MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013198	CCG	2	6	189504	189509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507173
3002	NC_013198	CAT	2	6	189655	189660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507173
3003	NC_013198	ATC	2	6	189674	189679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507173
3004	NC_013198	GCA	2	6	189705	189710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507173
3005	NC_013198	GTT	2	6	189746	189751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507173
3006	NC_013198	AAAG	2	8	189785	189792	75 %	0 %	25 %	0 %	258507173
3007	NC_013198	TTGA	2	8	189857	189864	25 %	50 %	25 %	0 %	258507173
3008	NC_013198	T	7	7	189868	189874	0 %	100 %	0 %	0 %	258507173
3009	NC_013198	GTG	2	6	189919	189924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507173
3010	NC_013198	GAT	2	6	189946	189951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507173
3011	NC_013198	TTTG	2	8	190289	190296	0 %	75 %	25 %	0 %	258507174
3012	NC_013198	TTG	2	6	190333	190338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507174
3013	NC_013198	CG	3	6	190363	190368	0 %	0 %	50 %	50 %	258507174
3014	NC_013198	ATG	2	6	190428	190433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507174
3015	NC_013198	CGG	2	6	190671	190676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507175
3016	NC_013198	TGC	2	6	190704	190709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507175
3017	NC_013198	ATG	2	6	190729	190734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507175
3018	NC_013198	TGG	2	6	190761	190766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507175
3019	NC_013198	A	6	6	190834	190839	100 %	0 %	0 %	0 %	258507175
3020	NC_013198	TCACT	2	10	190863	190872	20 %	40 %	0 %	40 %	258507175
3021	NC_013198	TGGC	2	8	190892	190899	0 %	25 %	50 %	25 %	258507175
3022	NC_013198	TGGC	2	8	190976	190983	0 %	25 %	50 %	25 %	258507175
3023	NC_013198	ATG	2	6	190991	190996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507175
3024	NC_013198	GTT	2	6	191011	191016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507175
3025	NC_013198	T	6	6	191067	191072	0 %	100 %	0 %	0 %	258507175
3026	NC_013198	GCA	2	6	191096	191101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507175
3027	NC_013198	GC	3	6	191114	191119	0 %	0 %	50 %	50 %	258507175
3028	NC_013198	GGAC	2	8	191172	191179	25 %	0 %	50 %	25 %	258507175
3029	NC_013198	TGC	2	6	191708	191713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507176
3030	NC_013198	CAA	2	6	191740	191745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507176
3031	NC_013198	ACA	2	6	191773	191778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507176
3032	NC_013198	CAG	2	6	191894	191899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507176
3033	NC_013198	CAAC	2	8	191917	191924	50 %	0 %	0 %	50 %	258507176
3034	NC_013198	CAC	2	6	191928	191933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507176
3035	NC_013198	CAACCG	2	12	191998	192009	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258507176
3036	NC_013198	GGCGA	2	10	192050	192059	20 %	0 %	60 %	20 %	258507176
3037	NC_013198	CTG	2	6	192077	192082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507176
3038	NC_013198	CG	3	6	192097	192102	0 %	0 %	50 %	50 %	258507176
3039	NC_013198	TGAT	2	8	192128	192135	25 %	50 %	25 %	0 %	258507176
3040	NC_013198	GCC	2	6	192199	192204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507176
3041	NC_013198	CG	3	6	192248	192253	0 %	0 %	50 %	50 %	258507176
3042	NC_013198	CAA	2	6	192267	192272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507176
3043	NC_013198	TTA	2	6	192273	192278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507176
3044	NC_013198	ATT	2	6	192319	192324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507176
3045	NC_013198	CGCAA	2	10	192376	192385	40 %	0 %	20 %	40 %	258507176
3046	NC_013198	TTCAT	2	10	192414	192423	20 %	60 %	0 %	20 %	258507176
3047	NC_013198	CTTT	2	8	192477	192484	0 %	75 %	0 %	25 %	258507176
3048	NC_013198	GAA	2	6	192487	192492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507176
3049	NC_013198	A	6	6	192700	192705	100 %	0 %	0 %	0 %	258507176
3050	NC_013198	A	7	7	192752	192758	100 %	0 %	0 %	0 %	258507176
3051	NC_013198	AAC	2	6	192790	192795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507176
3052	NC_013198	TCGAC	2	10	192891	192900	20 %	20 %	20 %	40 %	258507176
3053	NC_013198	TGA	2	6	192917	192922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507176
3054	NC_013198	GAT	2	6	193030	193035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507176
3055	NC_013198	CAT	2	6	193061	193066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507176
3056	NC_013198	GGC	2	6	193140	193145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507176
3057	NC_013198	GGT	2	6	193158	193163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507176
3058	NC_013198	CAC	2	6	193182	193187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507176
3059	NC_013198	GTC	2	6	193210	193215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507176
3060	NC_013198	A	6	6	193225	193230	100 %	0 %	0 %	0 %	258507176
3061	NC_013198	GCT	2	6	193239	193244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507176
3062	NC_013198	GATTTT	2	12	193261	193272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258507176
3063	NC_013198	ATT	2	6	193333	193338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507176
3064	NC_013198	CGG	2	6	193352	193357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507176
3065	NC_013198	AGTC	2	8	193364	193371	25 %	25 %	25 %	25 %	258507176
3066	NC_013198	AAC	2	6	193460	193465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507176
3067	NC_013198	AGA	2	6	193491	193496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507176
3068	NC_013198	CAGT	2	8	193527	193534	25 %	25 %	25 %	25 %	258507176
3069	NC_013198	TGA	2	6	193672	193677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507177
3070	NC_013198	CTG	2	6	193689	193694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507177
3071	NC_013198	CCA	2	6	193722	193727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507177
3072	NC_013198	T	6	6	193773	193778	0 %	100 %	0 %	0 %	258507177
3073	NC_013198	AGC	2	6	193786	193791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507177
3074	NC_013198	ACC	3	9	193844	193852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507177
3075	NC_013198	AGA	2	6	193859	193864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507177
3076	NC_013198	ATG	2	6	193884	193889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507177
3077	NC_013198	CTA	2	6	193917	193922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507177
3078	NC_013198	ACAA	2	8	193968	193975	75 %	0 %	0 %	25 %	258507177
3079	NC_013198	GAA	2	6	193983	193988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507177
3080	NC_013198	TTAAGT	2	12	194103	194114	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258507178
3081	NC_013198	CCGA	2	8	194177	194184	25 %	0 %	25 %	50 %	258507178
3082	NC_013198	TGG	2	6	194197	194202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507178
3083	NC_013198	TCGA	2	8	194234	194241	25 %	25 %	25 %	25 %	258507178
3084	NC_013198	CA	3	6	194320	194325	50 %	0 %	0 %	50 %	258507178
3085	NC_013198	GCT	2	6	194585	194590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507178
3086	NC_013198	GAT	2	6	194627	194632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507178
3087	NC_013198	ACC	2	6	194786	194791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507178
3088	NC_013198	GAA	2	6	194944	194949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507179
3089	NC_013198	A	6	6	194948	194953	100 %	0 %	0 %	0 %	258507179
3090	NC_013198	TGCC	2	8	194991	194998	0 %	25 %	25 %	50 %	258507179
3091	NC_013198	TGC	2	6	195028	195033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507179
3092	NC_013198	GC	3	6	195102	195107	0 %	0 %	50 %	50 %	258507179
3093	NC_013198	CCA	2	6	195180	195185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507179
3094	NC_013198	GTG	2	6	195200	195205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507179
3095	NC_013198	TTCA	2	8	195584	195591	25 %	50 %	0 %	25 %	258507179
3096	NC_013198	AAG	2	6	195657	195662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507179
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3098	NC_013198	CAAGC	2	10	195901	195910	40 %	0 %	20 %	40 %	258507179
3099	NC_013198	ATC	2	6	195965	195970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507179
3100	NC_013198	GCG	2	6	195991	195996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507179
3101	NC_013198	CTT	2	6	196014	196019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507179
3102	NC_013198	AGA	2	6	196119	196124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507180
3103	NC_013198	ATG	2	6	196126	196131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507180
3104	NC_013198	TGC	2	6	196170	196175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507180
3105	NC_013198	GGC	2	6	196235	196240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507180
3106	NC_013198	TTG	2	6	196285	196290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507180
3107	NC_013198	A	7	7	196356	196362	100 %	0 %	0 %	0 %	258507181
3108	NC_013198	AAG	2	6	196370	196375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507181
3109	NC_013198	CTA	2	6	196456	196461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507181
3110	NC_013198	GAT	2	6	196517	196522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507181
3111	NC_013198	ATA	2	6	196572	196577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507181
3112	NC_013198	CTG	2	6	196634	196639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507181
3113	NC_013198	TGA	2	6	196644	196649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507181
3114	NC_013198	CAA	2	6	196652	196657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507181
3115	NC_013198	GCT	2	6	196810	196815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507181
3116	NC_013198	TGG	2	6	196830	196835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507181
3117	NC_013198	CA	3	6	196837	196842	50 %	0 %	0 %	50 %	258507181
3118	NC_013198	AAC	2	6	196909	196914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507181
3119	NC_013198	AAG	2	6	197013	197018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507181
3120	NC_013198	TGG	2	6	197028	197033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507181
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3122	NC_013198	AGC	2	6	197205	197210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507181
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3229	NC_013198	GC	3	6	205516	205521	0 %	0 %	50 %	50 %	258507188
3230	NC_013198	CAT	2	6	205575	205580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507188
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3234	NC_013198	TATT	2	8	206084	206091	25 %	75 %	0 %	0 %	258507188
3235	NC_013198	GAA	3	9	206125	206133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507188
3236	NC_013198	TTCGG	2	10	206155	206164	0 %	40 %	40 %	20 %	258507188
3237	NC_013198	CAGC	2	8	206312	206319	25 %	0 %	25 %	50 %	258507189
3238	NC_013198	CAT	2	6	206324	206329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507189
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3240	NC_013198	GTC	2	6	206421	206426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507189
3241	NC_013198	ATT	2	6	206445	206450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507189
3242	NC_013198	CATG	2	8	206498	206505	25 %	25 %	25 %	25 %	258507189
3243	NC_013198	TCTTTG	2	12	206575	206586	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	258507189
3244	NC_013198	TGT	2	6	206670	206675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507189
3245	NC_013198	GGC	2	6	206697	206702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507189
3246	NC_013198	ATT	2	6	206793	206798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507189
3247	NC_013198	GAC	2	6	206808	206813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507189
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3273	NC_013198	TGA	3	9	208837	208845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507191
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3485	NC_013198	CG	3	6	221592	221597	0 %	0 %	50 %	50 %	258507203
3486	NC_013198	CGG	2	6	221685	221690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507203
3487	NC_013198	T	6	6	221845	221850	0 %	100 %	0 %	0 %	258507204
3488	NC_013198	GAT	2	6	221899	221904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507204
3489	NC_013198	ATG	2	6	221913	221918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507204
3490	NC_013198	TTG	2	6	221931	221936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507204
3491	NC_013198	TAA	2	6	221939	221944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507204
3492	NC_013198	CAA	2	6	221998	222003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507204
3493	NC_013198	GCC	2	6	222059	222064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507204
3494	NC_013198	TGC	2	6	222073	222078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507204
3495	NC_013198	TGTT	2	8	222139	222146	0 %	75 %	25 %	0 %	258507204
3496	NC_013198	GTTT	2	8	222156	222163	0 %	75 %	25 %	0 %	258507204
3497	NC_013198	TCC	2	6	222380	222385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258507204
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3499	NC_013198	GCCA	2	8	222569	222576	25 %	0 %	25 %	50 %	258507204
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