MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013198	CAG	2	6	253483	253488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507246
4002	NC_013198	TAT	2	6	253497	253502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507246
4003	NC_013198	TGC	3	9	253618	253626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507246
4004	NC_013198	CAA	2	6	253630	253635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507246
4005	NC_013198	AGC	2	6	253648	253653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507246
4006	NC_013198	GCT	2	6	253680	253685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507246
4007	NC_013198	TGC	2	6	253687	253692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507246
4008	NC_013198	GTTT	2	8	253739	253746	0 %	75 %	25 %	0 %	258507246
4009	NC_013198	TGG	2	6	253829	253834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507246
4010	NC_013198	AGC	2	6	253838	253843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507246
4011	NC_013198	TAC	2	6	253851	253856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507246
4012	NC_013198	GTT	2	6	253922	253927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507246
4013	NC_013198	GAT	2	6	254103	254108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507247
4014	NC_013198	TCG	2	6	254116	254121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507247
4015	NC_013198	AAG	2	6	254182	254187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507247
4016	NC_013198	ATG	2	6	254241	254246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507247
4017	NC_013198	CAG	2	6	254326	254331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507247
4018	NC_013198	CTTG	2	8	254573	254580	0 %	50 %	25 %	25 %	258507247
4019	NC_013198	GTT	2	6	254867	254872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507248
4020	NC_013198	GAT	2	6	254888	254893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507248
4021	NC_013198	CGG	2	6	254957	254962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507248
4022	NC_013198	GCAGAT	2	12	255056	255067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258507248
4023	NC_013198	AGC	2	6	255162	255167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507248
4024	NC_013198	ACG	2	6	255212	255217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507248
4025	NC_013198	GTCA	2	8	255252	255259	25 %	25 %	25 %	25 %	258507248
4026	NC_013198	TTGA	2	8	255303	255310	25 %	50 %	25 %	0 %	258507248
4027	NC_013198	ATC	2	6	255313	255318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507248
4028	NC_013198	CA	3	6	255354	255359	50 %	0 %	0 %	50 %	258507248
4029	NC_013198	AAAGC	2	10	255369	255378	60 %	0 %	20 %	20 %	258507248
4030	NC_013198	TTTG	2	8	255401	255408	0 %	75 %	25 %	0 %	258507248
4031	NC_013198	TCCGG	2	10	255446	255455	0 %	20 %	40 %	40 %	258507248
4032	NC_013198	GCG	2	6	255538	255543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507248
4033	NC_013198	ATG	2	6	255558	255563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507248
4034	NC_013198	AAT	2	6	255597	255602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507248
4035	NC_013198	GTC	2	6	255678	255683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507248
4036	NC_013198	ATG	2	6	255697	255702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507248
4037	NC_013198	GTT	2	6	255734	255739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507248
4038	NC_013198	AGA	2	6	255758	255763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507248
4039	NC_013198	CAT	2	6	255818	255823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507248
4040	NC_013198	AAAC	2	8	255921	255928	75 %	0 %	0 %	25 %	258507248
4041	NC_013198	GAA	2	6	255961	255966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507248
4042	NC_013198	GTT	2	6	255967	255972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507249
4043	NC_013198	GTTG	2	8	255979	255986	0 %	50 %	50 %	0 %	258507249
4044	NC_013198	TGC	2	6	256018	256023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507249
4045	NC_013198	GAT	2	6	256168	256173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507249
4046	NC_013198	AGTT	2	8	256182	256189	25 %	50 %	25 %	0 %	258507249
4047	NC_013198	GAC	2	6	256223	256228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507249
4048	NC_013198	ATG	2	6	256329	256334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507249
4049	NC_013198	ATG	2	6	256364	256369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507249
4050	NC_013198	TTGC	2	8	256370	256377	0 %	50 %	25 %	25 %	258507249
4051	NC_013198	AAT	2	6	256481	256486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507249
4052	NC_013198	TTAA	2	8	256577	256584	50 %	50 %	0 %	0 %	258507249
4053	NC_013198	ATC	2	6	256587	256592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507249
4054	NC_013198	AAC	2	6	256606	256611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507249
4055	NC_013198	GAT	2	6	256646	256651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507249
4056	NC_013198	GGTTT	2	10	256688	256697	0 %	60 %	40 %	0 %	258507249
4057	NC_013198	ATC	2	6	256796	256801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507249
4058	NC_013198	GTG	2	6	256805	256810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507249
4059	NC_013198	CGG	2	6	256838	256843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507249
4060	NC_013198	TGA	2	6	256846	256851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507249
4061	NC_013198	TGA	2	6	256863	256868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507249
4062	NC_013198	ACA	2	6	256967	256972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507249
4063	NC_013198	GCCGTT	2	12	256994	257005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507249
4064	NC_013198	AC	3	6	257046	257051	50 %	0 %	0 %	50 %	258507249
4065	NC_013198	AAG	2	6	257169	257174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507249
4066	NC_013198	TTC	2	6	257249	257254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507249
4067	NC_013198	T	6	6	257262	257267	0 %	100 %	0 %	0 %	258507249
4068	NC_013198	T	6	6	257334	257339	0 %	100 %	0 %	0 %	258507250
4069	NC_013198	AGCC	2	8	257349	257356	25 %	0 %	25 %	50 %	258507250
4070	NC_013198	CTGGG	2	10	257440	257449	0 %	20 %	60 %	20 %	258507250
4071	NC_013198	GC	3	6	257481	257486	0 %	0 %	50 %	50 %	258507250
4072	NC_013198	AAG	2	6	257684	257689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507251
4073	NC_013198	AGC	2	6	257739	257744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507251
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4075	NC_013198	GCCG	2	8	257862	257869	0 %	0 %	50 %	50 %	258507251
4076	NC_013198	GAT	2	6	257917	257922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507251
4077	NC_013198	CAG	2	6	257954	257959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507251
4078	NC_013198	CAC	2	6	257996	258001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507251
4079	NC_013198	AGC	2	6	258006	258011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507251
4080	NC_013198	TCG	2	6	258015	258020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507251
4081	NC_013198	CAT	2	6	258022	258027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507251
4082	NC_013198	AGTC	2	8	258110	258117	25 %	25 %	25 %	25 %	258507251
4083	NC_013198	AGC	2	6	258119	258124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507251
4084	NC_013198	TAT	2	6	258358	258363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507252
4085	NC_013198	TTA	2	6	258378	258383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507252
4086	NC_013198	GAT	2	6	258648	258653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507252
4087	NC_013198	TTGT	2	8	258654	258661	0 %	75 %	25 %	0 %	258507252
4088	NC_013198	CCG	2	6	258694	258699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507252
4089	NC_013198	CCA	2	6	258757	258762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507252
4090	NC_013198	GGT	2	6	258770	258775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507252
4091	NC_013198	ATG	2	6	258937	258942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507252
4092	NC_013198	CTT	3	9	258947	258955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507252
4093	NC_013198	ATA	2	6	259015	259020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507252
4094	NC_013198	GTT	2	6	259028	259033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507252
4095	NC_013198	GC	3	6	259041	259046	0 %	0 %	50 %	50 %	258507252
4096	NC_013198	AGT	2	6	259049	259054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507252
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4098	NC_013198	TATT	2	8	259124	259131	25 %	75 %	0 %	0 %	258507252
4099	NC_013198	ATTGAT	2	12	259170	259181	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258507252
4100	NC_013198	AAG	2	6	259198	259203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507252
4101	NC_013198	AGC	2	6	259250	259255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507252
4102	NC_013198	GGC	2	6	259269	259274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507252
4103	NC_013198	ATT	2	6	259276	259281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507252
4104	NC_013198	GCTT	2	8	259283	259290	0 %	50 %	25 %	25 %	258507252
4105	NC_013198	CAG	2	6	259321	259326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507252
4106	NC_013198	CTG	2	6	259363	259368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507252
4107	NC_013198	ACGGT	2	10	259432	259441	20 %	20 %	40 %	20 %	258507252
4108	NC_013198	AAC	2	6	259616	259621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507252
4109	NC_013198	GAT	2	6	259623	259628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507252
4110	NC_013198	AAG	2	6	259720	259725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507252
4111	NC_013198	TGT	2	6	259763	259768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507252
4112	NC_013198	GTT	2	6	259770	259775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507252
4113	NC_013198	A	6	6	259801	259806	100 %	0 %	0 %	0 %	258507252
4114	NC_013198	AC	3	6	259819	259824	50 %	0 %	0 %	50 %	258507252
4115	NC_013198	TGG	2	6	259912	259917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507253
4116	NC_013198	CTG	2	6	259952	259957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507253
4117	NC_013198	ACGC	2	8	259963	259970	25 %	0 %	25 %	50 %	258507253
4118	NC_013198	ATG	2	6	260013	260018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507253
4119	NC_013198	CTT	2	6	260068	260073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507253
4120	NC_013198	CTA	2	6	260081	260086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507253
4121	NC_013198	ACT	2	6	260151	260156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507253
4122	NC_013198	GCT	2	6	260171	260176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507253
4123	NC_013198	GCGA	2	8	260229	260236	25 %	0 %	50 %	25 %	258507253
4124	NC_013198	GAG	2	6	260246	260251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507253
4125	NC_013198	ATC	2	6	260421	260426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507253
4126	NC_013198	GAT	2	6	260447	260452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507253
4127	NC_013198	ATC	2	6	260517	260522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507253
4128	NC_013198	TGAT	2	8	260532	260539	25 %	50 %	25 %	0 %	258507253
4129	NC_013198	TAT	2	6	260548	260553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507253
4130	NC_013198	ATG	2	6	260627	260632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507253
4131	NC_013198	GAA	2	6	260961	260966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507254
4132	NC_013198	GAA	2	6	261195	261200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507254
4133	NC_013198	TCT	2	6	261307	261312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507254
4134	NC_013198	ATG	2	6	261352	261357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507254
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4136	NC_013198	TTC	2	6	261469	261474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507254
4137	NC_013198	GCA	2	6	261485	261490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507254
4138	NC_013198	CTTTGA	2	12	261551	261562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258507254
4139	NC_013198	TCA	2	6	261569	261574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507254
4140	NC_013198	TGT	2	6	261848	261853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507255
4141	NC_013198	GGC	2	6	261879	261884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507255
4142	NC_013198	ATCA	2	8	261966	261973	50 %	25 %	0 %	25 %	258507255
4143	NC_013198	CTT	2	6	261993	261998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507255
4144	NC_013198	TTAA	2	8	262012	262019	50 %	50 %	0 %	0 %	258507255
4145	NC_013198	TGC	2	6	262071	262076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507255
4146	NC_013198	GCG	2	6	262146	262151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507255
4147	NC_013198	GAT	2	6	262167	262172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507255
4148	NC_013198	GCG	2	6	262193	262198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507255
4149	NC_013198	TGA	2	6	262208	262213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507255
4150	NC_013198	TTG	2	6	262222	262227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507255
4151	NC_013198	TCGG	2	8	262249	262256	0 %	25 %	50 %	25 %	258507255
4152	NC_013198	TCAA	2	8	262318	262325	50 %	25 %	0 %	25 %	258507255
4153	NC_013198	CGCT	2	8	262378	262385	0 %	25 %	25 %	50 %	258507255
4154	NC_013198	CCA	2	6	262435	262440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507255
4155	NC_013198	T	7	7	262446	262452	0 %	100 %	0 %	0 %	258507255
4156	NC_013198	ACCGT	2	10	262453	262462	20 %	20 %	20 %	40 %	258507255
4157	NC_013198	CGC	2	6	262486	262491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507255
4158	NC_013198	GCATC	2	10	262568	262577	20 %	20 %	20 %	40 %	258507255
4159	NC_013198	GTT	2	6	263036	263041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507256
4160	NC_013198	TGC	2	6	263056	263061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507256
4161	NC_013198	TCG	3	9	263116	263124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507256
4162	NC_013198	GGC	2	6	263281	263286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507256
4163	NC_013198	GGC	2	6	263328	263333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507256
4164	NC_013198	TCG	2	6	263364	263369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507256
4165	NC_013198	ACCG	2	8	263395	263402	25 %	0 %	25 %	50 %	258507256
4166	NC_013198	CA	3	6	263518	263523	50 %	0 %	0 %	50 %	258507256
4167	NC_013198	GTT	2	6	263551	263556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507256
4168	NC_013198	CGC	2	6	263685	263690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507256
4169	NC_013198	AGA	2	6	263752	263757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507256
4170	NC_013198	A	6	6	263778	263783	100 %	0 %	0 %	0 %	258507256
4171	NC_013198	AAG	2	6	263808	263813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507256
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4174	NC_013198	TCG	2	6	263901	263906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507256
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4179	NC_013198	ATCT	2	8	264176	264183	25 %	50 %	0 %	25 %	258507256
4180	NC_013198	TTC	2	6	264188	264193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507256
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4184	NC_013198	TTC	2	6	264317	264322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507256
4185	NC_013198	ATT	2	6	264383	264388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507256
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4195	NC_013198	CTG	2	6	265070	265075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507257
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4200	NC_013198	ATG	2	6	265304	265309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507257
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4202	NC_013198	AAG	2	6	265416	265421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507257
4203	NC_013198	GTC	2	6	265469	265474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507257
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4209	NC_013198	AAGG	2	8	265868	265875	50 %	0 %	50 %	0 %	258507257
4210	NC_013198	CAG	2	6	265899	265904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507257
4211	NC_013198	TTGCCA	2	12	266040	266051	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258507257
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4213	NC_013198	CATT	2	8	266201	266208	25 %	50 %	0 %	25 %	258507257
4214	NC_013198	AAG	2	6	266261	266266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507257
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4217	NC_013198	CGGTT	2	10	266697	266706	0 %	40 %	40 %	20 %	258507258
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4225	NC_013198	AGC	2	6	267238	267243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507259
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4228	NC_013198	GAT	2	6	267458	267463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507259
4229	NC_013198	GAA	2	6	267509	267514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507259
4230	NC_013198	GCC	2	6	267542	267547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507259
4231	NC_013198	AGA	2	6	267577	267582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507259
4232	NC_013198	GTG	2	6	267695	267700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507259
4233	NC_013198	TAT	2	6	267755	267760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507259
4234	NC_013198	ATT	2	6	267788	267793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507259
4235	NC_013198	ATC	2	6	267825	267830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507259
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4237	NC_013198	TCA	2	6	267891	267896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507259
4238	NC_013198	ATCATT	2	12	267939	267950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	258507259
4239	NC_013198	TGC	2	6	268003	268008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507259
4240	NC_013198	TGC	2	6	268069	268074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507259
4241	NC_013198	TTC	2	6	268102	268107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507259
4242	NC_013198	AG	3	6	268156	268161	50 %	0 %	50 %	0 %	258507259
4243	NC_013198	AGG	2	6	268164	268169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507259
4244	NC_013198	CAA	2	6	268281	268286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507260
4245	NC_013198	TTGATG	2	12	268291	268302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	258507260
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4265	NC_013198	TGC	2	6	269534	269539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507260
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4352	NC_013198	ATT	2	6	275614	275619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507266
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4357	NC_013198	A	6	6	275911	275916	100 %	0 %	0 %	0 %	258507267
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4484	NC_013198	GTT	2	6	283483	283488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507273
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