MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013198	CAA	2	6	284290	284295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507274
4502	NC_013198	ACA	2	6	284341	284346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507274
4503	NC_013198	TGT	2	6	284403	284408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507274
4504	NC_013198	GCTG	2	8	284427	284434	0 %	25 %	50 %	25 %	258507274
4505	NC_013198	T	6	6	284476	284481	0 %	100 %	0 %	0 %	258507274
4506	NC_013198	TGC	2	6	284511	284516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507274
4507	NC_013198	AATT	2	8	284517	284524	50 %	50 %	0 %	0 %	258507274
4508	NC_013198	GGC	2	6	284544	284549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507274
4509	NC_013198	GC	3	6	284826	284831	0 %	0 %	50 %	50 %	258507274
4510	NC_013198	AGG	3	9	284868	284876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507274
4511	NC_013198	CAT	2	6	284885	284890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507274
4512	NC_013198	TGC	2	6	284921	284926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507275
4513	NC_013198	AATC	2	8	284947	284954	50 %	25 %	0 %	25 %	258507275
4514	NC_013198	TTG	3	9	284986	284994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507275
4515	NC_013198	ATG	2	6	284995	285000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507275
4516	NC_013198	CG	3	6	285020	285025	0 %	0 %	50 %	50 %	258507275
4517	NC_013198	TTGA	2	8	285057	285064	25 %	50 %	25 %	0 %	258507275
4518	NC_013198	ATT	2	6	285127	285132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507275
4519	NC_013198	GAT	2	6	285150	285155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507275
4520	NC_013198	GC	3	6	285185	285190	0 %	0 %	50 %	50 %	258507275
4521	NC_013198	TGG	2	6	285214	285219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507275
4522	NC_013198	ATG	2	6	285226	285231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507275
4523	NC_013198	GCT	2	6	285308	285313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507275
4524	NC_013198	ATG	2	6	285348	285353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507275
4525	NC_013198	TGG	2	6	285417	285422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507275
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4527	NC_013198	TTA	2	6	285538	285543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507275
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4530	NC_013198	TA	3	6	285745	285750	50 %	50 %	0 %	0 %	258507276
4531	NC_013198	CAT	2	6	285816	285821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507276
4532	NC_013198	ATT	2	6	285905	285910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507276
4533	NC_013198	T	7	7	285909	285915	0 %	100 %	0 %	0 %	258507276
4534	NC_013198	GGC	2	6	285966	285971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507276
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4536	NC_013198	TATC	2	8	286108	286115	25 %	50 %	0 %	25 %	258507276
4537	NC_013198	GGC	2	6	286137	286142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507276
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4539	NC_013198	TCTG	2	8	286243	286250	0 %	50 %	25 %	25 %	258507276
4540	NC_013198	GCA	2	6	286293	286298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507276
4541	NC_013198	A	6	6	286323	286328	100 %	0 %	0 %	0 %	258507276
4542	NC_013198	AAC	2	6	286354	286359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507276
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4544	NC_013198	GAA	2	6	286369	286374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507276
4545	NC_013198	TTG	2	6	286385	286390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507276
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4548	NC_013198	CAT	2	6	286536	286541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507276
4549	NC_013198	CAT	2	6	286543	286548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507276
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4553	NC_013198	T	8	8	286917	286924	0 %	100 %	0 %	0 %	258507277
4554	NC_013198	GTC	2	6	287035	287040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507277
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4556	NC_013198	GAC	2	6	287127	287132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507277
4557	NC_013198	TAT	2	6	287202	287207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507277
4558	NC_013198	T	6	6	287228	287233	0 %	100 %	0 %	0 %	258507277
4559	NC_013198	GCG	2	6	287263	287268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507277
4560	NC_013198	T	7	7	287360	287366	0 %	100 %	0 %	0 %	258507277
4561	NC_013198	GCA	2	6	287505	287510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507277
4562	NC_013198	GCA	2	6	287605	287610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507277
4563	NC_013198	TAC	2	6	287684	287689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507277
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4565	NC_013198	ATG	2	6	287723	287728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507277
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4567	NC_013198	CAT	2	6	287991	287996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507277
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4570	NC_013198	G	6	6	288115	288120	0 %	0 %	100 %	0 %	258507277
4571	NC_013198	TGGTG	2	10	288168	288177	0 %	40 %	60 %	0 %	258507277
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4590	NC_013198	TGA	2	6	289280	289285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507278
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4592	NC_013198	AACC	2	8	289533	289540	50 %	0 %	0 %	50 %	258507279
4593	NC_013198	A	6	6	289541	289546	100 %	0 %	0 %	0 %	258507279
4594	NC_013198	GAA	2	6	289583	289588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507279
4595	NC_013198	GAT	2	6	289673	289678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507279
4596	NC_013198	GAT	2	6	289702	289707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507279
4597	NC_013198	CAG	2	6	290086	290091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507280
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4602	NC_013198	TGA	2	6	290502	290507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507280
4603	NC_013198	ACCA	2	8	290632	290639	50 %	0 %	0 %	50 %	258507280
4604	NC_013198	TATT	2	8	290641	290648	25 %	75 %	0 %	0 %	258507280
4605	NC_013198	TGG	2	6	290839	290844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507281
4606	NC_013198	GGTT	2	8	290882	290889	0 %	50 %	50 %	0 %	258507281
4607	NC_013198	GCG	2	6	290898	290903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507281
4608	NC_013198	TGC	2	6	290941	290946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507281
4609	NC_013198	TAT	2	6	291113	291118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507281
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4611	NC_013198	CGG	2	6	291195	291200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507281
4612	NC_013198	TTCG	2	8	291212	291219	0 %	50 %	25 %	25 %	258507281
4613	NC_013198	TCGG	2	8	291222	291229	0 %	25 %	50 %	25 %	258507281
4614	NC_013198	AGTA	2	8	291252	291259	50 %	25 %	25 %	0 %	258507281
4615	NC_013198	ATTT	2	8	291267	291274	25 %	75 %	0 %	0 %	258507281
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4619	NC_013198	TGC	2	6	291488	291493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507281
4620	NC_013198	A	6	6	291686	291691	100 %	0 %	0 %	0 %	258507282
4621	NC_013198	TA	3	6	291786	291791	50 %	50 %	0 %	0 %	258507282
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4623	NC_013198	ATG	2	6	291886	291891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507282
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4986	NC_013198	TTC	2	6	320617	320622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507314
4987	NC_013198	GCT	2	6	320769	320774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507314
4988	NC_013198	TTG	2	6	320813	320818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507314
4989	NC_013198	TAT	2	6	320829	320834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507314
4990	NC_013198	GTT	2	6	320942	320947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507314
4991	NC_013198	ATG	2	6	321155	321160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507314
4992	NC_013198	ACC	2	6	321161	321166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507315
4993	NC_013198	TAA	2	6	321257	321262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507315
4994	NC_013198	GGC	2	6	321339	321344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507315
4995	NC_013198	AAC	2	6	321483	321488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507315
4996	NC_013198	GATTG	2	10	321611	321620	20 %	40 %	40 %	0 %	258507315
4997	NC_013198	TAAA	2	8	321628	321635	75 %	25 %	0 %	0 %	258507315
4998	NC_013198	GTG	2	6	321675	321680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507315
4999	NC_013198	CAC	2	6	321729	321734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507315
5000	NC_013198	AGC	2	6	321791	321796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507315

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