MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013199	CAT	2	6	30749	30754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538221
502	NC_013199	GCC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538222
503	NC_013199	TGC	2	6	31035	31040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538222
504	NC_013199	AAT	2	6	31041	31046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538222
505	NC_013199	TAA	2	6	31053	31058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538222
506	NC_013199	GCG	2	6	31071	31076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538222
507	NC_013199	GAT	2	6	31080	31085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538222
508	NC_013199	GCC	2	6	31098	31103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538222
509	NC_013199	GTG	2	6	31153	31158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538222
510	NC_013199	TTC	2	6	31207	31212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538222
511	NC_013199	GCA	2	6	31279	31284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538222
512	NC_013199	CTT	2	6	31340	31345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538222
513	NC_013199	CGC	2	6	31428	31433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538222
514	NC_013199	GAT	2	6	31434	31439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538222
515	NC_013199	CAAT	2	8	31478	31485	50 %	25 %	0 %	25 %	258538222
516	NC_013199	AGA	2	6	31486	31491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538222
517	NC_013199	TAC	2	6	31505	31510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538222
518	NC_013199	AATCAG	2	12	31521	31532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258538222
519	NC_013199	GAG	2	6	31573	31578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538222
520	NC_013199	AACC	2	8	31586	31593	50 %	0 %	0 %	50 %	258538222
521	NC_013199	TGG	2	6	31638	31643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538222
522	NC_013199	GTC	2	6	32065	32070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538223
523	NC_013199	GGT	2	6	32091	32096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538223
524	NC_013199	CAG	2	6	32140	32145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538223
525	NC_013199	T	6	6	32157	32162	0 %	100 %	0 %	0 %	258538223
526	NC_013199	T	6	6	32172	32177	0 %	100 %	0 %	0 %	258538223
527	NC_013199	ATT	2	6	32256	32261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538223
528	NC_013199	TTA	2	6	32267	32272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538223
529	NC_013199	ATTT	2	8	32295	32302	25 %	75 %	0 %	0 %	258538223
530	NC_013199	GCGA	2	8	32321	32328	25 %	0 %	50 %	25 %	258538223
531	NC_013199	A	6	6	32332	32337	100 %	0 %	0 %	0 %	258538223
532	NC_013199	GGA	2	6	32361	32366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538223
533	NC_013199	TTG	2	6	32393	32398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538223
534	NC_013199	TTAT	2	8	32402	32409	25 %	75 %	0 %	0 %	258538223
535	NC_013199	TTG	2	6	32444	32449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538223
536	NC_013199	AAT	2	6	32482	32487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538223
537	NC_013199	GGC	2	6	32856	32861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538224
538	NC_013199	A	7	7	32929	32935	100 %	0 %	0 %	0 %	258538224
539	NC_013199	TTCA	2	8	32978	32985	25 %	50 %	0 %	25 %	258538224
540	NC_013199	TGG	2	6	32991	32996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538224
541	NC_013199	TGG	2	6	33047	33052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538224
542	NC_013199	ATA	2	6	33161	33166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538224
543	NC_013199	TTG	2	6	33189	33194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538224
544	NC_013199	ATA	2	6	33239	33244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538224
545	NC_013199	TGT	2	6	33291	33296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538224
546	NC_013199	GAA	2	6	33337	33342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538224
547	NC_013199	GTC	2	6	33461	33466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538225
548	NC_013199	TAA	2	6	33506	33511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538225
549	NC_013199	AGA	2	6	33559	33564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538225
550	NC_013199	AGC	2	6	33611	33616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538225
551	NC_013199	ATT	2	6	33632	33637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538225
552	NC_013199	AAT	2	6	33679	33684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538225
553	NC_013199	T	6	6	33713	33718	0 %	100 %	0 %	0 %	258538225
554	NC_013199	TTG	2	6	34047	34052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538226
555	NC_013199	AAG	2	6	34055	34060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538226
556	NC_013199	GAT	2	6	34081	34086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538226
557	NC_013199	GGT	2	6	34387	34392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538226
558	NC_013199	TGA	2	6	34495	34500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538226
559	NC_013199	TCA	2	6	34528	34533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538226
560	NC_013199	GGC	2	6	34537	34542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538226
561	NC_013199	TGA	2	6	34555	34560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538226
562	NC_013199	GATT	2	8	34600	34607	25 %	50 %	25 %	0 %	258538226
563	NC_013199	GAT	2	6	34619	34624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538226
564	NC_013199	ATC	2	6	34665	34670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538226
565	NC_013199	GAA	2	6	34681	34686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538226
566	NC_013199	GCAG	2	8	34723	34730	25 %	0 %	50 %	25 %	258538226
567	NC_013199	AGA	2	6	34767	34772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538226
568	NC_013199	AGC	2	6	34874	34879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538226
569	NC_013199	GCG	2	6	35018	35023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538226
570	NC_013199	CTGG	2	8	35029	35036	0 %	25 %	50 %	25 %	258538226
571	NC_013199	T	6	6	35072	35077	0 %	100 %	0 %	0 %	258538226
572	NC_013199	CAC	2	6	35086	35091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538226
573	NC_013199	TGG	2	6	35172	35177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538226
574	NC_013199	CG	3	6	35258	35263	0 %	0 %	50 %	50 %	258538226
575	NC_013199	TGC	2	6	35379	35384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538226
576	NC_013199	GGC	2	6	35435	35440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538226
577	NC_013199	CCG	2	6	35680	35685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538227
578	NC_013199	TTAT	2	8	35815	35822	25 %	75 %	0 %	0 %	258538227
579	NC_013199	TTC	2	6	35829	35834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538227
580	NC_013199	TTGG	2	8	35870	35877	0 %	50 %	50 %	0 %	258538227
581	NC_013199	CG	3	6	35964	35969	0 %	0 %	50 %	50 %	258538227
582	NC_013199	ATC	2	6	35973	35978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538227
583	NC_013199	GAC	2	6	35991	35996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538227
584	NC_013199	ACC	2	6	35997	36002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538227
585	NC_013199	GCG	2	6	36096	36101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538227
586	NC_013199	ATT	2	6	36134	36139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538227
587	NC_013199	T	6	6	36708	36713	0 %	100 %	0 %	0 %	258538228
588	NC_013199	A	6	6	36746	36751	100 %	0 %	0 %	0 %	258538228
589	NC_013199	TGA	2	6	36823	36828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538228
590	NC_013199	ATG	2	6	36872	36877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538228
591	NC_013199	TTTTC	2	10	36912	36921	0 %	80 %	0 %	20 %	258538228
592	NC_013199	CTT	3	9	36956	36964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538228
593	NC_013199	TCC	2	6	36984	36989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258538228
594	NC_013199	GAA	2	6	37016	37021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538228
595	NC_013199	TCA	2	6	37035	37040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538228
596	NC_013199	TG	3	6	37086	37091	0 %	50 %	50 %	0 %	258538228
597	NC_013199	TAT	2	6	37115	37120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538228
598	NC_013199	TGC	3	9	37174	37182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538228
599	NC_013199	TCT	2	6	37188	37193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538228
600	NC_013199	CAT	2	6	37882	37887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538229
601	NC_013199	T	6	6	37900	37905	0 %	100 %	0 %	0 %	258538229
602	NC_013199	TCT	2	6	37980	37985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538229
603	NC_013199	T	6	6	37985	37990	0 %	100 %	0 %	0 %	258538229
604	NC_013199	TTA	2	6	38001	38006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538229
605	NC_013199	CAT	2	6	38016	38021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538229
606	NC_013199	GAG	2	6	38038	38043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538229
607	NC_013199	AAAT	2	8	38046	38053	75 %	25 %	0 %	0 %	258538229
608	NC_013199	TAC	2	6	38088	38093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538229
609	NC_013199	TGC	2	6	39271	39276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538230
610	NC_013199	TTG	3	9	39467	39475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538230
611	NC_013199	AAT	2	6	39487	39492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538230
612	NC_013199	T	6	6	39515	39520	0 %	100 %	0 %	0 %	258538230
613	NC_013199	CAA	2	6	39624	39629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538230
614	NC_013199	CAA	2	6	39679	39684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538230
615	NC_013199	GCA	2	6	39731	39736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538230
616	NC_013199	AGCT	2	8	39750	39757	25 %	25 %	25 %	25 %	258538230
617	NC_013199	TGC	2	6	39760	39765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538230
618	NC_013199	AGTC	2	8	39780	39787	25 %	25 %	25 %	25 %	258538230
619	NC_013199	ATC	2	6	39823	39828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538230
620	NC_013199	T	6	6	39847	39852	0 %	100 %	0 %	0 %	258538230
621	NC_013199	TGC	2	6	39952	39957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538230
622	NC_013199	AT	3	6	40138	40143	50 %	50 %	0 %	0 %	258538230
623	NC_013199	TTC	2	6	40252	40257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538230
624	NC_013199	AAAC	2	8	40265	40272	75 %	0 %	0 %	25 %	258538230
625	NC_013199	AT	3	6	40337	40342	50 %	50 %	0 %	0 %	258538230
626	NC_013199	ACA	2	6	40400	40405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538230
627	NC_013199	TGC	2	6	40432	40437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538230
628	NC_013199	CGAC	2	8	40613	40620	25 %	0 %	25 %	50 %	258538230
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755	NC_013199	GCA	2	6	49445	49450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538234
756	NC_013199	GAT	2	6	49553	49558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538234
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1000	NC_013199	ATC	2	6	64409	64414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538245

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