MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 1856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013192	GAAAT	2	10	1171	1180	60 %	20 %	20 %	0 %	257124815
2	NC_013192	GATAT	2	10	1806	1815	40 %	40 %	20 %	0 %	257124815
3	NC_013192	AAAAT	2	10	2736	2745	80 %	20 %	0 %	0 %	257124816
4	NC_013192	ACAAA	2	10	3102	3111	80 %	0 %	0 %	20 %	257124817
5	NC_013192	GAAAA	2	10	5381	5390	80 %	0 %	20 %	0 %	257124818
6	NC_013192	ATAAA	2	10	6038	6047	80 %	20 %	0 %	0 %	257124819
7	NC_013192	AAAAT	2	10	6221	6230	80 %	20 %	0 %	0 %	257124819
8	NC_013192	TTTAC	2	10	8439	8448	20 %	60 %	0 %	20 %	257124821
9	NC_013192	ATATT	2	10	9809	9818	40 %	60 %	0 %	0 %	257124822
10	NC_013192	CCCTT	2	10	11456	11465	0 %	40 %	0 %	60 %	257124823
11	NC_013192	GCTAT	2	10	12982	12991	20 %	40 %	20 %	20 %	257124824
12	NC_013192	CTTCT	2	10	14948	14957	0 %	60 %	0 %	40 %	257124826
13	NC_013192	GAAAA	2	10	16869	16878	80 %	0 %	20 %	0 %	257124828
14	NC_013192	ACTTT	2	10	18739	18748	20 %	60 %	0 %	20 %	257124829
15	NC_013192	TTGAT	2	10	20408	20417	20 %	60 %	20 %	0 %	257124831
16	NC_013192	TAATT	2	10	23519	23528	40 %	60 %	0 %	0 %	257124833
17	NC_013192	ACTTT	2	10	25254	25263	20 %	60 %	0 %	20 %	257124834
18	NC_013192	AATGC	2	10	27664	27673	40 %	20 %	20 %	20 %	257124837
19	NC_013192	TAAAA	2	10	28391	28400	80 %	20 %	0 %	0 %	257124838
20	NC_013192	TGGAA	2	10	29409	29418	40 %	20 %	40 %	0 %	257124839
21	NC_013192	AAAGC	2	10	31861	31870	60 %	0 %	20 %	20 %	257124841
22	NC_013192	AATGA	2	10	31923	31932	60 %	20 %	20 %	0 %	257124841
23	NC_013192	ATTTT	2	10	32218	32227	20 %	80 %	0 %	0 %	257124842
24	NC_013192	TATTT	2	10	34249	34258	20 %	80 %	0 %	0 %	257124843
25	NC_013192	CTTTT	2	10	36153	36162	0 %	80 %	0 %	20 %	257124846
26	NC_013192	TTTTA	2	10	36285	36294	20 %	80 %	0 %	0 %	257124847
27	NC_013192	GAAAA	2	10	41825	41834	80 %	0 %	20 %	0 %	257124848
28	NC_013192	ATAAA	2	10	43030	43039	80 %	20 %	0 %	0 %	257124849
29	NC_013192	ACTTT	2	10	43126	43135	20 %	60 %	0 %	20 %	257124849
30	NC_013192	AATTT	2	10	46291	46300	40 %	60 %	0 %	0 %	257124851
31	NC_013192	ATAAA	2	10	46676	46685	80 %	20 %	0 %	0 %	257124851
32	NC_013192	ATTTT	2	10	47108	47117	20 %	80 %	0 %	0 %	257124852
33	NC_013192	GCCAA	2	10	47640	47649	40 %	0 %	20 %	40 %	257124852
34	NC_013192	TTTTC	2	10	49427	49436	0 %	80 %	0 %	20 %	257124854
35	NC_013192	TAGAT	2	10	49509	49518	40 %	40 %	20 %	0 %	257124854
36	NC_013192	TAAAA	2	10	52450	52459	80 %	20 %	0 %	0 %	257124855
37	NC_013192	AAATC	2	10	54909	54918	60 %	20 %	0 %	20 %	257124859
38	NC_013192	CGTTC	2	10	55383	55392	0 %	40 %	20 %	40 %	257124860
39	NC_013192	ATTTT	2	10	55630	55639	20 %	80 %	0 %	0 %	257124860
40	NC_013192	TACAA	2	10	58256	58265	60 %	20 %	0 %	20 %	257124863
41	NC_013192	AAAAT	2	10	58305	58314	80 %	20 %	0 %	0 %	257124863
42	NC_013192	ATATA	2	10	59517	59526	60 %	40 %	0 %	0 %	257124864
43	NC_013192	AAATC	2	10	61747	61756	60 %	20 %	0 %	20 %	257124866
44	NC_013192	AAGCA	2	10	62287	62296	60 %	0 %	20 %	20 %	257124866
45	NC_013192	ATTAT	2	10	63531	63540	40 %	60 %	0 %	0 %	257124867
46	NC_013192	GGCTA	2	10	63640	63649	20 %	20 %	40 %	20 %	257124867
47	NC_013192	AACAA	2	10	64996	65005	80 %	0 %	0 %	20 %	257124869
48	NC_013192	GGAAT	2	10	65181	65190	40 %	20 %	40 %	0 %	257124869
49	NC_013192	AAGAA	2	10	65307	65316	80 %	0 %	20 %	0 %	257124869
50	NC_013192	ATTTT	2	10	66682	66691	20 %	80 %	0 %	0 %	257124871
51	NC_013192	AGTTT	2	10	73034	73043	20 %	60 %	20 %	0 %	257124876
52	NC_013192	TTGTA	2	10	73888	73897	20 %	60 %	20 %	0 %	257124876
53	NC_013192	TTCCT	2	10	79489	79498	0 %	60 %	0 %	40 %	257124884
54	NC_013192	CTTGA	2	10	79782	79791	20 %	40 %	20 %	20 %	257124884
55	NC_013192	ATTTG	2	10	85275	85284	20 %	60 %	20 %	0 %	257124892
56	NC_013192	TTTTC	2	10	85520	85529	0 %	80 %	0 %	20 %	257124893
57	NC_013192	AGGAA	2	10	86552	86561	60 %	0 %	40 %	0 %	257124894
58	NC_013192	AATTT	2	10	87075	87084	40 %	60 %	0 %	0 %	257124894
59	NC_013192	AATTT	2	10	89024	89033	40 %	60 %	0 %	0 %	257124897
60	NC_013192	ATCAA	2	10	89218	89227	60 %	20 %	0 %	20 %	257124898
61	NC_013192	TAAAG	2	10	92857	92866	60 %	20 %	20 %	0 %	257124903
62	NC_013192	TTGAA	2	10	93018	93027	40 %	40 %	20 %	0 %	257124903
63	NC_013192	ATTGA	2	10	95310	95319	40 %	40 %	20 %	0 %	257124905
64	NC_013192	AAAGA	2	10	95785	95794	80 %	0 %	20 %	0 %	257124905
65	NC_013192	AAAAG	2	10	95829	95838	80 %	0 %	20 %	0 %	257124905
66	NC_013192	GAAAA	2	10	98397	98406	80 %	0 %	20 %	0 %	257124907
67	NC_013192	AAAAT	2	10	101215	101224	80 %	20 %	0 %	0 %	257124910
68	NC_013192	ATTTG	2	10	104145	104154	20 %	60 %	20 %	0 %	257124917
69	NC_013192	TGATA	2	10	104691	104700	40 %	40 %	20 %	0 %	257124917
70	NC_013192	ATTTT	2	10	110984	110993	20 %	80 %	0 %	0 %	257124924
71	NC_013192	GTAAA	2	10	114216	114225	60 %	20 %	20 %	0 %	257124927
72	NC_013192	GAAAA	2	10	114539	114548	80 %	0 %	20 %	0 %	257124927
73	NC_013192	AAGCA	2	10	114903	114912	60 %	0 %	20 %	20 %	257124927
74	NC_013192	AAACA	2	10	115683	115692	80 %	0 %	0 %	20 %	257124928
75	NC_013192	AAAAT	2	10	124906	124915	80 %	20 %	0 %	0 %	257124930
76	NC_013192	ATTTA	2	10	126836	126845	40 %	60 %	0 %	0 %	257124932
77	NC_013192	AAAAG	2	10	128330	128339	80 %	0 %	20 %	0 %	257124934
78	NC_013192	ATTTT	2	10	129621	129630	20 %	80 %	0 %	0 %	257124935
79	NC_013192	TTTTA	2	10	130849	130858	20 %	80 %	0 %	0 %	257124935
80	NC_013192	TTGAT	2	10	133745	133754	20 %	60 %	20 %	0 %	257124939
81	NC_013192	AGATC	2	10	134241	134250	40 %	20 %	20 %	20 %	257124939
82	NC_013192	AAAAG	2	10	134515	134524	80 %	0 %	20 %	0 %	257124939
83	NC_013192	AATAA	2	10	136832	136841	80 %	20 %	0 %	0 %	257124941
84	NC_013192	AAATC	2	10	137433	137442	60 %	20 %	0 %	20 %	257124941
85	NC_013192	TTAGT	2	10	141252	141261	20 %	60 %	20 %	0 %	257124945
86	NC_013192	ATTGT	2	10	141431	141440	20 %	60 %	20 %	0 %	257124945
87	NC_013192	ATTTT	2	10	142379	142388	20 %	80 %	0 %	0 %	257124946
88	NC_013192	ATTTT	2	10	142445	142454	20 %	80 %	0 %	0 %	257124946
89	NC_013192	TCCAT	2	10	143754	143763	20 %	40 %	0 %	40 %	257124948
90	NC_013192	TATTT	2	10	145125	145134	20 %	80 %	0 %	0 %	257124949
91	NC_013192	CTAAA	2	10	150519	150528	60 %	20 %	0 %	20 %	257124952
92	NC_013192	GCTAT	2	10	151189	151198	20 %	40 %	20 %	20 %	257124952
93	NC_013192	GAAAT	2	10	151773	151782	60 %	20 %	20 %	0 %	257124953
94	NC_013192	ATTTG	2	10	151813	151822	20 %	60 %	20 %	0 %	257124953
95	NC_013192	AAACA	2	10	152377	152386	80 %	0 %	0 %	20 %	257124954
96	NC_013192	ACATA	2	10	154440	154449	60 %	20 %	0 %	20 %	257124955
97	NC_013192	GAAAA	2	10	155173	155182	80 %	0 %	20 %	0 %	257124956
98	NC_013192	AAAAT	2	10	156710	156719	80 %	20 %	0 %	0 %	257124958
99	NC_013192	AAATA	2	10	156796	156805	80 %	20 %	0 %	0 %	257124959
100	NC_013192	CAAGG	2	10	157693	157702	40 %	0 %	40 %	20 %	257124959
101	NC_013192	TTTGA	2	10	159056	159065	20 %	60 %	20 %	0 %	257124959
102	NC_013192	AAATG	2	10	159340	159349	60 %	20 %	20 %	0 %	257124959
103	NC_013192	AATAA	2	10	159425	159434	80 %	20 %	0 %	0 %	257124959
104	NC_013192	AAAAT	2	10	159755	159764	80 %	20 %	0 %	0 %	257124959
105	NC_013192	AATTA	2	10	160566	160575	60 %	40 %	0 %	0 %	257124961
106	NC_013192	GAAAA	2	10	164638	164647	80 %	0 %	20 %	0 %	257124965
107	NC_013192	AGCAA	2	10	168228	168237	60 %	0 %	20 %	20 %	257124969
108	NC_013192	GAAAA	2	10	169004	169013	80 %	0 %	20 %	0 %	257124969
109	NC_013192	CTTCA	2	10	169302	169311	20 %	40 %	0 %	40 %	257124969
110	NC_013192	AAAAT	2	10	172936	172945	80 %	20 %	0 %	0 %	257124973
111	NC_013192	AAATA	2	10	173435	173444	80 %	20 %	0 %	0 %	257124974
112	NC_013192	TTGTA	2	10	174539	174548	20 %	60 %	20 %	0 %	257124975
113	NC_013192	GAAGA	2	10	174710	174719	60 %	0 %	40 %	0 %	257124976
114	NC_013192	AAAAG	2	10	174832	174841	80 %	0 %	20 %	0 %	257124976
115	NC_013192	TAAAA	2	10	175186	175195	80 %	20 %	0 %	0 %	257124976
116	NC_013192	TTTCT	2	10	177230	177239	0 %	80 %	0 %	20 %	257124979
117	NC_013192	TTTTC	2	10	185694	185703	0 %	80 %	0 %	20 %	257124982
118	NC_013192	ATTAT	2	10	189994	190003	40 %	60 %	0 %	0 %	257124986
119	NC_013192	TTAAA	2	10	195212	195221	60 %	40 %	0 %	0 %	257124992
120	NC_013192	TAATT	2	10	195896	195905	40 %	60 %	0 %	0 %	257124992
121	NC_013192	AAAAT	2	10	201762	201771	80 %	20 %	0 %	0 %	257124997
122	NC_013192	ACCAA	2	10	201975	201984	60 %	0 %	0 %	40 %	257124997
123	NC_013192	TGGAA	2	10	207575	207584	40 %	20 %	40 %	0 %	257124998
124	NC_013192	TAAAA	2	10	207971	207980	80 %	20 %	0 %	0 %	257124998
125	NC_013192	ATTTT	2	10	208776	208785	20 %	80 %	0 %	0 %	257124999
126	NC_013192	CATTA	2	10	208883	208892	40 %	40 %	0 %	20 %	257124999
127	NC_013192	TTATC	2	10	210603	210612	20 %	60 %	0 %	20 %	257125000
128	NC_013192	GAAAA	2	10	210876	210885	80 %	0 %	20 %	0 %	257125001
129	NC_013192	ATGAA	2	10	211988	211997	60 %	20 %	20 %	0 %	257125001
130	NC_013192	TAAAA	2	10	215979	215988	80 %	20 %	0 %	0 %	257125005
131	NC_013192	CTATG	2	10	216000	216009	20 %	40 %	20 %	20 %	257125005
132	NC_013192	TTTAT	2	10	217627	217636	20 %	80 %	0 %	0 %	257125007
133	NC_013192	TACAA	2	10	219373	219382	60 %	20 %	0 %	20 %	257125011
134	NC_013192	GTGTT	2	10	222415	222424	0 %	60 %	40 %	0 %	257125014
135	NC_013192	AATGC	2	10	222996	223005	40 %	20 %	20 %	20 %	257125015
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263	NC_013192	ATACA	3	15	416136	416150	60 %	20 %	0 %	20 %	257125194
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