MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 6316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258506996
2	NC_013198	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258506996
3	NC_013198	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258506996
4	NC_013198	TGAT	2	8	3221	3228	25 %	50 %	25 %	0 %	258506998
5	NC_013198	AATT	2	8	3616	3623	50 %	50 %	0 %	0 %	258506999
6	NC_013198	TTTG	2	8	3707	3714	0 %	75 %	25 %	0 %	258506999
7	NC_013198	AAGA	2	8	4525	4532	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
8	NC_013198	AAGA	2	8	4546	4553	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
9	NC_013198	GCCA	2	8	6295	6302	25 %	0 %	25 %	50 %	258507000
10	NC_013198	ACGT	2	8	6649	6656	25 %	25 %	25 %	25 %	258507001
11	NC_013198	ATGA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	258507001
12	NC_013198	GATT	2	8	6968	6975	25 %	50 %	25 %	0 %	258507001
13	NC_013198	TATT	2	8	8376	8383	25 %	75 %	0 %	0 %	258507001
14	NC_013198	GCAC	2	8	8533	8540	25 %	0 %	25 %	50 %	258507001
15	NC_013198	CCGG	2	8	8887	8894	0 %	0 %	50 %	50 %	258507001
16	NC_013198	CGAA	2	8	9930	9937	50 %	0 %	25 %	25 %	258507003
17	NC_013198	GCCG	2	8	11225	11232	0 %	0 %	50 %	50 %	258507005
18	NC_013198	CTGG	2	8	11308	11315	0 %	25 %	50 %	25 %	258507005
19	NC_013198	TTCA	2	8	11970	11977	25 %	50 %	0 %	25 %	258507007
20	NC_013198	TTGG	2	8	12097	12104	0 %	50 %	50 %	0 %	258507007
21	NC_013198	AGCG	2	8	12762	12769	25 %	0 %	50 %	25 %	258507008
22	NC_013198	TGAA	2	8	13380	13387	50 %	25 %	25 %	0 %	258507010
23	NC_013198	TCAA	2	8	13605	13612	50 %	25 %	0 %	25 %	258507010
24	NC_013198	TCGG	2	8	14191	14198	0 %	25 %	50 %	25 %	258507011
25	NC_013198	CTGG	2	8	15229	15236	0 %	25 %	50 %	25 %	258507011
26	NC_013198	CAAT	2	8	15810	15817	50 %	25 %	0 %	25 %	258507012
27	NC_013198	TGTT	2	8	15857	15864	0 %	75 %	25 %	0 %	258507012
28	NC_013198	TTTA	2	8	16291	16298	25 %	75 %	0 %	0 %	258507012
29	NC_013198	GTTT	2	8	17002	17009	0 %	75 %	25 %	0 %	258507014
30	NC_013198	ATCA	2	8	20988	20995	50 %	25 %	0 %	25 %	258507017
31	NC_013198	CGGT	2	8	21691	21698	0 %	25 %	50 %	25 %	258507017
32	NC_013198	GATT	2	8	22235	22242	25 %	50 %	25 %	0 %	258507018
33	NC_013198	TTAT	2	8	22709	22716	25 %	75 %	0 %	0 %	258507018
34	NC_013198	TACA	2	8	23641	23648	50 %	25 %	0 %	25 %	258507020
35	NC_013198	AACT	2	8	24049	24056	50 %	25 %	0 %	25 %	258507020
36	NC_013198	TGGG	2	8	24440	24447	0 %	25 %	75 %	0 %	258507021
37	NC_013198	CAAG	2	8	24492	24499	50 %	0 %	25 %	25 %	258507021
38	NC_013198	ACCG	2	8	24511	24518	25 %	0 %	25 %	50 %	258507021
39	NC_013198	GATG	2	8	25422	25429	25 %	25 %	50 %	0 %	258507021
40	NC_013198	TAAA	2	8	25879	25886	75 %	25 %	0 %	0 %	258507022
41	NC_013198	GAAA	2	8	26099	26106	75 %	0 %	25 %	0 %	258507023
42	NC_013198	GCTG	2	8	26489	26496	0 %	25 %	50 %	25 %	258507023
43	NC_013198	ATCA	2	8	26666	26673	50 %	25 %	0 %	25 %	258507023
44	NC_013198	TTGT	2	8	27581	27588	0 %	75 %	25 %	0 %	258507024
45	NC_013198	GTTG	2	8	27710	27717	0 %	50 %	50 %	0 %	258507024
46	NC_013198	GGCA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	50 %	25 %	258507024
47	NC_013198	AGTT	2	8	28586	28593	25 %	50 %	25 %	0 %	258507024
48	NC_013198	GACG	2	8	29436	29443	25 %	0 %	50 %	25 %	258507025
49	NC_013198	TGCC	2	8	30282	30289	0 %	25 %	25 %	50 %	258507026
50	NC_013198	GTTG	2	8	30433	30440	0 %	50 %	50 %	0 %	258507026
51	NC_013198	CTTT	2	8	30909	30916	0 %	75 %	0 %	25 %	258507026
52	NC_013198	TGTT	2	8	31070	31077	0 %	75 %	25 %	0 %	258507026
53	NC_013198	TTGG	2	8	32207	32214	0 %	50 %	50 %	0 %	258507027
54	NC_013198	GGTT	2	8	32384	32391	0 %	50 %	50 %	0 %	258507027
55	NC_013198	TGAA	2	8	32584	32591	50 %	25 %	25 %	0 %	258507027
56	NC_013198	TTGC	2	8	33148	33155	0 %	50 %	25 %	25 %	258507027
57	NC_013198	GGCA	2	8	33215	33222	25 %	0 %	50 %	25 %	258507027
58	NC_013198	CAGG	2	8	33430	33437	25 %	0 %	50 %	25 %	258507027
59	NC_013198	GATT	2	8	33691	33698	25 %	50 %	25 %	0 %	258507027
60	NC_013198	TGAC	2	8	33793	33800	25 %	25 %	25 %	25 %	258507027
61	NC_013198	AGCC	2	8	34408	34415	25 %	0 %	25 %	50 %	258507028
62	NC_013198	ATCC	2	8	34568	34575	25 %	25 %	0 %	50 %	258507028
63	NC_013198	GAAA	2	8	35502	35509	75 %	0 %	25 %	0 %	258507030
64	NC_013198	TCAA	2	8	35606	35613	50 %	25 %	0 %	25 %	258507030
65	NC_013198	CCGG	2	8	36003	36010	0 %	0 %	50 %	50 %	258507030
66	NC_013198	CGGT	2	8	36182	36189	0 %	25 %	50 %	25 %	258507030
67	NC_013198	CAAT	2	8	37320	37327	50 %	25 %	0 %	25 %	258507032
68	NC_013198	AACC	2	8	37428	37435	50 %	0 %	0 %	50 %	258507032
69	NC_013198	ATTT	2	8	38137	38144	25 %	75 %	0 %	0 %	258507033
70	NC_013198	GCGA	2	8	38163	38170	25 %	0 %	50 %	25 %	258507033
71	NC_013198	TTAT	2	8	38244	38251	25 %	75 %	0 %	0 %	258507033
72	NC_013198	TTCA	2	8	38813	38820	25 %	50 %	0 %	25 %	258507034
73	NC_013198	GATT	2	8	40435	40442	25 %	50 %	25 %	0 %	258507036
74	NC_013198	TGGC	2	8	40865	40872	0 %	25 %	50 %	25 %	258507036
75	NC_013198	TTAT	2	8	41651	41658	25 %	75 %	0 %	0 %	258507037
76	NC_013198	AAAT	2	8	43884	43891	75 %	25 %	0 %	0 %	258507039
77	NC_013198	AGCT	2	8	45591	45598	25 %	25 %	25 %	25 %	258507040
78	NC_013198	ATGA	2	8	45613	45620	50 %	25 %	25 %	0 %	258507040
79	NC_013198	GAAA	2	8	47210	47217	75 %	0 %	25 %	0 %	258507042
80	NC_013198	TCCA	2	8	47610	47617	25 %	25 %	0 %	50 %	258507042
81	NC_013198	ATTG	2	8	47708	47715	25 %	50 %	25 %	0 %	258507042
82	NC_013198	AAGT	2	8	47885	47892	50 %	25 %	25 %	0 %	258507042
83	NC_013198	CGAC	2	8	48017	48024	25 %	0 %	25 %	50 %	258507042
84	NC_013198	ATGA	2	8	48547	48554	50 %	25 %	25 %	0 %	258507043
85	NC_013198	GACG	2	8	48870	48877	25 %	0 %	50 %	25 %	258507043
86	NC_013198	GATC	2	8	49096	49103	25 %	25 %	25 %	25 %	258507043
87	NC_013198	CTGT	2	8	49215	49222	0 %	50 %	25 %	25 %	258507043
88	NC_013198	CTGC	2	8	49472	49479	0 %	25 %	25 %	50 %	258507044
89	NC_013198	TGGA	2	8	49880	49887	25 %	25 %	50 %	0 %	258507045
90	NC_013198	GCCG	2	8	50262	50269	0 %	0 %	50 %	50 %	258507045
91	NC_013198	AAAG	2	8	50772	50779	75 %	0 %	25 %	0 %	258507045
92	NC_013198	CTGG	2	8	51239	51246	0 %	25 %	50 %	25 %	258507045
93	NC_013198	GGCT	2	8	51282	51289	0 %	25 %	50 %	25 %	258507045
94	NC_013198	AAGT	2	8	51631	51638	50 %	25 %	25 %	0 %	258507045
95	NC_013198	AAAC	2	8	52596	52603	75 %	0 %	0 %	25 %	258507046
96	NC_013198	GCAG	2	8	53036	53043	25 %	0 %	50 %	25 %	258507046
97	NC_013198	AGTA	2	8	53420	53427	50 %	25 %	25 %	0 %	258507046
98	NC_013198	TCAA	2	8	53612	53619	50 %	25 %	0 %	25 %	258507046
99	NC_013198	CGGG	2	8	53982	53989	0 %	0 %	75 %	25 %	258507046
100	NC_013198	CAGT	3	12	54193	54204	25 %	25 %	25 %	25 %	258507046
101	NC_013198	GGCA	2	8	55356	55363	25 %	0 %	50 %	25 %	258507046
102	NC_013198	GGCA	2	8	55572	55579	25 %	0 %	50 %	25 %	258507046
103	NC_013198	ACCA	2	8	55754	55761	50 %	0 %	0 %	50 %	258507046
104	NC_013198	AGCA	2	8	56235	56242	50 %	0 %	25 %	25 %	258507046
105	NC_013198	TTAC	2	8	56879	56886	25 %	50 %	0 %	25 %	258507047
106	NC_013198	TTAA	2	8	57495	57502	50 %	50 %	0 %	0 %	258507047
107	NC_013198	GGCT	2	8	57721	57728	0 %	25 %	50 %	25 %	258507048
108	NC_013198	TTGA	2	8	57917	57924	25 %	50 %	25 %	0 %	258507048
109	NC_013198	CGAT	2	8	57997	58004	25 %	25 %	25 %	25 %	258507048
110	NC_013198	CAGC	2	8	58135	58142	25 %	0 %	25 %	50 %	258507048
111	NC_013198	CATT	2	8	58563	58570	25 %	50 %	0 %	25 %	258507048
112	NC_013198	ACTG	2	8	59219	59226	25 %	25 %	25 %	25 %	258507049
113	NC_013198	GCTG	2	8	59505	59512	0 %	25 %	50 %	25 %	258507050
114	NC_013198	CATG	2	8	60370	60377	25 %	25 %	25 %	25 %	258507051
115	NC_013198	CAAG	2	8	61724	61731	50 %	0 %	25 %	25 %	258507052
116	NC_013198	ATCA	2	8	61973	61980	50 %	25 %	0 %	25 %	258507052
117	NC_013198	TCAG	2	8	62262	62269	25 %	25 %	25 %	25 %	258507052
118	NC_013198	GGCA	2	8	62474	62481	25 %	0 %	50 %	25 %	258507052
119	NC_013198	TTAA	2	8	63001	63008	50 %	50 %	0 %	0 %	258507053
120	NC_013198	ACAA	2	8	63291	63298	75 %	0 %	0 %	25 %	258507053
121	NC_013198	TAAG	2	8	64321	64328	50 %	25 %	25 %	0 %	258507053
122	NC_013198	ATAG	2	8	64344	64351	50 %	25 %	25 %	0 %	258507053
123	NC_013198	AATC	2	8	64922	64929	50 %	25 %	0 %	25 %	258507054
124	NC_013198	ATTT	2	8	65734	65741	25 %	75 %	0 %	0 %	258507055
125	NC_013198	CATG	2	8	66285	66292	25 %	25 %	25 %	25 %	258507055
126	NC_013198	TTTG	2	8	66676	66683	0 %	75 %	25 %	0 %	258507056
127	NC_013198	GGCA	2	8	66999	67006	25 %	0 %	50 %	25 %	258507056
128	NC_013198	ATGG	2	8	68141	68148	25 %	25 %	50 %	0 %	258507056
129	NC_013198	GACT	2	8	68950	68957	25 %	25 %	25 %	25 %	258507056
130	NC_013198	TTGG	2	8	69478	69485	0 %	50 %	50 %	0 %	258507057
131	NC_013198	ATGT	2	8	69590	69597	25 %	50 %	25 %	0 %	258507057
132	NC_013198	ATGA	2	8	69882	69889	50 %	25 %	25 %	0 %	258507058
133	NC_013198	GTGA	2	8	70784	70791	25 %	25 %	50 %	0 %	258507059
134	NC_013198	GCCA	2	8	70931	70938	25 %	0 %	25 %	50 %	258507059
135	NC_013198	AGGC	2	8	72362	72369	25 %	0 %	50 %	25 %	258507060
136	NC_013198	ATAA	2	8	72394	72401	75 %	25 %	0 %	0 %	258507060
137	NC_013198	GTAA	2	8	72428	72435	50 %	25 %	25 %	0 %	258507060
138	NC_013198	CAAC	2	8	72677	72684	50 %	0 %	0 %	50 %	258507060
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