_013199	TGA	2	6	152280	152285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538327
2485	NC_013199	CAA	2	6	152399	152404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538327
2486	NC_013199	AAC	2	6	152487	152492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538327
2487	NC_013199	CAAA	2	8	152561	152568	75 %	0 %	0 %	25 %	258538328
2488	NC_013199	T	6	6	152576	152581	0 %	100 %	0 %	0 %	258538328
2489	NC_013199	ATCGG	2	10	152673	152682	20 %	20 %	40 %	20 %	258538328
2490	NC_013199	TTCA	2	8	152714	152721	25 %	50 %	0 %	25 %	258538328
2491	NC_013199	GGA	2	6	152758	152763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538328
2492	NC_013199	GCA	2	6	152787	152792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538329
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2495	NC_013199	AGC	2	6	153152	153157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538329
2496	NC_013199	GCT	2	6	153210	153215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538329
2497	NC_013199	TGA	2	6	153240	153245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538329
2498	NC_013199	GACA	2	8	153311	153318	50 %	0 %	25 %	25 %	258538329
2499	NC_013199	GGC	2	6	153392	153397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538329
2500	NC_013199	AGTG	2	8	153402	153409	25 %	25 %	50 %	0 %	258538329

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